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レーザー脱離法による孤立DNA塩基対とその水和クラスターの生成

研究課題

研究課題/領域番号 17550017
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 物理化学
研究機関横浜市立大学

研究代表者

三枝 洋之  横浜市立大学, 国際総合科学研究科, 教授 (90162180)

研究分担者 立川 仁典  横浜市立大学, 国際総合科学研究科, 教授 (00267410)
研究期間 (年度) 2005 – 2006
研究課題ステータス 完了 (2006年度)
配分額 *注記
3,700千円 (直接経費: 3,700千円)
2006年度: 500千円 (直接経費: 500千円)
2005年度: 3,200千円 (直接経費: 3,200千円)
キーワードレーザー脱離 / DNA塩基 / 水和クラスター / ヌクレオシド / 互変異性体
研究概要

本助成によりDNA塩基などの熱的に不安定な生体分子を気化するためのレーザー脱離法を開発した。本手法の特色は、塩基対生成や塩基水和クラスターを効率的に生成することができる点である。このレーザー脱離法を用いて、グアニン塩基の互変異性体の電子スペクトルを測定した結果、最も安定であるはずの互変異性体が観測されないことが明らかとなった。更にメチル置換したグアニンを用いて互変異性化を制御することでこれを確かめることができた。このことは、DNA中で存在するような安定な異性体は、電子励起状態の寿命は非常に短いことを示唆しており、DNA塩基が紫外線照射により損傷することを妨げている一因となっていると考えられる。
本脱離レーザー装置を用いて、グアノシンなどの糖鎖の結合したヌクレオシドの非破壊的気化と、更にその水和物を生成させることに成功した。その結果、これらの水和物の高分解能電子スペクトルを世界で初めて観測することができた。このスペクトルを糖鎖の代わりにメチル基で置換したメチルグアニンの水和物のスペクトルと比較することで、糖鎖に水和していることが示唆された。また2'-デオキシグアノシンの水和物の電子スペクトルはグアノシンの場合と異なることが観測され、水分子は糖鎖の水酸基に結合していることが明らかとなった。現在これら水和物の赤外振動スペクトルを測定し、高精度の量子化学計算と比較することで、微細水和構造を検討している。
本研究で開発したレーザー脱離法は、DNA塩基分子のみでなく多くの生体分子に適用できると考えられ、今後の飛躍的発展が期待される。

報告書

(3件)
  • 2006 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2005 実績報告書
  • 研究成果

    (17件)

すべて 2007 2006 2005

すべて 雑誌論文 (17件)

  • [雑誌論文] Tautomerization behavior in guanine and methylated guanines, and its relation to the base pairing and hydration2007

    • 著者名/発表者名
      K.Miyazaki, N.Mizuno, T.Katayama, K.Takahashi, M.Tachikawa, H.Saigusa
    • 雑誌名

      Physical Chemistry and Chemical Physics (submitted)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 実績報告書 2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Excited-State Dynamics of Nucleic Acid Bases and Their Clusters2006

    • 著者名/発表者名
      H.Saigusa
    • 雑誌名

      Journal of Photochemistry and Photobiology C : Photochemistry Reviews 7

      ページ: 197-210

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] A matrix-free laser desorption method for production of nucleobase clusters and their hydrates2006

    • 著者名/発表者名
      H.Saigusa, A.Tomioka, T.Katayama, E.Iwase
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters 418・1

      ページ: 119-125

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Excited-state dynamics of nucleic acid base and their clusters2006

    • 著者名/発表者名
      H.Saigusa
    • 雑誌名

      Journal of Photochemistry and Photobiology C : Photochemistry Reviews 7

      ページ: 197-210

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] A matrix-free laser desorption method for production of nucleobase clusters and their hydrates2006

    • 著者名/発表者名
      H.Saigusa, A.Tomioka, T.Katayama, E.Iwase
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters 418(1)

      ページ: 119-125

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Excited-State Dynamics of Nucleic Acid Bases and Their Clusters2006

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Saigusa
    • 雑誌名

      journal of Photochemistry and Photobiology C : Photochemistry Reviews 7

      ページ: 197-210

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] A matrix-free laser desorption method for production of nucleobase clusters and their hydrates2006

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Saigusa, Azusa Tomioka, Takumi katayama, Eijiro Iwase
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters 418・1

      ページ: 119-125

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] レーザー脱離法を用いたDNA塩基分子の気相分光2006

    • 著者名/発表者名
      三枝洋之
    • 雑誌名

      日本化学会東北支部郡山地区講演会招待講演(11月17日、日本大学工学部)

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] グアニンにおける水和と塩基対生成との関連 : メチル変換による検証2006

    • 著者名/発表者名
      宮崎 謙二, 片山 巧, 三枝 洋之
    • 雑誌名

      分子構造総合討論会2006要旨集

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] グラファイトマトリクスを用いたアデニン類のレーザー脱離2006

    • 著者名/発表者名
      三枝洋之, 水野信輝, 宮崎謙二
    • 雑誌名

      分子構造総合討論会2006要旨集

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] 気相中のグアニン異性体のダイマー形成に関する理論的分析2006

    • 著者名/発表者名
      高橋研志, 三枝洋之, 立川仁典
    • 雑誌名

      分子構造総合討論会2006要旨集

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Pairing and Hydration of Guanine Tautomers2006

    • 著者名/発表者名
      H.SAIGUSA
    • 雑誌名

      Sendai International Symposium on Molecular Cluster Spectroscopy, Sendai (poster, May 29, 2006)

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Excited-state dynamics of hydrated clusters of the nucleobases2006

    • 著者名/発表者名
      H.SAIGUSA
    • 雑誌名

      XXIst IUPAC Symposium on Photochemistry, Kyoto (poster, Apr.4, 2006)

      ページ: 52-52

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] A matrix-free laser desorption method for production of nucleobase clusters and their hydrates2006

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Saigusa, Azusa Tomioka, Takumi Katayama, Eijiro Iwase
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters 418・1

      ページ: 119-125

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] DNA塩基水和クラスターの構造と励起ダイナミクス2005

    • 著者名/発表者名
      三枝洋之, 片山匠, 林晃夫, 徳村邦弘
    • 雑誌名

      分子構造総合討論会2005要旨集

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] レーザー脱離法によるグアニン-シトシン塩基クラスターとその水和物の生成2005

    • 著者名/発表者名
      片山匠, 三枝洋之
    • 雑誌名

      分子構造総合討論会2005要旨集

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] DNA塩基の微細水和構造とダイナミクス2005

    • 著者名/発表者名
      三枝洋之
    • 雑誌名

      分子研研究会「多様な水素結合系と量子効果」要旨集

      ページ: 13-13

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書

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公開日: 2005-04-01   更新日: 2016-04-21  

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