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結晶性キチン分解におけるキチナーゼドメインの機能発現機構

研究課題

研究課題/領域番号 17580061
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 応用微生物学
研究機関新潟大学

研究代表者

渡邉 剛志  新潟大学, 自然科学系, 教授 (10201203)

研究期間 (年度) 2005 – 2006
研究課題ステータス 完了 (2006年度)
配分額 *注記
3,700千円 (直接経費: 3,700千円)
2006年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
2005年度: 2,500千円 (直接経費: 2,500千円)
キーワード酵素 / 応用微生物 / 結晶性キチン / キチナーゼ / 立体構造 / キチン吸着ドメイン / X線小角散乱
研究概要

キチナーゼの基質であるキチンは結晶性で強固な不溶性多糖であり、結晶性キチン分解機構の解明はキチナーゼにとってきわめて本質的な課題である。これまではキチナーゼを構成するドメイン上のアミノ酸残基の機能に着目して研究を行ってきたが、本研究ではより高次の構造にも着目してより本質的な理解を目指した。
1)オーバーハングループの結晶性キチン分解における重要性。
Bacillus circulans WL-12キチナーゼA1の活性クレフト上部には、覆いかぶさるように突き出たループ構造が存在する。このループの欠失変異体を作成した結果、このループが結晶性キチン分解に重要な役割を果たしていることを明らかにすることができた。詳細な解析のため、ループ欠失変異体の結晶化を目的に大量調製を試みた。しかし、ループ欠失によってタンパク質の性質が変化し、不溶化したため立体構造解析にはいたらなかった。
2)結晶性キチンにのみ特異的に吸着するキチン吸着ドメインの吸着機構。
キチナーゼA1のキチン吸着ドメインは結晶性キチンに特異的なユニークなキチン吸着ドメインである。部位特異的変異によってキチン吸着に重要な役割を果たす新たなアミノ酸残基を探索した結果、W687に加えて新たにGln679を同定することができた。この残基を種々のアミノ酸残基に置換した結果、側鎖の極性・長さ・向きいずれもが重要であり、さらに他のアミノ酸残基の吸着への関与が示唆された。
3)Serratia maecscensキチナーゼBの露出した芳香族アミノ酸残基の機能。
S.maecscensキチナーゼB表面には活性クレフトに向かって並ぶ4つの芳香族アミノ酸残基(Y240,W252,W479,Y481)の機能解明のために、Y→W, W→Yの変異をおこなった。その結果Y→Wによって吸着活性が上昇、W→Yによって低下したが、いずれの場合も結晶性キチン分解活性は低下し、効率的な分解には酵素の動きやすさと吸着活性のバランスが重要であることが明らかとなった。

報告書

(3件)
  • 2006 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2005 実績報告書
  • 研究成果

    (22件)

すべて 2006 2005

すべて 雑誌論文 (22件)

  • [雑誌論文] Structure of full-length bacterial chitinase containing two fibronectin type III domains revealed by small angle X-ray scattering.2006

    • 著者名/発表者名
      T.Toratani 他
    • 雑誌名

      Biochem. Biophys. Res. Commun. 348・3

      ページ: 814-818

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Comparison of the enzymatic and antifungal properties between family 18 and 19 chitinases from S. coelicolor A3(2).2006

    • 著者名/発表者名
      T.Kawase 他
    • 雑誌名

      Biosci. Biotechnol. Biochem. 70・4

      ページ: 988-998

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 実績報告書 2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Importance of Trp59 and Trp60 in chitin-binding, hydrolytic, and antifungal activities of Streptomyces griseus chitinase C.2006

    • 著者名/発表者名
      Y.Itoh 他
    • 雑誌名

      Appl. Microbiol. Biotechnol. 72・6

      ページ: 1176-1184

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Identification of the substrate interaction region of the chitin-binding domain of Streptomyces griseus chitinase C.2006

    • 著者名/発表者名
      K.Akagi 他
    • 雑誌名

      J. Biochem. 139・3

      ページ: 483-493

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Structural studies of a two-domain chitinase from Streptomyces griseus HUT6037.2006

    • 著者名/発表者名
      Y.Kezuka 他
    • 雑誌名

      J. Mol. Biol. 358・2

      ページ: 472-484

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray analysis of the catalytic domain of chitinase D from Bacillus circulans2006

    • 著者名/発表者名
      Y.Kezuka 他
    • 雑誌名

      Protein Pept. Lett. 60

      ページ: 485-491

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Structure of full-length bacterial chitinase containing two fibronectin type III domains revealed by small angle X-ray scattering2006

    • 著者名/発表者名
      T.Toratani et al.
    • 雑誌名

      Biochem.Biophys.Res.Commun. 348(3)

      ページ: 814-818

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Comparison of the enzymatic and antifungal properties between family 18 and 19 chitinases from S. coelicolor A3(2).2006

    • 著者名/発表者名
      T.Kawase et al.
    • 雑誌名

      Biosci.Biotechnol.Biochem. 70(4)

      ページ: 988-999

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Importance of Trp59 and Trp60 in chitin-binding, hydrolytic, and antifungal activities of Streptomyces griseus chitinase C.2006

    • 著者名/発表者名
      Y.Itoh et al.
    • 雑誌名

      Appl.Microbiol.Biotechnol. 72(6)

      ページ: 1176-1184

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Identification of the substrate interaction region of the chitin-binding domain of Streptomyces griseus chitinase C.2006

    • 著者名/発表者名
      K.Akagi et al.
    • 雑誌名

      J.Biochem. 139(3)

      ページ: 483-493

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Structural studies of a two-domain chitinase from Streptomyces griseus HUT6037.2006

    • 著者名/発表者名
      Y.Kezuka et al.
    • 雑誌名

      J.Mol.Biol. 358(2)

      ページ: 472-484

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray analysis of the catalytic domain of chitinase D from Bacillus circulans2006

    • 著者名/発表者名
      Y.Kezuka et al.
    • 雑誌名

      Protein Pept.Lett. 60

      ページ: 485-491

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Structure of full-length bacteria chitinase containing two fibronectin type III domains revealed by small angle X-ray scattering.2006

    • 著者名/発表者名
      T.Toratani 他
    • 雑誌名

      Biochem. Biophys. Res. Commun. 348・3

      ページ: 814-818

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Importance of Trp59 and Trp60 in chitin-binding, hydrolytic, and antifungal activities of Streptomyces griseus chitinase C.2006

    • 著者名/発表者名
      Y.Itoh 他
    • 雑誌名

      Apl. Microbiol. Biotechnol. 72・6

      ページ: 1176-1184

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Identification of the substrate interaction of the chitin-binding domain of Streptomyces griseus chitinase C.2006

    • 著者名/発表者名
      K.Akagi 他
    • 雑誌名

      J. Biochem. 139・3

      ページ: 483-493

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Structural studies of a two-domain chitinase from Streptomyes griseus HUT6037.2006

    • 著者名/発表者名
      Y.Kezuka 他
    • 雑誌名

      J. Mol. Biol. 358・2

      ページ: 472-484

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary x-ray analysis of the catalytic domain of chitinase D from Bacillus circulans2006

    • 著者名/発表者名
      Y.Kezuka 他
    • 雑誌名

      Protein Pept. Lett. 60

      ページ: 485-491

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Comparison of the enzymatic and antifungal properties between family 18 and 19 chitinases from S. coelicolor A3(2).2006

    • 著者名/発表者名
      T.Kawase et al.
    • 雑誌名

      Biosci.Biotechnol.Biochem. (印刷中)

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Importance of Trp59 and Trp60 in chitin-binding, hydrolytic, and antifungal activities of Streptomyces griseus chitinase C.2006

    • 著者名/発表者名
      Y.Itoh et al.
    • 雑誌名

      Appl.Microbiol.Biotechnol. (印刷中)

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Structural studies of a two-domain chitinase from Streptomyces griseus HUT6037.2006

    • 著者名/発表者名
      Y.Kezuka et al.
    • 雑誌名

      J.Mol.Biol. (印刷中)

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Identification of the substrate interaction region of the chitin-binding domain of Streptomyces griseus chitinase C.2006

    • 著者名/発表者名
      K.Akagi et al.
    • 雑誌名

      J.Biochem. (印刷中)

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Molecular directionality in crystalline b-chitin ; hydrolysis by chitinases A and B from Serratia marcescens 2170.2005

    • 著者名/発表者名
      E.-L.Hult et al.
    • 雑誌名

      Biochem.J. 388(3)

      ページ: 851-856

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書

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公開日: 2005-04-01   更新日: 2016-04-21  

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