臨床型DNAチップを用いた生検標本による大腸癌臨床診断システムの構築

• 研究課題/領域番号: 17591396
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 消化器外科学
• 研究機関: 大阪大学
• 研究代表者: 竹政 伊知朗 大阪大学, 医学系研究科, 助手 (50379252)
• 研究分担者: 山本 浩文 大阪大学, 医学系研究科, 助手 (30322184) ; 池田 正孝 大阪大学, 医学系研究科, 助手 (80335356) ; 関本 貢嗣 大阪大学, 医学系研究科, 助教授 (10273658)
• 研究期間 (年度): 2005 – 2006
• 研究課題ステータス: 完了 (2006年度)
• 配分額: 3,300千円 (直接経費: 3,300千円); 2006年度: 1,700千円 (直接経費: 1,700千円); 2005年度: 1,600千円 (直接経費: 1,600千円)
• キーワード: 大腸癌 / DNAチップ / 遺伝子発現プロファイル / 遺伝子診断システム / 生検標本 / 遣伝子診断システム

研究概要

本研究の目的は、DNAチップが持つ技術面、金銭面での問題点を改善し、これまでにわれわれが培ってきたcDNAマイクロアレイのノウハウを基に一般臨床への汎用化により、内視鏡下生検標本を対象とした個々の癌の生物学的特性に対応した体系的診断・医療を実践化することである。これまでに、ヒト全遺伝子に対して特異的配列をもったオリゴDNA(30000種類)を搭載したヒト全遺伝子型DNAチップを用い200例以上の大腸癌の遺伝子発現情報を取得し、転移・再発予後・再発形式の予測診断システムを確立するとともに、それぞれ関連遺伝子群の同定を行っている。
具体的には、1)平成17年度より術前内視鏡標本とその隣接生検病理情報、および手術切除標本と臨床病理学的情報を集積し、2)収集された大腸癌切除標本からmRNAを抽出し、超微量mRNA分析用マイクロラボチップによるquality checkを行なった上で、target DNA(臨床検体)の調整を進め、3)予備検討により決定されたプロトコールに従い一定条件下でヒト全遺伝子型オリゴDNAチップおよび臨床診断用DNAチップによる遺伝子情報を取得し、予測モデル式を構築しその精度を検証した。現在までに同一症例の腫瘍と正常部分から採取された2ヶ所の生検標本の解析より、腫瘍内組織不均性は腫瘍間組織差異より小さく、一ヶ所の生検でその腫瘍の代表的遺伝子発現プロファイルを取得できること、また正常、腺腫、癌の違いはほぼ完全に判別可能であることがわかった。

研究成果

• [雑誌論文] Hypoxia-induced up-regulation of angiopoietin-2 in colorectal cancer. (2006)
  • 著者名/発表者名: Gu J., et al.
  • 雑誌名: Oncol Rep 15(4) ページ: 779-783
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Central genetic alterations common to all HCV-positive, HBV-positive and non-B, non-C hepatocellular carcinoma : a new approach to identify novel tumor markers. (2006)
  • 著者名/発表者名: Kurokawa Y., et al.
  • 雑誌名: Int J Oncol 28(2) ページ: 383-391
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Construction of a novel DNA decoy that inhibits the oncogenic beta-catenin/T-cell factor pathway. (2006)
  • 著者名/発表者名: Seki Y., et al.
  • 雑誌名: Mol Cancer Ther 5(4) ページ: 985-994
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Antisense to cyclin D1 inhibits, vascular endothelial growth factor-stimulated growth of vascular endothelial cells : implication of tumor vascularization. (2006)
  • 著者名/発表者名: Yasui M., et al.
  • 雑誌名: Clin Cancer Res 12(15) ページ: 4720-4729
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Prediction of peritoneal metastasis in advanced gastric cancer by gene expression profiling of the primary site. (2006)
  • 著者名/発表者名: Motoori M., et al.
  • 雑誌名: Eur J Cancer 42 ページ: 1897-1903
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Expression and Mutation of SMAD4 in poorly Differentiated Carcinoma and Signet-ring Cell Carcinoma of the Colorectum. (2006)
  • 著者名/発表者名: Seshimo I., et al.
  • 雑誌名: J. Exp. Clin. Cancer Res 25 ページ: 433-442
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Low-dose oxaliplatin enhances the antitumor efficacy of paclitaxel in human gastric cancer cell lines. (2006)
  • 著者名/発表者名: Gu J., et al.
  • 雑誌名: Digestion 74(1) ページ: 19-27
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Expression of PPARdelta in multistage carcinogenesis of the colorectum : implications of malignant cancer morphology. (2006)
  • 著者名/発表者名: Takayama O., et al.
  • 雑誌名: Br J Cancer 95(7) ページ: 889-895
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Correlation of GLUT-1 Overexpression, Tumor Size, and Depth of Invasion with 18F-2-fluoro-2-deoxy-D : -glucose Uptake by Positron Emission Tomography in Colorectal Cancer. (2006)
  • 著者名/発表者名: Gu J., et al.
  • 雑誌名: Dig Dis Sci 11(3) ページ: 2198-2205
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Involvement of ribonucleotide reductase M1 subunit overexpression in gemcitabine resistance of human pancreatic cancer. (2006)
  • 著者名/発表者名: Nakahira S., et al.
  • 雑誌名: Int J Cancer 27 120(6) ページ: 1355-1363
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Hypoxia-induced up-regulation of angiopoietin-2 in colorectal cancer. (2006)
  • 著者名/発表者名: Gu J., Yamamoto H., Ogawa M., Ngan C.Y., Danno K., Hemmi H., Kyo N., Takemasa I., Ikeda M., Sekimoto M., Monden M.
  • 雑誌名: Oncol Rep. 15(4) ページ: 779-783
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Central genetic alterations common to all HCV-positive, HBV-positive and non-B, non-C hepatocellular carcinoma : a new approach to identify novel tumor markers. (2006)
  • 著者名/発表者名: Kurokawa Y., Honma K., Takemasa I., Nakamori S., Kita-Matsuo H., Motoori M, Nagano H, Dono K, Ochiya T., Monden M, Kato K.
  • 雑誌名: Int J Oncol. 28(2) ページ: 383-391
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Construction of a novel DNA decoy that inhibits the oncogenic beta-catenin/T-cell factor pathway. (2006)
  • 著者名/発表者名: Seki Y, Yamamoto H, Yee Ngan C, Yasui M, Tomita N, Kitani K, Takemasa I, Ikeda M, Sekimoto M, Matsuura N, Albanese C, Kaneda Y, Pestell RG, Monden M.
  • 雑誌名: Mol Cancer Ther. 5(4) ページ: 985-994
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Antisense to cyclin DI inhibits vascular endothelial growth factor-stimulated growth of vascular endothelial cells : implication of tumor vascularization. (2006)
  • 著者名/発表者名: Yasui M, Yamamoto H., Ngan CY., Damdinsuren B., Sugita Y., Fukunaga H., Gu J., Maeda M., Takemasa I., Ikeda M., Fujio Y, Sekimoto M., Matsuura N., Weinstein IB., Monden M.
  • 雑誌名: Clin Cancer Res. 12(15) ページ: 4720-4729
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Prediction of peritoneal metastasis in advanced gastric cancer by gene expression profiling of the primary site. (2006)
  • 著者名/発表者名: Motoori M., Takemasa I., Doki Y., Saito S., Miyata H., Takiguchi S., Fujiwara Y, Yasuda T., Yano M., Kurokawa Y., Komori T., Yamasaki M., Ueno N., Oba S., Ishii S., Monden M., Kato K.
  • 雑誌名: Eur J Cancer 42 ページ: 1897-1903
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Expression and Mutation of SMAD4 in poorly Differentiated Carcinoma and Signet-ring Cell Carcinoma of the Colorectum. (2006)
  • 著者名/発表者名: Seshimo I, Yamamoto H., Mishima H., Kurata A., Suzuki R., Ezumi K., Takemasa 1., Ikeda M., Fukushima T., Tujinaka T., Sekimoto M., Kikkawa N., Takenoshita S., Monden M.
  • 雑誌名: J.Exp.Clin.Cancer Res 25 ページ: 433-442
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Low-dose oxaliplatin enhances the antitumor efficacy of paclitaxel in human gastric cancer cell lines. (2006)
  • 著者名/発表者名: Gu J., Yamamoto H., Lu X., Ngan CY., Tsujino T., Konishi K., Takemasa I., Ikeda M., Nagata H., Hashimoto S., Matsuzaki T., Sekimoto M., Takagi A., Monden M.
