• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

ミトコンドリア病のゲノム解析と原因遺伝子の機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 17F17714
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分外国
研究分野 病態医化学
研究機関順天堂大学 (2018)
埼玉医科大学 (2017)

研究代表者

岡崎 康司  順天堂大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (80280733)

研究分担者 LIM SZE CHERN  順天堂大学, 医学(系)研究科(研究院), 外国人特別研究員
研究期間 (年度) 2017-07-26 – 2019-03-31
研究課題ステータス 完了 (2018年度)
配分額 *注記
2,300千円 (直接経費: 2,300千円)
2018年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
2017年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
キーワードMitochondria / Human genetics / Molecular biology
研究実績の概要

Whole exome sequencing of mitochondrial disease patients was performed in our laboratory. In fiscal year 2018, I investigated candidate mutations in 4 genes/gene cluster for their pathogenicity in 9 patients. Bioinformatic, molecular genetic and biochemical analyses including RNA sequencing, Sanger sequencing, DNA cloning, qPCR, SDS-PAGE and BN-PAGE western blotting, respiration rate analysis and OXPHOS enzyme assays were performed.
We detected large chromosomal deletions and rearrangements of the gene region in several patients with confirmed or suspected mitochondrial disease. My research highlighted the technical challenge in elucidating the exact gDNA mutations in the gene cluster region. Molecular diagnosis was confirmed in 2 of the 5 patients investigated. This is an on-going research in collaboration with Prof. David Thorburn from Murdoch Children’s Research Institute in Australia.
One of the novel disease genes was investigated in collaboration with Dr Diana Stojanovski from the University of Melbourne in Australia. As a result, the variant was excluded from further analysis in two patients due to the lack of supportive evidence for pathogenicity.
Two novel DNA variants in a nuclear gene encoding an OXPHOS complex III subunit were identified in a patient with Leigh Syndrome. Genomic DNA, RNA and protein analyses were performed to identify evidence for pathogenicity caused by those 2 compound heterozygous variants in the patient. This study led to an on-going collaboration with Prof. David Thorburn. A joint-publication is in preparation.

現在までの達成度 (段落)

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2018 実績報告書
  • 2017 実績報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2019 2018 2017 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 4件)

  • [国際共同研究] Murdoch Children’s Research Institute/The University of Melbourne(オーストラリア)

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [国際共同研究] University of Melbourne(Australia)

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [雑誌論文] Mitochondrial ribosomal protein PTCD3 mutations cause oxidative phosphorylation defects with Leigh syndrome.2019

    • 著者名/発表者名
      Borna NN, Kishita Y, Kohda M, Lim SC, Shimura M, Wu Y, Mogushi K, Yatsuka Y, Harashima H, Hisatomi Y, Fushimi T, Ichimoto K, Murayama K, Ohtake A, Okazaki Y.
    • 雑誌名

      Neurogenetics

      巻: 20(1) 号: 1 ページ: 9-25

    • DOI

      10.1007/s10048-018-0561-9

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Genetic causes of mitochondrial oxidative phosphorylation (OXPHOS) disorders.2018

    • 著者名/発表者名
      Sze Chern Lim
    • 学会等名
      Wellcome Genome Campus Advanced Course: NGS Bioinformatics, Hinxton in UK.
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Providing molecular diagnosis to patients with mitochondrial oxidative phosphorylation disease using functional studies following next generation sequencing.2018

    • 著者名/発表者名
      Sze Chern Lim, Yoshihito Kishita, Masakazu Kohda, Tomoko Hirata, Yukiko Yatsuka, Hiroko Harashima, Kei Murayama, Akira Ohtake and Yasushi Okazaki.
    • 学会等名
      Variant Effect Prediction Training Course, Johor in Malaysia.
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Identification of the genetic causes of mitochondrial oxidative phosphorylation (OXPHOS) disease2017

    • 著者名/発表者名
      Sze Chern Lim, Yoshihito Kishita, Masakazu Kohda, Yosuke Mizuno, Tomoko Hirata, Yukiko Yatsuka, Nurun Nahar Borna, Hiroko Harashima, Kei Murayama, Akira Ohtake and Yasushi Okazaki.
    • 学会等名
      Annual Meeting of the American Society of Human Genetics 2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Investigation of causative genes for mitochondrial oxidative phosphorylation (OXPHOS) disorders2017

    • 著者名/発表者名
      Sze Chern Lim, Yoshihito Kishita, Masakazu Kohda, Tomoko Hirata, Yukiko Yatsuka, Atsuko Imai-Okazaki, Hiroko Harashima, Masaru Shimura, Kei Murayama, Akira Ohtake and Yasushi Okazaki.
    • 学会等名
      The 59th Annual Meeting of the Japanese Society for Inherited Metabolic Diseases/The 15th Asian Symposium of Inherited Metabolic Diseases
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会

URL: 

公開日: 2017-07-28   更新日: 2024-03-26  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi