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環日本海地域に分布するトミヨ属魚類遺存固有種群の分子マーカーから見た種分化の過程

研究課題

研究課題/領域番号 17570075
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生物多様性・分類
研究機関信州大学

研究代表者

高田 啓介  信州大学, 理学部, 准教授 (90197096)

研究期間 (年度) 2005 – 2007
研究課題ステータス 完了 (2007年度)
配分額 *注記
2,810千円 (直接経費: 2,600千円、間接経費: 210千円)
2007年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2006年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
2005年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
キーワードトミヨ属 / 遺存固有種 / アロザイム / ミトコンドリアDNA
研究概要

環日本海地域に遺存固有種として分布するトミヨ属種群について、種分化の過程を考慮に入れた分類の再整理を研究目的とし、アロザイムとミトコンドリアDNAを遺伝的マーカーとして解析をおこないこれらの解析データを基に系統解析をおこなった。
アロザイム15遺伝子座の解析に基づいて遺伝的関係を構築した結果、環日本海地域に分布するこれらの遺存固有種群は2つの大きなグループから構成されていることが明らかになった。そこで、アロザイム解析で得られた2つの遺伝的集団、すなわち、山形・秋田の雄物型各2個体群と韓国南部に分布するP. kaibaraeの1個体群から成る遺伝的集団と、ロシア沿海州のP. bussei2個体群と韓国北部のP. kaibarae個体群から構成される遺伝的集団が、mtDNA解析からも支持されるかどうかを検証するために、CR、Cyt-b、およびATPase6の進化速度が異なるとされる3つの領域の塩基配列データを基に解析を行った。
CRでは346bp、Cyt-bでは872bp、およびATPase6では383bpの合計1601bpを解析の対象とした。そして、今回解析した環日本海地域に分布する6つの遺存固有種群はCRでは115箇所、Cyt-bでは255箇所、およびATPase6では45箇所で塩基置換が認められた。これらの解析データに、淡水型のデータを加え、イトヨを外群としたNJ樹では、山形の雄物型からなるクラスター、P. busseiとP. kaibaraeからなるクラスター、そして、淡水型と秋田の雄物型のクラスターの3つの集団に分かれた。P. busseiとP. kaibaraeからなるクラスターはTakahashi&Goto(2001)の解析したアジア大陸にのみ認められるP.sinensisの持つハプロタイプグループと同一である可能性が示唆された。また、今回見いだされた3つの集団はアロザイムから得られた2つの遺伝的集団とは一致しなかった。両性遺伝をする核ゲノムの指標であるアロザイムの解析と母系遺伝をするmtDNA解析の結果の不一致から、秋田の雄物型は淡水型との間で過去に交雑をおこし、淡水型からのmtDNAの移入を受けたことが示唆された。

報告書

(4件)
  • 2007 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2006 実績報告書
  • 2005 実績報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2008 2007 2006 2005

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (4件) 図書 (2件)

  • [雑誌論文] Isolation and characterization of polymorphic microsatellite DNA markers in the Omono type of ninespine stickleback, genus Pungitius2007

    • 著者名/発表者名
      Koizumi, N
    • 雑誌名

      Molecular Ecology Notes 7

      ページ: 1315-1318

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Isolation and characterization of polymorphic microsatellite DNA markers in the Omono type of ninespinc stickleback, genus Pungilius2007

    • 著者名/発表者名
      Koizumi, N. H. Jinguji, H. Takahashi. M. Higuchi, K. Takata, M. Minezawa, T. Takemura, A. Mori
    • 雑誌名

      Molecular Ecology Notes7

      ページ: 1315-1318

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Isolation and characterization of polymorphic microsatellite DNA markers in the Omono type of ninespine stickleback, genus Pungitius2007

    • 著者名/発表者名
      Koizumi, N., H. Jinguji, H. Takahashi, M. Higuchi, K. Takata, M. Minezawa, T. Takemura & A. Mori
    • 雑誌名

      Molecular Ecology Notes 7

      ページ: 1315-1318

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 山形県における絶滅危惧種イバラトミヨ雄物型の生息環境と営巣特性2008

    • 著者名/発表者名
      伊藤 聡
    • 学会等名
      日本生態学会
    • 発表場所
      第55回日本生態学会福岡大会
    • 年月日
      2008-03-17
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Habitat and spawning site of an endangered ninespine stickleback Pungitins sp. Omono type in Yamagata2008

    • 著者名/発表者名
      Itoh, S., K., Watanabe, E., Watanabe, K., Satoh, M., Kawauchi, A., Ohi, K., Takata, S., Maruyoshi
    • 学会等名
      Annual meeting of Ecological Society of Japan
    • 発表場所
      Fukuoka International Congress Center
    • 年月日
      2008-03-17
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] 絶滅危惧種イバラトミヨ雄物型の山形県小見川における成長様式および生息個体数の推定2007

    • 著者名/発表者名
      河内正行
    • 学会等名
      日本水産学会
    • 発表場所
      東京海洋大学
    • 年月日
      2007-03-29
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Estimation of growth and population size of an endangered ninespine stickleback Pungitius sp. Omono type in Yamagata2007

    • 著者名/発表者名
      Kawauchi, M. A. Ohi, K. Watanabe, S. Itoh, K. Satoh, K. Takata, I. Akoshima
    • 学会等名
      Annual meeting of the Japanese Society of Fisheries Science
    • 発表場所
      Tokyo University of Marine Science and Technology
    • 年月日
      2007-03-29
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [図書] ツナイモツゴの保全への模索 -長野県のシナイモツゴを例に- ブラックバスを退治する. (細谷, 高橋編)2006

    • 著者名/発表者名
      高田啓介
    • 総ページ数
      152
    • 出版者
      恒星社恒星閣
    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [図書] シナイモツゴからモツゴへ,交雑をとおした種の置き換わり.希少淡水魚の現在と未来 -積極的保全のシナリオ(片野修・森誠一編)2005

    • 著者名/発表者名
      小西繭, 高田啓介
    • 総ページ数
      416
    • 出版者
      信山社
    • 関連する報告書
      2005 実績報告書

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公開日: 2005-04-01   更新日: 2016-04-21  

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