  • 雑誌名: Digestion. 74(1) ページ: 19-27
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Expression of PPARdelta in multistage carcinogenesis of the colorectum : implications of malignant cancer morphology. (2006)
  • 著者名/発表者名: Takayama 0., Yamamoto H., Damdinsuren B., Sugita Y., Ngan CY., Xu X., Tsujino T., Takemasa I., Ikeda M., Sekimoto M., Matsuura N., Monden M.
  • 雑誌名: Br J Cancer 95(7) ページ: 889-895
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Correlation of GLUT-1 Overexpression, Tumor Size, and Depth of Invasion with 18F-2-fluoro-2-deoxy-D : -glucose Uptake by Positron Emission Tomography in Colorectal Cancer. (2006)
  • 著者名/発表者名: Gu J., Yamamoto H, Fukunaga H, Danno K, Takemasa I, Ikeda M, Tatsumi M, Sekimoto M, Hatazawa J, Nishimura T, Monden M.
  • 雑誌名: Dig Dis Sci. 11(3) ページ: 2198-205
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Involvement of ribonuclectide reductase M1 Subunit overexpression in gemcttabine resistance of human pancreatic cancer. (2006)
  • 著者名/発表者名: Nakahira S., et al.
  • 雑誌名: Int J Canet 27 120(6) ページ: 1355-63
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Hypoxia-induced up-regulation of angiopoietin-2 in colorectal cancer. (2006)
  • 著者名/発表者名: Gu J., Yamamoto H., Ogawa M., Ngan C.Y., Danno K., Hemmi H., Kyo N., Takemasa I., Ikeda M., Sekimoto M., Monden M.
  • 雑誌名: Oncol Rep 15(4) ページ: 779-783
• [雑誌論文] Central genetic alterations common to all HCV-positive, HBV-positive and non-B, non-C hepatocellular carcinoma : a new approach to identify novel tumor markers. (2006)
  • 著者名/発表者名: Kurokawa Y., Honma K., Takemasa I., Nakamori S., Kita-Matsuo H., Motoori M, Nagano H, Dono K, Ochiya T., Monden M, Kato K.
  • 雑誌名: Int J Oncol 28(2) ページ: 383-391
• [雑誌論文] Construction of a novel DNA decoy that inhibits the oncogenic beta-catenin/T-cell factor pathway. (2006)
  • 著者名/発表者名: Seki Y, Yamamoto H, Yee Ngan C, Yasui M, Tomita N, Kitani K, Takemasa I, Ikeda M, Sekimoto M, Matsuura N, Albanese C, Kaneda Y, Pestell RG, Monden M.
  • 雑誌名: Mol Cancer Ther 5(4) ページ: 985-994
• [雑誌論文] Antisense to cyclin D1 inhibits vascular endothelial growth factor-stimulated growth of vascular endothelial cells : implication of tumor vascularization. (2006)
  • 著者名/発表者名: Yasui M, Yamamoto H., Ngan CY., Damdinsuren B., Sugita Y., Fukunaga H., Gu J., Maeda M., Takemasa I., Ikeda M., Fujio Y., Sekimoto M., Matsuura N., Weinstein IB., Monden M.
  • 雑誌名: Clin Cancer Res 12(15) ページ: 4720-4729
• [雑誌論文] Prediction of peritoneal metastasis in advanced gastric cancer by gene expression profiling of the primary site. (2006)
  • 著者名/発表者名: Motoori M., Takemasa I., Doki Y., Saito S., Miyata H., Takiguchi S., Fujiwara Y., Yasuda T., Yano M., Kurokawa Y., Komori T., Yamasaki M., Ueno N., Oba S., Ishii S., Monden M., Kato K.
  • 雑誌名: Eur J Cancer 42 ページ: 1897-1903
• [雑誌論文] Expression and Mutation of SMAD4 in poorly Differentiated Carcinoma and Signet-ring Cell Carcinoma of the Colorectum. (2006)
  • 著者名/発表者名: Seshimo I, Yamamoto H., Mishima H., Kurata A., Suzuki R., Ezumi K., Takemasa I., Ikeda M., Fukushima T., Tujinaka T., Sekimoto M., Kikkawa N., Takenoshita S., Monden M
  • 雑誌名: J. Exp. Clin. Cancer Res 25 ページ: 433-442
• [雑誌論文] Low-dose oxaliplatin enhances the antitumor efficacy of paclitaxel in human gastric cancer cell lines. (2006)
  • 著者名/発表者名: Gu J., Yamamoto H., Lu X., Ngan CY., Tsujino T., Konishi K., Takemasa I., Ikeda M., Nagata H., Hashimoto S., Matsuzaki T., Sekimoto M., Takagi A., Monden M.
