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非コード領域DNAマーカーにおける日本近隣ヒト集団の分子遺伝学的異質性の研究

研究課題

研究課題/領域番号 17390200
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 法医学
研究機関名古屋大学

研究代表者

山本 敏充  名古屋大学, 大学院医学系研究科, 助教授 (50260592)

研究分担者 打樋 利英子  名古屋大学, 大学院医学系研究科, 助手 (20223571)
玉木 敬二 (玉木 啓二)  京都大学, 大学院医学研究科, 教授 (90217175)
勝又 義直  名古屋大学, 大学院・医学系研究科, 教授 (30109326)
研究期間 (年度) 2005 – 2006
研究課題ステータス 完了 (2006年度)
配分額 *注記
12,700千円 (直接経費: 12,700千円)
2006年度: 5,100千円 (直接経費: 5,100千円)
2005年度: 7,600千円 (直接経費: 7,600千円)
キーワード集団遺伝学 / 非コード領域 / 日本人 / STR / 遺伝的異質性 / 遺伝的系統関係 / 遺伝子プール / 遺伝プール
研究概要

本研究では、常染色体上の105STRローカスを用いて、日本人(名古屋・沖縄)、中国人(北京、陵西、湖南、福建、広東)、タイ人(バンコク)、ミャンマー人(ヤンゴン)の計9つの東・東南アジアの地域ヒト集団における、日本人と中国人の遺伝的系統関係や遺伝子プール構造などについて、系統樹作成、多次元分析、Structure-Distructプログラム等による解析を行い、これらの成果は論文として掲載された。これらの結果から、日本人は、大陸の中国ハン民族の五地域集団とは系統遺伝学的にも異なるクラスターを形成し、遺伝構造的にも異なる要素を示すことが示された。さらに、日本人においては、中国の南部の少数民族と同様の要素を共通してもっており、日本人が、中国南部の要素を少なからず保持している可能性が示唆された。その後、秋田・大分・長崎の日本人地域集団およびモンゴル人の二地域集団の各32名のDNAを用いて、同様に、105ローカスの型判定を行い、Genetixソフトウエアを用いて、三次元的ドット解析をしたところ、日本人五地域集団、中国北京地域集団、その他中国人四地域集団、東南アジア二集団、モンゴル人二地域集団がおおよそ区別された5つのブロックとして空間的に分布した。また、日本人五地域集団は、大陸のヒト集団とは明らかに要素を異にする集団であることが示された。さらに、長崎の集団には、他の日本人四地域集団に比べ大陸的要素が多く含まれていることが示された。この研究成果の一部は、第60回日本人類学会大会において、発表された。本研究において、100以上の常染色体上の突然変異率がほぼ同じであると考えられる4塩基リピートSTRマーカーを用いることにより、同じ東アジア人においても日本人と中国人のような近縁なヒト地域集団を区別できるような異質性も検出可能であろうことが示唆された。

報告書

(3件)
  • 2006 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2005 実績報告書
  • 研究成果

    (18件)

すべて 2007 2006 2005

すべて 雑誌論文 (17件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Population data of six STR loci using hexaplex PCR amplification and typing system, "Midi-6" in four regional populations in Japan2007

    • 著者名/発表者名
      R.Uchihi
    • 雑誌名

      Forensic Sci. Int. (in press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 実績報告書 2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Allele frequencies of six miniSTR loci (D20S480, D6S2439, D6S1056, D9S1118, D4S2639 and D17S1290), "Midi-6", in a Basque Country autochthonous population2007

    • 著者名/発表者名
      O.Garcia
    • 雑誌名

      Forensic Sci. Int. (in press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 実績報告書 2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Population data of six STR loci using hexaplex PCR amplification and typing system, "Midi-6" in four regional populations in Japan.C2007

    • 著者名/発表者名
      Uchihi R
    • 雑誌名

      Forensic ScienceInternational (in press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Allele frequencies of six miniSTR loci (D20S480, D6S2439, D6S1056, D9S1118, D4S2639 and D17S1290), "Midi-6", in a Basque Country autochthonous population.2007

    • 著者名/発表者名
      Garcia O
    • 雑誌名

      Forensic ScienceInternational (in press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Phylogenetic relationship of the populations within and around Japan using 105 short tandem repeat polymorphic loci2006

    • 著者名/発表者名
      S-L. Li
    • 雑誌名

      Hum. Genet. 118

      ページ: 695-707

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Allele frequency distributions at three pentanucleotide repeat STR in a Japanese population2006

    • 著者名/発表者名
      H.Ohtaki
    • 雑誌名

      J. Forensic Sci. 51(1)

      ページ: 193-194

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] 新しい市販のY-STR型判定用マルチプレックスキットで観察された突然変異2006

    • 著者名/発表者名
      吉本高士
    • 雑誌名

      DNA多型 14

      ページ: 234-236

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 実績報告書 2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Phylogenetic relationship of the populations within and around Japan using 105 short tandem repeat polymorphic loci2006

    • 著者名/発表者名
      Li S-L
    • 雑誌名

      Human Genetics 118

      ページ: 695-707

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Allele frequency distributions at three pentanucleotide repeat STR in a Japanese population.2006

    • 著者名/発表者名
      Ohtaki H
    • 雑誌名

      Journal of Forensic Sciences 51(1)

      ページ: 193-194

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Mutations observed at 17 Y-STR loci using a newly commercially released multiplex kit among Japanese father-son relationships.2006

    • 著者名/発表者名
      Yoshimoto T
    • 雑誌名

      DNA Polymorphisms 14

      ページ: 234-236

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Phylogenetic relationship of the populations within and around Japan using 105 short tandem repeat polymorphic loci2006

    • 著者名/発表者名
      S-L.Li
    • 雑誌名

      Hum.Genet. 118

      ページ: 695-707

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Allele frequency distributions at three pentanucleotide repeat STR in a Japanese population2006

    • 著者名/発表者名
      H.Ohtaki
    • 雑誌名

      J.Forensic Sci. 51(1)

      ページ: 193-194

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] 新しいペンタヌクレオチドSTRマルチプレックス・タイピングシステム2005

    • 著者名/発表者名
      打樋利英子
    • 雑誌名

      DNA多型 13

      ページ: 21-23

    • NAID

      10015685125

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要 2005 実績報告書
  • [雑誌論文] 日本人で識別力の高い非コード領域のSNPsのアリール特異的PCRマルチプレックス判定法2005

    • 著者名/発表者名
      井上知加子
    • 雑誌名

      DNA多型 13

      ページ: 24-26

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要 2005 実績報告書
  • [雑誌論文] A new multiplex typing system for three pentanucleotide STR loci.2005

    • 著者名/発表者名
      Uchihi R
    • 雑誌名

      DNA Polymorphisms 13

      ページ: 21-23

    • NAID

      10015685125

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] A novel quadruplex typing system by allele-specific PCR for SNPs in non-coding regions with high discriminating power in Japanese.2005

    • 著者名/発表者名
      Inoue C
    • 雑誌名

      DNA Polymorphisms 13

      ページ: 24-26

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] DNA profiling-Its ability and limitations.2005

    • 著者名/発表者名
      Katsumata Y
    • 雑誌名

      Nagoya University Press

      ページ: 1-305

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [図書] DNA鑑定-その能力と限界-2005

    • 著者名/発表者名
      勝又 義直
    • 総ページ数
      305
    • 出版者
      名古屋大学出版会
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要 2005 実績報告書

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公開日: 2005-04-01   更新日: 2016-04-21  

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