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病原放線菌Nocardiaのマイクロアレイ解析に基づく新しい分類基準

研究課題

研究課題/領域番号 17590385
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 細菌学(含真菌学)
研究機関千葉大学

研究代表者

三上 襄  千葉大学, 真菌医学研究センター, 教授 (40092100)

研究分担者 五ノ井 透  千葉大学, 真菌医学研究センター, 講師 (30134365)
研究期間 (年度) 2005 – 2006
研究課題ステータス 完了 (2006年度)
配分額 *注記
3,400千円 (直接経費: 3,400千円)
2006年度: 1,600千円 (直接経費: 1,600千円)
2005年度: 1,800千円 (直接経費: 1,800千円)
キーワードNocardia / taneno / 鑑別法 / gyrB遺伝子 / real time PCR / siderophore / 種の鑑別法
研究概要

申請者らは、世界に先駆けて病原放線菌で最も感染症の多いNocardiaの菌種であるNocardia forcinica IFM 10152株の全ゲノムを解析して2004年に報告した。本研究では、その情報やアレイ情報に基づいて、Nocardiaの菌種に特異的な遺伝子を探求した結果、N. forcinicaに特異的な遺伝子断片を見出した。この遺伝子は、ゲノム配列から検索するとN. forcinicaに特異的な蛋白の一部と考えられる(hypothetical protein nfa29510)の一部で、nfa29520に隣接した遺伝子であることが明らかになった。本遺伝子の解析結果から、N. forcinicaの菌種に特異的はPCR primerを作製することができ、その特異性が確認できた。マウスを用いて実験的なノカルジア症の血液中のN. farcinicaの検出にも、本PCR primerが有用であることが確認され、さらにRealTime PCRにも応用可能であることが明らかとなった。また、N. farcinicaのゲノム情報から、微生物にとって必須遺伝子であるgyrB遺伝子についても特異的な配列があることから、プライマーを作製して、60種の全ての菌種の遺伝子解析を完了することができた。その結果。gyrB遺伝子情報を用いるとNocardiaは同じ抗酸菌であるMycobacteriumやRhodococcusからは、それぞれ82%および76%の相同性値を基準に区別することが出来た。
細菌の分類においては、16SrDNAの配列情報が最も良く用いられており、Nocardiaにおいても基準法となっている。16SrDNAの場合に60種のNocardiaの菌種間の相違の幅は94.5-100.0%と極めて狭い範囲に多くの菌種が分布している。しかし、今回解析したgyrBでは、菌種の相違幅は,82.4-99.9%と格段に増加しており、菌種の解析力が極めて高くなり、その有用性が確認でき、新しい分類体系として提案した。GyrB遺伝子は、その長さは約1,200塩基であるが、その中で変異領域が約500-600塩基に集中していることから、1回のPCRで種の確定が可能な長さにおいて、その検討を進めている。

報告書

(3件)
  • 2006 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2005 実績報告書
  • 研究成果

    (22件)

すべて 2007 2006 2005

すべて 雑誌論文 (21件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Construction of a pair of practical Nocardia-Escherichia coli shuttle vectors.2007

    • 著者名/発表者名
      Chiba K
    • 雑誌名

      Jpn J Infect Dis 60

      ページ: 45-47

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Nocardia terpenica sp. nov., isolated from Japanese patients with nocardiosis.2007

    • 著者名/発表者名
      Hoshino Y
    • 雑誌名

      Int J Syst Evol Microbiol (In press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Nocardia terpenica sp. nov., isolated from Japanese patients with nocardiosis.2007

    • 著者名/発表者名
      Hoshino Y
    • 雑誌名

      Int J Syst Evol Microbiol (in press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Construction of a pair of practical Nocardia-Escherichia coli shuttle vectors.2007

    • 著者名/発表者名
      Chiba K, et al.
    • 雑誌名

      Jpn J Infect Dis 60

      ページ: 45-47

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Nocardia terpenica sp. nov., isolated from Japanese patients with nocardiosis.2007

    • 著者名/発表者名
      Hoshino Y, et al.
    • 雑誌名

      Int J Syst Evol Microbiol In press

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Nocardia exalbida sp. nov., isolated from Japanese patients with nocardiosis.2006

    • 著者名/発表者名
      Iida S
    • 雑誌名

      Int J Syst Evol Microbiol 56

      ページ: 1193-1196

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] First clinical isolate of Nocardia carnea, Nocardia elegans, Nocardia paucivorans, Nocardia puris and Nocardia takedensis from patients in Japan.2006

    • 著者名/発表者名
      Watanabe K
    • 雑誌名

      Jap J Med Mycol 47

      ページ: 85-89

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Gordonia araii sp. nov. and Gordonia effusa sp. nov. isolated from patients in Japan.2006

    • 著者名/発表者名
      Kageyama A
    • 雑誌名

      Int J Syst Evol Microbiol 56

      ページ: 1817-1821

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Majority of Actinomadura clinical isolates from sputa or bronchoalveolar lavage fluid in Japan belongs to the cluster of Actinomadura cremea and Actinomadura nitritigenes, and the description of Actinomadura chibensis sp. nov.2006

    • 著者名/発表者名
      Hanafy A
    • 雑誌名

      Mycopathologia 164

      ページ: 281-287

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Nocardia exalbida sp.nov., isolated from Japanese patients with nocardiosis.2006

    • 著者名/発表者名
      Iida S
    • 雑誌名

      Int J Syst Evol Microbiol 56

      ページ: 1193-1196

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Majority of Actinomadura clinical isolates from sputa or bronchoalveolar lavage fluid in Japan belongs to the cluster of Actinomadura cremea and Antinomadura nitritigenes, and the description of Actinomadura chibensis sp. nov.2006

    • 著者名/発表者名
      Hanafy A
    • 雑誌名

      Mucopathologia 164

      ページ: 281-287

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Nocardia exalbida sp. nov.,isolated from Japanese patients with nocardiosis.2006

    • 著者名/発表者名
      Iida S, et al.
    • 雑誌名

      Int J Syst Evol Microbiol 56

      ページ: 1193-1196

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] First clinical isolate of Nocardia carnea, Nocardia elegans, Nocardia paucivorans, Nocardia puris and Nocardia takedensis from patients in Japan.2006

    • 著者名/発表者名
      Waranabe K, et al.
    • 雑誌名

      Jap J Med Mycol 47

      ページ: 85-89

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Gordonia araii sp. nov. and Gordonia effusa sp. nov. isolated from patients in Japan.2006

    • 著者名/発表者名
      Kageyama A, et al.
    • 雑誌名

      Int J Syst Evol Microbiol 56

      ページ: 1817-1821

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Majority of Actinomadura clinical isolates from sputa or bronchoalveolar lavage fluid in Japan belongs to the cluster of Actinomadura cremea and Actinomadura nitritigenes, and the description of Actinomadura chibensis sp. nov.2006

    • 著者名/発表者名
      Hanafy A, et al.
    • 雑誌名

      Mycopathologia 164

      ページ: 281-287

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Nocardia anaemiae sp. nov. isolated from an immunocompromised patient and first isolation report of Nocardia vinacea from human2005

    • 著者名/発表者名
      Kageyama A, et al.
    • 雑誌名

      Japanese Journal of Medical Mycology 46

      ページ: 21-26

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Gorodnia otitidis sp. nov., isolated from a patient with external otitis2005

    • 著者名/発表者名
      Iida S, et al.
    • 雑誌名

      International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 55

      ページ: 1871-1876

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Nocardia cyriacigeorgica is a significant pathogen of nocardiosis in Japan and Thailand2005

    • 著者名/発表者名
      Kageyama A, et al.
    • 雑誌名

      Mycopathologia 160

      ページ: 15-19

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Nocardia concava sp. nov. isolated from Japanese patients2005

    • 著者名/発表者名
      Kageyama A, et al.
    • 雑誌名

      International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 55

      ページ: 2081-2083

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Biotransformation of bile acids by pathogenic Nocardia otitidiscaviarum and Amycolatopsis sp. strains2005

    • 著者名/発表者名
      Mukai A, et al.
    • 雑誌名

      Journal of Antibiotics 58

      ページ: 356-360

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Characterization of clinical isolates of pathogenic Nocardia strains and related actinomycetes in Thailand2005

    • 著者名/発表者名
      Poonwan N, et al.
    • 雑誌名

      Mycopathologia 159

      ページ: 361-368

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [図書] 感染症予防必携(第2版):放線菌症、ノカルジア症2005

    • 著者名/発表者名
      三上 襄(分担)
    • 総ページ数
      675
    • 出版者
      (財)日本公衆衛生協会(山崎修道他編)
    • 関連する報告書
      2005 実績報告書

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公開日: 2005-04-01   更新日: 2016-04-21  

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