  • 雑誌名: Digestion 74(1) ページ: 19-27
• [雑誌論文] Expression of PPARdelta in multistage carcinogenesis of the colorectum : implications of malignant cancer morphology. (2006)
  • 著者名/発表者名: Takayama O., Yamamoto H., Damdinsuren B., Sugita Y., Ngan CY., Xu X., Tsujino T., Takemasa I, Ikeda M., Sekimoto M., Matsuura N., Monden M.
  • 雑誌名: Br J Cancer 95(7) ページ: 889-895
• [雑誌論文] Correlation of GLUT-1 Overexpression, Tumor Size, and Depth of Invasion with 18F-2-fluoro-2-deoxy-D : -glucose Uptake by Positron Emission Tomography in Colorectal Cancer. (2006)
  • 著者名/発表者名: Gu J., Yamamoto H, Fukunaga H, Danno K, Takemasa I, Ikeda M, Tatsumi M, Sekimoto M, Hatazawa J, Nishimura T, Monden M.
  • 雑誌名: Dig Dis Sci 11(3) ページ: 2198-2205
• [雑誌論文] Involvement of ribonucleotide reductase M1 subunit overexpression in gemcitabine resistance of human pancreatic cancer. (2006)
  • 著者名/発表者名: Nakahira S, Nakamori S., Tsujie M., Takahashi Y., Okami J., Yoshioka S., Yamasaki M., Marubashi S., Takemasa I., Miyamoto A., Takeda Y., Nagano H., Dono K., Umeshita K., Sakon M., Monden M.
  • 雑誌名: Int J Cancer 27 120(6) ページ: 1355-1363
• [雑誌論文] Central genetic alterations common to all HCV-positive, HBV-positive and non-B, non-C hepatocellular carcinoma : a new approach to identify novel tumor markers. (2006)
  • 著者名/発表者名: Kurokawa Y, Honma K, Takemasa I, Nakamori S, Kita-Matsuo H, Motoori M, Nagano H, Dono K, Ochiya T, Monden M, Kato K.
  • 雑誌名: Int J Oncnl. 28(2) ページ: 383-391
• [雑誌論文] Prediction of recurrence in advanced gastric cancer patients after curative resection by gene expression profiling. (2005)
  • 著者名/発表者名: Motoori M, Takemasa I, Yano M, Saito S, Miyata H, Takiguchi S, Fujiwara Y, Yasuda T, Doki Y, Kurokawa Y, Ueno N, Oba S, Ishii S, Monden M, Kato K.
  • 雑誌名: Int J Cancer 114(6) ページ: 963-968
• [雑誌論文] DNAマイクロアレイを用いたトランスクリプトーム解析による腫瘍マーカーの探索 (2005)
  • 著者名/発表者名: 小森孝通, 竹政伊知朗, 山崎誠, 本告正明, 吉岡慎一, 小山太一, 池田正孝, 山本浩文, 関本貢嗣, (松原謙一), 門田守人
  • 雑誌名: 日本分子腫瘍マーカー研究会誌 20 ページ: 76-77
  • NAID: 130004436355
• [雑誌論文] 肝細胞癌・化学療法感受性予測-IFN/5FU併用療法の効果予測- (2005)
  • 著者名/発表者名: 黒川幸典, 永野浩昭, 門田守人
  • 雑誌名: 肝臓 46・10 ページ: 35-39
• [図書] 『消化器病学の進歩2005-モノグラフ 消化器病学のニューフロンティア編』DNA chipの癌臨床への応用-大腸癌診断用DNA chip(Mini Chip)の開発・作製-(荒川泰行 編集) (2005)
  • 著者名/発表者名: 山崎誠, 竹政伊知朗, 門出守人
  • 総ページ数: 407
  • 出版者: 財団法人日本消化器病学会
• [図書] 『癌転移のメカニズムがよくわかる 肺転移のすべて』2.網羅的遺伝子・タンパク解析 1)DNAマイクロアレイ (2005)
  • 著者名/発表者名: 竹政伊知朗, 池田正孝, 山本浩文, 関本貢嗣, 門田守人
  • 総ページ数: 146
  • 出版者: 永井書店