中生代の大陸移動とトカゲ類の系統分岐の関係

• 研究課題/領域番号: 17570076
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 生物多様性・分類
• 研究機関: 名古屋大学
• 研究代表者: 熊澤 慶伯 名古屋大学, 理学研究科, 講師 (60221941)
• 研究分担者: 長谷川 政美 情報システム研究機構, 統計数理研究所, 教授 (60011657)
• 研究期間 (年度): 2005 – 2006
• 研究課題ステータス: 完了 (2006年度)
• 配分額: 3,500千円 (直接経費: 3,500千円); 2006年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円); 2005年度: 2,400千円 (直接経費: 2,400千円)
• キーワード: トカゲ亜目 / イグアナ下目 / 爬虫綱 / ミトコンドリアゲノム / 大陸移動 / 生物地理 / 分子系統解析 / 中生代 / ヤモリ下目 / 分岐年代 / トカゲ類 / ミトコンドリアDNA / マダガスカル

研究概要

トカゲ亜目を構成する主要な科より代表種を選んでミトコンドリアDNA全塩基配列約17キロ塩基対の決定を行った。その結果、イグアナ下目やヤモリ下目を構成する科から多数の種について(その他の科の殆どからは少なくとも代表種1種について)ミトコンドリアDNA全塩基配列を決定することができた。コードされる37遺伝子の塩基配列を用いて最尤法などによる分子系統解析を行い、信頼できる系統関係を構築するとともに、分子時計を仮定しないベイズ法を用いて分岐年代の推定を行った。その結果に、大陸移動に関する地質学的情報と古生物学的情報を加味して、トカゲ類の系統分岐と中生代の大陸移動の関係について考察を行った。主な生物地理学的成果は次の通りである。1)トカゲ類の主要な科間の分岐は白亜紀の大規模な大陸分離の以前にさかのぼる、2)ただしアガマ科とカメレオン科の分岐だけは約1億年前のゴンドワナ大陸で起き、その後アガマ科はインド亜大陸などに乗ってユーラシアに分散した可能性がある、3)マラガシートカゲ亜科のイグアナ類は他のイグアナ類と大陸の分断に伴い分岐した、4)ヤモリ科とトカゲモドキ科の分岐はパンゲア超大陸のローラシア大陸とゴンドワナ大陸への分裂に伴い分断的に起きたと考えられる。またこれらの研究を行う過程で、Draconinae亜科アガマ類のミトコンドリアゲノムの遺伝子配置に、脊椎動物としては初めてとなる遺伝子(本件ではプロリンtRNA遺伝子)の逆位を発見し、その分子進化機構として相同的DNA組換えを提唱した。

研究成果

• [雑誌論文] Mitochondrial genomes from major lizard families suggest their phylogenetic relationships and ancient radiations. (2007)
  • 著者名/発表者名: Kumazawa Y.
  • 雑誌名: Gene 388 ページ: 19-26
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] The mitochondrial genome of the lizard Calotes versicolor and a novel gene inversion in South Asian draconine agamids. (2007)
  • 著者名/発表者名: Amer S.A.M., Kumazawa Y.
  • 雑誌名: Molecular Biology and Evolution 24(In press)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Mitochondrial genomes from major lizard families suggest their phylogenetic relationships and ancient radiations. (2007)
  • 著者名/発表者名: Kumazawa, Y.
  • 雑誌名: Gene 388 ページ: 19-26
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] The mitochondrial genome of the lizard Calotes versicolor and a novel gene inversion in South Asian draconine agamids. (2007)
  • 著者名/発表者名: Amer, S.A.M., Kumazawa, Y.
  • 雑誌名: Molecular Biology and Evolution 24(in press)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] The mitochondrial genome of the lizard Calotes versicolor and a novel gene inversion in South Asian draconine agamids. (2007)
  • 著者名/発表者名: Amer SAM, Kumazawa Y.
  • 雑誌名: Molecular Biology and Evolution 24(In press)
• [雑誌論文] Molecular phylogenetic analyses of snakeheads (Perciformes : Channidae) using mitochondrial DNA sequences. (2006)
  • 著者名/発表者名: Li X., Musikasinthorn P., Kumazawa Y.
  • 雑誌名: Ichthyological Research 53 ページ: 148-159
  • NAID: 10017483085
• [雑誌論文] Sister group relationship of turtles to the bird-crocodilian clade revealed by nuclear DNA-coded proteins. (2005)
  • 著者名/発表者名: Iwabe N., HaraY., KumazawaY., Shibamoto K, Saito Y, Miyata T., Kato K.
  • 雑誌名: Molecular Biology and Evolution 22 ページ: 810-813
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Complete mitochondrial DNA sequences of six snakes : phylogenetic relationships and molecular evolution of genomic features. (2005)
  • 著者名/発表者名: Dong S., Kumazawa Y.
  • 雑誌名: Journal of Molecular Evolution 61 ページ: 12-22
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Mitochondrial genome of Pogona vitticepes (Reptilia; Agamidae) : control region duplication and the origin of Australasian agamids. (2005)
  • 著者名/発表者名: Amer S.A.M., Kumazawa Y.
  • 雑誌名: Gene 346 ページ: 249-256
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Mitochondrial DNA sequences of the Afro-Arabian spiny-tailed lizards (genus Uromastyx; family Agamidae) : phylogenetic analyses and evolution of gene arrangements. (2005)
  • 著者名/発表者名: Amer S.A.M., Kumazawa Y.
  • 雑誌名: Biological Journal of the Linnean Society 85 ページ: 247-260
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Complete mitochondrial DNA sequences of six snakes : phylogenetic relationships and molecular evolution of genomic features. (2005)
  • 著者名/発表者名: Dong, S., Kumazawa, Y.
  • 雑誌名: Journal of Molecular Evolution 61(1) ページ: 12-22
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Sister group relationship of turtles to the bird-crocodilian clade revealed by nuclear DNA-coded proteins. (2005)
  • 著者名/発表者名: Iwabe, N., Hara, Y., Kumazawa, Y., Shibamoto, K, Saito, Y, Miyata, T., Kato, K.
  • 雑誌名: Molecular Biology and Evolution 22(4) ページ: 810-813
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Mitochondrial genome of Pogona vitticepes (Reptilia ; Agamidae) : control region duplication and the origin of Australasian agamids. (2005)
  • 著者名/発表者名: Amer, S.A.M., Kumazawa, Y.
  • 雑誌名: Gene 346 ページ: 249-256
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Mitochondrial DNA sequences of the Afro-Arabian spiny-tailed lizards (genus Uromastyx ; family Agamidae) : phylogenetic analyses and evolution of gene arrangements. (2005)
  • 著者名/発表者名: Amer, S.A.M., Kumazawa, Y.
  • 雑誌名: Biological Journal of the Linnean Society 85(2) ページ: 247-260
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Sister group relationship of turtles to bird-crocodilian clade revealed by nuclear DNA-coded proteins. (2005)
  • 著者名/発表者名: Iwabe, N., Hara, Y., Kumazawa, Y., Shibamoto, K, Saito, Y, Miyata, T., Kato, K.
  • 雑誌名: Molecular Biology and Evolution 22 ページ: 810-813
• [雑誌論文] Mitochondrial DNA sequences of the Afro-Arabian spiny-tailed lizards (genus Uromastyx ; family Agamidae) : phylogonetic analyses and evolution of gene arrangements. (2005)
  • 著者名/発表者名: Amer, S.A.M., Kumazawa, Y.
  • 雑誌名: Biological Journal of the Linnean Society 85 ページ: 247-260
• [雑誌論文] Complete mitochondrial DNA sequences of six snakes : phylogenetic relationships and molecular evolution of genomic features. (2005)
  • 著者名/発表者名: Dong, S., Kumazawa, Y.
  • 雑誌名: Journal of Molecular Evolution 61 ページ: 12-22
• [雑誌論文] 第7章:分子データを用いた魚類の分岐年代の推定.
  • 著者名/発表者名: 熊澤 慶伯
  • 雑誌名: 海洋生命系のダイナミクス-第1巻、海洋の生命誌(西田睦編)(東海大学出版会) (印刷中)
• [雑誌論文] Molecular phylogenetic analyses of snakeheads (Perciformes : Channidae) using mitochondrial DNA sequences.
  • 著者名/発表者名: Li, X., Musikasinthorn, P., Kumazawa, Y.
  • 雑誌名: Ichthyological Research (In press)
  • NAID: 10017483085