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メダカのグロビンおよび孵化酵素遺伝子からみた硬骨魚の遺伝子進化

研究課題

研究課題/領域番号 17570189
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 進化生物学
研究機関上智大学

研究代表者

井内 一郎  上智大学, 理工学部, 教授 (10011694)

研究分担者 安増 茂樹  上智大学, 理工学部, 教授 (00222357)
IUCHI Ichiro  Sophia University, Institute of Science and Technology, Professor (10011694)
研究期間 (年度) 2005 – 2007
研究課題ステータス 完了 (2007年度)
配分額 *注記
4,030千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 330千円)
2007年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2006年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
2005年度: 1,500千円 (直接経費: 1,500千円)
キーワード遺伝子 / ゲノム / 進化 / タンパク質 / ヘモグロビン / 孵化酵素 / 卵化酵素 / 蛋白質 / グロビン / メダカ / 硬骨魚
研究概要

メダカグロビン遺伝子の遺伝子座では,αGbとβGb遺伝子がぺアーとなってhead-to-headの向きに並んでいること,約1Kbという短い5'上流域に時期特異的,部域特異的発現を制御しているcis-調節領域が存在すること,極めて多様な遺伝子が2つの染色体に2つの群(クラスター)として存在することを明らかにした。また,分子系統学的研究から,現在知られている硬骨魚全体のGb遺伝子は4つのグループに種分けでき,メダカではその4つの遺伝子を全て持っており,他の魚類で成体型Gbとして機能している遺伝子が,メダカでは偽遺伝子化していることを明らかにした。
一方,我々は,メダカ孵化酵素をモデル分子として,約30種の硬骨魚の孵化酵素遺伝子を同定しその進化を調べた。カライワシ上目の魚類の孵化酵素遺伝子が先祖形を保っていること,その後分岐したであろうニシン、骨驃類と正真骨魚では,それぞれ,2種類の孵化酵素に多様化したことを明らかにした。特に,正真骨魚の孵化酵素HCE遺伝子は「系統依存的かつ段階的にイントロンが消失」によって進化していた。
グロビンと孵化酵素をモデルタンパク質として硬骨魚の進化を見てくると,それらは,多様な環境に生息し,多様な環境に適応して進化してきたであろうと考えられる硬骨魚の特徴をよく表していた。

報告書

(4件)
  • 2007 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2006 実績報告書
  • 2005 実績報告書
  • 研究成果

    (17件)

すべて 2008 2007 2006 2005 その他

すべて 雑誌論文 (14件) (うち査読あり 6件) 学会発表 (3件)

  • [雑誌論文] Hatching enzyme of ovoviviparous black rockfish Sebastes schlegelii:environmental adaptation of hatching enzyme and evolutionary aspects of formation of pseudogene2008

    • 著者名/発表者名
      Kawaguchi, M., Nakagawa, M., Noda, T., Yoshizaki, N., Hiroi, J., Nishida, M., Iuchi, I., Yasumasu, S.
    • 雑誌名

      FEBS Journal (In Press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Hatching enzyme of ovoviviparous black rockfish Sebastes schlegelii : environmental adaptation of hatching enzyme and evolutionary aspects of formation of pseudogene2008

    • 著者名/発表者名
      Kawaguchi, M., Nakagawa, M., Noda, T., Yoshizaki, N., Hiroi, J., Nishida, M., Iuchi, I., Yasumasu, S
    • 雑誌名

      FEBS Journal (In Press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Hatching enzyme of ovoviviparous black rockfish Sebastes schlegelii:environmental adaptation of hatching enzyme and evolutionary aspects of formation of pseudogene2008

    • 著者名/発表者名
      Kawaguchi, M., Nakagawa, M. Noda, T. Yoshizaki, N. Hiroi, J. Nishida, M. Iuchi, I. Yasumasu, S
    • 雑誌名

      FEBS Journal (In Press)

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Globin Gene Enhancer Activity of a DNase-l Hypersensitive Site-40 Homolog in Medaka,Oryzias latipes2007

    • 著者名/発表者名
      Maruyama K, Ishikawa Y, Yasumasu S, luchi I
    • 雑誌名

      Zool.Sci. 24

      ページ: 997-1004

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Analysis of the exon-intron structures of fish,amphibian,bird and mammalian hatching enzyme genes,with special reference to the intron loss evolution of hatching enzyme genes in Teleostei2007

    • 著者名/発表者名
      Kawaguchi, M., Yasumasu, S., Hiroi.J., Naruse, N., Suzuki, T.and luchi, I.
    • 雑誌名

