• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

多剤排出トランスポーター群の内因性基質の解析

研究課題

研究課題/領域番号 17770091
研究種目

若手研究(B)

配分区分補助金
研究分野 構造生物化学
研究機関大阪大学

研究代表者

村上 聡  阪大, 産業科学研究所, 助教授 (30300966)

研究期間 (年度) 2005 – 2007
研究課題ステータス 完了 (2006年度)
配分額 *注記
2,700千円 (直接経費: 2,700千円)
2006年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
2005年度: 1,500千円 (直接経費: 1,500千円)
キーワード構造生物学 / 多剤耐性 / X線結晶構造解析
研究概要

多剤排出トランスポーター群は構造的に関連性の乏しい多様な生体にとって異物となる化合物を排出する膜蛋白質群である。これは、古細菌からヒトの細菌に至るまで広く生物界に存在し、あらゆる細胞の持つ最も基本的な生体防御機構であると理解されている。AcrBは大腸菌で構成的に発現しているトランスポーターで、広い基質選択性を持ち、大腸菌の最も強力な排出トランスポーターであり、また薬剤自然抵抗性の主因としても知られている。我々はこの立体構造を2002年に解き、その後基質認識機構や、薬剤排出機構の解明を進める一方で、本助成のテーマであるこれらトランスポーターの発現を制御する転写制御因子の結晶化および構造解析を進めてきた。この転写因子は、細胞内に進入した薬剤を検地するセンサでもあり、多剤認識メカニズムについては、その制御対象であるトランスポーターと比較することは非常に興味深い。本年の研究成果として以下の項目を挙げる。
1)AcrRの1.1Å分解能での超高分解能X腺結晶構造解析に成功した。(論文準備中)
2)結晶標品からクロロホルム・メタノール法で脂質成分を抽出し、ガスクロマトグラフィーを用いたマス・スペクトログラフィー(GCマス)による分析により、抽出した脂溶性リガンドの定性を行った。その結果、いわゆる脂溶性物質の混合物として検出した。
GCマスの解析結果として現れた脂溶性リガンドのうち、結晶構造中に見出された内因性基質の電子密度の形と部分的に合致するものもあり、今後より詳細なマス解析を行うと共に、バイオ・アッセイを行い、生物学的意味づけを行うことで生理的基質の同定を行う。
また大腸菌を使って、内因性基質がいかなる原因で発生するのか?発生したその物質は細胞にとってどれほど有害なものか?それはどのような遺伝子群を高進させるか?いかなる種類のトランスポーターがその排除にあたるか。などを今後明らかにする。

報告書

(1件)
  • 2005 実績報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2006 2005

すべて 雑誌論文 (8件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Solution-stirring method improves crystal quality of human triose phosphate isomerase2006

    • 著者名/発表者名
      H.Adachi, A.Niino, T.Kinoshita, M.Warizaya, R, Maruki, K.Takano, H.Matsumura, T.Inoue, S.Murakami, Y.Mori, T.sasaki
    • 雑誌名

      Journal of Bioscience and Bioengineering 101

      ページ: 83-86

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Effect of laser irradiation on enzyme activity2005

    • 著者名/発表者名
      S.Murakami, M.Kashii, H.Kitano, H.Adachi, K.Takano, H.Matsumura, T.Inoue, Y.Mori, M.Doi, K.Sugamoto, H.Yoshikawa, T.Sasaki
    • 雑誌名

      Japanese Journal of Applied Physics 44

      ページ: 8216-8218

    • NAID

      10016872076

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Direct interaction of multidrug efflux transporter AcrB and outer membrane channel To1C detected via site-directed disulfide cross-linking2005

    • 著者名/発表者名
      N.Tamura, S.Murakami, Y.Oyama, M.Ishiguro, A.Yamaguchi
    • 雑誌名

      Biochemistry 44

      ページ: 11115-11121

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Processing of membrane protein crystal using UV laser irradiation2005

    • 著者名/発表者名
      H.Kitano, S.Murakami, H.Adachi, H.Matsumura, K.Takano, T.Inoue, Y.Mori, M.Doi, T.Sasaki
    • 雑誌名

      Japanese Bioscience and Bioengineering 100

      ページ: 50-53

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Semiautomatic protein crystallization system featuring crystallization solution preparation function2005

    • 著者名/発表者名
      H.Adachi, H.Matsumura, T.Inoue, A.Niino, K.Takano, S.Murakami, Y.Mori, T.Sasaki
    • 雑誌名

      Japanese Journal of Applied Physics 44

      ページ: 6302-6303

    • NAID

      130004534592

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Femtosecond laser processing of protein crystals in crystallization drop2005

    • 著者名/発表者名
      M.Kashii, H.Kitano, Y.Hosokawa, H.Adachi, Y.Mori, T.Sasaki, H.Masuhara, K.Takano, H.Matsumura, T.Inoue, S.Murakami, K.Sugamoto, H.Yoshikawa
    • 雑誌名

      Japanese Journal of Applied Physics 44

    • NAID

      10016591033

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Temperature-screening system for determining protein crystallization conditions2005

    • 著者名/発表者名
      H.Adachi, A.Niino, K.Takano, H.Matsumura, S.murakami, T.Inoue, Y.Mori, T.Sasaki
    • 雑誌名

      Japanese Journal of Applied Physics 44

      ページ: 4080-4083

    • NAID

      10016442017

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Protein crystal growth using laser-processed seed crystals2005

    • 著者名/発表者名
      K.Takeuchi, H.Kitano, H.Adachi, Y.Mori, T.Sasaki, H.Matsumura, T.Inoue, S.Murakami, M.Doi, Y.Koga, K.Takano, S.Kanaya
    • 雑誌名

      Japanese Journal of Applied Physics 44

      ページ: 3177-3179

    • NAID

      10015707035

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [図書] タンパク質のかたちから生命の謎を解く 生物マシーナリー構造生物学の最前線2005

    • 著者名/発表者名
      田中薫, 森川耿石, 山縣ゆり子, 濡木理, 若槻壮市, 田之倉優, 三木邦夫, 豊島近, 稲垣冬彦, 箱島敏雄, 中川敦史, 難波啓一, 有坂文雄, 西野武士, 千田俊哉, 村上聡, 河野俊之, 鈴木榮一郎, 月原富武(分担執筆)
    • 総ページ数
      232
    • 出版者
      株式会社クバフロ
    • 関連する報告書
      2005 実績報告書

URL: 

公開日: 2005-04-01   更新日: 2016-04-21  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi