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リン酸化プロテオーム解析に向けた新しい電気泳動法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 17790034
研究種目

若手研究(B)

配分区分補助金
研究分野 物理系薬学
研究機関広島大学

研究代表者

木下 英司  広島大学, 大学院医歯薬学総合研究科, 助教授 (80304418)

研究期間 (年度) 2005 – 2006
研究課題ステータス 完了 (2006年度)
配分額 *注記
3,400千円 (直接経費: 3,400千円)
2006年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
2005年度: 2,200千円 (直接経費: 2,200千円)
キーワードリン酸化 / プロテオーム / リン酸化プロテオーム / リン酸化タンパク質 / 電気泳動 / リン酸化アフィニティー / キナーゼプロファイリング / ウェスタンブロッティング / ビオチン
研究概要

最近,研究代表者らは,生理条件下で特異的にリン酸モノエステルと結合するナノ分子(二核金属錯体,Phos-tag)の開発に成功した。このリン酸基結合分子をアクリルアミドに固定することに成功すれば,リン酸化された蛋白質を効率良く非リン酸化蛋白質から分離する新しい電気泳動法が確立できると考え,本研究の着想に至った。
そこで,本研究では,
(1)Phos-tagにアクリルアミド基を導入した誘導体を合成し,SDS-ポリアクリルアミドゲル電気泳動(Laemmli法のSDS-PAGE)への適用を計ること,
(2)様々なリン酸化状態にあるリン酸化蛋白質を分離・検出する新しい電気泳動法を確立し,キナーゼプロファイリング法として実用化すること,を目的とした。
そして,その研究実績を以下にまとめる。
リン酸基に結合能を示す機能性分子,Phos-tagを用いて新規のリン酸アフィニティー電気泳動法を開発した。これは,アクリルアミド結合型Phos-tagのマンガン錯体をSDS-PAGEの分離ゲルに共重合させ,リン酸化蛋白質をゲルシフトバンドとして検出する方法(Mn2+-Phos-tag SDS-PAGE)である。この方法ではリン酸化量やリン酸化部位の異なる蛋白質アイソフォームを同時に検出することが可能で,キナーゼ反応の進行を定量的に解析できるという利点をもつ。今回はこの利点を活用した3つのキナーゼプロファイリング法を行い,in vitroにおける様々なキナーゼ反応の解析やキナーゼ阻害剤の検定に適用できることを示し,さらには,in vivoにおけるキナ-ゼ反応の解析にも有効であることを示した。以上のことから,この新しい電気泳動法が,今後のリン酸化プロテオーム研究に貢献できることを期待する。
なお,本研究成果により研究代表者は,2006年度第7回日本電気泳動学会奨励賞を受賞した。

報告書

(2件)
  • 2006 実績報告書
  • 2005 実績報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて 2007 2006 2005

すべて 雑誌論文 (11件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] Label-free kinase profiling using phosphate affinity polyacrylamide gel electrophoresis2007

    • 著者名/発表者名
      Emiko Kinoshita-Kikuta
    • 雑誌名

      Molecular & Cellular Proteomics 6

      ページ: 356-366

    • NAID

      120000878140

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] A single nucleotide polymorphism genotyping method using phosphate-affinity polyacrylamide gel electrophoresis2007

    • 著者名/発表者名
      Eiji Kinoshita
    • 雑誌名

      Analytical Biochemistry 361

      ページ: 294-298

    • NAID

      120000878055

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Non-SCN5A related Brugada syndromes : Verification of normal splicing and trafficking of SCN5A without exonic mutations2007

    • 著者名/発表者名
      Yukiko Nakano
    • 雑誌名

      Annals of Human Genetics 71

      ページ: 8-17

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Separation of a phosphorylated-His protein using phosphate-affinity polyacrylamide gel electrophores2007

    • 著者名/発表者名
      Seiji Yamada
    • 雑誌名

      Analytical Biochemistry 360

      ページ: 160-162

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] リン酸基親和性クロマトグラフィーを用いた細胞内のリン酸化タンパク質の網羅的精製2007

    • 著者名/発表者名
      木下英司
    • 雑誌名

      バイオテクノロジージャーナル 7巻・2号

      ページ: 217-220

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Enrichment of phosphorylated proteins from cell lysate using a novel phosphate-affinity chromatography at physiological pH2006

    • 著者名/発表者名
      Emiko Kinoshita-Kikuta
    • 雑誌名

      Proteomics 6

      ページ: 5088-5095

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Phos-tagを用いたリン酸化タンパク質の検出法 (2)アクリルアミド化 Phos-tagを用いたリン酸アフィニティー電気泳動2006

    • 著者名/発表者名
      木下恵美子
    • 雑誌名

      実験医学 24巻・17号

      ページ: 2649-2654

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Phos-tagを用いたリン酸化タンパク質の検出法 (1)ビオチン化 Phos-tagを用いたケミルミ検出2006

    • 著者名/発表者名
      木下英司
    • 雑誌名

      実験医学 24巻・16号

      ページ: 2523-2528

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Phosphate-binding tag, a new tool to visualize phosphorylated proteins2006

    • 著者名/発表者名
      Eiji Kinoshita
    • 雑誌名

      Molecular & Cellular Proteomics 5(in press)

    • NAID

      120000878114

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Reliable and cost-effective screening of inherited heterozygosity by using Zn^<2+>-cyclen polyacrylamide gel electrophoresis2005

    • 著者名/発表者名
      Eiji Kinoshita
    • 雑誌名

      Clinical Chemistry 51

      ページ: 2195-2198

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Detection and quantification of on-chip phosphorylated peptides by surface plasmon resonance imaging techniques using a novel phosphate capture molecule2005

    • 著者名/発表者名
      Kazumi Inamori
    • 雑誌名

      Analytical Chemistry 77

      ページ: 3979-3985

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [産業財産権] リン酸基を有する物質の染色方法2005

    • 発明者名
      小池 透, 木下 英司, 木下 恵美子
    • 権利者名
      広島大学, マナック(株)
    • 出願年月日
      2005-08-09
    • 関連する報告書
      2005 実績報告書

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公開日: 2005-04-01   更新日: 2016-04-21  

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