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ゲノム情報に基づいた線虫病害診断技術の開発

研究課題

研究課題/領域番号 17380048
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 植物栄養学・土壌学
研究機関東京農工大学

研究代表者

豊田 剛己  東京農工大学, 大学院・共生科学技術研究院, 准教授 (30262893)

研究期間 (年度) 2005 – 2007
研究課題ステータス 完了 (2007年度)
配分額 *注記
14,130千円 (直接経費: 13,200千円、間接経費: 930千円)
2007年度: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2006年度: 3,500千円 (直接経費: 3,500千円)
2005年度: 6,600千円 (直接経費: 6,600千円)
キーワードPratylenchus penetrans / Meloidogyne incognita / Globodera rostochiensis / Heterodera glycines / denaturing gradient gel electrophoresis / Baermann / soil compaction / nematode diagnosis / キタネグサレセンチュウ / 自活性線虫 / PCR-DGGE / リアルタイムPCR / 定量PCR / 群集構造 / 微生物 / ダイコン
研究概要

本プロジェクトでは、我が国における重要植物寄生性線虫であるキタネグサレセンチュウ、サツマイモネコブセンチュウ、ジャガイモシストセンチュウ、ダイズシストセンチュウに対するリアルタイムPCR用プライマーを設計した。またこれらの線虫数を、ベルマン法を介さずに土壌から直接検出できる新規な手法である締固め法を用いて定量できることを明らかにした。これにより、従来3日間以上を要した虫の定量が、半日で可能となった。また、線虫群集構造を評価するための手法として、PCR-DGGE法の開発を行った。ベルマン法と二層遠心浮遊法では抽出される線虫群集構造が異なることを明らかにし、両手法を紐み合わせることで、土壌中の線虫をより網羅的に評価できることがわかった。ダイコン栽培圃場を対象とした4年間の研究により、作付け時のキタネグサレセンチュウ密度が土壌20g当たり2.5頭以下の場合、収穫時のダイコンに全く線虫被害がみられないこと、3.4〜12頭の範囲内ではキタネグサレセンチュウの密度からは線虫被害を予測できないが、PCR-DGGE法により線虫群集を評価することで、被害大と被害小の土壌を区別できることを明らかにした。一方、キタネグサレセンチュウ密度が30頭/20g以上の圃場では、被害が甚大であることがわかった。また、線虫によるダイコンの被害を予測する際には、表層土壌だけでなく、主根が伸びる範囲であるO-60cmまで採取して、キタネグサレセンチュウ密度を推定する必要があることを明らかにできた。そのほか、ジャガイモ、エダマメ、サツマイモ栽培圃場の線虫診断を行った。

報告書

(4件)
  • 2007 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2006 実績報告書
  • 2005 実績報告書
  • 研究成果

    (34件)

すべて 2009 2008 2007 2006 2005

すべて 雑誌論文 (12件) (うち査読あり 8件) 学会発表 (15件) 図書 (2件) 産業財産権 (5件)

  • [雑誌論文] Development of a real-time PCR method for the potato cyst nema tode Globodera rostochiensis and the root-knot nematode Meloidog yne incognita2008

    • 著者名/発表者名
      Toyota, K., Shirakashi, T., Sato, E., Wada, S., Min, Y. Y.
    • 雑誌名

      Soil Science and Plant Nutrition 54(1)

      ページ: 72-76

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] リアルタイムPCRを用いた植物寄生性線虫定量法の確立2008

    • 著者名/発表者名
      豊田剛己, 佐藤恵利華, 後藤圭太, 白樫知明
    • 雑誌名

      植物防疫 62(11)

      ページ: 571-576

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Development of a real-time PCR method for the potato cyst nematode Globodera rostochiensis and the root-knot nematodeMeloidogyne incognita2008

    • 著者名/発表者名
      Toyota, K, Shirakashi, T., Sato, E., Wada, S., Min, Y. Y.
    • 雑誌名

      Soil Science and Plant Nutrition 54(1)

      ページ: 72-76

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Development of a real-time PCR method for the potato cyst nematode Globodera rostochiensis and the root-knot nematode Meloidogyne incognita2008

    • 著者名/発表者名
      Toyota, K., Shirakashi, T., Sato, E., Wada, S., Min, Y. Y.
    • 雑誌名

      Soil Science and Plant Nutrition 54(1)

      ページ: 72-76

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] リアルタイムPCRを用いた植物寄生性線虫定量法の確立2008

    • 著者名/発表者名
      豊田剛己・佐藤恵利華・後藤圭太・白樫知明
    • 雑誌名

      植物防疫 62(11)

      ページ: 571-576

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Suppressive effect of anaerobically digested slurry on the root lesi on nematode Pratylenchus penetrans and its potential mechanisms2007

    • 著者名/発表者名
      Min, Y. Y., Sato, E., Shirakashi, T., Wada, S., Toyota, K., Watanabe, A.
    • 雑誌名

      Japanese Journal of Nematology 37(2)

      ページ: 93-100

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書 2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Detection of the root-lesion nematode, Pratylenchus penetrans, from a nematode community using real-time PCR2007

    • 著者名/発表者名
      Sato, E., Min, Y. Y., Shirakas hi, T., Wada, S., Toyota, K.
    • 雑誌名

      Japanese Journal of Nematology 37(2)

      ページ: 87-92

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Suppressive effect of anaerobioally digested slurry on the root lesion nematode Pratylenchus penetrans and its potential mechanisms2007

    • 著者名/発表者名
      Min, Y. Y, Sato, E., Shirakashi, T., Wada, S., Toyota, K., Watanabe, A.
    • 雑誌名

      Japanese Journal of Nematology 37(2)

      ページ: 93-100

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Detection of the root-lesion nematode, Pratylenchus penetrans, from a nematode community using real-time PCR2007

    • 著者名/発表者名
      Sato, E., Min, Y. Y, Shirakashi, T., Wada, S., Toyota, K.
    • 雑誌名

      Japanese Journal of Nematology 37(2)

      ページ: 87-92

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Detection of the root-lesion nematode, Pratylenchus penetrans, from a nematode community using real-time PCR2007

    • 著者名/発表者名
      Sato, E., Min, Y. Y., Shirakashi, T., Wada, S., Toyota, K.
    • 雑誌名

      Japanese Journal of Nematology 37(2)

      ページ: 87-92

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] PCR-DGGE法を用いた土壌線虫群集構造解析法の開発2006

    • 著者名/発表者名
      佐藤恵利華, 豊田剛己
    • 雑誌名

      日本土壌肥料学雑誌 77(2)

      ページ: 157-163

    • NAID

      110006280029

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要 2006 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] PCR-DGGE法を用いた土壌線虫群集構造解析法の開発2006

    • 著者名/発表者名
      佐藤恵利華, 豊田剛己
    • 雑誌名

      日本土壌肥料学雑誌

    • NAID

      110006280029

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [学会発表] 土壌締固めとリアルタイムPCRを介した新規のダイスシストセンチュウ検出法の開発2008

    • 著者名/発表者名
      後藤圭太, 佐藤恵利華, 豊田剛己
    • 学会等名
      日本線虫学会
    • 発表場所
      つくば研究交流センター
    • 年月日
      2008-09-18
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] 土壌締固めとリアルタイムPCRを介した新規のダイズシストセンチュウ検出法の開発2008

    • 著者名/発表者名
      後藤圭太・佐藤恵利華・豊田剛己
    • 学会等名
      日本線虫学会
    • 発表場所
      つくば研究交流センター
    • 年月日
      2008-09-18
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 畑地生態系の生物性評価法の開発に向けた試み-線虫群集と線虫害2008

    • 著者名/発表者名
      佐藤恵利華, 豊田剛己
    • 学会等名
      日本土壌肥料学会シンポジウム
    • 発表場所
      名古屋市立大学
    • 年月日
      2008-09-11
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] 畑地生態系の生物性評価法の開発に向けた試み-線虫群集と線虫害-2008

    • 著者名/発表者名
      佐藤恵利華・豊田剛己
    • 学会等名
      日本土壌肥料学会シンポジウム
    • 発表場所
      名古屋市立大学
    • 年月日
      2008-09-11
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Quantitative detection of the major plant-parasitic nematodes in Japan using real-time PCR2008

    • 著者名/発表者名
      Toyota, K., Sato E., Shirakashi T., Min Y. Y.
    • 学会等名
      5^<th> International Congress of Nematology
    • 発表場所
      Brisbane
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書 2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Potential nematicidal effect of anaerobically fermentation residues (biogas and bioethanol) on Pratylenchus penetrans2008

    • 著者名/発表者名
      Yu Yu Min., Erika Sato, Koki Toyota, Satoko Wada
    • 学会等名
      5^<th> International Congress of Nematology
    • 発表場所
      Brisbane
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書 2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Possible mechanisms decreasing. the damage on radish by the root-lesi on nematode in a soil amended with okara and coffee compost2008

    • 著者名/発表者名
      Erika Sato, Yu Yu Min, Koki Toyota, Hajime Takeda, Ichi Okumura
    • 学会等名
      5^<th> International Congress of Nematology
    • 発表場所
      Brisbane
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Potential nematicidal effect of anaerobically fermentation residues (biogas and bioethanol) on Pratylenchus penetrans2008

    • 著者名/発表者名
      Yu Yu Min., Erika Sato, Koki Toyota, Satoko Wada
    • 学会等名
      5th International Congress of Nematology
    • 発表場所
      Brisbane (poster)
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Possible mechanisms decreasing the damage on radish by the root-lesion nematode in a soil amended with okara and coffee compost2008

    • 著者名/発表者名
      Erika Sato, Yu Yu Min, Koki Toyota, Hajime Takeda, Ichi Okumura
    • 学会等名
      5th International Congress of Nematology
    • 発表場所
      Brisbane (poster)
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Quantitative detection of the major plant-parasitic nematodes in Japan using real-time PCR2008

    • 著者名/発表者名
      Toyota, K., Sato E., Shirakashi T., Min Y. Y.
    • 学会等名
      5th International Congress of Nematology
    • 発表場所
      Brisbane (poster)
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Possible mechanisms decreasing the damage on radish by the root-lesi on nematode in a soil amended with okara and coffee compost2008

    • 著者名/発表者名
      Erika Sato, Yu Yu Min, Koki Toyota, Hajime Takeda, Ichi Okumura
    • 学会等名
      5^<th> International Congress of Nematology
    • 発表場所
      Brisbane
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 土壌生物性診断指標作成にむけた土壌線虫群集構造と線虫害調査2007

    • 著者名/発表者名
      佐藤恵利華, Yu Yu Min, 豊田剛己, 高田敦之, 武田甲
    • 学会等名
      日本線虫学会
    • 発表場所
      京都大学
    • 年月日
      2007-09-13
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] オカラ・コーヒー粕堆肥連用土壌の根圏微生物群集構造解析2007

    • 著者名/発表者名
      佐藤恵利華, 武田甲, 豊田剛己
    • 学会等名
      日本土壌微生物学会
    • 発表場所
      東葛テクノプラザ(千葉県)
    • 年月日
      2007-06-08
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] POR-DGGEとqPCRによる線虫群集および有害線虫数の推計に向けた取り組み2006

    • 著者名/発表者名
      白樫知明, 豊田剛己, 佐藤恵利華, Yu Yu Min
    • 学会等名
      日本線虫学会
    • 発表場所
      筑波研修センター
    • 年月日
      2006-09-15
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] 定量PCRによるPratylenchus penetransの検出2006

    • 著者名/発表者名
      佐藤恵利華, 豊田剛己, Yu YuMin, 白樫知明
    • 学会等名
      日本線虫学会
    • 発表場所
      筑波研修センター
    • 年月日
      2006-09-15
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [図書] 畑地生態系の生物性評価手法の開発に向けた試み-線虫群集と線虫害-2009

    • 著者名/発表者名
      佐藤恵利華, 豊田剛己
    • 出版者
      日本土壌肥料学会監修「原生生物や線虫からみた土壌生態系の解明と活用」、博友社(発行確定)
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [図書] 環境保全型農業事典、土壌病害2005

    • 著者名/発表者名
      豊田剛己
    • 出版者
      朝倉書店
    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [産業財産権] 特許権2008

    • 発明者名
      豊田剛己ら
    • 権利者名
      東京農工大学, 大起理化工業
    • 産業財産権番号
      2008-039438
    • 出願年月日
      2008-02-20
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [産業財産権] 特許権2008

    • 発明者名
      豊田剛己
    • 権利者名
      東京農工大学・大起理化工業
    • 産業財産権番号
      2008-039438
    • 出願年月日
      2008-02-20
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [産業財産権] 特許権2007

    • 発明者名
      豊田剛己ら
    • 権利者名
      東京農工大学, 株式会社荏原製作所
    • 産業財産権番号
      2007-037132
    • 出願年月日
      2007-03-05
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [産業財産権] 特許権2005

    • 発明者名
      豊田剛己ら
    • 権利者名
      東京農工大学, デザイナーブース株式会社
    • 産業財産権番号
      2005-262798
    • 出願年月日
      2005-09-09
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [産業財産権] 土壌線虫病害診断手法2005

    • 発明者名
      豊田 剛己, 佐藤 恵理華, 和田 さと子, 小笠原 真清
    • 権利者名
      東京農工大学, 株式会社デザイナーフーズ
    • 産業財産権番号
      2005-262798
    • 出願年月日
      2005
    • 関連する報告書
      2005 実績報告書

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公開日: 2005-04-01   更新日: 2016-04-21  

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