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活性酸素ラジカルによるテロメア四重鎖の損傷

研究課題

研究課題/領域番号 17570092
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 構造生物化学
研究機関京都工芸繊維大学

研究代表者

金折 賢二  京都工芸繊維大学, 工芸科学研究科, 助教授 (30273543)

研究期間 (年度) 2005 – 2006
研究課題ステータス 完了 (2006年度)
配分額 *注記
3,400千円 (直接経費: 3,400千円)
2006年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
2005年度: 2,200千円 (直接経費: 2,200千円)
キーワード活性酸素 / テロメア / 塩基損傷 / 電子スピン共鳴 / ラジカル / 核磁気共鳴
研究概要

活性酸素によるテロメアDNAの損傷についての磁気共鳴を用いた研究を行なった。テロメアDNAの構造であるGカルテットは、結合するアルカリ金属イオンの違いにより構造変化が生じ、ラジカル反応が変化したため、様々なアルカリ金属イオンについて構造を詳細に検討した。それらの構造学的知見をもとに、この状態で核酸のラジカルによる損傷を直接測定し、その時間変化を観測した。現在、最終的な生成物については、三次元液体クロマトグラフィーにより分取した後、質量分析やNMRにより同定中である。しかしながら、当初用いていたラジカル発生系およびストップトフロー反応系では、核酸との反応を直接測定することは、濃度的さらに反応速度的においても難しいことがわかったため、再度、反応混合系を見直し、ストップトフローの結合部やミキサーを試作し改良した。さらに検出部においても、キャピラリーセルを改良したものを試作し、使用することにした。これらの改良により、ストップトフロー-ESR測定システムに照射システムを組み込み、活性酸素ラジカル種を効率的に発生、および、生体試料と反応させることに成功した。核酸ラジカル検出の方法を確立した。また、いくつかのニトロン系スピントラップ試薬を化学合成し、再結晶により生成し、発生した核酸ラジカルを選択的に検出できることになった。さらに、このシステムをアミノ酸の活性酸素による損傷の研究に応用した。現在、テロメアDNAのラジカル反応の構造特異性が明らかになり、NMRの結果と併せてDNAの損傷のメカニズムを明らかにしつつある。

報告書

(3件)
  • 2006 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2005 実績報告書
  • 研究成果

    (8件)

すべて 2006 2005

すべて 雑誌論文 (8件)

  • [雑誌論文] The roles of conserved amino acids on substrate binding and conformational integurity of C1pB N-terminal domain2006

    • 著者名/発表者名
      Tanaka, N.
    • 雑誌名

      Biochemistry 45

      ページ: 8556-8561

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] The roles of conserved amino acids on substrate binding and conformational integurity of ClpB N-terminal domain2006

    • 著者名/発表者名
      Tanaka, N., Tani, Y., Tada, T., Lee, Y.-F., Kanaori, K., Kunugi, S.
    • 雑誌名

      Biochemistry 45

      ページ: 8556-8561

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] The roles of conserved amino acids on substrate binding and conformational integrity of ClpB N-terminal domain2006

    • 著者名/発表者名
      Tanaka, N.
    • 雑誌名

      Biochemistry 45

      ページ: 8556-8561

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Pyrene is highly emissive when attached to the RNA duplex but not to the DNA duplex : the structural basis of this difference2005

    • 著者名/発表者名
      Nakamura, M.
    • 雑誌名

      Nucleic Acid Res. 33

      ページ: 5887-5895

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要 2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Interaction of gymnemic acid with cyclodextrins analyzed by isothermal titration calorimetry, NMR and dynamic light scattering2005

    • 著者名/発表者名
      Izutani, Y.
    • 雑誌名

      FEBS 272

      ページ: 6154-6160

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要 2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Pyrene is highly emissive when attached to the RNA duplex but not to the DNA duplex : the structural basis of this difference2005

    • 著者名/発表者名
      Nakamura, M., Fukunaga, Y., Sasa, K., Ohtoshi, Y., Kanaori, K., Hayashi, H., Nakano, H., Yamana, K.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res. 33

      ページ: 5887-5895

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Interaction of gymnemic acid with cyclodextrins analyzed by isothermal titration calorimetry, NMR and dynamic light scattering2005

    • 著者名/発表者名
      Izutani, Y., Kanaori, K., Imoto, T., Oda, M.
    • 雑誌名

      FEBS 272

      ページ: 6154-6160

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Relationship between temporary inhibition and structure of disulfide-linkage analogs of marinostatin, a natural ester-linked protease inhibitor2005

    • 著者名/発表者名
      Taniguchi, M.
    • 雑誌名

      J.peptide Res. 66

      ページ: 49-58

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書

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公開日: 2005-04-01   更新日: 2016-04-21  

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