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RNA分解酵素によるsiRNAの切断様式の解明とそれに基づく安定化修飾法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 17790185
研究種目

若手研究(B)

配分区分補助金
研究分野 医化学一般
研究機関名古屋大学

研究代表者

武井 佳史  名古屋大学, 大学院医学系研究科, 講師 (70362233)

研究期間 (年度) 2005 – 2006
研究課題ステータス 完了 (2006年度)
配分額 *注記
3,400千円 (直接経費: 3,400千円)
2006年度: 1,300千円 (直接経費: 1,300千円)
2005年度: 2,100千円 (直接経費: 2,100千円)
キーワードRNA interference / short interfering RNA / 酵素消化 / 血清 / リボヌクレアーゼ / 安定性 / 化学修飾
研究概要

3'インバート・チミジン基修飾siRNAの各RNA分酵素に対する耐性の検討
RNA interference(RNAi)は2本鎖RNAがその相補的な配列を持つ遺伝子の発現を特異的に抑制する現象である。RNAiによる遺伝子サイレンシングはその配列特異性と発現抑制効果が非常に高く、癌やエイズなどの難治性疾患に対する臨床応用が期待されている。しかし、RNAiを誘導するsiRNA分子は動物に投与した場合、非常に分解されやすい。siRNA分子自体を医薬品のシーズとして臨床応用するためには、生体内環境でsiRNA分子自身を安定化させることが必要不可欠である。そこで、siRNA分子の3'オーバーハングの1個のデオキシチミジン基をインバート・デオキシチミジン基(以下Inv.T基)に置換したInv.T修飾siRNA(Inv.T siRNA)を昨年度までに合成した。今年度は上記Inv.T siRNAの各種RNA分解酵素に対する耐性をPAGE法にて検討し、以下に示す新規知見を得た。対象酵素はRNaseS1,Phosphodiesterase I, RNase P1,RNase HおよびRNase Aの5種とした。
(1)RNase S1と反応させると、Inv.T siRNAは未修飾siRNAとほぼ同等に消化された。生成した消化フラグメントRNAもほぼ同じであった。本酵素は小RNAに対して、エンドヌクレアーゼ活性とエキソヌクレアーゼ活性の両方を示した。
(2)Phosphodiesterase Iと反応させると、Inv.T siRNAは未修飾siRNAと比べて強い耐性を示した。本酵素は小RNAに対して、エキソヌクレアーゼ活性のみを示した。Inv.T siRNAは、エキソヌクレアーゼ活性を示す分解酵素に対して、とても有効な安定化修飾法であった。
(3)Inv.T siRNAと未修飾siRNAはRNase P1,RNase HおよびRNase Aに対してほぼ同等の酵素耐性を示した。各酵素の基質特異性はRNase P1(1本鎖RNA)、RNase H(DNA-RNAハイブリッド鎖)、RNase A(1本鎖RNA)であり、小RNA分子に対してもこの基質特異性が保持されていた。
【結論】
siRNA分子を安定化する為には、RNA分解酵素群のエンドヌクレーゼ活性とエキソヌクレアーゼ活性の両方を抑える必要がある。特にエンドヌクレアーゼ活性を抑える必要性を証明した。

報告書

(2件)
  • 2006 実績報告書
  • 2005 実績報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2006 2005

すべて 雑誌論文 (9件) 産業財産権 (2件)

  • [雑誌論文] Combinational antitumor effect of siRNA against midkine and paclitaxel on growth of human prostate cancer xenografts.2006

    • 著者名/発表者名
      Takei Y, Kadomatsu K, Goto T, Muramatsu T.
    • 雑誌名

      Cancer Vol. 107 No. 4

      ページ: 864-873

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Controlled release of small interfering RNA targeting midkine attenuates intimal hyperplasia in vein grafts.2006

    • 著者名/発表者名
      Banno H, Takei Y, Muramatsu T, Komori K, Kadomatsu K.
    • 雑誌名

      Journal of Vascular Surgery Vol. 44 No. 3

      ページ: 633-641

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Intratumor injection of small interfering RNA-targeting human papillomavirus 18 E6 and E7 successfully inhibits the growth of cervical cancer.2006

    • 著者名/発表者名
      Fujii T, Saito M, Iwasaki E, Ochiya T, Takei Y, Hayashi S, Ono A, Hirao N, Nakamura M, Kubushiro K, Tsukazaki K, Aoki D.
    • 雑誌名

      International Journal of Oncology Vol. 29 No. 3

      ページ: 541-548

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Growth factor midkine is involved in the pathogenesis of diabetic nephropathy2006

    • 著者名/発表者名
      Kosugi T, Yuzawa Y, Sato W, Kawai H, Matsuo S, Takei Y, Muramatsu T, Kadomatsu K
    • 雑誌名

      American Journal of Patholoay Vol. 168 No. 1

      ページ: 9-19

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Growth factor midkine is involved in the pathogenesis of diabetic nephropathy2006

    • 著者名/発表者名
      Kosugi T, Yuzawa Y, Sato W, Kawai H, Matsuo S, Takei Y, Muramatsu T, Kadomatsu K
    • 雑誌名

      American Journal of Pathology Vol.168 No.1

      ページ: 9-19

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Morpholino antisense oligomer targeting human midkine : its application for cancer therapy2005

    • 著者名/発表者名
      Takei Y, Kadomatsu K, Yuasa K, Sato W, Muramatsu T
    • 雑誌名

      International Journal of Cancer Vol.114 No.3

      ページ: 490-497

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] In vivo delivery technique of nucleic acid compounds using atelocollagen : Its use in cancer therapeutics targeted at the heparin-binding growth factor midkine2005

    • 著者名/発表者名
      Takei Y, Kadomatsu K
    • 雑誌名

      Gene Therapy and Molecular Biology Vol.9 No.B

      ページ: 257-264

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Midkine antisense oligodeoxynucleotide inhibits renal damage induced by ischemic reperfusion2005

    • 著者名/発表者名
      Sato W, Takei Y, Yuzawa Y, Matsuo S, Kadomatsu K, Muramatsu T
    • 雑誌名

      Kidney International Vol.67 No.4

      ページ: 1330-1339

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Antisense oligodeoxynucleotide as to the growth factor midkine suppresses neointima formation induced by balloon injury2005

    • 著者名/発表者名
      Hayashi K, Banno H, Kadomatsu K, Takei Y, Komori K, Muramatsu T
    • 雑誌名

      American Journal of Physiology - Heart and Circulatory Physiology Vol.288 No.5

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [産業財産権] エレクトロポレーション装置の制御方法2006

    • 発明者名
      武井佳史, 藤島達也, 村松喬, 門松健治
    • 権利者名
      武井佳史, 藤島達也, 村松喬, 門松健治
    • 出願年月日
      2006-07-14
    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [産業財産権] エレクトロポレーション装置の制御方法2005

    • 発明者名
      武井 佳史, 藤島 達也, 村松 喬, 門松 健治
    • 権利者名
      武井 佳史, 藤島 達也, 村松 喬, 門松 健治
    • 産業財産権番号
      2005-207067
    • 出願年月日
      2005-07-15
    • 関連する報告書
      2005 実績報告書

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公開日: 2005-04-01   更新日: 2016-04-21  

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