• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

ゲノムからのペプチド予測に基づいた新規生理活性ペプチドの網羅的探索

研究課題

研究課題/領域番号 17590214
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 薬理学一般
研究機関千葉大学

研究代表者

木村 定雄  千葉大学, 大学院医学研究院, 教授 (40134225)

研究分担者 粕谷 善後 (粕谷 善俊)  千葉大学, 大学院医学研究院, 助教授 (70221877)
西山 真理子  千葉大学, 大学院医学研究院, 助手 (00092081)
諸井 佳代子  千葉大学, 大学院医学研究院, 助手 (80110352)
研究期間 (年度) 2005 – 2006
研究課題ステータス 完了 (2006年度)
配分額 *注記
3,700千円 (直接経費: 3,700千円)
2006年度: 1,500千円 (直接経費: 1,500千円)
2005年度: 2,200千円 (直接経費: 2,200千円)
キーワードGタンパク質共役受容体 / GPCR / オーファン受容体 / 生理活性ペプチド / ゲノム構造 / バイオインフォーマティクス
研究概要

(1)既知ペプチドホルモンの生合成の経験則に基づいて、ヒトゲノム構造からG蛋白質共役型受容体(GPCR)のペプチドリガンド候補を予測するプログラムを開発し、GPCRペプチドリガンド候補951個と799個の合計1750個(Pharma GPEP、Ver.1およびVer.2)を予測し、その化学合成を行った。
(2)それらの合成品を用いて、34種類の種々の細胞を用いた細胞内カルシウム濃度上昇アッセイと、モルモット回腸平滑筋およびラット輸精管平滑筋の収縮弛緩アッセイの生物活性の測定を行いて、GPCRの新規リガンドスクリーニングを行った。
(3)その結果、活性をもつ140個(ver.1)と97個(ver.2)のペプチドを検出した。そのうち38個の中および高活性をもつペプチドを再合成して活性の再確認を行い、濃度応答曲線を検討したところ、いずれも高濃度(10^<-6>M以上)でのみ細胞に作用するペプチドであった。
(4)PharmaGPEPVer.1とVer.2は低濃度で活性が出ず、高濃度を用いると強い活性が見られた結果は、用いた細胞の内在受容体あるいはオーファン受容体に候補ペプチドがクロスしてシグナルを生じたと思われ、真のGPCRリガンドではないと推定された。
(5)将来展望として、ゲノム構造から候補ペプチドを抽出するソフトのさらなる改良型の開発が必須であり、また、特徴のあるペプチド構造に着目した抽出プログラム作成が必要と思われる。新規スクリーニング法の開発と多数のオーファン受容体を用いた探索ストラテジーとの組み合わせの研究も発見効率を上昇させるために必須と思われる。

報告書

(3件)
  • 2006 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2005 実績報告書
  • 研究成果

    (8件)

すべて 2006 2005

すべて 雑誌論文 (8件)

  • [雑誌論文] Involvement of p38alpha mitgen-activayed protein kinase in lung metastasis of tumor cells.2006

    • 著者名/発表者名
      Matsuo Y, Amano S, Furuya M, Namiki K, Sakurai K, Nishiyama M, Sudo T, Tatsumi K, Kuriyama T, Kimura S, Kasuya Y
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem. 281・48

      ページ: 36767-36775

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Involvement of p38alpha mitogen-activated protein kinase in lung metastasis of tumor cells.2006

    • 著者名/発表者名
      Matsuo Y, Amano S, Furuya M, Namiki K, Sakurai K, Nishiyama M, Sudo T, Tatsumi K, Kuriyama T, Kimura S, Kasuya Y.
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem. 281

      ページ: 36767-36775

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 実績報告書 2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Pathophysiology of Tumor Neovascularization.2005

    • 著者名/発表者名
      Furuya M, Nishiyama M, Kasuya Y, Kimura S, Ishikura H
    • 雑誌名

      Vasc. Health Risk Management 1・4

      ページ: 277-290

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] RGS4 and RGS5 are in vivo substrates of the N-end rule pathway.2005

    • 著者名/発表者名
      Lee MJ, Tasaki T, Moroi K, An JY, Kimura S, Davydov IV, Kwon YT
    • 雑誌名

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA 102・42

      ページ: 15030-15035

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Pathophysiology of Tumor Neovascularization.2005

    • 著者名/発表者名
      Furuya M, Nishiyama M, Kasuya Y, Kimura S, Ishikura H
    • 雑誌名

      Vasc. Health Risk Management I(4)

      ページ: 277-290

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] RGS4 and RGS5 are in vivo substrates of the N-end rule pathway.2005

    • 著者名/発表者名
      Lee MJ, Tasaki T, Moroi K, An JY, Kimura S, Davydov IV, Kwon YT
    • 雑誌名

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA 102

      ページ: 15030-15035

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Pathophysiology of Tumor Neovascularization.2005

    • 著者名/発表者名
      Furuya M, Nishiyama M, Kasuya Y, Kimura S, Ishikura H
    • 雑誌名

      Vasc.Health Risk Management 1・4

      ページ: 277-290

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] RGS4 and RGS5 are in vivo substrates of the N-end rule pathway.2005

    • 著者名/発表者名
      Lee MJ, Tasaki T, Moroi K, An JY, Kimura S, Davydov IV, Kwon YT
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA 102・42

      ページ: 15030-15035

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書

URL: 

公開日: 2005-04-01   更新日: 2016-04-21  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi