• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

天然mRNAを利用した全長蛋白質ディスプレーと蛋白質相互作用解析

研究課題

研究課題/領域番号 17750157
研究種目

若手研究(B)

配分区分補助金
研究分野 生体関連化学
研究機関京都大学

研究代表者

山東 信介  京都大学, 工学研究科, 助手 (20346084)

研究期間 (年度) 2005 – 2006
研究課題ステータス 完了 (2006年度)
配分額 *注記
3,500千円 (直接経費: 3,500千円)
2006年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
2005年度: 2,500千円 (直接経費: 2,500千円)
キーワードリボソーム / ディスプレー / 蛋白質 / 相互作用 / 細胞 / 活性 / mRNA / 解析 / 試験管内進化 / 網羅的 / 非翻訳領域 / tRNA / 探索
研究概要

天然型mRNAを荷札として用い、かつ、全長蛋白質を提示できる改良型リボソームディスプレー法の開発を目標とする。具体的には、終止コドンを読み飛ばし、その後に続く非翻訳領域をリンカーとして利用可能な改変翻訳系の構築を目指した。昨年度においては原核系翻訳システムにおけるコンセプトレベルでの具現化を実施、RNAの安定性、リボソームディスプレー後のRNA回収率から再構成蛋白質翻訳系を用いた改変翻訳系の構築を検討した。また、3種の終止コドンを効率的に読み飛ばすことが可能なサプレッサーtRNAの探索を行ない、サプレッション効率、また、3種の終止コドンに対する適応性の点からtRNAserを基本とする3種サプレッサーが本系の目的を満たすことを見出している(サプレッション効率向上のため、Release Factor非含有翻訳システムを利用した)。また、天然型と同じ配列の(かつ、様々な長さの)3'側非翻訳領域を有する擬似天然型Dihydrofolate Reductase mRNAを人工的に準備し、作成した改変翻訳系でのリボソームディスプレーを実施した。終始コドンより3末端側にT7-tagを組み込んでおいたところ、T7抗体によるタグ釣り上げが可能であり、この結果より、本系において終始コドンの読み飛ばし、3'-UTRのリンカーとしての利用が可能であることが示された。また、DHFRの配列を標的とする抗体を用いた実験も実施した。併せて、終結因子を取り除いた非再構成型タンパク質翻訳システムの調整を目的とし、RF1に対するRNAアプタマーを取得、サプレッション効率を上昇させる系の構築にも成功した。

報告書

(2件)
  • 2006 実績報告書
  • 2005 実績報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて 2006 その他

すべて 雑誌論文 (2件) 産業財産権 (2件)

  • [雑誌論文] Termination-Free Prokaryotic Protein Translation by Using Anticodon-adjusted E.coli tRNASer as Unified Suppressors of the UAA/UGA/UAG stop codons. Read-Through Ribosome Display of Full-Length DHFR with Translated UTR as a Buried Spacer Arm2006

    • 著者名/発表者名
      Atsushi Ogawa, Shisnuke Sando, Yasuhiro Aoyama
    • 雑誌名

      ChemBioChem 7

      ページ: 249-252

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Termination-free prokaryotic protein translation by using anticodon-adjusted E.coli tRNA Ser as unified suppressors of the UAA/UGA/UAG stop codons. Read-through ribosome display of full-length DHFR with translated UTR as a buried spacer arm.2006

    • 著者名/発表者名
      Atsushi Ogawa, Shinsuke Sando, Yasuhiro Aoyama
    • 雑誌名

      ChemBioChem 7・2

      ページ: 249-252

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [産業財産権] タンパク質の表示方法

    • 発明者名
      青山安宏他2名
    • 産業財産権番号
      2006-552409
    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [産業財産権] タンパク質の表示方法

    • 発明者名
      青山 安宏, 山東 信介, 小川 敦
    • 関連する報告書
      2005 実績報告書

URL: 

公開日: 2005-04-01   更新日: 2016-04-21  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi