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海綿動物由来医薬品資源の生合成研究

研究課題

研究課題/領域番号 17F17114
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分外国
研究分野 天然資源系薬学
研究機関北海道大学

研究代表者

脇本 敏幸  北海道大学, 薬学研究院, 教授 (70363900)

研究分担者 URIA AGUSTINUS  北海道大学, 薬学研究科(研究院), 外国人特別研究員
研究期間 (年度) 2017-07-26 – 2019-03-31
研究課題ステータス 完了 (2018年度)
配分額 *注記
2,400千円 (直接経費: 2,400千円)
2018年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
2017年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
キーワード海綿 / メタゲノム / 生合成
研究実績の概要

海綿動物は多種多様な共生微生物を宿す付着性の多細胞動物である。世界中の海に生息し、1万種が現存するといわれる海綿動物からは、これまで2万以上の生理活性物質が単離、報告されてきた。ランダムスクリーニングに由来するため細胞毒性物質の数が多く、pM程度の濃度で強力な細胞毒性を示す化合物も少なくない。しかしながら、それらの多くが稀少かつ複雑な構造を有するために、抗がん剤として研究開発がなされた化合物は極めて少ない。一方で、それら海綿由来細胞毒性物質のほとんどは共生微生物によって生産されることが示唆されている。本研究では医薬品資源として有望な海綿由来稀少生理活性物質の生合成遺伝子および生産菌を同定し、可培養化や異種生産を目指した基礎的知見を得る。昨年度より海綿動物から微量成分として見出されたspongistatinの生合成遺伝子の特定を進めてきた。Spongistatinはtrans AT型PKSによる生合成経路が予想される化合物であり、その生合成遺伝子には特徴的な配列を有するketosynthase (KS)が含まれる。したがってKSの縮重プライマーを用いたtrans AT型PKSの探索を重点的に行った。その結果、海綿メタゲノムDNAよりtrans AT型PKSに属するKS配列を得た。さらに海綿メタゲノムライブラリーを構築し、得られたtrans AT型KS配列に基づくスクリーニングを行った。その結果、複数のヒットクローンを得ることに成功した。現在詳細なシークエンス解析を進めている。また、海綿共生微生物の可培養化を目指し、沖縄産海綿Theonella swinhoeiから様々な組成の培地を用いた培養を試みた。その結果、既知微生物と相同性が低い微生物を含む数百種類の微生物を単離した。その中にはPKSやNRPS遺伝子を有する微生物群も数多く含まれており今後さらに物質生産能の検証を進める。

現在までの達成度 (段落)

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2018 実績報告書
  • 2017 実績報告書
  • 研究成果

    (31件)

すべて 2019 2018 2017 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (14件) (うち国際共著 3件、 査読あり 14件、 オープンアクセス 4件、 謝辞記載あり 4件) 学会発表 (14件) (うち国際学会 11件、 招待講演 14件) 備考 (1件) 産業財産権 (1件) (うち外国 1件)

  • [国際共同研究] スイス連邦工科大学チューリッヒ校(スイス)

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [雑誌論文] SurE is a trans-acting thioesterase cyclizing two distinct non-ribosomal peptides2019

    • 著者名/発表者名
      Matsuda, K., Kobayashi, M., Kuranaga, T., Takagda, K., Ikeda, H., Matsunaga, S., Wakimoto, T.,
    • 雑誌名

      Org. Biomol. Chem.

      巻: 17 号: 5 ページ: 1058-1061

    • DOI

      10.1039/c8ob02867b

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The revised structure of surugamide A2019

    • 著者名/発表者名
      Matsuda Kenichi、Kuranaga Takefumi、Ayae Sano, Akihiro Ninomiya、Takada Kentaros、Wakimoto Toshiyuki
    • 雑誌名

      Chemical and Pharmaceutical Bulletin

      巻: -

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Diastereoselective Total Synthesis and Structural Confirmation of Surugamide F2018

    • 著者名/発表者名
      Kuranaga Takefumi、Fukuba Atsuki、Ninomiya Akihiro、Takada Kentaro、Matsunaga Shigeki、Wakimoto Toshiyuki
    • 雑誌名

      CHEMICAL & PHARMACEUTICAL BULLETIN

      巻: 66 号: 6 ページ: 637-641

    • DOI

      10.1248/cpb.c18-00072

    • NAID

      130007382323

    • ISSN
      0009-2363, 1347-5223
    • 年月日
      2018-06-01
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Biosynthetic Insights of Calyculin- and Misakinolide-Type Compounds in “ Candidatus Entotheonella sp.”2018

    • 著者名/発表者名
      Uria Agustinus R.、Piel Joern、Wakimoto Toshiyuki
    • 雑誌名

      Methods in Enzymology

      巻: 604 ページ: 287-330

    • DOI

      10.1016/bs.mie.2018.02.017

    • ISBN
      9780128139592
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Discovery of Unprecedented Hydrazine-Forming Machinery in Bacteria2018

    • 著者名/発表者名
      Matsuda Kenichi、Tomita Takeo、Shin-ya Kazuo、Wakimoto Toshiyuki、Kuzuyama Tomohisa、Nishiyama Makoto
    • 雑誌名

      Journal of the American Chemical Society

      巻: 140 号: 29 ページ: 9083-9086

    • DOI

      10.1021/jacs.8b05354

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Total Synthesis of the Nonribosomal Peptide Surugamide?B and Identification of a New Offloading Cyclase Family2018

    • 著者名/発表者名
      Kuranaga Takefumi、Matsuda Kenichi、Sano Ayae、Kobayashi Masakazu、Ninomiya Akihiro、Takada Kentaro、Matsunaga Shigeki、Wakimoto Toshiyuki
    • 雑誌名

      Angewandte Chemie International Edition

      巻: 57 号: 30 ページ: 9447-9451

    • DOI

      10.1002/anie.201805541

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Palmitoyl lactic acid induces adipogenesis and a brown fat-like phenotype in 3T3-L1 preadipocytes2018

    • 著者名/発表者名
      Uno Yuka、Yamamoto Hirona、Shuto Takatsuki、Sato Yoshinori、Kuranaga Takefumi、Yazawa Kazunaga、Ono Yasuo、Wakimoto Toshiyuki
    • 雑誌名

      Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular and Cell Biology of Lipids

      巻: 1863 号: 7 ページ: 772

    • DOI

      10.1016/j.bbalip.2018.04.003

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書 2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Biosynthetic insights of calyculin- and misakinolide-type compounds in “Candidatus Entotheonella sp.”2018

    • 著者名/発表者名
      Uria Agustinus、Piel Joern、Wakimoto Toshiyuki
    • 雑誌名

      Methods in Enzymology

      巻: 604

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Diastereoselective total synthesis and structural confirmation of surugamide F2018

    • 著者名/発表者名
      Kuranaga Takefumi、Fukuba Atsuki、Ninomiya Akihiro、Takada Kentaro、Matsunaga Shigeki、Wakimoto Toshiyuki
    • 雑誌名

      Chemical and Pharmaceutical Bulletin

      巻: 66

    • NAID

      130007382323

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Protein phosphatases 1 and 2A and their naturally occurring inhibitors: current topics in smooth muscle physiology and chemical biology2017

    • 著者名/発表者名
      Takai Akira、Eto Masumi、Hirano Katsuya、Takeya Kosuke、Wakimoto Toshiyuki、Watanabe Masaru
    • 雑誌名

      J Physiol Sci

      巻: 68 号: 1 ページ: 1-17

    • DOI

      10.1007/s12576-017-0556-6

    • NAID

      40021443577

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Total synthesis of theonellapeptolide Id2017

    • 著者名/発表者名
      Kuranaga, T., Enomoto, A., Tan, H., Fujita, K., Wakimoto, T.
    • 雑誌名

      Org. Lett.

      巻: 19 号: 6 ページ: 1366-1369

    • DOI

      10.1021/acs.orglett.7b00249

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Toward dark matter of natural products”2017

    • 著者名/発表者名
      Wakimoto, T.
    • 雑誌名

      Chem. Rec.

      巻: 17 号: 11 ページ: 1124-1134

    • DOI

      10.1002/tcr.201700009

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Identification of pyridinium with three indole moieties as an antimicrobial agent2017

    • 著者名/発表者名
      Okada, M., Sugita, T., Wong, C. P., Wakimoto, T., Abe, I.
    • 雑誌名

      J. Nat. Prod.,

      巻: 80 号: 4 ページ: 1205-1209

    • DOI

      10.1021/acs.jnatprod.6b01152

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Characterization of giant modular PKSs provides insight into genetic mechanism for structural diversification of aminopolyol polyketides2017

    • 著者名/発表者名
      Zhang, L., Hashimoto, T., Qin, B., Hashimoto, J., Kozone, I., Kawahara, T., Okada, M., Awakawa, T., Ito, T., Asakawa, Y., Ueki, M., Takahashi, S., Osada, H., Wakimoto, T., Ikeda, H., Shin-ya, K., Abe, I.
    • 雑誌名

      Angew. Chem. Int. Ed.

      巻: 56 号: 7 ページ: 1740-1745

    • DOI

      10.1002/anie.201611371

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [学会発表] Investigating spongistatin biosynthesis in complex sponge-bacteria association2018

    • 著者名/発表者名
      Agustinus R. Uria, Kenichi Matsuda, Toshiyuki Wakimoto
    • 学会等名
      3rd International Symposium on Sponge Microbiology
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] A new off-loading enzyme in non-ribosomal peptide biosynthesis2018

    • 著者名/発表者名
      Toshiyuki Wakimoto
    • 学会等名
      2nd China-Japan Joint Symposium on Natural Product Biosynthesis
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Marine Sponge-derived Metagenomes/uncultured Bacteria - a Rich Source of Novel Natural Product Biosynthetic Genes2018

    • 著者名/発表者名
      Toshiyuki Wakimoto
    • 学会等名
      International Seminar on Natural Products Medicines 2018
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Unusual Processes of PKS and NRPS Assembly Lines in Marine Bacteria2018

    • 著者名/発表者名
      Toshiyuki Wakimoto
    • 学会等名
      1st German-Japanese Joint Symposium on the Biosynthesis of Natural Products
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 生合成遺伝子から見出した新規天然物と難培養微生物2018

    • 著者名/発表者名
      脇本敏幸
    • 学会等名
      新化学技術推進協会ライフサイエンス技術部会講演会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 難培養微生物を起源とする希少医薬品資源の量産2018

    • 著者名/発表者名
      脇本敏幸
    • 学会等名
      生物合成系の再設計による複雑骨格機能分子の革新的創成科学、第2回公開シンポジウム
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] メタゲノムマイニングによる海綿由来新規天然物の探索2018

    • 著者名/発表者名
      脇本敏幸
    • 学会等名
      日本薬学会第138会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] メタゲノムマイニングによる海綿由来新規天然物の探索2017

    • 著者名/発表者名
      脇本敏幸
    • 学会等名
      理研シンポジウム、高磁場・高感度NMR利活用促進のための天然物分野における日中連携シンポジウム2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Marine sponge-derived metagenomes/uncultured bacteria - a rich source of novel natural product biosynthetic genes2017

    • 著者名/発表者名
      Wakimoto Toshiyuki
    • 学会等名
      South China Sea Institute of Oceanology, Chinese Academy of Sciences, China
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Marine sponge-derived metagenomes/uncultured bacteria - a rich source of novel natural product biosynthetic genes2017

    • 著者名/発表者名
      Wakimoto Toshiyuki
    • 学会等名
      Jinan University, College of Pharmacy, China
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Marine sponge-derived metagenomes/uncultured bacteria - a rich source of novel natural product biosynthetic genes2017

    • 著者名/発表者名
      Wakimoto Toshiyuki
    • 学会等名
      International Conference on Marine Biodiversity and Biotechnology, Jakarta, Indonesia
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Marine sponge-derived metagenomes/uncultured bacteria - a rich source of novel natural product biosynthetic genes2017

    • 著者名/発表者名
      Wakimoto Toshiyuki
    • 学会等名
      1st China-Japan Joint Symposium on Natural Product Biosynthesis, Shanghai, China
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Activated Chemical Defense of Japanese Marine Sponge Discodermia calyx2017

    • 著者名/発表者名
      Wakimoto Toshiyuki
    • 学会等名
      ISCE/APACE, Kyoto, Japan
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Marine sponge-derived metagenomes/uncultured bacteria - a rich source of novel natural product biosynthetic genes2017

    • 著者名/発表者名
      Wakimoto Toshiyuki
    • 学会等名
      9th US-Japan Seminar on Natural Product Biosynthesis, UCLA Lake Arrowhead Conference Center, California, USA
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [備考] 北海道大学大学院薬学研究院天然物化学研究室

    • URL

      http://www.pharm.hokudai.ac.jp/tennen/index.html

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書 2017 実績報告書
  • [産業財産権] ペプチド類の大環状化酵素2018

    • 発明者名
      脇本敏幸、倉永健史、松田研一
    • 権利者名
      北海道大学
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2019-050797
    • 出願年月日
      2018
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 外国

URL: 

公開日: 2017-07-28   更新日: 2024-03-26  

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