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藍色細菌の概日振動システムにおける遺伝的ロバストネスの評価

研究課題

研究課題/領域番号 17370088
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 進化生物学
研究機関名古屋大学

研究代表者

小山 時隆  名古屋大学, 大学院・理学研究科, 助教 (30324396)

研究分担者 近藤 孝男  名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (10124223)
研究期間 (年度) 2005 – 2007
研究課題ステータス 完了 (2007年度)
配分額 *注記
14,210千円 (直接経費: 13,400千円、間接経費: 810千円)
2007年度: 3,510千円 (直接経費: 2,700千円、間接経費: 810千円)
2006年度: 3,400千円 (直接経費: 3,400千円)
2005年度: 7,300千円 (直接経費: 7,300千円)
キーワード概日時計 / シアノバクテリア / 遺伝的ロバストネス / 進化 / 突然変異 / サプレッサー
研究概要

藍色細菌の概日時計遺伝子kaiA, kaiB, kaiC遺伝子座での遺伝的ロバストネスを検証するため、ランダムな点突然変異体の表現型解析とデータの統合的解析を行った。300余りの1アミノ酸置換を持つ突然変異体を作成し、それらの生物発光概日リズムを測定・周期表現型解析を行った。kaiA, kaiB, kaiC遺伝子内の変異の影響を比較すると、kaiA内の変異は他の2遺伝子と比較して、周期への影響が非常に少ないことが明らかになり、3つの必須遺伝子で遺伝的ロバストネスに大きな違いが生じていることを示した。また、kaiB, KaiC内の9割以上の変異は正常範囲の周期を逸脱させることを明らかにし、周期長に関する限り、両者の遺伝的ロバストネスがこれまで解析されている他の遺伝子・システムに比べて、著しく低いことを示した。
また、細胞内における概日時計システムのロバスト性を生みだす分子機構として、時計タンパク質間の相互作用による同期現象を明らかにするとともに、細胞内での時計遺伝子とそのタンパク質産物間のフィードバック制御様式を明らかにした。さらに、周期については、KaiCのもつATP分解活性そのものが、振動数(周期の逆数)と比例関係にあることをしめし、ロバスト性は時計タンパク質内の性質に大きく依存していることを示した。これらの成果は、遺伝的ロバストネスという概念的な尺度をタンパク質相互作用等の実体を有する尺度へ変換できることを実証し、時計遺伝子突然変異のシステム安定性に対する評価を細胞時計と試験管内時計の両面から多角的に評価できる可能性を示唆している。

報告書

(4件)
  • 2007 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2006 実績報告書
  • 2005 実績報告書
  • 研究成果

    (38件)

すべて 2008 2007 2006 2005

すべて 雑誌論文 (25件) (うち査読あり 9件) 学会発表 (12件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Regulation of circadian clock gene expression by phosphorylation states of KaiC in cyanobacteria2008

    • 著者名/発表者名
      Murayama Y, Oyama T, Kondo T
    • 雑誌名

      J Bacteriol 190

      ページ: 1691-1698

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Regulation of circadian clock gene expression by phosphorylation states of KaiC in cyanobacteria2008

    • 著者名/発表者名
      Murayama, Y, Oyama, T, Kondo, T
    • 雑誌名

      J Bacteriol 190

      ページ: 1691-1698

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] The cyanobacterial circadian clock (in Japanese)2008

    • 著者名/発表者名
      Oyama, T
    • 雑誌名

      Ishida N ed. "Kitinto Wakaru Tokei Idenshi" Sanso-Ken Books

      ページ: 223-250

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Regulation of circadian clock gene expression by phosphorylation states of KaiC in cyanobacteria2008

    • 著者名/発表者名
      Murayama Y, Oyama T, *Kondo T
    • 雑誌名

      J Bacteriol 190

      ページ: 1691-1698

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Autonomous synchronization of the circadian KaiC phosphorylation rhythm2007

    • 著者名/発表者名
      Ito H, Kageyama H, Mutsuda M, Nakajima M, *Oyama T, *Kondo T(*共同責任著者)
    • 雑誌名

      Nat Struct Mol Biol 14

      ページ: 1084-1088

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書 2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] ATPase activity of KaiC determines the basic timing for circadian clock of cyanobacteria2007

    • 著者名/発表者名
      Terauchi K, Kitayama K, Nishiwaki T, Miwa K, Murayama Y, Oyama T, Kondo T
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci U S A. 104

      ページ: 16377-16381

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] labA: a novel gene required for negative feedback regulation of the cyanobacterial circadian clock protein KaiC2007

    • 著者名/発表者名
      Taniguchi Y, Katayama K, Ito R, Takai N, Kondo T, Oyama T
    • 雑誌名

