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リボヌクレオプロテインにおけるRNAの役割

研究課題

研究課題/領域番号 17370036
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 構造生物化学
研究機関東京工業大学

研究代表者

濡木 理  東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 教授 (10272460)

研究期間 (年度) 2005 – 2007
研究課題ステータス 完了 (2007年度)
配分額 *注記
15,660千円 (直接経費: 14,400千円、間接経費: 1,260千円)
2007年度: 5,460千円 (直接経費: 4,200千円、間接経費: 1,260千円)
2006年度: 4,900千円 (直接経費: 4,900千円)
2005年度: 5,300千円 (直接経費: 5,300千円)
キーワードリボヌクレオプロテイン / トランスファーRNA / RNAプロセシング / RNAの転写後修飾 / 遺伝子暗号翻訳 / 遺伝暗号翻訳 / アミノアシルtRNA合成酵素 / X線結晶構造解析 / 変異体解析
研究概要

タンパク質はRNAと協働し、リボヌクレオプロテイン複合体を形成し、高特異的な遺伝情報変換過程に働く。本研究では、遺伝暗号翻訳過程に注目し、まずtRNAのプロセシングおよび転写後化学修飾の過程において働くCCA付加酵素(RNAポリメラーゼ)およびMnmAチオ化ウリジン合成酵素とtRNA(前駆体)との複合体について、各反応ステップの複数の結晶構造(スナップショット)を決定することで、高精度・高特異的な化学反応を触媒する動的なメカニズムを分子動画として原子分解能で明らかにした(Nature 2006, Nature 2006)。これらの動的過程では、核酸とタンパク質が協同的に構造を変化させながら活性化して行き、正確な化学反応を可能にしていた。さらに、真核細胞やその祖先となる古細菌の翻訳系酵素は、複数のタンパク質が(超分子)複合体を形成し、統合された化学反応(チャネリング反応)を触媒すると考えられる。本研究では、第2に、tRNAの化学修飾や間接的なアミノアシル化に働くチャネリング複合体(TusE・tRNA・MnmA、TYW1-4、box C/D snoRNP)、アミノアシルtRNA合成酵素(aaRS)分子複合体(MARS)の再構成と予備的な結晶化に成功し、構造研究を推進している。また、古細菌において3つの連続した化学反応を触媒してGln-tRNA^<Gln>を合成するGatDEアミド基転移酵素とtRNA^<Gln>との複合体のX線結晶構造解析を行い、統合された連鎖反応の触媒機構、さらにアンモニア分子を輸送する分子トンネルを明らかにした(Science 2006)。第3に、タンパク質が細胞内から膜を隔てた細胞外へ輸送される一般的なメカニズムを解明するために、細胞膜(真核細胞では小胞体膜)を介した新生ペプチドの輸送を行うトランスロコン(超分子複合体)を構成する膜タンパク質、SecYEとSecDFのX線結晶構造解析を行い、構造決定に成功した。

報告書

(4件)
  • 2007 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2006 実績報告書
  • 2005 実績報告書
  • 研究成果

    (92件)

すべて 2009 2008 2007 2006 2005 その他

すべて 雑誌論文 (69件) (うち査読あり 35件) 学会発表 (19件) 図書 (3件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Structural basis for translational fidelity ensured by tRNA lvsidine synthetase2009

    • 著者名/発表者名
      K.Nakanishi, et al.
    • 雑誌名

      Nature 461

      ページ: 1144-1148

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mechanism for the definition of elongation and termlination by the class II CCA-adding enzyme2009

    • 著者名/発表者名
      Toh Y, et al.
    • 雑誌名

      EMBO J 28

      ページ: 3353-3365

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure of a tRNA-dependent kinase essential for selenocysteine decoding.2009

    • 著者名/発表者名
      Y.Araiso, et al.
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 106

      ページ: 16215-16220

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Stnlctural basis of AdoMet-dependent aminocarboxypropyl transfer reaction catalyzed by tRNA-wybutosine synthesizing enzyme. TYW2.2009

    • 著者名/発表者名
      M.Umitsu, et al.
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 106

      ページ: 15616-15621

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural modelling of the complex of leucyl-tRNA synthetase and mis-aminoacylated tRNA(Leu).2009

    • 著者名/発表者名
      Y.Hagiwara, et al.
    • 雑誌名

      FEBS Lett. (in press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The structure of alanyl-tRNA synthetase with editing domain.2009

