| 研究課題/領域番号 |
17710164
|
|---|
| 研究種目 |
若手研究(B)
|
| 配分区分 | 補助金 |
|---|
| 研究分野 |
基礎ゲノム科学
|
|---|
| 研究機関 | 順天堂大学 |
|---|
研究代表者 |
竹内 史比古 順天堂大学, 大学院・医学研究科, 講師 (50384152)
|
|---|
| 研究期間 (年度) |
2005 – 2006
|
| 研究課題ステータス |
完了 (2006年度)
|
| 配分額 *注記 |
3,200千円 (直接経費: 3,200千円)
2006年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
2005年度: 2,200千円 (直接経費: 2,200千円)
|
|---|
| キーワード | ゲノム進化 / 水平伝播 / 垂直伝播 / 相同遺伝子グループ / ブドウ球菌 / oriC environ / genomic island |
|---|
| 研究概要 |
ブドウ球菌属を対象に、垂直・水平伝播を網羅的に同定することによりゲノム進化を解明した。Staphylococcus aureus, S. epideriDidis, S. haemolyticusの3種10株の網羅的比較により、ブドウ球菌の種分化は、染色体の中でも複製起点の周囲の領域(oriCenviron)が多様化することによりもたらされていることを明らかにした。この現象は、新たにゲノム解読されたS. saprophyticusにおいても確認された。ブドウ球菌属にはメチシリン耐性などをもたらすSCCmecという水平伝播因子がある。SCCmecはoriCenviron中の複製起点に近い側に含まれている。oriC environの形成については、SCCmecの関わりが推察されるが、まだ解明できていない。一方、ブドウ球菌属に最も近いBacillus属においても、複製起点の周囲の領域が種により異なっていることを見つけた。Bacillus属には、SCCmecに類似する領域も存在するが、それはoriC environ類似領域とは複製起点を挟んで反対側に位置していた。その他の細菌においては、複製起点の周囲での種の多様性は確認できなかった。このことから、oriC environはブドウ球菌あるいはその近縁に限られた、種分化の仕組であると結論づけられる。これらの成果について、12th International Symposium on Staphylococci and Staphylococcal Infections(マーストリヒト)において発表した。またゲノム進化解析の手法についても出版している(Ji、Yindou編Methicillin-ResistantStaphylococcus aureus(MRSA)Protocols、Humana Press)。
|
