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マングローブ林保全のためのグローバル景観ゲノミクス

研究課題

研究課題/領域番号 17H01414
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生物資源保全学
研究機関琉球大学

研究代表者

梶田 忠  琉球大学, 熱帯生物圏研究センター, 教授 (80301117)

研究分担者 岩崎 貴也  神奈川大学, 理学部, 助教 (10636179)
津田 吉晃  筑波大学, 生命環境系, 准教授 (40769270)
高山 浩司  京都大学, 理学研究科, 准教授 (60647478)
研究期間 (年度) 2017-04-01 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2020年度)
配分額 *注記
42,510千円 (直接経費: 32,700千円、間接経費: 9,810千円)
2020年度: 8,190千円 (直接経費: 6,300千円、間接経費: 1,890千円)
2019年度: 8,970千円 (直接経費: 6,900千円、間接経費: 2,070千円)
2018年度: 8,970千円 (直接経費: 6,900千円、間接経費: 2,070千円)
2017年度: 16,380千円 (直接経費: 12,600千円、間接経費: 3,780千円)
キーワード生物多様性保全 / 自然現象観測・予測 / ゲノム解析 / マングローブ
研究成果の概要

全世界の熱帯・亜熱帯の海岸域に分布するマングローブ林は、比較的少数の種が広域に分布することで成立している。マングローブ林の破壊が世界各地で進行する中、マングローブ林構成種が、過去の気候変動や環境の変化を経て、現在の分布域を形成してきたのかは、マングローブ林の保全に指針を与えると期待される。そこで、種内の遺伝的変異の空間分布に注目して景観ゲノミクス研究を行った。国際研究ネットワークを構築して、研究を実施したところ、数種の広域分布種について、分布域内での遺伝的変異の空間分布と形成過程、過去の集団の拡大・縮小の歴史、適応遺伝子の地理的分布などが明らかになり、今後の保全を検討する上での指針が得られた。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究により、アメリカヒルギ等のマングローブ林主要構成種に加え、ハマアズキ等、マングローブ植物と同様に広域分布する海流散布種(関連種)について、分布域を広く網羅するような地域集団からゲノムデータを取得することができた。また、得られたデータを解析することで、広域分布するマングローブ植物及び関連種の、分布域内での詳細な遺伝的変異の地理的分布パターンとその形成過程と、地域集団ごとの拡大・縮小の歴史、地域ごとの適応候補遺伝子等が明らかになった。これらのデータは海流散布を経て世界に広がった植物の分布域の形成過程を明らかにしただけで無く、今後のマングローブ林の保全について指針を与えるものとなった。

報告書

(5件)
  • 2020 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2019 実績報告書
  • 2018 実績報告書
  • 2017 実績報告書
  • 研究成果

    (49件)

すべて 2021 2020 2019 2018 2017 その他

すべて 国際共同研究 (12件) 雑誌論文 (9件) (うち国際共著 7件、 査読あり 9件、 オープンアクセス 7件) 学会発表 (23件) (うち国際学会 14件、 招待講演 6件) 備考 (3件) 学会・シンポジウム開催 (2件)

  • [国際共同研究] 広西大学(中国)

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [国際共同研究] Universidade Estadual Paulista(ブラジル)

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [国際共同研究] Universidad Nacional Autonoma de Mexico(メキシコ)

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [国際共同研究] 広西大学(中国)

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [国際共同研究] Universidade Estadual Paulista(ブラジル)

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [国際共同研究] Universidad Nacional Autonoma de Mexico(メキシコ)

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [国際共同研究] 広西大学/中山大学(中国)

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [国際共同研究] Universidade Estadual Paulista(メキシコ)

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      2018 実績報告書
  • [国際共同研究] Universidad Nacional Autonoma de Mexico(ブラジル)

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      2018 実績報告書
  • [国際共同研究] 広西大学/中山大学(中国)

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [国際共同研究] Universidade Estadual Paulista(ブラジル)

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [国際共同研究] Universidad Nacional Autonoma de Mexico(メキシコ)

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [雑誌論文] Testing species hypotheses in the mangrove genus Rhizophora from the Western hemisphere and South Pacific islands2021

    • 著者名/発表者名
      Mori Gustavo Maruyama、Madeira Andr? Guilherme、Cruz Mariana Vargas、Tsuda Yoshiaki、Takayama Koji、Matsuki Yu、Suyama Yoshihisa、Iwasaki Takaya、de Souza Anete Pereira、Zucchi Maria Imaculada、Kajita Tadashi
    • 雑誌名

      Estuarine, Coastal and Shelf Science

      巻: 248 ページ: 106948-106948

    • DOI

      10.1016/j.ecss.2020.106948

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] The complete chloroplast genome of a pantropical legume, Canavalia rosea2021

    • 著者名/発表者名
      Imai Ryosuke、Kajita Yui、Yamamoto Takashi、Takayama Koji、Kajita Tadashi
    • 雑誌名

      Mitochondrial DNA Part B

      巻: 6 号: 2 ページ: 295-296

    • DOI

      10.1080/23802359.2020.1859341

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Global phylogeography of a pantropical mangrove genus Rhizophora2021

    • 著者名/発表者名
      Takayama Koji、Tateishi Yoichi、Kajita Tadashi
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 11 号: 1 ページ: 7228-7228

    • DOI

      10.1038/s41598-021-85844-9

    • NAID

      120007017207

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The complete chloroplast genome of a hemiparasitic plant Santalum boninense (Santalaceae), endemic to the Bonin (Ogasawara) Islands2020

    • 著者名/発表者名
      Nishimura Akihiro、Kajita Tadashi、Takayama Koji
    • 雑誌名

      Mitochondrial DNA Part B

      巻: 5 号: 2 ページ: 1386-1387

    • DOI

      10.1080/23802359.2020.1735963

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Genetic structures across a biogeographical barrier reflect dispersal potential of four Southeast Asian mangrove plant species2020

    • 著者名/発表者名
      Wee Alison K. S.、Noreen Annika M. E.、Ono Junya、Takayama Koji、Kumar Prakash P.、Tan Hugh T. W.、Saleh Mohd N.、Kajita Tadashi、Webb Edward L.
    • 雑誌名

      Journal of Biogeography

      巻: 00 号: 6 ページ: 1-14

    • DOI

      10.1111/jbi.13813

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] The presence of a cryptic barrier in the West Pacific Ocean suggests the effect of glacial climate changes on a widespread sea-dispersed plant, Vigna marina (Fabaceae)2019

    • 著者名/発表者名
      Takashi Yamamoto, Yoshiaki Tsuda, Koji Takayama, Reiko Nagashima, Yoichi Tateishi and Tadashi Kajita
    • 雑誌名

      Ecology and Evolution

      巻: 印刷中

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] The integration and application of genomic information in mangrove conservation2018

    • 著者名/発表者名
      Wee Alison K.S.、Mori Gustavo M.、Lira Catarina F.、Nunez-Farfan Juan、Takayama Koji、Faulks Leanne、Shi Suhua、Tsuda Yoshiaki、Suyama Yoshihisa、Yamamoto Takashi、Iwasaki Takaya、Nagano Yukio、Wang Zhengzhen、Watanabe Shin、Kajita Tadashi
    • 雑誌名

      Conservation Biology

      巻: 33 号: 1 ページ: 206-209

    • DOI

      10.1111/cobi.13140

    • NAID

      120006937751

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Vicariance, oceanic barriers and geographic distance drive contemporary genetic structure of widespread mangrove species Sonneratia alba in the Indo-West Pacific2017

    • 著者名/発表者名
      A.K.S. Wee, J. X. H. Teo, J. L Chua, K. Takayama, T. Asakawa, S. H. Meenakshisundaram, Onrizal, B. Adjie, E. R. Ardli, S. Sungkaew, M. Suleiman, X. T. Nguyen, S. G Salmo III, O. B. Yllano, M N. Saleh, K. K. Soe, Y. Tateishi, Y. Watano, Y. Tsuda, T. Kajita, E. L Webb
    • 雑誌名

      Forests

      巻: 8 号: 12 ページ: 483-483

    • DOI

      10.3390/f8120483

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Genetic structure and population demographic history of a widespread mangrove plant Xylocarpus granatum (Meliaceae) across the Indo - West Pacific region2017

    • 著者名/発表者名
      Y. Tomizawa, Y. Tsuda, M. N. Saleh, A. K. S. Wee, Koji Takayama, T. Yamamoto, O. B. Yllano, S. G. Salmo III, S. Sungkaew, B. Adjie, E. R. Ardli, M. Suleiman, N. X. Tung, K. K. Soe, K. Kandasamy, T. Asakawa, Y. Watano, S. Baba, T. Kajita
    • 雑誌名

      Forests

      巻: 8 号: 12 ページ: 480-480

    • DOI

      10.3390/f8120480

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] ゲノムデータを用いたホウガンヒルギの遺伝的多様性と自然選択の検出2020

    • 著者名/発表者名
      Ryosuke Imai,Yoshiaki Tsuda, Takashi Yamamoto,Yuki Tomizawa, Nazre Saleh,Alison K. S. Wee,Koji Takayama,Orlex B. Yllano,Severino Iii Salmo,Sarawood Sungkaew, Bayu Adjie,Erwin Ardli,Monica Suleiman,Nguyen X. Tung, Khinkhin Soe,Kathiresan Kandasamy,Takeshi Asakawa, Yasuyuki Watano,Shigeyuki Baba, Tadashi Kajita
    • 学会等名
      日本植物学会第84回大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] Toward the Global Assessment of Species Diversity of Fish and Macrobenthos in Mangroves Through DNA Metabarcoding2020