    • 著者名/発表者名
      M.Sokabe, et al.
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 106

      ページ: 11028-11033

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of the nucleophilic factors and the productive complex for the editing reaction by leucyl-tRNA synthetase.2009

    • 著者名/発表者名
      Hagiwara Y, et al.
    • 雑誌名

      FEBS Lett.. 583

      ページ: 1901-1908

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Conserved Cysteine Residues of GidA Are Essential for Biogenesis of 5-Carboxymethylaminomethyluridine at tRNA Anticodon2009

    • 著者名/発表者名
      T.Osawa, et al.
    • 雑誌名

      Structure. 17

      ページ: 713-724

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Atomic structure of a folate/FAD-dependent tRNA T54 methyltransferase2009

    • 著者名/発表者名
      H.Nishimasu, et al.
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.USA. 106

      ページ: 8180-8185

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural basis of tRNA modification with CO2 fixation and methylation by wybutosine synthesizing enzyme TYW42009

    • 著者名/発表者名
      Y.Suzuki, et al.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res. 37

      ページ: 2910-2925

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Pyrrolysyl-tRNA synthetase-tRNA(Pyl) structure reveals the molecular basis of orthogonality2009

    • 著者名/発表者名
      K.Nozawa, et al.
    • 雑誌名

      Nature 457

      ページ: 1163-1167

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural basis for translational fidelity ensured by tRNA lysidine synthetase2009

    • 著者名/発表者名
      K.Nakanishi, et al.
    • 雑誌名

      Nature 461

      ページ: 1144-1148

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Mechanism for the definition of elongation and termination by the class II CCA-adding enzyme2009

    • 著者名/発表者名
      Toh Y, et al.
    • 雑誌名

      EMBO J. 28

      ページ: 3353-3365

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Structure of a tRNA-dependent kinase essential for selenocysteine decoding2009

    • 著者名/発表者名
      Y.Araiso, et al.
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 106

      ページ: 16215-16220

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Structural basis of AdoMet-dependent aminocarboxypropyl transfer reaction catalyzed by tRNA-wybutosine synthesizing enzyme, TYW22009

    • 著者名/発表者名
      M.Umitsu, et al.
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 106

      ページ: 15616-15621

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Structural modelling of the complex of leucyl-tRNA synthetase and mis-aminoacylated tRNA(Leu)2009

    • 著者名/発表者名
      Y.Hagiwara, et al.
    • 雑誌名

      FEBS Lett. (in press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] The structure of alanyl-tRNA synthetase with editing domain2009

    • 著者名/発表者名
      M.Sokabe, et al.
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 106

      ページ: 11028-11033

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Identification of the nucleophilic factors and the productive complex for the editing reaction by leucyl-tRNA synthetase2009

    • 著者名/発表者名
      Hagiwara Y, et al.
    • 雑誌名

      FEBS Lett. 583

      ページ: 1901-1908

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Conserved Cysteine Residues of GidA Are Essential for Biogenesis of 5-Carboxymethylaminomethyluridine at tRNA Anticodon2009

    • 著者名/発表者名
      T.Osawa, et al
    • 雑誌名

      Structure. 17

      ページ: 713-724

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Atomic structure of a folate/FAD-dependent tRNA T54 methyltransferase2009

    • 著者名/発表者名
      H.Nishimasu, et al
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.USA. 106

      ページ: 8180-8185

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Structural basis of tRNA modification with CO2 fixation and methylation by wybutosine synthesizing enzyme TYW42009

    • 著者名/発表者名
      Y.Suzuki, et al
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res. 37

      ページ: 2910-2925

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Pyrrolysyl-tRNA synthetase-tRNA(Pyl)structure reveals the molecular basis of orthogonality2009

    • 著者名/発表者名
      K.Nozawa, et al
    • 雑誌名

      Nature 457

      ページ: 1163-1167

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Conformational transition of Sec machinery inferred from bacterial SecYE structures2008

    • 著者名/発表者名
      T.Tsukazaki, et al.
    • 雑誌名

      Nature 455

      ページ: 988-991

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular basis for maintenance of fidelity during the CCA-adding reaction by a CCA-adding enzyme2008

    • 著者名/発表者名
      Y.Toh, et al.
    • 雑誌名

      EMBO J. 27

      ページ: 1944-1952

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure, dynamics, and function of RNA modification enzymes2008

    • 著者名/発表者名
      R.Ishitani, et al.
    • 雑誌名

      Curr Opin Struct Biol. 18

      ページ: 330-339

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural insights into RNA-dependent eukaryal and archaeal selenocysteine formation2008

    • 著者名/発表者名
      Y.Araiso, et al.
    • 雑誌名

      Nucteic Acids Res. 36

      ページ: 1187-1199

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Conformational transition of Sec machinery inferred from bacterial SecYE structures2008

    • 著者名/発表者名
      T.Tsukazaki, et al
    • 雑誌名

      Nature 455

      ページ: 988-991

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Molecular basis for maintenance of fidelity during the CCA-adding reaction by a CCA-adding enzyme2008

    • 著者名/発表者名
      Y.Toh, et al
    • 雑誌名

      EMBO J. 27

      ページ: 1944-1952

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Structure, dynamics, and function of RNA modification enzymes2008

    • 著者名/発表者名
      R.Ishitani, et al
    • 雑誌名

      Curr Opin Struct Biol. 18

      ページ: 330-339

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Structural insights into RNA-dependent eukaryal and archaeal selenocysteine formation2008

    • 著者名/発表者名
      Y.Araiso, et al.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res. 36

      ページ: 1187-1199

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Anticodon Recognition and Discrimination by the alpha-Helix Cage Domain of Class I Lysyl-tRNA Synthetase2007

    • 著者名/発表者名
      J.D.Levengood, et al.
    • 雑誌名

      Biochemistry 46

      ページ: 11033-11038

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of the radical SAM enzyme catalyzing tricyclic modified base formation in tRNA2007

    • 著者名/発表者名
      Y.Suzuki, et al.
    • 雑誌名

      J.Mol.Biol. 372

      ページ: 1204-1214

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of the Sec4p・Sec2p complex in the nucleotide exchanging intermediate state2007

    • 著者名/発表者名
      Y. Sato, S. Fukai, R. Ishitani, O. Nureki
    • 雑誌名

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA 104

      ページ: 8305-8310

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of the MgtE Mg^<2+> transporter2007

    • 著者名/発表者名
      M. Hattori, Y. Tanaka, S. Fukai, R. Ishitani, O. Nureki
    • 雑誌名

      Nature 448

      ページ: 1072-1075

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of the radical SAM enzyme catalyzing tricyclic modified base formation in tRNA2007

    • 著者名/発表者名
      Y. Suzuki, A. Noma, T. Suzuki, M. Senda, T. Senda, R. Ishitani, O. Nureki
    • 雑誌名

      J. Mol. Biol. 372

      ページ: 1204-1214

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of leucyl/phenylalanyl-tRNA-protein transferase and its complex with aminoacyl-tRNA analog2006

    • 著者名/発表者名
      K.Suto, et al.
    • 雑誌名

      EMBO J. 13

      ページ: 5942-5950

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of the catalytic domain of pyrrolysyl-tRNA synthetase from the methanogenic archaeon Methanosarcina mazei.2006

    • 著者名/発表者名
      T.Yanagisawa, et al.
    • 雑誌名

      Acta. Crystallograph. Sect. F Struct. Biol. Cryst. Commun. 62

      ページ: 1031-1033

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Functional categorization of the conserved basic amino acid residues in TrmH [tRNA(Gml8) methyltansferase] enzymes2006

    • 著者名/発表者名
      K.Watanabe, et al.
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem. 281

      ページ: 34630-34639

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Complete crystallographic analysis of the dynamics of CCA-addition2006

    • 著者名/発表者名
      K.Tomita, et al.
    • 雑誌名

      Nature 443

      ページ: 956-960

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural basis of RNA-dependent recruitment of glutamine to the genetic code2006

    • 著者名/発表者名
      H.Oshikane, et al.
    • 雑誌名

      Science 312

      ページ: 1950-1954

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Snapshots of tRNA sulfuration via an adenylated intermediate2006

    • 著者名/発表者名
      T.Numata, et al.
    • 雑誌名

      Nature 442

      ページ: 419-424

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Purification, crystallization and preliminary X-ray difffaction of SecDF, a translocon-associated membrane protein, from Thermus thermophilus2006

    • 著者名/発表者名
      T.Tsukazaki, et al.
    • 雑誌名

      Acta Crystallographica F 62

      ページ: 376-380

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray analysis of tRNA thiolation enzyme MnmA from Escherichia coli complexed with tRNA^Glu2006

    • 著者名/発表者名
      T.Numata, et al.
    • 雑誌名

      Acta Crystallographica F 62

      ページ: 368-371

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural basis for RNA unwinding by the DEAD-box protein Drosophila Vasa2006

    • 著者名/発表者名
      T.Sengoku, et al.
    • 雑誌名

      Cell 125

      ページ: 287-300

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural basis for sulfur relay to RNA mediated by heterohexameric TusBCD complex2006

    • 著者名/発表者名
      T.Numata, et al.
    • 雑誌名

      Structure 14

      ページ: 357-366

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of the catalytic domain of pyrrolysyl-tRNA synthetase from the methanogenic archaeon Methanosarcina mazei2006

    • 著者名/発表者名
      T.Yanagisawa, et al.
    • 雑誌名

      Acta.Crystallograph.Sect.F Struct.Biol.Cryst.Commun. 62

      ページ: 1031-1033

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Functional categorization of the conserved basic amino acid residues in TrmH[tRNA(Gm18)methyltansferase]enzymes2006

    • 著者名/発表者名
      K.Watanabe, et al.
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem. 281

      ページ: 34630-34639

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Purification, crystallization and preliminary X-ray diffraction of SecDF, a translocon-associated membrane protein, from Thermus thermophilus2006

    • 著者名/発表者名
      T.Tsukazaki, et al.
    • 雑誌名

      Acta Crystallographica F 62

      ページ: 376-380

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray analysis of tRNA thiolation enzyme MnmA from Escherichia coli complexed with tRNA^<Glu>2006

    • 著者名/発表者名
      T.Numata, et al.
    • 雑誌名

      Acta Crystallographica F 62

      ページ: 368-371

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Structural basis for RNA unwinding by the DEAD-box protein Drosonhila Vasa2006

    • 著者名/発表者名
      T.Sengoku, et al.
    • 雑誌名

      Cell 125

      ページ: 287-300

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Structural basis for sulfur relay to RNA mediated by heterohexameric TusBCD complex2006

    • 著者名/発表者名
      T.Numata, S.Fukai, Y.Ikeuchi, T.Suzuki, O.Nureki
    • 雑誌名

      Structure 14,

      ページ: 357-366

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Structural basis for RNA unwinding by the DEAD-box protein Drosophila Vasa2006

    • 著者名/発表者名
      T.Sengoku, O.Nureki, A.Nakamura, S.Kobayashi, S.Yokoyama
    • 雑誌名

      Cell 125

      ページ: 287-300

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Snapshots of tRNA sulfuration via an adenylated intermediate2006

    • 著者名/発表者名
      T.Numata, Y.Ikeuchi, S.Fukai, T.Suzuki, O.Nureki
    • 雑誌名

      Nature 442

      ページ: 419-424

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Structural basis of RNA-dependent recruitment of glutamine to the genetic code2006

    • 著者名/発表者名
      (12名)D.Soll, O.Nureki
    • 雑誌名

      Science 312

      ページ: 1950-1954

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Complete crystallographic analysis of the dynamics of CCA-addition2006

    • 著者名/発表者名
      K.Tomita, R.Ishitani, S.Fukai, O.Nureki
    • 雑誌名

      Nature 443

      ページ: 956-960

    • NAID

      130006997728

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Crystal structure of leucyl/phenylalanyl-tRNA-protein transferase and its complex with aminoacyl-tRNA analog2006

    • 著者名/発表者名
      K.Suto, Y.Shimizu, K.Watanabe, T.Ueda, S.Fukai, O.Nureki, K.Tomita
    • 雑誌名

      EMBO J 13

      ページ: 5942-5950

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Structural basis for sulfur relay to RNA mediated by heterohexameric TusBCD complex2006

    • 著者名/発表者名
      T.Numata, S.Fukai, Y.Ikeuchi, T.Suzuki, O.Nureki
    • 雑誌名

      Structure 14

      ページ: 357-366

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Crystallization of leucyl-tRNA synthetase complexed with tRNALeu from the archaeon Pyrococcus horikoshii2005

    • 著者名/発表者名
      R.Fukunaga, et al.
    • 雑誌名

      Acta Crystallographica F 61

      ページ: 30-32

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural basis for anticodon recognition by methionyl-tRNA synthetase2005

    • 著者名/発表者名
      Y.Ogiso, et al.
    • 雑誌名

      Nature Struct.Mol.Biol. 12

      ページ: 931-932

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Recent progress of structural biology of tRNA processing and modification2005

    • 著者名/発表者名
      K.Nakanishi, O.Nureki
    • 雑誌名

      Mol. Cells 19

      ページ: 157-166

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural basis for lysidine formation by ATP pyrophosphatase accompanied with a lysine-specific loop and a tRNA-recognition domain2005

    • 著者名/発表者名
      K.Nakanishi, et al.
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA 21

      ページ: 7487-7492

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Roles of conserved amino acid sequence motifs in the SpoU (TmiH) RNA methyltransferase family2005

    • 著者名/発表者名
      K.Watanabe, et al.
    • 雑誌名

      J Biol Chem. 280

      ページ: 10368-10377

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural basis for anticodon recognition by methionyl-tRNA synthetase2005

    • 著者名/発表者名
      K.Nakanishi, et al.
    • 雑誌名

      Nature Struct.Mol.Biol. 12

      ページ: 931-932

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Recent progress of structural biology of tRNA processing and modification2005

    • 著者名/発表者名
      K.Nakanishi, O.Nureki
    • 雑誌名

      Mol.Cells 19

      ページ: 157-166

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要 2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Roles of conserved amino acid sequence motifs in the SpoU(TrmH)RNA methyltransferase family2005

    • 著者名/発表者名
      K.Watanabe, et al.
    • 雑誌名

      J Biol Chem. 280

      ページ: 10368-10377

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Roles of conserved amino acid sequence motifs in the SpoU (TrmH) RNA methyltransferase family2005

    • 著者名/発表者名
      K.Watanabe, O.Nureki, S.Fukai, R.Ishii, H.Okamoto, S.Yokoyama, Y.Endo, H.Hori
    • 雑誌名

      J Biol Chem 280

      ページ: 10368-10377

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Structural basis for lysidine formation by ATP pyrophosphatase accompanied with a lysine- specific loop and a tRNA-recognition domain2005

    • 著者名/発表者名
      K.Nakanishi, S.Fukai, Y.Ikeuchi, A.Soma, Y.Sekine, T.Suzuki, O.Nureki
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA 21

      ページ: 7487-7492

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Structural basis for anticodon recognition by methionyl-tRNA synthetase2005

    • 著者名/発表者名
      K.Nakanishi, Y.Ogiso, T.Nakama, S.Fukai, O.Nureki
    • 雑誌名

      Nat.Struct.Mol.Biol. 12

      ページ: 931-932

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Structural basis for RNA unwinding by the DEAD-box protein Drosophila Vasa

    • 著者名/発表者名
      T.Sengoku, O.Nureki, A.Nakamura, S.Kobayashi, S.Yokoyama
    • 雑誌名

      Cell (in press)

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [学会発表] Structural Biology of tRNA Maturation2008

    • 著者名/発表者名
      O.Nureki
    • 学会等名
      The Seventh R.O.C.-Japan Joint Seminar on Crystallography
    • 発表場所
      Tokyo, Japan
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Crystal structure of the MgtE Mg^2+ transporter2008

    • 著者名/発表者名
      O.Nureki
    • 学会等名
      Gordon Research Conference -Magnesium in Biochemical Processes & Medicine-
    • 発表場所
      Ventura, CA, USA
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Crystal structure of the MgtE Mg^<2+> transporter2008

    • 著者名/発表者名
      O.Nureki
    • 学会等名
      Gordon Research Conference-Magnesium in Biochemical Processes & Medicine-
    • 発表場所
      Ventura, CA, USA
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Structural insights into translational quality control2007

    • 著者名/発表者名
      O. Nureki
    • 学会等名
      American Society for Microbiology General 107th Meeting
    • 発表場所
      Toronto
    • 年月日
      2007-05-24
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Structural basis for highly specific chemical reaction in the genetic code translation2007

    • 著者名/発表者名
      O.Nureki
    • 学会等名
      A Three-day Symposium on Advamces in Structural Biology and Structure Prediction
    • 発表場所
      Hyderabad, India
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Structural basis for highly specific chemical reaction in the genetic code translation2007

    • 著者名/発表者名
      O.Nureki
    • 学会等名
      International Symposium on Chemical Biology
    • 発表場所
      Kolkata, India
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Structural Insights into Translational Quality Control2007

