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相同組換えタンパク質の高次構造ダイナミクスとその機能的役割の解明

研究課題

研究課題/領域番号 17570097
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 構造生物化学
研究機関早稲田大学

研究代表者

胡桃坂 仁志  早稲田大学, 理工学術院, 助教授 (80300870)

研究期間 (年度) 2005 – 2006
研究課題ステータス 完了 (2006年度)
配分額 *注記
3,600千円 (直接経費: 3,600千円)
2006年度: 1,400千円 (直接経費: 1,400千円)
2005年度: 2,200千円 (直接経費: 2,200千円)
キーワード相同組換え / 二重鎖切断修復 / 遺伝的組換え / Rad51 / Dmc1 / 減数分裂 / RecA / ATPase / タンパク質と酵素 / 核酸 / 遺伝子及び染色体 / 構造生物学 / X線結晶解析 / 生体高分子構造・機能 / 遺伝情報複製・再編 / 染色体構築・機能・分配
研究概要

相同組換えは、DNAの二重鎖切断損傷の修復や減数分裂期での遺伝的組換えにおいて重要な役割を果たしている。相同組換えの要の反応である相同的対合は、バクテリアRecAおよび2種類の真核生物型RecAホモログであるRad51とDmc1によって触媒されることが知られている。これらの相同的対合タンパク質(RecA、Rad51、およびDmc1)は、WalkerタイプのATPaseモチーフを持ち、単量体としては酷似した立体構造を形成しており、自己会合によりらせんフィラメント状の四次構造を形成する。しかし、Dmc1は、このようならせんフィラメント状構造以外にも8量体のリング構造を形成することが明らかになった。Dmc1とRad51は、互いに50%以上のアミノ酸配列相同性を有するにも関わらず、Dmc1で見られる8量体のリング構造は、Rad51では観察されていない。このようなRad51とDmc1との問の四次構造における差異が、それらの相同組換えにおける役割の違いを生じていると考えられる。申請者らは、X線結晶構造解析法によって、すでにヒトDmc1の8量体リング構造を原子分解能で決定することに成功している。そこで本年度は、このDmc1のリング構造形成の分子機構1を明らかにするために、ヒト由来のRad51とDmc1とのキメラタンパク質のデザインを行った。それらのRad51/Dmc1キメラタンパク質を用いて物理化学的および生化学的解析を行い、Rad51およびDmc1のリング-フィラメント構造の変換機構の解析を行う予定である。また、Rad51およびDmc1の性質に変化を生じる変異体の作製に成功した。これらの点変異体Rad51およびDmc1の物理化学的および生化学的解析の結果、Rad51のDNA結合部位やDmc1のリング構造形成に重要なアミノ酸残基の特定に成功した。

報告書

(3件)
  • 2006 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2005 実績報告書
  • 研究成果

    (17件)

すべて 2007 2006 2005

すべて 雑誌論文 (17件)

  • [雑誌論文] Genetic variance modifies apoptosis susceptibility in mature oocytes via alterations in DNA repair capacity and mitochondrial ultrastructure2007

    • 著者名/発表者名
      Perez GI, Acton BM, Jurisicova A, Perkins GA, White A, Brown J, Trbovich AM, Kim MR, Fissore R, Xu J, Ahmady A, D'Estaing SG, Li H, Kagawa W, Kurumizaka H, Yokoyama S, Okada H, Mak TW, Ellisman MH, Casper RF, Tilly JL
    • 雑誌名

      Cell Death Differ. 14(3)

      ページ: 524-533

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] HIV-1 Vpr induces ATM-dependent cellular signal with enhanced homologous recombination2007

    • 著者名/発表者名
      Nakai-Murakami C, Shimura M, Kinomoto M, Takizawa Y, Tokunaga K, Taguchi T, Hoshino S, Miyagawa K, Sata T, Kurumizaka H, Yuo A, Ishizaka Y
    • 雑誌名

      Oncogene 26(4)

      ページ: 477-486

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Genetic variance modifies apoptosis susceptibility in mature oocytes via alterations in DNA repair capacity and mitochondrial ultrastructure.2007

    • 著者名/発表者名
      Perez GI, Acton BM, Jurisicova A, Perkins GA, White A, Brown J, Trbovich AM, Kim MR, Fissore R, Xu J, Ahmady A, D'Estaing SG, Li H, Kagawa W, Kurumizaka H, Yokoyama S, Okada H, Mak TW, Ellisman MH, Casper RF, Tilly JL.
    • 雑誌名

      Cell Death Differ. 14(3)

      ページ: 524-533

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] HIV-1 Vpr induces ATM-dependent cellular signal with enhanced homologous recombination.2007

    • 著者名/発表者名
      Nakai-Murakami C, Shimura M, Kinomoto M, Takizawa Y, Tokunaga K, Taguchi T, Hoshino S, Miyagawa K, Sata T, Kurumizaka H, Yuo A, Ishizaka Y.
    • 雑誌名

      Oncogene 26(4)

      ページ: 477-486

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Genetic variance modifies apopotosis susceptibility in mature oocytes via alterations in DNA repair capacity and mitochondrial ultrastructure.2007

    • 著者名/発表者名
      Perez GI et al.
    • 雑誌名

      Cell Death Differ. 14(3)

      ページ: 524-533

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] HIV-1 Vpr induces ATM-dependent cellular signal with enhanced homologous recombination.2007

    • 著者名/発表者名
      Nakai-Murakami C. et al.
    • 雑誌名

      Oncogene 26(4)

      ページ: 477-486

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Stimulation of Dmcl-mediated DNA strand exchange by the human Rad54B protein2006

    • 著者名/発表者名
      Sarai N, Kagawa W, Kinebuchi T, Kagawa A, Tanaka K, Miyagawa K, Ikawa S, Shibata T, Kurumizaka H, Yokoyama S
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res. 34(16)

      ページ: 4429-4437

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Roles of the human Rad51 L1 and L2 loops in DNA binding2006

    • 著者名/発表者名
      Matsuo Y, Sakane I, Takizawa Y, Takahashi M, Kurumizaka H
    • 雑誌名

      FEBS Journal 273(14)

      ページ: 3148-3159

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] The DnaA homolog of the hyperthermophilic eubacterium Thermotoga maritima forms an open complex with a minimal 149-bp origin region in an ATP-dependent manner2006

    • 著者名/発表者名
      Ozaki S, Fujimitsu K, Kurumizaka H, Katayama T
    • 雑誌名

      Genes Cells 11(4)

      ページ: 425-438

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Stimulation of Dmc1-mediated DNA strand exchange by the human Rad54B protein.2006

    • 著者名/発表者名
      Sarai N, Kagawa W, Kinebuchi T, Kagawa A, Tanaka K, Miyagawa K, Ikawa S, Shibata T, Kurumizaka H, Yokoyama S.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res. 34(16)

      ページ: 4429-4437

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Roles of the human Rad51 L1 and L2 loops in DNA binding.2006

    • 著者名/発表者名
      Matsuo Y, Sakane I, Takizawa Y, Takahashi M, Kurumizaka H.
    • 雑誌名

      FEBS J. 273(14)

      ページ: 3148-3159

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] The DnaA homolog of the hyperthermophilic eubacterium Thermotoga maritima forms an open complex with a minimal 149-bp origin region in an ATP-dependent manner.2006

    • 著者名/発表者名
      Ozaki S, Fujimitsu K, Kurumizaka H, Katayama T.
    • 雑誌名

      Genes Cells 11(4)

      ページ: 425-438

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Stimulation of Dmc1-mediated DNA strand exchange by the human Rad54B protein.2006

    • 著者名/発表者名
      Srai N.et al.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research 34(16)

      ページ: 4429-4437

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Roles of the human Rad51L1 loops in DNA binding.2006

    • 著者名/発表者名
      Matsuo Y, Sakane I, Takizawa Y, Takahashi M, Kurumizaka H
    • 雑誌名

      FEBS Journal 273(14)

      ページ: 3148-3159

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] forms an open complex with a minimal 149-bp origin region in an ATP-dependent manner.2006

    • 著者名/発表者名
      Ozaki S, Fujimitsu K, Kurumizaka H, Katayama T
    • 雑誌名

      Genes to Cell 11(4)

      ページ: 425-438

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Structural and biochemical analyses of human centromere proteins A and B.2006

    • 著者名/発表者名
      Tanaka Y, Kurumizaka H
    • 雑誌名

      DNA Structure,Chromatin and Gene Expression (eds.R.Kiyama and M.Shimizu)

      ページ: 207-218

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Role of the N-terminal domain of the human DMC 1 protein in octamer formation and DNA binding2005

    • 著者名/発表者名
      Kinebuchi, T., Kagawa, W., Kurumizaka, H., Yokoyama, S.
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry 280(31)

      ページ: 28382-28387

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書

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公開日: 2005-04-01   更新日: 2016-04-21  

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