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ペプチドタグを用いたタンパク質のアモルファス凝集体の制御及びその細胞毒性の解析

研究課題

研究課題/領域番号 17F17392
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分外国
研究分野 生物物理学
研究機関東京農工大学

研究代表者

黒田 裕  東京農工大学, 工学(系)研究科(研究院), 教授 (10312240)

研究分担者 VELMURUGAN PUNITHA  東京農工大学, 工学(系)研究科(研究院), 外国人特別研究員
研究期間 (年度) 2017-11-10 – 2020-03-31
研究課題ステータス 完了 (2019年度)
配分額 *注記
2,200千円 (直接経費: 2,200千円)
2019年度: 500千円 (直接経費: 500千円)
2018年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
2017年度: 600千円 (直接経費: 600千円)
キーワード生物物理 / 組換えタンパク質 / バイオテクノロジー / 細胞毒性 / タンパク質断片 / デング / 溶解性制御タグ / 可溶性ペプチドタグ / アモルファス凝集 / 凝集形成の分光計測 / タンパク質
研究実績の概要

タンパク質の不定形な凝集(アモルファス凝集)は、創薬やバイオ産業において重要な現象であるにもかかわらず、その物理化学的特徴解析及び生物学的影響は殆ど解明されていない。本計画では、受入研究者が独自に開発した3~7残基から成る溶解性制御タグ(Solubility Controlling Peptide;SCPタグ)を用いてタンパク質(デング4型由来エンベロープ糖タンパク質第3ドメイン、以下DEN4-ED3)を不定形な可溶性凝集体(soluble amorphous aggregates)に会合させた。くわえて、SCPタグ配列を変異させることで凝集体のサイズを制御し、不定形で可溶な凝集体を安定的に形成させ、凝集の物性や構造を動的光散乱法などの分光学的手法を用いて明らかにした。
また、単量体では無毒なDEN4-ED3にSCPタグを付加し可溶性会合体を形成させると細胞毒性を有することを解明した。さらに、可溶性会合体が大きな凝集体に成長すると細胞毒性が失われるということも見出した。神経変性疾患の原因分子とされているアミロイドでも類似した観測がされており、アミロイド線維核(pre-fibril)は毒性を有し、線維に成長したアミロイドは細胞毒性を失うという報告が多くなされている。しかし、アモルファス凝集では我々が知る限り初めての報告である。以上のことから、タンパク質が比較的小さなアモルファスな会合体を形成すると細胞毒性が生ずることを解明した。
なお、現在執筆中の論文においては、外国人特別研究員Velmurugan氏が執筆した原稿を基に論文を共同で仕上げて投稿する予定であったが、コロナウイルス流行のため、執筆が遅れている。

現在までの達成度 (段落)

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(3件)
  • 2019 実績報告書
  • 2018 実績報告書
  • 2017 実績報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2020 2019 2018

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (5件)

  • [雑誌論文] Misfolding of a Single Disulfide Bonded Globular Protein into a Low-Solubility Species Conformationally and Biophysically Distinct from the Native One2019

    • 著者名/発表者名
      Saotome Tomonori、Yamazaki Toshio、Kuroda Yutaka
    • 雑誌名

      Biomolecules

      巻: 9(6) 号: 6 ページ: 250-250

    • DOI

      10.3390/biom9060250

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Amorphous aggregates of dengue variants induce irreversible depolarization of mitochondria and the release of cytochrome c. online2020

    • 著者名/発表者名
      Aklima Jannatul, Velmurugan Punitha, Kuroda Yutaka, Ohta Yoshihiro
    • 学会等名
      第93回日本生成化学大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 溶解性制御タグ(SCPタグ)を用いたタンパク質凝集体の形成速度の解析及びその制御法の開発2020

    • 著者名/発表者名
      Onchaiya Sawaros、Velmurugan Punitha、黒田 裕
    • 学会等名
      第9回日本生物物理学会関東支部会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Investigation on the relationship between cytotoxicity and amorphous oligomers2019

    • 著者名/発表者名
      Velmurugan Punitha, Aklima Jannatul, Ohta Yoshihiro, Kuroda Yutaka
    • 学会等名
      第5回国立精神神経医療センター・東京農工大学合同シンポジウム
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Investigation on the relationship between cytotoxicity and amorphous oligomers2019

    • 著者名/発表者名
      Velmurugan Punitha, Aklima Jannatul, Ohta Yoshihiro, Kuroda Yutaka
    • 学会等名
      第57回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Biophysical characterization of an insoluble species formed by a chemically intact single disulfide bonded BPTI2018

    • 著者名/発表者名
      Punitha Velmurugan, Yutaka Kuroda
    • 学会等名
      第18回日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書

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公開日: 2017-11-13   更新日: 2024-03-26  

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