    • 著者名/発表者名
      Tadashi Kajita
    • 学会等名
      The 2nd International Conference on Natural Resources and Technology
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] ゲノムデータを用いたホウガンヒルギの遺伝的多様性と自然選択の検出2020

    • 著者名/発表者名
      Ryosuke Imai,Yoshiaki Tsuda, Takashi Yamamoto,Yuki Tomizawa, Nazre Saleh,Alison K. S. Wee,Koji Takayama,Orlex B. Yllano,Severino Iii Salmo,Sarawood Sungkaew, Bayu Adjie,Erwin Ardli,Monica Suleiman,Nguyen X. Tung, Khinkhin Soe,Kathiresan Kandasamy,Takeshi Asakawa, Yasuyuki Watano,Shigeyuki Baba, Tadashi Kajita
    • 学会等名
      第26回日本マングローブ学会大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] リシークエンスデータから読み解く大西洋・東太平洋・南太平洋に分布するヤエヤマヒルギ属複数種の遺伝構造、集団動態および環境適応2020

    • 著者名/発表者名
      津田吉晃、今井亮介、岩崎貴也、山本崇、高山浩司、梶田忠
    • 学会等名
      森林遺伝育種学会第9回大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] Understanding Mangrove Through DNA Metabarcoding: a Case Study from Iriomote Island.2019

    • 著者名/発表者名
      Tadashi Kajita, Severino Salmo, Katsuya Ito, Hironori Toyama, Rintaro Shimoda, Takashi Yamamoto, Tetsuya Sado, Ryo Gotoh, Tomoyuki Komai, Masaki Miya
    • 学会等名
      5th International Mangrove, Macrobenthos and Management Meeting
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Multi-species Genetic Structure, Demography and Adaptation of the Mangrove Genus Rhizophora, Revealed by Re-sequencing Data: Implications for Conservation Genomics Under Climate Change2019

    • 著者名/発表者名
      Yoshiaki Tsuda,Ryosuke Imai, Takaya Iwasaki, Takashi Yamamoto, Munemitsu Akasaka, Koji Takayama, Tadashi Kajita.
    • 学会等名
      5th International Mangrove, Macrobenthos and Management Meeting
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] The Cold Stress Response of Indo-West Pacific Mangrove Species with Varying Latitudinal Limits.2019

    • 著者名/発表者名
      Aidan William Short, V.S. John Sunoj, Zhong Cai Ma, Chen Dan, Tadashi Kajita, Alison K S Wee
    • 学会等名
      5th International Mangrove, Macrobenthos and Management Meeting
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Genome-wide Insights into Low Temperature and Drought Stress Regulated Genes in Bruguiera gymnorhiza2019

    • 著者名/発表者名
      Alison K S Wee, Aidan William Short, Tianhui Yu, Huaitong Shi, Zhong Cai Ma, V.S. John Sunoj, John Parker,Tadashi Kajita, Kun-fang Cao
    • 学会等名
      5th International Mangrove, Macrobenthos and Management Meeting
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Delimiting Species In The Red Mangrove Rhizophora mangle Species Complex2019

    • 著者名/発表者名
      Gustavo Maruyama Mori, Andre Guilherme Madeira, Mariana Vargas Cruz, Koji Takayama, Yu Matsuki, Yoshihisa Suyama, Takaya Iwasaki, Yoshiaki Tsuda, Anete Pereira Souza, Maria Imaculada Zucchi, Tadashi Kajita
    • 学会等名
      5th International Mangrove, Macrobenthos and Management Meeting
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ゲノムデータを用いたマングローブ植物ホウガンヒルギの集団動態解析2019

    • 著者名/発表者名
      Imai R, Tsuda Y, Yamamoto T, Tomizawa Y, Saleh MN, Wee AKS, Takayama K, Yllano OB, Salmo III SG, Sungkaew S, Adjie B, Ardli E, Suleiman M, Tung NX, Soe KK, Kandasamy K, Asakawa T, Watano Y, Baba S, Tadashi Kajita
    • 学会等名
      日本植物学会第83回大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] ゲノムデータが示す汎熱帯海流散布植物ナガミハマナタマメの遺伝的分化2019

    • 著者名/発表者名
      今井亮介・梶田結衣・山本崇・高山浩司・梶田忠
    • 学会等名
      日本植物分類学会第 19 回大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Multi-species genetic structure, demography and adaptation of the mangrove genus Rhizophora in the Atlantic East Pacific and South Pacific region, revealed by re-sequencing data2018

    • 著者名/発表者名
      Yoshiaki Tsuda, Takashi Yamamoto, Ryosuke Imai, Takaya Iwasaki, Koji Takayama, Tadashi Kajita
    • 学会等名
      SMBE 2018
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Post-glacial expansion and admixture effects on the intra-oceanic genetic structure of widespread sea-dispersed plants Vigna marina in the Asia-Pacific region2018

    • 著者名/発表者名
      Koji Takayama, Takashi Yamamoto, Yoshiaki Tsuda, Reiko Nagashima, Yoichi Tateishi, Ryosuke Imai, Yu Takahashi, Norihiko Tomooka, Ken Naito, Tadashi Kajita
    • 学会等名
      7th International Legume Conference
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] リシークエンスデータからみたヤエヤマヒルギ属の遺伝構造および集団動態パターン2018

    • 著者名/発表者名
      津田吉晃, 山本崇, 今井亮介, 岩崎貴也, 高山浩司, 梶田忠
    • 学会等名
      日本植物分類学会第17回大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 広域分布する 海流散布植物の比較系統地理学研究2018

    • 著者名/発表者名
      山本崇, 今井亮介, 高山浩司, 津田吉晃, 梶田忠
    • 学会等名
      日本植物分類学会第17回大会,
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Global phylogeography of the mangrove genus Rhizophora: separation and reunion across the ocean2017

    • 著者名/発表者名
      Koji Takayama
    • 学会等名
      XIX International Botanical Congress
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] The integration and application of genetics in mangrove conservation2017

    • 著者名/発表者名
      Alison K.S. Wee, Gustavo M. Mori, Aidan W. Short, Tianhui Yu, Catarina F. Lira-Medeiros, Juan Nunez-Farfan, Koji Takayama, Leanne Faulks, Suhua Shi, Yoshiaki Tsuda, Yoshihisa Suyama, Takashi Yamamoto, Takaya Iwasaki, Yukio Nagano, Zhengzhen Wang, Shin Watanabe, Tadashi Kajita
    • 学会等名
      XIX International Botanical Congress
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] A multiple disciplinary approach to unveil the evolutionary history of New World Rhizophora2017

    • 著者名/発表者名
      Gustavo Maruyama Mori, Takaya Iwasaki, Mariana Vargas, Stephanie Karenina Bajay, Koji Takayama, Yu Matsuki, Rafael Silva Oliveira, Yoshihisa Suyama, Anete Pereira De Souza, Suhua Shi, Maria Imaculada Zucchi, Tadashi Kajita
    • 学会等名
      XIX International Botanical Congress
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Genetic structure and population demography of widespread sea-dispersal legume Vigna marina in the Pacific2017

    • 著者名/発表者名
      Takashi Yamamoto, Yoshiaki Tsuda, Koji Takayama, Reiko Nagashima, Yoichi Tateishi, Tadashi Kajita
    • 学会等名
      XIX International Botanical Congress
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] What you will know about mangroves by studying DNA2017

    • 著者名/発表者名
      Tadashi Kajita
    • 学会等名
      2nd International Scientists Forum on Mangroves Seacology Sudeesa Sri Lanka
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 次世代シーケンシングデータで示されたRhizophora mangleおよび近縁種の遺伝構造2017

    • 著者名/発表者名
      山本 崇、今井 亮介、高山 浩司、津田 吉晃、梶田 忠
    • 学会等名
      平成29年度 第23回日本マングローブ学会大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 西表研究施設から発信するゲノムベースのマングローブ研究紹介2017

    • 著者名/発表者名
      梶田忠、山本崇、今井亮介、津田吉晃、高山浩司、岩崎貴哉、伊藤克哉、下田凜太郎、佐土哲也、後藤亮、宮正樹
    • 学会等名
      平成29年度 第23回日本マングローブ学会大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Global landscape genomics of mangrove plants2017

    • 著者名/発表者名
      16.Kajita T., Mori G.M. Iwasaki T., Tsuda Y., Koji T., Wee A.K.S., Yamamoto T., Nunez-Farfan J., Munemitsu A., Suyama Y
    • 学会等名
      IUCN Mangrove Symposium 2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [備考] マングローブ植物の全球分布と分化過程を解明―ヤエヤマヒルギ属の種・地域を網羅した系統解析―

    • URL

      https://www.u-ryukyu.ac.jp/news/21487/

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [備考] Workshop: Mangrove Conservation Genetics

    • URL

      http://nesseiken.info/?page_id=67&lang=english

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [備考] Workshop: Mangrove Conservation Genetics

    • URL

      http://nesseiken.info/?page_id=67

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会・シンポジウム開催] Evolution of mangroves: phylogeny, conservation genetics and genomics. T2-33 at the the XIX International Botanical Congress in 2017, Shenzen, China2017

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会・シンポジウム開催] Workshop: Mangrove Conservation Genetics, Shenzen, China2017

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書

URL: 

公開日: 2017-04-28   更新日: 2022-01-27  

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