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敗血症治療に向けた自然免疫系のTLR受容体のタンパク質のX線構造解析

研究課題

研究課題/領域番号 17390010
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 物理系薬学
研究機関東京大学

研究代表者

佐藤 能雅  東京大学, 大学院・薬学研究科, 教授 (30150014)

研究分担者 野口 修治  東京大学, 大学院・薬学系研究科, 助教 (60237823)
藤間 祥子  東京大学, 大学院・薬学系研究科, 助教 (40363535)
水谷 隆太  東京大学, 大学院・薬学系研究科, 助手 (70272482)
研究期間 (年度) 2005 – 2007
研究課題ステータス 完了 (2007年度)
配分額 *注記
15,930千円 (直接経費: 14,700千円、間接経費: 1,230千円)
2007年度: 5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円)
2006年度: 4,900千円 (直接経費: 4,900千円)
2005年度: 5,700千円 (直接経費: 5,700千円)
キーワード自然免疫 / Toll-Like-Peceptor / MD-2 / 敗血症 / エンドトキシン / リポ多糖 / X線結晶構造解析 / 構造生物学 / Toll-Like-Recetor / X線結晶構造析 / Toll-Like-Receptor
研究概要

自然免疫系のMD-2タンパク質は細菌のリポ多糖(LPS)を認識し,細胞表面の受容体のToll-Like Receptor 4(TLR4)に認識情報を伝達する共受容体である。細菌感染による重篤な敗血症ショックは,このLPSへの過度の応答により惹起される。研究では,これらタンパク質によるLPS応答の構造的な要因をX線結晶構造解析により明らかにするため,MD-2の発現,精製,性状解析,結晶化とX線解析などを行った。
ヒトとマウスのMD-2について,大量発現,精製,結晶化を行った。ヒトMD-2の結晶は双晶または混晶の兆候を示したが,単結晶を得てX線回折データを測定した。その結果,ヒトMD-2単体およびリピッドIVaとMD-2の複合体の結晶について,高分解能での三次元構造の解析に成功した。
リピッドIVaは,エンドトキシンであるLPSの骨格部を成すリピッドAの前駆体であり,ヒトではアンタゴニスト,マウスではアゴニストとして働く。MD-2の疎水性ポケットに結合しているリピッドIVa複合体の三次元構造から,エンドトキシンの認識に関する詳細な構造知見を得た。また,ヒトMD-2単体の結晶では,3分子脂肪酸様の分子を見出すことができた。
エンドトキシンのアゴニストは,MD-2とTLR4の受容体系を活性化することから,ヒトTLR4の細胞外ドメインの大量発現系の構築に向けて,昆虫細胞由来の宿主などを用いて研究を進めた。また,リピッドAなどのアンタゴニストとヒトMD-2との複合体の共結晶化と,結晶のX線回折法による評価も行った。
研究により得た三次元構造の知見は,LPS応答を遮断する敗血症治療薬の開発に有効な構造知見をもたらすと期待される。

報告書

(4件)
  • 2007 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2006 実績報告書
  • 2005 実績報告書
  • 研究成果

    (50件)

すべて 2008 2007 2006 2005 その他

すべて 雑誌論文 (13件) (うち査読あり 6件) 学会発表 (35件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Crystal Twinning of Human MD-2 Recognizing Endotoxin Cores of Lipopolysaccharide2008

    • 著者名/発表者名
      Umeharu Ohto, Yoshinori Satow
    • 雑誌名

      Journal of Synchrotron Radiation 15

      ページ: 262-265

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structures of Human MD-2 Coreceptor and Its Complex with Antiendotoxic Lipid IVa Preventing Endotoxin Shock2008

    • 著者名/発表者名
      Yoshinori Satow and Umeharu Ohto
    • 雑誌名

      SPring-8 Research Frontiers 2007 (印刷中)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Structures of Human MD-2 Coreceptor and Its Complex with Antiendotoxic Lipid IVa Preventing Endotoxin Shock2008

    • 著者名/発表者名
      Yoshinori Satow, Umeharu Ohto
    • 雑誌名

      SPring-8 Research Frontiers 2007 (in press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Crystal Twinning of Human MD-2 Recognizing Endotoxin Cores of Lipopolysaccharide2008

    • 著者名/発表者名
      Umeharu Ohto, Ybshinoh Satow
    • 雑誌名

      Journal of Synchrotron Radiation 15

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal Structures of Human MD-2 and Its Complex with Antiendotoxic Lipid IVa2007

    • 著者名/発表者名
      Umeharu Ohto, Koichi Fukase, Kensuke Miyake, Yoshinori Satow
    • 雑誌名

      Science 316

      ページ: 1632-1634

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal Structures if Human MD-2 and Its Complex with Antiendotoxic Lipid IVa2007

    • 著者名/発表者名
      Umeharu Ohto, Koichi Fukase, Kensuke Miyake, Yoshinori Satow
    • 雑誌名

      Science 316

      ページ: 1632-1634

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal Structures of Human MD-2 and Its Complex with Anti-endotoxic Lipid IVa2007

    • 著者名/発表者名
      Umeharu Ohto, Koichi Fukase, Kensuke Miyake, Yoshinori Satow
    • 雑誌名

      Science (in press)

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Purification of Human β_2-Adrenergic Receptor Expressed in Methylotrophic Yeast Pichia Pastoris2006

    • 著者名/発表者名
      Shuji Noguchi and Yoshinori Satow
    • 雑誌名

      J. Biochem. 140

      ページ: 799-804

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Purification of Human β2-Adrenergic Receptor Expressed in Methylotrophic Yeast Pichia pastoris2006

    • 著者名/発表者名
      Shuji Noguchi, Yoshinori Satow
    • 雑誌名

      J. Biochem 140

      ページ: 799-804

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Purification of Human β2-Adrenergic Receptor Expressed in Methylotrophic Yeast Pichia pastris2006

    • 著者名/発表者名
      Shuji Noguchi, Yoshinori Satow
    • 雑誌名

      J.Biochem. 140

      ページ: 799-804

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Purification of Human β_2-Adrenergic Receptor Expressed in Methylotrophic Yeast Pichia Pastoris2005

    • 著者名/発表者名
      Yasuhiro Anraku, Ryuta Mizutani and Yoshinori Satow
    • 雑誌名

      IUBMB Life 57

      ページ: 563-574

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Protein splicing : Its discovery and structural insight into novel chemical mechanisms2005

    • 著者名/発表者名
      Y. Anraku, R. Mizutani, Y. Satow
    • 雑誌名

      IUBMB Life 57

      ページ: 563-574

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Protein splicing : Its discovery and structural insight into novel chemical mechanisms2005

    • 著者名/発表者名
      Y.Anraku, R.Mizutani, Y.Satow
    • 雑誌名

      IUBMB Life 57(8)

      ページ: 563-574

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [学会発表] ヒト熱ショック蛋白質Hsp40ポリペプチド結合ドメインの精製および結晶化2008

    • 著者名/発表者名
      鈴木浩典, 野口修治, 佐藤能雅
    • 学会等名
      日本薬学会第128年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2008-03-28
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書 2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Purification and crystallization of Polypeptide-Binding domain of human Heat-Shock Protein Hsp402008

    • 著者名/発表者名
      Hironori Suzuki, Shuji Noguchi, Yoshinori Satow
    • 学会等名
      The 128th Annual Meeting of the Pharmaceutical Society of Japan
    • 発表場所
      Yokohama
    • 年月日
      2008-03-28
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Crystal Structures of Human MD-2 Recognizing Bacterial Endotoxin2007

    • 著者名/発表者名
      大戸梅治, 佐藤能雅
    • 学会等名
      第30回日本分子生物学会年会, 第80回日本生化学会大会 合同大会BMB2007
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2007-12-11
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] ヒトHsp40 C末端側ドメインの精製および結晶化2007

    • 著者名/発表者名
      鈴木浩典, 野口修治, 佐藤能雅
    • 学会等名
      第30回日本分子生物学会年会, 第80回日本生化学会大会 合同大会BMB2007
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2007-12-11
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Crystal structures of human MD-2 recognizing bacterial endotoxin2007

    • 著者名/発表者名
      Umeharu Ohto, Yoshinori Satow
    • 学会等名
      The 30th Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan/The 80th Annual Meeting of the Japanese Biochemical Society : BMB2007
    • 発表場所
      Yokohama
    • 年月日
      2007-12-11
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Purification and crystallization of C-terminal domain of human Hsp402007

    • 著者名/発表者名
      Hironori Suzuki, Shuji Noguchi, Yoshinori Satow
    • 学会等名
      The 30th Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan/The 80th Annual Meeting of the Japanese Biochemical Society : BMB2007
    • 発表場所
      Yokohama
    • 年月日
      2007-12-11
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Crystal Structures of Human MD-2 Recognizing Bacterial Endotoxin2007

    • 著者名/発表者名
      大戸 梅治, 佐藤 能雅
    • 学会等名
      第30回日本分子生物学会年会, 第80回日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2007-12-11
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] ヒトHsp40C末端側ドメインの精製および結晶化2007

    • 著者名/発表者名
      鈴木 浩典, 野口 修治, 佐藤 能雅
    • 学会等名
      第30回日本分子生物学会年会, 第80回日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2007-12-11
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] リボ多糖を認識するヒトMD-2蛋白質の双晶2007

    • 著者名/発表者名
      大戸梅治, 佐藤能雅
    • 学会等名
      日本結晶学会2007年度年会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2007-12-01
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書 2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Crystal Twinning of Human MD-2 protein Recognizing Lipopolysaccharide2007

    • 著者名/発表者名
      Umeharu Ohto, Yoshinori Satow
    • 学会等名
      The Annual Meeting of the Crystallographic Society of Japan 2007
    • 発表場所
      Tokyo
    • 年月日
      2007-12-01
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] 自然免疫系蛋白質ヒトMD-2によるエンドトキシンの認識2007

    • 著者名/発表者名
      大戸 梅治, 佐藤 能雅
    • 学会等名
      東京大学生命科学研究ネットワークシンポジウム
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2007-09-15
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Endotoxin Recognition by the Innate Immunity Protein of Human MD-22007

    • 著者名/発表者名
      Umeharu Ohto, Yoshinori Satow
    • 学会等名
      Biological Science Research Symposium of the University of Tokyo
    • 発表場所
      Tokyo
    • 年月日
      2007-09-15
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Crystal Twinning of Human MD-2 Recognizing Endotoxin Cores of Lipopolysaccharide2007

    • 著者名/発表者名
      Umeharu Ohto and Yoshinori Satow
    • 学会等名
      International Symposium on Diffraction Structural Biology 2007
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2007-09-12
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Crystal Twinning of Human MD-2 Recognizing Endotoxin Cores of Lipopolysaccharide2007

    • 著者名/発表者名
      Umeharu Ohto, Yoshinori Satow
    • 学会等名
      International Symposium on Diffraction Structural Biology 2007
    • 発表場所
      Tokyo
    • 年月日
      2007-09-12
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Crystal Twinning of Human MD-2 Recognizing Endotoxin Cores of Lipopolysaccharide2007

    • 著者名/発表者名
      Umeharu Ohto, Yoshinori Satow
    • 学会等名
      International Symposium on Diffiraction Structural Biology2007
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2007-09-12
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] ヒトβ2アドレナリン受容体の大量精製2007

    • 著者名/発表者名
      野口 修治, 佐藤 能雅
    • 学会等名
      日本薬学会第127年会
    • 発表場所
      富山
    • 年月日
      2007-03-29
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] 敗血症エンドトキシンに結合するヒトMD-2蛋白質の結晶構造2007

    • 著者名/発表者名
      大戸 梅治, 佐藤 能雅
    • 学会等名
      日本薬学会第127年会
    • 発表場所
      富山
    • 年月日
      2007-03-29
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Large-Scale Purification of Human β2-Adrenergic Receptor2007

    • 著者名/発表者名
      Shuji Noguchi, Yoshinori Satow
    • 学会等名
      The 127th Annual Meeting of the Pharmaceutical Society of Japan
    • 発表場所
      Toyama
    • 年月日
      2007-03-29
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Crystal Structure of Human MD-2 Protein Recognizing Sepsis Endotoxin2007

    • 著者名/発表者名
      Umeharu Ohto, Yoshinori Satow
    • 学会等名
      The 127th Annual Meeting of the Pharmaceutical Society of Japan
    • 発表場所
      Toyama
    • 年月日
      2007-03-29
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] メタノール資化酵母Pichia pastoris発現ヒトβ2アドレナリン受容体の精製2006

    • 著者名/発表者名
      野口 修治, 佐藤 能雅
    • 学会等名
      東京大学生命科学研究ネットワークシンポジウム
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2006-11-25
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Purification of Human β-Adrenergic Receptor Expressed in Methylo-trophic Yeast Pichla pastoris2006

    • 著者名/発表者名
      Shuji Noguchi, Yoshinori Satow
    • 学会等名
      Biological Science Research Symposium of the University of Tokyo
    • 発表場所
      Tokyo
    • 年月日
      2006-11-25
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] メタノール資化酵母による糖(膜)蛋白質の発現と精製・機能解析2006

    • 著者名/発表者名
      佐藤 能雅
    • 学会等名
      日本蛋白質科学会第6回年会
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2006-04-25
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Expression, purification, and characterization of glycoproteins as well as membrane proteins using methyltropic yeast Pichia pastoris2006

