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共生がもたらす超深海への適応:ナラクハナシガイ共生細菌の代謝機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 17613010
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 極限環境生物学
研究機関独立行政法人海洋研究開発機構

研究代表者

藤原 義弘  独立行政法人海洋研究開発機構, 極限環境生物圏研究センター, サブリーダー (20344294)

研究期間 (年度) 2005 – 2007
研究課題ステータス 完了 (2007年度)
配分額 *注記
3,610千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 210千円)
2007年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2006年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
2005年度: 1,700千円 (直接経費: 1,700千円)
キーワードナラクハナシガイ / 共生現象 / 化学合成 / 硫黄細菌 / 超深海 / SoxB遺伝子 / 二重共生 / 蛍光in situハイブリダイゼーション / 化学合成生態系 / 機能遺伝子 / SoxB / 還元環境 / 海洋生態 / 共焦点顕微鏡 / 共生 / 遺伝子 / 細菌
研究概要

本研究の目的は超深海の還元的極限環境に生息するナラクハナシガイについて,共生細菌の代謝機能を明らかにし,環境適応メカニズムを解明することにある.ナラクハナシガイは日本海溝の水深7千メートルを超える湧水域に生息するハナシガイ科二枚貝であり,鰓上皮細胞内に無数の細菌を宿す.この二枚貝は明瞭に系統の異なる2種類の共生細菌を宿し,これら2種類の細菌は鰓内で空間的住み分けを行う.
平成17年度からナラクハナシガイ共生細菌の代謝に関わる遺伝子の探索を試みた.これまで近縁性が指摘されていたシロウリガイ類の共生硫黄細菌の遺伝子配列をもとに,硫黄代謝に関わる重要な遺伝子であるSoxB遺伝子に特異的なプライマーを作成した.PCR条件を調整した結果,平成19年度には作成したプライマーを用いてナラクハナシガイ鰓のトータルDNAから顕著PCR増幅を確認した.このことから,少なくとも2種の共生細菌のうちの1種は硫黄細菌であることが判明し,これまで16SリボゾームRNA遺伝子配列を用いた系統解析のみから推定していた細菌の機能を,機能遺伝子解析によって明確に示すことができた.
また平成18年度には代謝遺伝子の局在性を明らかにするための予備実験として,試料の得やすい共生イガイ科二枚貝であるヒラノマクラの鰓を用いた蛍光in situハイブリダイゼーション(FISH)実験を実施した.その結果,固定試薬および時間がFISH結果に大きな影響を及ぼすことを見出した.現状では新鮮なナラクハナシガイ試料を用いて固定処理を行うことは不可能であり,どちらの細菌が硫黄酸化を担うのかを特定するためには大深度に潜航可能な調査機器の再配備を待たねばならない.
本研究では超深海の還元環境に生息するナラクハナシガイ共生システムの代謝機能の一部を明らかにした.硫黄酸化による化学合成が超深海域でも可能であるという事実は今後,共生無脊椎動物の生物地理や進化を考える上でも有用な知見となるであろう.

報告書

(4件)
  • 2007 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2006 実績報告書
  • 2005 実績報告書
  • 研究成果

    (30件)

すべて 2008 2007 2006 2005

すべて 雑誌論文 (20件) (うち査読あり 9件) 学会発表 (10件)

  • [雑誌論文] Molecular identification of the ichthyosporean protist Pseudoperkinsus tapetis from the mytilid mussel Adipicola pacifica associated with submerged whale carcasses in Japan2008

    • 著者名/発表者名
      Kiyotaka Takishita
    • 雑誌名

      Marine Biotechnology 10

      ページ: 13-18

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Neptunomonas japonica sp.nov.,an Osedax japonicus symbiont-like bacterium isolated from sediment adjacent to sperm whale carcasses off Kagoshima,Japan2008

    • 著者名/発表者名
      Masayuki Miyazaki
    • 雑誌名

      IJSEM 58

      ページ: 866-871

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular identification of the ichthyosporean protist Pseudoperkinsus tapetis from the mytilid mussel Adipicola pacifica associated with submerged whale carcasses in Japan2008

    • 著者名/発表者名
      Takishita, K.
    • 雑誌名

      Marine Biotechnology 10

      ページ: 13-18

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Neptunomonas japonica sp. nov., an Osedax japonicus symbiont-like bacterium isolated from sediment adjacent to sperm whale carcasses off Kagoshima, Japan2008

    • 著者名/発表者名
      Miyazaki, M.
    • 雑誌名

      IJSEM 68

      ページ: 866-871

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Molecular identification of the ichthyosporean protist Pseudoperkinsus tapetis from the mytilid mussel Adipicola pacifica associated with submerged whale carcasses in Japan2008

    • 著者名/発表者名
      Takishita, K
    • 雑誌名

      Marine Biotechnology 10

      ページ: 13-18

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Neptunomonas japonica sp.nov.,an Osedax japonicus symbiont-like bacterium isolated from sediment adjacent to sperm whale carcasses off Kagoshima,Japan2008

    • 著者名/発表者名
      Miyazaki
    • 雑誌名

      International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 58

      ページ: 866-871

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Three-year investigations into sperm whale-fall ecosystems in Japan.2007

    • 著者名/発表者名
      Yoshihiro Fujiwara
    • 雑誌名

      Marine Ecology 28

      ページ: 219-232

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Reduced genome of the thioautotrophic intracellular symbiont in a deep-sea clam,Calyptogena okutanii2007

    • 著者名/発表者名
      Hirokazu Kuwahara
    • 雑誌名

      Current Biology 17

      ページ: 881-886

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Three-year investigations into sperm whale-fall ecosystems in Japan.2007

    • 著者名/発表者名
      Fujiwara, Y.
    • 雑誌名

      Marine Ecology 28

      ページ: 219-232

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Reduced genome of the thioautotrophic intracellular symbiont in a deep-sea clam, Calyptogena okutanii2007

    • 著者名/発表者名
      Kuwahara, H.
    • 雑誌名

      Current Biology 17

      ページ: 881-886

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Reduced genome of the thioautotrophic intracellular symbiont in a deep-sea clam, Calyptogena okutanii2007

    • 著者名/発表者名
      Kuwahara, H
    • 雑誌名

      Current Biology 17

      ページ: 881-886

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Three-year investigation into sperm whala-fall ecosystems in Japan2007

    • 著者名/発表者名
      fujiwara et al.
    • 雑誌名

      Marine Ecology 28

      ページ: 219-232

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Evolutionary relationships of deep-sea mussels inferred by mitochondrial DNA sequences2006

    • 著者名/発表者名
      Hiromi Iwasaki
    • 雑誌名

      Marine Biology 149

      ページ: 1111-1122

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Evolutionary relationships of deep-sea mussels inferred by mitochondrial DNA sequences2006

    • 著者名/発表者名
      Iwasaki, H.
    • 雑誌名

      Marine Biology 149

      ページ: 1111-1122

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Evolutionary relationships of deep-sea mussels inferred by mitochondrial DNA sequences2006

    • 著者名/発表者名
      Iwasaki H, Kyuno A, Shintaku M, fujita Y, Fujiwara Y, Fujikura K, Hashimoto J, Martins LD, Gebruk A, Miyazaki Jl
    • 雑誌名

      Marine Biology 149

      ページ: 1111-1122

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] 深海底の化学合成共生システム2005

    • 著者名/発表者名
      藤原義弘
    • 雑誌名

      生物工学 83巻10号

      ページ: 466-468

    • NAID

      110002954146

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要 2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Four protobranch bivalves collected by the ROV Kaiko from hadal depths in the Japan Trench2005

    • 著者名/発表者名
      Takashi Okutani
    • 雑誌名

      Venus 63

      ページ: 87-94

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Four protobranch bivalves collected by the ROV Kaiko from hadal depths in the Japan Trench2005

    • 著者名/発表者名
      Okutani, T.
    • 雑誌名

      Venus 63

      ページ: 87-94

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Four protobranch bivalves collected by the ROV Kaiko from hadal depths in the Japan Trench2005

    • 著者名/発表者名
      Okutani, Fujiwara
    • 雑誌名

      VENUS 63

      ページ: 87-94

    • NAID

      110004856831

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] 鯨骨生物群集で発見された新種ナメクジウオ2005

    • 著者名/発表者名
      窪川かおる, 藤原義弘
    • 雑誌名

      うみうし通信 49

      ページ: 8-9

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [学会発表] 化学合成共生システムの進化における生物起源化学合成環境(Biogenic Chemosynthetic Environment)の重要性2008

    • 著者名/発表者名
      藤原義弘
    • 学会等名
      ブルーアース'08
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2008-03-14
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] The significance of biogenic chemosynthetic environments in evolution of chemosynthetic symbiosis2008

    • 著者名/発表者名
      Yoshihiro FUJIWARA
    • 学会等名
      Blue Earth '08
    • 発表場所
      Yokohama
    • 年月日
      2008-03-14
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Symbioses at whale falls2007

    • 著者名/発表者名
      Yoshihiro FUJIWARA
    • 学会等名
      1st EuroDEEP Workshop
    • 発表場所
      タオルミナ(イタリア)
    • 年月日
      2007-11-27
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書 2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Symbioses at whale falls2007

    • 著者名/発表者名
      Yoshihiro FUJIWARA
    • 学会等名
      1st EuroDEEP Workshop
    • 発表場所
      Taormina, Italy
    • 年月日
      2007-11-27
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] 鯨骨を用いた実験的生物地理学2007

    • 著者名/発表者名
      藤原義弘
    • 学会等名
      ブルーアース'07
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2007-03-09
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Experimental biogeography using whale falls2007

    • 著者名/発表者名
      Yoshihiro FUJIWARA
    • 学会等名
      Blue Earth '07
    • 発表場所
      Yokohama
    • 年月日
      2007-03-09
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Whale-fall ecosystems and associated symbioses around Japan2007

    • 著者名/発表者名
      Yoshihiro FUJIWARA
    • 学会等名
      Diwood Workshop
    • 発表場所
      グアデロープ(フランス)
    • 年月日
      2007-02-19
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Whale-fall ecosystems and associated symbioses around Japan2007

    • 著者名/発表者名
      Yoshihiro FUJIWARA
    • 学会等名
      Diwood Workshop
    • 発表場所
      Guadeloupe, France
    • 年月日
      2007-02-19
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] 鹿児島県野間岬沖・鯨骨生物群集調査〜地理的ステッピング・ストーンから進化的ステッピング・ストーンへ2006

    • 著者名/発表者名
      藤原義弘
    • 学会等名
      ブルーアース'06
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2006-02-23
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Shallow-water whale-fall ecosystems in Japan - An evolutionary stepping stone for chemosynthetic symbioses2006

    • 著者名/発表者名
      Yoshihiro FUJIWARA
    • 学会等名
      Blue Earth '06
    • 発表場所
      Yokohama
    • 年月日
      2006-02-23
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要

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公開日: 2005-04-01   更新日: 2016-04-21  

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