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プロテオミクス基盤技術としてのリガンド-情報分子コンジュゲート創製

研究課題

研究課題/領域番号 17750165
研究種目

若手研究(B)

配分区分補助金
研究分野 生体関連化学
研究機関東京大学 (2006)
九州大学 (2005)

研究代表者

野島 高彦  東京大学, 生産技術研究所, 助手 (00291930)

研究期間 (年度) 2005 – 2006
研究課題ステータス 完了 (2006年度)
配分額 *注記
3,500千円 (直接経費: 3,500千円)
2006年度: 1,300千円 (直接経費: 1,300千円)
2005年度: 2,200千円 (直接経費: 2,200千円)
キーワード蛋白質 / ペプチド / 生体分子 / プローブ / チップ / ヌクレオチド / 共有結合 / コンジュゲート / プロテオミクス / DNA / 生体分子間相互作用 / マスキング / インタフェース
研究概要

蛋白質やペプチドなどの生体分子を固体表面に保持するための手法を開発することを本申請課題の目標とした.そのための第一段階として,ペプチドをプローブとして保持したチップ上において,ペプチド-蛋白質相互作用を行うための分析手法を開発した.ここではペプチドをオリゴヌクレオチドとのコンジュゲートとして調製することによって,疎水性ペプチドであっても水溶液中において取り扱い可能となることを期待するとともに,先行するDNAチップ技術を取り込むことを目論んだ.また,オリゴヌクレオチドコンジュゲートの二重鎖置換能を利用することによって,新しい概念の生体分子間相互作用検出法を実現することも目標とした.
リガンドをオリゴヌクレオチドと共有結合することによって,分子間相互作用の特異性が損なわれる恐れがある.そこでオリゴヌクレオチドと共有結合したリガンド分子と,水溶液中のリガンド分子とによる競争標的蛋白質結合実験を行い,生体分子間相互作用能を維持した状態でのリガンド固定法を実現するための基礎的知見を得た.
続いて,オリゴヌクレオチド分子が可逆的に二重鎖を形成および解離する性質を利用して,リガンド分子を固体表面上において可逆的に着脱する分子操作法確立を試みた.分子鎖置換における熱力学的最適条件の検討を含め,基礎なデータを収集し,オリゴヌクレオチド分子がコードする情報を用いて生体分子間相互作用の有無を検出する,新しい概念の分析手法を実現した.
さらに,リガンド-情報分子コンジュゲートをマイクロリアクター内に導入し,微小空間内における分子鎖置換反応を達成するための予備的検討にとりくんだ.約1cm四方のDNAチップ上にマイクロ流路を組み合わせたマイクロ流体デバイスを作製し,これを用いた生体分子ハンドリングに関する基礎的知見を得た.

報告書

(2件)
  • 2006 実績報告書
  • 2005 実績報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて 2007 2006 2005

すべて 雑誌論文 (12件)

  • [雑誌論文] Direct modification of mRNA by ferrocenylcarbodiimide and its application for electrochemical detection of mRNA2007

    • 著者名/発表者名
      K.Mukumoto et al.
    • 雑誌名

      Analytical Sciences 23

      ページ: 115-119

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Detection of cRNA hybridized on a DNA chip using tetrakis-acridinyl peptide (TAP) cassette, consisting of TAP and partial self-complementary oligonucleotide, d[A18(TA)5]2007

    • 著者名/発表者名
      K.Kawaai et al.
    • 雑誌名

      Analytical Sciences 23

      ページ: 267-270

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Ferrocenylnaphthalene diimide-based electrochemical detection of methylated gene2006

    • 著者名/発表者名
      S.Sato et al.
    • 雑誌名

      Analytica Chimica Acta 578

      ページ: 82-87

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Tetrakis-acridinyl peptide : Distance dependence of photoinduced electron transfer in DNA duplex2006

    • 著者名/発表者名
      K.Mizuki et al.
    • 雑誌名

      Analytica Chimica Acta 578

      ページ: 88-92

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] G quadruplex-based FRET probes with the thrombin-binding aptamer (TBA) sequence designed for the efficient fluorometric detection of potassium ion2006

    • 著者名/発表者名
      S.Nagatoishi et al.
    • 雑誌名

      ChemBioChem 7

      ページ: 1730-1737

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Fluorescence energy transfer probes based on the guanine quadruplex formation for the fluorometric detection of potassium ion2006

    • 著者名/発表者名
      S.Nagatoishi et al.
    • 雑誌名

      Analytica Chimica Acta 581

      ページ: 125-131

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Immobilization of RNase S-peptide on a single-stranded DNA-fixed gold surface and effective masking of its surface by an acridinyl poly(ethvlene glycol)2006

    • 著者名/発表者名
      K.Ohtsuka et al.
    • 雑誌名

      Analyst 131

      ページ: 55-61

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Determination of termination efficiency of transcription terminator using different fluorescent profile in green fluorescent protein mutants2005

    • 著者名/発表者名
      T.Nojima et al.
    • 雑誌名

      Analytical Sciences 21

      ページ: 1479-1481

    • NAID

      10016889496

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Genotyping of human lipoprotein lipase gene by using ferrocenylnaphthalene diimide-based electrochemical hybridization assay (FND-EHA)2005

    • 著者名/発表者名
      T.Nojima et al.
    • 雑誌名

      Analytical Sciences 21

      ページ: 1437-1441

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Electrochemical telomerase assay with ferrocenylnaphthalene diimide as a tetraplex DNA-specific binder2005

    • 著者名/発表者名
      S.Sato et al.
    • 雑誌名

      Analytical Chemistry 77

      ページ: 7304-7309

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Synthesis of ferrocenylcarbodiimide as a convenient electrochemically active labeling reagent for nucleic acids2005

    • 著者名/発表者名
      K.Mukumoto et al.
    • 雑誌名

      Tetrahedron 49

      ページ: 11705-11715

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] A Pyrene-labeled G-quadruplex oligonucleotide as a fluorescence probe for potassium ions detection in biological applications2005

    • 著者名/発表者名
      S.Nagatoishi et al.
    • 雑誌名

      Angewandte Chemie International Edition 44

      ページ: 449-454

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書

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公開日: 2005-04-01   更新日: 2016-04-21  

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