      Gene 392

      ページ: 77-88

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Globin Gene Enhancer Activity of a DNase-I Hypersensitive Site-40 Homolog in Medaka, Oryzias latipes2007

    • 著者名/発表者名
      Maruyama, K, Ishikawa, Y, Yasumasu, S, Iuchi, I
    • 雑誌名

      Z001. Sci 24

      ページ: 997-1004

    • NAID

      40016396313

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Analysis of the exon-intron structures of fish, amphibian, bird and mammalian hatching enzyme genes, with special reference to the intron loss evolution of hatching enzyme genes in Teleostei2007

    • 著者名/発表者名
      Kawaguchi, M., Yasumasu, S., Hiroi, J., Naruse, N., Suzuki, T. and Iuchi, I
    • 雑誌名

      Gene 392

      ページ: 77-88

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Globin Gene Enhancer Activity of a DNase-I Hypersensitive Site-40 Homolog in Medaka,Oryzias latipes2007

    • 著者名/発表者名
      Maruyama K, Ishikawa Y, Yasumasu S, Iuchi I
    • 雑誌名

      Zool.Sci 24

      ページ: 997-1004

    • NAID

      40016396313

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Analysis of the exon-intron structures of fish,amphibian,bird and mammalian hatching enzyme genes,with special reference to the intron loss evolution of hatching enzyme genes in Teleostei2007

    • 著者名/発表者名
      Kawaguchi, M., Yasumasu, S., Hiroi, J., Naruse, N., Suzuki, T., Iuchi, I
    • 雑誌名

      Gene 392

      ページ: 77-88

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Analysis of the exon-intron structures of fish, amphibian, bird and mammalian hatching enzyme genes, with special reference to the intron loss evolution of hatching enzyme genes in Teleostei2007

    • 著者名/発表者名
      Kawaguchi, Yasumasu, Hiroi, Naruse, Suzukiho, Iuchi
    • 雑誌名

      Gene in press

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Evolution of teleostean hatching enzyme genes and their paralogous genes.2006

    • 著者名/発表者名
      Kwaguchi, Yasumasu, Hiroi, Naruse, Inoue, Ichiro Iuchi
    • 雑誌名

      Dev Genes Evol. 216

      ページ: 769-784

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Thyroid hormone-induced expression of a bZip-containing transcription factor activates epithelial cell proliferation during Xenopus larval-to-adult intestinal remodeling2006

    • 著者名/発表者名
      Ikuzawa M, Shimizu K, Yasumasu S, Iuchi I, Shi YB, Ishizuya-Oka A.
    • 雑誌名

      Dev Genes Evol. 216

      ページ: 109-118

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Purification and gene cloning of Fundulus heteroclitus hatching enzyme : A hatching enzyme system composed of high choriolytic enzyme(HCE) and low choriolytic enzyme(LCE) is conserved between two different teleosts, F.heteroclitus and medaka Oryzias latipes.2005

    • 著者名/発表者名
      Kawaguchi, M., Yasumasu, S., Shimizu, A., Hiroi, J., Yoshizaki, N., Nagata, K., Tanokura, M., luchi, I.
    • 雑誌名

      FEBS J. 272

      ページ: 4315-4326

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Expression of CCAAT/enhancer binding protein δ is closely associated with degeneration of surface mucous cells of larval stomach during the metamorphosis of Xenopus laevis.2005

    • 著者名/発表者名
      Ikuzawa, M., Kobayashi, Yasumasu, S., K., Iuchi.I.
    • 雑誌名

      Comp.Biochem.Physiol.B.Biochem.Mol.Biol. 140

      ページ: 505-511

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [学会発表] 卵胎生魚クロソイの孵化酵素LCE遺伝子における偽遺伝子形成過程2007

    • 著者名/発表者名
      川口 眞理, 安増 茂樹, 廣井 準也, 中川 雅弘, 野田 勉, 井内 一郎
    • 学会等名
      進化学会
    • 発表場所
      京都
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] 卵胎生魚クロソィの艀化酵素LCE遺伝子における偽遺伝子形成過程2007

    • 著者名/発表者名
      川口 真理、安増 茂樹、廣井 準也、中川 雅弘、野田 勉、井内 一郎
    • 学会等名
      進化学会
    • 発表場所
      京都
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Pseudogenization of LCE(One of Hatching Enzyme) Gene in Ovoviviparous Black Rockfish Sebastes schlegelii

    • 著者名/発表者名
      Kawaguchi, M., Yasumasu, S., Hiroi, J., Nakagawa, M., Noda, T., Iuchi, I
    • 学会等名
      Society of Evolutionary Studies, Japan
    • 発表場所
      Kyoto
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要

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公開日: 2005-04-01   更新日: 2016-04-21  

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