    • 著者名/発表者名
      O.Nureki
    • 学会等名
      American Society for Microbiology General 107^th Meeting
    • 発表場所
      Toronto, Canada
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] 鋳型に依存しないRNA重合反応の原子メカニズム2007

    • 著者名/発表者名
      冨田耕造、石谷隆一郎、深井周也、濡木理
    • 学会等名
      第9回RNAミーティング
    • 発表場所
      Nagoya, Japan
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Structural insights into the modification in the tRNA anticodon region2007

    • 著者名/発表者名
      T.Numata, K.Nakanishi, Y.Suzuki, A.Noma, Y.Ikeuchi, T.Suzuki, R.Ishitani, O.Nureki
    • 学会等名
      FEBS-CNRS Workshop
    • 発表場所
      Aussois, France
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Animated crystallography of genetic code translation2007

    • 著者名/発表者名
      O.Nureki
    • 学会等名
      1^st International Conference on ARS Network and Signaling
    • 発表場所
      Seoul, Korea
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Animated crystallography of genetic code translation2007

    • 著者名/発表者名
      K.Tomita, T.Numata, T.Suzuki, S.Fukai, R.Ishitani, O.Nureki
    • 学会等名
      5^th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
    • 発表場所
      Tokyo, Japan
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] 非翻訳RNAの化学修飾の構造基盤2007

    • 著者名/発表者名
      沼田倫征、中西孝太郎、鈴木陽子、野間あきこ、池内与志穂、鈴木勉、深井周也、石谷隆一郎、濡木理
    • 学会等名
      第45回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      Yokohama, Japan
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Structural basis for chemical modification of non-coding RNAs2007

    • 著者名/発表者名
      T.Numata, K.Nakanishi, Y.Suzuki, A.Noma, Y.Ikeuchi, T.Suzuki, S.Fukai, R.Ishitani, O.Nureki
    • 学会等名
      45th Annual Meeting of The Biophysical Society of Japan
    • 発表場所
      Yokohama
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Animated crystallography of genetic code translation2007

    • 著者名/発表者名
      K.Tomita, T.Numata, T.Suzuki, S.Fukai, R.Ishitani, O.Nureki
    • 学会等名
      5^<th> International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
    • 発表場所
      Tokyo
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Animated crystallography of genetic code translation2007

    • 著者名/発表者名
      O.Nureki
    • 学会等名
      1^<st> International Conference on ARS Network and Signaling
    • 発表場所
      Seoul, Korea
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Complete crystallographic analysis of the dynamics of CCA-addition2007

    • 著者名/発表者名
      K.Tomita, R.Ishitani, S.Fukai, O.Nureki
    • 学会等名
      RNA2007
    • 発表場所
      Nagoya, Japan
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Structural Insights into Translational Quality Control2007

    • 著者名/発表者名
      O.Nureki
    • 学会等名
      American Society for Microbiology General 107^<th> Meeting
    • 発表場所
      Toronto, Canada
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Deep knot folding of methyltransferase structures2006

    • 著者名/発表者名
      O.Nureki
    • 学会等名
      FASEB Summer Research Conferences : Biological Methylation
    • 発表場所
      Vermont, USA
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Structural Basis of RNA-Dependent Recruitment of Amino Acid to the Genetic Code2006

    • 著者名/発表者名
      O.Nureki(also Co-organizer, Chair)
    • 学会等名
      International Conference on Aminoacyl-tRNA Synthetases : From the Genetic Code to Human Diseases & Medicine
    • 発表場所
      San Diego, USA
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [図書] RNAに依存した遺伝コード形成のメカニズム2007

    • 著者名/発表者名
      濡木理
    • 総ページ数
      12
    • 出版者
      蛋白質核酸酵素
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [図書] RNA修飾マシーナリーの時間分解能での反応機構2006

    • 著者名/発表者名
      濡木 理
    • 出版者
      蛋白質核酸酵素
    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [図書] 細胞の生と死を統括するアミノアシルtRNA合成酵素複合体2005

    • 著者名/発表者名
      濡木 理
    • 総ページ数
      6
    • 出版者
      共立出版
    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [備考] 「研究成果報告書概要(和文)」より

    • URL

      http://www.nurekilab.net/index.php/ja?Research%2FncRNA

    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要

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公開日: 2005-04-01   更新日: 2016-04-21  

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