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ダイコン連鎖地図の作成と根部形質のQTL解析

研究課題

研究課題/領域番号 17380006
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 育種学
研究機関京都府立大学

研究代表者

平井 正志  京都府立大学, 農学研究科, 教授 (50343405)

研究分担者 久保 中央  京都府立大学, 農学研究科, 助教授 (60347440)
藤村 達人  筑波大学, 生命環境科学研究科, 教授 (70292513)
太田 賢  筑波大学, 生命環境科学研究科, 講師 (00361311)
津呂 正人  名城大学, 農学部, 講師 (40410774)
研究期間 (年度) 2005 – 2007
研究課題ステータス 完了 (2007年度)
配分額 *注記
17,080千円 (直接経費: 15,700千円、間接経費: 1,380千円)
2007年度: 5,980千円 (直接経費: 4,600千円、間接経費: 1,380千円)
2006年度: 4,600千円 (直接経費: 4,600千円)
2005年度: 6,500千円 (直接経費: 6,500千円)
キーワード根こぶ病 / 開花 / 春化処理 / QTL解析 / 根の肥大 / 着色 / 連鎖地図 / ダイコン / 系統関係 / 野生集団 / 根こぶ病抵抗性 / QTL / 抽台 / マイクロサテライト / 根部形質 / 形態形成
研究概要

ダイコンの開花についてサヤダイコンx春福のF2集団を用いて遺伝解析を行った。低温による開花は1遺伝子座によって支配され、低温を必要としない開花が優性であると推定された。バルク法によりこの開花制御遺伝子座(Frs)周辺の連鎖地図を作成した、その結果、開花制御遺伝子座はOPR19SとOPE06-2間にあると推定された。このゲノム領域はシロイヌナズナの第1染色体下腕との相同性が高く、開花遺伝子座FTの位置に近かった。しかし、上記2マーカー間にFTは座乗せず、FT以外の遺伝子座の関与も考えられた。ダイコンの根こぶ病抵抗性遺伝子座を解析した。抵抗性は1遺伝子座もしくは密接に連鎖する複数の遺伝子座によって支配されると推定された。また聖護院ダイコンの起源についてSSRマーカーを用いて調べた。聖護院ダイコンは遺伝的多様性が他の品種より低く、少数の個体から選抜されたと推定された。(平井のグループ)
ダイコンの根の肥大について聖護院ダイコンx万葉(台湾の品種)のF2集団を用いてQTL解析を行った。根の横方向への肥大には6遺伝子座が関与しており、そのうち5座が大きな影響を示した。(藤村のグループ)
ダイコンの根の肥大および着色について研究し、それぞれQTL解析を行い。作用遺伝子座を推定した。アントシアニン着色では作用の大きな遺伝子座が見いだされた。(津呂のグループ)

報告書

(4件)
  • 2007 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2006 実績報告書
  • 2005 実績報告書
  • 研究成果

    (23件)

すべて 2008 2007 2006

すべて 雑誌論文 (16件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (5件) 図書 (2件)

  • [雑誌論文] Mapping of QTLs controlling root shape and red pigmentation in radish, Raphanus sativus L.2008

    • 著者名/発表者名
      Masato Tsuro
    • 雑誌名

      Breeding Science 58

      ページ: 55-61

    • NAID

      110006632573

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書 2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genetic diversity of radish(Raphanus sativus)germplasms and relation-ships among worldwide accessions analyzed with AFLP markers2008

    • 著者名/発表者名
      Ning Wang
    • 雑誌名

      Breeding Science 58

      ページ: 107-112

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mapping of QTLs controlling root shape and red pigmentation in radish, Raphanus sativus L.2008

    • 著者名/発表者名
      Tsuro, M., Suwabe, K., Kubo, N., Matsumoto, S., Hirai, M.
    • 雑誌名

      Breed.Sci. 58

      ページ: 55-61

    • NAID

      110006632573

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Genetic Diversity of Radish(Raphanus sativus)Germplasms and Relationships Among Worldwide Accessions Analyzed with AFLP Markers2008

    • 著者名/発表者名
      Wang N., N.Kitamoto, R.Ohsawa, T.Fujimura
    • 雑誌名

      Breed.Sci. 58

      ページ: 107-112

    • NAID

      110006781635

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Genetic diversity of Shogoin and other radish cultivars in Japan2008

    • 著者名/発表者名
      Hirai, M., N.Matsumoto, M.Tsuro, N.Kubo
    • 雑誌名

      Breed.Sci. (Submitted)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Mapping of a locus regulating flowering time in Raphanus sativus2008

    • 著者名/発表者名
      Tanigaki, et al.
    • 雑誌名

      Breeding Research 10(suppl 1)

      ページ: 120-120

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Identification and characterization of microsatellite markers derived from expressed sequence tags(ESTs)of radish(Raphanus sativus L.)2007

    • 著者名/発表者名
      Wang, N., J.Hu, R.Osawa, M.Ohta, T.Fujimura
    • 雑誌名

      Mol.Ecol.Notes 7

      ページ: 503-506

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Brassica rapa2007

    • 著者名/発表者名
      Hirai, M., S.Matsumoto
    • 雑誌名

      Genome mapping and molecular breeding in plants(Springer Verlag) Vol.5

      ページ: 129-134

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Genetic diversity of Shogoin radish and other radish cultivars in Japan2007

    • 著者名/発表者名
      Hirai, et al.
    • 雑誌名

      Breeding Research 9(suppl 2)

      ページ: 244-244

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] QTL analysis for root plumpness in cultivated radish(Raphanus sativus)2007

    • 著者名/発表者名
      Wang, et al.
    • 雑誌名

      Breeding Research 9(suppl 2)

      ページ: 194-194

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Genetic analysis of clubroot resistance in Brasscia rapa2006

    • 著者名/発表者名
      Hirai, M.
    • 雑誌名

      Breed.Sci. 56

      ページ: 223-229

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Phylogenic study of radish(Raphanus sativus)world wide germplasms with AFLP marker2006

    • 著者名/発表者名
      Wang, et al.
    • 雑誌名

      Breeding Research 8(suppl.2)

      ページ: 247-247

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] QTL analysis of clubroot resistance in radish(Raphanus sativus L.)2006

    • 著者名/発表者名
      Kamei, et al.
    • 雑誌名

      Breeding Research 9(suppl 2)

      ページ: 83-83

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Sequence and expression analysis of FLC homologues in Brassica oleraces2006

    • 著者名/発表者名
      Togashi, et al.
    • 雑誌名

      Breeding Research 8(suppl.1)

      ページ: 140-140

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] QTL analysis of hypertrophying and coloring traits of root in radish, Raphanus sativus L.2006

    • 著者名/発表者名
      Tsuro, et al.
    • 雑誌名

      Breeding Research 8(suppl.1)

      ページ: 145-145

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Genetic analysis of clubroot resistance in Brassica crops.2006

    • 著者名/発表者名
      M.Hirai
    • 雑誌名

      Breeding Science 56

      ページ: 223-229

    • NAID

      110004789101

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [学会発表] ダイコンにおける低温要求性開花制御遺伝子座のマッピング2008

    • 著者名/発表者名
      谷垣晴美
    • 学会等名
      日本育種学会 第113回講演会
    • 発表場所
      川崎市 明治大学
    • 年月日
      2008-03-30
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書 2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] 聖護院ダイコンおよびその他のダイコン品種の遺伝的多様性2007

    • 著者名/発表者名
      平井正志
    • 学会等名
      日本育種学会 第112回講演会
    • 発表場所
      鶴岡市 山形大学
    • 年月日
      2007-09-22
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書 2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] 栽培ダイコンにおける根の肥大性に関するQTL解析2007

    • 著者名/発表者名
      王寧
    • 学会等名
      日本育種学会 第112回講演会
    • 発表場所
      鶴岡市 山形大学
    • 年月日
      2007-09-22
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書 2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Brassica rapa L.(ハクサイ)における根こぶ病抵抗性遺伝子(Crr3)のマップベースクローニング2007

    • 著者名/発表者名
      伊吹隆
    • 学会等名
      日本育種学会 第112回講演会
    • 発表場所
      鶴岡市 山形大学
    • 年月日
      2007-09-22
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書 2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] QTL analysis for clubroot resistance in radish(Raphanus sativus)2006

    • 著者名/発表者名
      Kamei, A., Tsuro, M., Kubo, N., Hirai, M.
    • 学会等名
      15th Crucifer Genetics Workshop : Brassica 2006
    • 発表場所
      Wageningen, The Netherlands
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [図書] Brassica rapa(in Genome mapping and molecular breeding in plants. Vol.5.pp.129-134.2007

    • 著者名/発表者名
      Masashi Hirai
    • 総ページ数
      6
    • 出版者
      Springer Verlag
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [図書] Brassica rapa(in Genome mapping and molecular breeding in plants. Vol. 5. pp. 129-134.2007

    • 著者名/発表者名
      Masashi Hirai
    • 総ページ数
      6
    • 出版者
      Springer Verlag
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書

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公開日: 2005-04-01   更新日: 2016-04-21  

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