      Genes & Development 21

      ページ: 60-70

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 光合成生物の概日時計の分子進化2007

    • 著者名/発表者名
      小山時隆
    • 雑誌名

      植物細胞工学シリーズ、植物の進化 細胞工学別冊、植物細胞工学(秀潤社) 23

      ページ: 174-182

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要 2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Autonomous synchronization of the circadian KaiC phosphorylation rhythm2007

    • 著者名/発表者名
      Ito, H, Kageyama, H, Mutsuda, M, Nakajima, M, *Oyama, T, *Kondo, T(* co-corresponding authors)
    • 雑誌名

      Nat Struct Mol Biol 14

      ページ: 1084-1088

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] ATPase activity of KaiC determines the basic timing for circadian clock of cyanobacteria2007

    • 著者名/発表者名
      Terauchi, K, Kitayama, K, Nishiwaki, T, Miwa, K, Murayama, Y, Kondo, T
    • 雑誌名

      Proc Nati Aced Sci USA 104

      ページ: 16377-16381

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] labA : a novel gene required for negative feedback regulation of the cyanobacterial circadian clock protein KaiC2007

    • 著者名/発表者名
      Taniguchi, Y, Katayama, K, Ito, R, Takai, N, *Kondo, T, *Dyarno, T, (* co-corresponding authors)
    • 雑誌名

      Genes & Development 21

      ページ: 60-70

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Molecular evolution of circadian clocks in photosynthetic organisms (in Japanese)2007

    • 著者名/発表者名
      Oyama, T
    • 雑誌名

      Shokubutsu-Saibo-Kogaku 23 "Evolution of Plants" Shujyun-sha

      ページ: 174-182

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] ATPase activity of KaiC determines the basic timing for circadian clock of cyanobacteria2007

    • 著者名/発表者名
      Terauchi K, Kitayama K, Nishiwaki T, Miwa K, Murayama Y, Oyama T, *Kondo T
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci U S A. 104

      ページ: 16377-16388

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] labA : a novel gene required for negative feedback regulation of the cyanobacterial circadian clock protein KaiC2007

    • 著者名/発表者名
      Taniguchi Y, Katayama K, Ito R, Takai N, Kondo T, Oyama T
    • 雑誌名

      Genes & Development 21

      ページ: 60-70

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] A KaiC-associating SasA-RpaA two-component regulatory system as a major circadian timing mediator in cyanobacteria2006

    • 著者名/発表者名
      Takai N, Nakajima M, Oyama T, Kito R, Sugita C, Sugita M, Kondo T, Iwasaki H
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci U S A. 103

      ページ: 12109-12114

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要 2006 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Cyanobacterial circadian pacemaker: Kai protein complex dynamics in the KaiC phosphorylation cycle in vitro2006

    • 著者名/発表者名
      Kageyama H, Nishiwaki T, Nakajima M, Iwasaki H, Oyama T, Kondo T'
    • 雑誌名

      Molecular Cell 23

      ページ: 161-171

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Cyanobacterial circadian pacemaker : Kai protein complex dynamics in the KaiC phosphorylation cycle in vitro2006

    • 著者名/発表者名
      Kageyama, H, Nishiwaki, T, Nakajima, M, Iwasaki, H, Kondo, T
    • 雑誌名

      Mal Cell 23

      ページ: 161-171

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] A KaiC-associating SasA-RpaA two-component regulatory system as a major circadian timing mediator in cyanobacteria2006

    • 著者名/発表者名
      Takai, N, Nakajima, M, Kito, R, Sugita, C, Sugita, M, Kondo, T, Iwasaki, H
    • 雑誌名

      Proc Natl Aced Sci USA 103

      ページ: 12109-12114

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Cyanobacterial circadian pacemaker : Kai protein complex dynamics in the KaiC phosphorylation cycle in vitro2006

    • 著者名/発表者名
      Kageyama H, Nishiwaki T, Nakajima M, Iwasaki H, Oyama T, Kondo T
    • 雑誌名

      Molecular Cell 23

      ページ: 161-171

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Reconstitution of circadian oscillation of cyanobacterial KaiC phosphorylation in vitro.2005

    • 著者名/発表者名
      Nakajima M, Imai K, Ito H, Nishiwaki T, Murayama Y, Iwasaki H, Oyama T, Kondo T
    • 雑誌名

      Science 21

      ページ: 414-415

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] ルシフェラーゼ2005

    • 著者名/発表者名
      小山時隆、近藤孝男
    • 雑誌名

      モデル植物の実験プロトコール 植物細胞工学シリーズ 21

      ページ: 172-175

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Reconstitution of circadian oscillation of cyanobacterial Kale phosphorylation in vitro2005

    • 著者名/発表者名
      Nakajima, M, Imai, K, Ito, H, Nishiwaki, T, Murayama, Y, Iwasaki, H, Ovamn, T, Kondo, T
    • 雑誌名