    • 著者名/発表者名
      Yoshinori Satow
    • 学会等名
      The 6th Annual Meeting of the Protein Science Society of Japan
    • 発表場所
      Kyoto
    • 年月日
      2006-04-25
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] メタノール資化酵母Pichia pastoris発現の七回膜貫通型ヒトβ2アドレナリン受容体の発現,精製と性状解析2006

    • 著者名/発表者名
      野口 修治, 佐藤 能雅
    • 学会等名
      日本薬学会第126年会
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      2006-03-28
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] ヒトMD-2蛋白質の発現,精製と結晶化2006

    • 著者名/発表者名
      大戸 梅治, 水谷 隆太, 佐藤 能雅
    • 学会等名
      日本薬学会第126年会
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      2006-03-28
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Purification of Human β2-Adrenergic Receptor Expressed in Methylo-trophic Yeast Pichia pastoris2006

    • 著者名/発表者名
      Shuji Noguchi, Yoshinori Satow
    • 学会等名
      The 126th Annual Meeting of the Pharmaceutical Society of Japan
    • 発表場所
      Sendai
    • 年月日
      2006-03-28
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Expression, Purification, and Crystallization of Human MD-2 Protein2006

    • 著者名/発表者名
      Umeharu Ohto, RyutaMizutani, Yoshinori Satow
    • 学会等名
      The 126th Annual Meeting of the Pharmaceutical Society of Japan
    • 発表場所
      Sendai
    • 年月日
      2006-03-28
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] リポポリサッカライドを認識するヒトMD-2蛋白質の発現,精製と性状解析2005

    • 著者名/発表者名
      大戸 梅治, 水谷 隆太, 佐藤 能雅
    • 学会等名
      日本生化学会第78回大会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2005-10-19
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] MRSA薬剤耐性遺伝子組換え酵素CcrCのN末端ドメインと組換部位コンセンサスDNA配列の相互作用2005

    • 著者名/発表者名
      水谷 隆太, 佐藤 能雅
    • 学会等名
      日本生化学会第78回大会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2005-10-19
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] ヒトβ-ガラクトシダーゼの精製,性状解析と結晶化2005

    • 著者名/発表者名
      臼井 公人, 越智 俊成, 水谷 隆太, 佐藤 能雅
    • 学会等名
      日本生化学会第78回大会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2005-10-19
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] MRSA薬剤耐性遺伝子組換え酵素CcrBによる部位特異的なDNA結合2005

    • 著者名/発表者名
      大冨 友加, 水谷 隆太, 佐藤 能雅
    • 学会等名
      日本生化学会第78回大会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2005-10-19
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] The 78th Annual Expression, purification, and characterization of human MD-2 protein recognizing lipopolysaccharide2005

    • 著者名/発表者名
      Umeharu Ohto, RyutaMizutani, Yoshinori Satow
    • 学会等名
      Meeting of the Japanese Biochemical Society
    • 発表場所
      Kobe
    • 年月日
      2005-10-19
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] N-terminal domain of MRSA cassette chromosome recombinase CcrC interacts with consensus DNA repeats of the resistance gene junctions2005

    • 著者名/発表者名
      Ryuta Mizutani, Yoshinori Satow
    • 学会等名
      The 78th Annual Meeting of the Japanese Biochemical Society
    • 発表場所
      Kobe
    • 年月日
      2005-10-19
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Purification, characterization and crystallization of human β-galactosidase2005

    • 著者名/発表者名
      Kimihito Usui, Toshinari Ochi, Ryuta Mizutani, Yoshinori Satow
    • 学会等名
      The 78th Annual Meeting of the Japanese Biochemical Society
    • 発表場所
      Kobe
    • 年月日
      2005-10-19
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Satow; Site-specific DNA binding of MRSA cassette chromosome recombinase CcrB2005

    • 著者名/発表者名
      Yuka Ohtomi, Ryuta Mizutani, Yoshinori
    • 学会等名
      The 78th Annual Meeting of the Japanese Biochemical Society
    • 発表場所
      Kobe
    • 年月日
      2005-10-19
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [備考] 「研究成果報告書概要(和文)」より

    • URL

      http://www.f.u-tokyo.ac.jp/~kouzou/research/research1.html

    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [備考]

    • URL

      http://www.f.u-tokyo.ac.jp/~kouzou/research/research1.html

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書

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公開日: 2005-04-01   更新日: 2016-04-21  

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