      Science 308

      ページ: 414-415

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Luciferases2005

    • 著者名/発表者名
      Oyama, T, Kondo, T
    • 雑誌名

      Shokubutsu-Saibo-Kogaku 21 "Protocols for model plants" Shujun-sha

      ページ: 172-175

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Reconstitution of circadian oscillation of cyanobacterial KaiC phosphorylation in vitro.2005

    • 著者名/発表者名
      Nakajima M, Imai K, Ito H, Nishiwaki T, Murayama Y, Iwasaki H, Oyama T, Kondo T
    • 雑誌名

      Science 308

      ページ: 414-415

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] ルシフェラーゼ2005

    • 著者名/発表者名
      小山時隆, 近藤孝男
    • 雑誌名

      モデル植物の実験プロトコール 植物細胞工学シリーズ 21

      ページ: 172-175

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [学会発表] Evaluation for genetic robustness in the machinery of period determination of the cyanobacterial circadian clock2007

    • 著者名/発表者名
      Nishioka, Y, Kondo, T, Oyama, T
    • 学会等名
      13th Annual meeting of the Japanese Society for Chronobiology
    • 発表場所
      Tokyo
    • 年月日
      2007-12-01
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] シアノバクテリア時計タンパク質の突然変異に対する周期安定性の評価2007

    • 著者名/発表者名
      西岡有希乃、近藤孝男、小山時隆
    • 学会等名
      日本時間生物学会年会 第14回
    • 発表場所
      東京 京王プラザ
    • 年月日
      2007-11-07
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Evaluation for genetic robustness in the machinery of period determination of the cyanobacterial circadian clock2007

    • 著者名/発表者名
      Nishioka, Y, Kondo, T, Oyama, T
    • 学会等名
      14th Annual meeting of the Japanese Society for Chronobiology
    • 発表場所
      Tokyo
    • 年月日
      2007-11-07
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] シアノバクテリアの時計を見る、知る、作る2007

    • 著者名/発表者名
      小山時隆
    • 学会等名
      ファイトテクノロジー研究会研究交流会 第19回
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2007-10-20
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] シアノバクテリアの概日時計周期決定機構の遺伝的安定性の評価2007

    • 著者名/発表者名
      小山時隆、西岡有希乃、近藤孝男
    • 学会等名
      日本進化学会年会 第9回
    • 発表場所
      京都 京都大学
    • 年月日
      2007-09-01
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Evaluation for genetic robustness in the machinery of period determination of the cyanobacterial circadian clock2007

    • 著者名/発表者名
      Oyama, T, Nishioka, Y, Kondo, T
    • 学会等名
      9th Annual meeting of the of Evolutionary Studies
    • 発表場所
      Japan, Kyoto
    • 年月日
      2007-09-01
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] The cyanobacterial circadian clockwork made of three Kai proteins2007

    • 著者名/発表者名
      小山時隆
    • 学会等名
      Joint Annual Meeting of the Society for Mathematical Biology and The Japanese Society for Mathematical Biology
    • 発表場所
      San Jose, USA
    • 年月日
      2007-08-03
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] The cyanobacterial circadian clockwork made of three Kai proteins2007

    • 著者名/発表者名
      Oyama, T
    • 学会等名
      Joint Meeting of the Society for Mathematical Biology and The Japanese Society for Mathematical Biology
    • 発表場所
      San Jose, USA
    • 年月日
      2007-08-03
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] The resilience of the cyanobacterial circadian clock embeded in the Kai-protein oscillatory system in vitro2007

    • 著者名/発表者名
      小山時隆、伊藤浩史、影山伯春、陸田径典、近藤孝男
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor 72nd Symposium: Clocks & Rhythms
    • 発表場所
      Cold Spring Harbor, USA
    • 年月日
      2007-06-01
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] The resilience of the cyanobacterial circadian clock embedded in the Kai-protein oscillatory system in vivo2007

    • 著者名/発表者名
      Oyama, T, Ito, H, Kageyama, H, Mutsuda, M, Kondo, T
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor 72nd Symposium ; Clocks and Rhythms
    • 発表場所
      Cold Spring Harbor USA
    • 年月日
      2007-06-01
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] The cyanobacterial circadian clockwork made of three Kai proteins2007

    • 著者名/発表者名
      小山時隆
    • 学会等名
      Joint Annual Meetings of The Society for Mathematical Biology and The Japanese Society for Mathematical Biology
    • 発表場所
      San Jose, CA, USA
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] シアノバクテリアの概日時計周期決定機構の遺伝的安定性の評価2006

    • 著者名/発表者名
      小山時隆、西岡有希乃、近藤孝男
    • 学会等名
      日本時間生物学会年会 第13回
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2006-12-01
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [図書] 産総研ブックスシアノバクテリアの概日時計『きちんとわかる時計遺伝子』内第10章2008

    • 著者名/発表者名
      小山時隆
    • 総ページ数
      28
    • 出版者
      白日社
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書 2007 研究成果報告書概要

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公開日: 2005-04-01   更新日: 2016-04-21  

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