シロアリ腸内微生物群集の網羅的シングルセル解析による複雑性成立機構の解明

• 研究課題/領域番号: 17H01447
• 研究種目: 基盤研究(A)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 生物多様性・分類
• 研究機関: 国立研究開発法人理化学研究所
• 研究代表者: 大熊 盛也 国立研究開発法人理化学研究所, バイオリソース研究センター, 室長 (10270597)
• 研究期間 (年度): 2017-04-01 – 2021-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2020年度)
• 配分額: 42,250千円 (直接経費: 32,500千円、間接経費: 9,750千円); 2020年度: 10,270千円 (直接経費: 7,900千円、間接経費: 2,370千円); 2019年度: 10,270千円 (直接経費: 7,900千円、間接経費: 2,370千円); 2018年度: 10,270千円 (直接経費: 7,900千円、間接経費: 2,370千円); 2017年度: 11,440千円 (直接経費: 8,800千円、間接経費: 2,640千円)
• キーワード: 共生 / 微生物群集 / ゲノム解析 / シングルセル / 微生物資源 / 微生物機能 / トランスクリプトーム / ゲノム / 難培養微生物 / シングルセル解析 / 微生物 / 生態学 / 進化

研究成果の概要

複雑ではあるが安定して再現性良く同一の微生物群集が得られるシロアリ腸内の共生微生物群集を主な対象として、細菌にはシングルセルゲノム解析、原生生物にはシングルセルトランスクリプトーム解析を実施して、群集を構成する個々の微生物種の機能と共生機構の解明を行った。二層構造のマイクロカプセルを用いた微量スケールのゲノム増幅により、操作性が簡便でありながら、より高いゲノム完全率が得られる効率的なシングルセルゲノム解析技術の開発にも成功した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

生態系の複雑な微生物群集を構成する個々の微生物種の機能を明らかにすることは、微生物間の相互作用と生態系や群集の成立・維持機構の理解に極めて重要で、ひとつひとつ解明されていくことは学術上に大きな進展である。シングルセルゲノム解析の技術が高度化・効率化される意義も大きく、従来技術と相補的となる。これらの進展により、自然界の生態系の理解と保全、そして、微生物の複合系の効果的な制御や人為構築などの革新的な産業応用技術のための基盤がもたらされる。

研究成果

• [国際共同研究] Chulalongkorn University/Eastern Asia University(タイ)
• [国際共同研究] University of Sydney(オーストラリア)
• [国際共同研究] National University of Singapore(シンガポール)
• [国際共同研究] Southwest University(中国)
• [雑誌論文] Conexivisphaera calida gen. nov., sp. nov., a thermophilic sulfur- and iron-reducing archaeon, and proposal of Conexivisphaeraceae fam. nov., Conexivisphaerales ord. nov., and Conexivisphaeria class. nov. in the phylum Thaumarchaeota (2021)
  • 著者名/発表者名: Kato Shingo、Ohnishi Masafumi、Nagamori Mai、Yuki Masahiro、Takashina Tomonori、Ohkuma Moriya、Itoh Takashi
  • 雑誌名: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 巻: 71 号: 1 ページ: 004595-004595
  • DOI: 10.1099/ijsem.0.004595
  • 査読あり
• [雑誌論文] Division of functional roles for termite gut protists revealed by single-cell transcriptomes (2020)
  • 著者名/発表者名: Nishimura Yuki、Otagiri Masato、Yuki Masahiro、Shimizu Michiru、Inoue Jun-ichi、Moriya Shigeharu、Ohkuma Moriya
  • 雑誌名: The ISME Journal 巻: 14 号: 10 ページ: 2449-2460
  • DOI: 10.1038/s41396-020-0698-z
  • 査読あり
• [雑誌論文] Parallel reductive genome evolution in Desulfovibrio ectosymbionts independently acquired by Trichonympha protists in the termite gut (2020)
  • 著者名/発表者名: Takeuchi Mariko、Kuwahara Hirokazu、Murakami Takumi、Takahashi Kazuki、Kajitani Rei、Toyoda Atsushi、Itoh Takehiko、Ohkuma Moriya、Hongoh Yuichi
  • 雑誌名: The ISME Journal 巻: 14 号: 9 ページ: 2288-2301
  • DOI: 10.1038/s41396-020-0688-1
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Increased Mutation Rate Is Linked to Genome Reduction in Prokaryotes (2020)
  • 著者名/発表者名: Bourguignon Thomas、Kinjo Yukihiro、Villa-Martin Paula、Coleman Nicholas V.、Tang Qian、Arab Daej A.、Wang Zongqing、Tokuda Gaku、Hongoh Yuichi、Ohkuma Moriya、Ho Simon Y.W.、Pigolotti Simone、Lo Nathan
  • 雑誌名: Current Biology 巻: 30 号: 19 ページ: 3848-3855.e4
  • DOI: 10.1016/j.cub.2020.07.034
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Lactococcus insecticola sp. nov. and Lactococcus hodotermopsidis sp. nov., isolated from the gut of the wood-feeding lower termite Hodotermopsis sjostedti (2020)
  • 著者名/発表者名: S. Noda, F. Koyama, C. Aihara, N. Ikeyama, M. Yuki, and M. Ohkuma, M. Sakamoto
  • 雑誌名: Int. J. Syst. Evol. Microbiol 巻: 70 号: 8 ページ: 4514-4522
  • DOI: 10.1099/ijsem.0.004309
  • 査読あり
• [雑誌論文] Actinomadura decatromicini sp. nov., isolated from mountain soil in Thailand (2020)
  • 著者名/発表者名: Songsumanus Apakorn、Kuncharoen Nattakorn、Kudo Takuji、Yuki Masahiro、Ohkuma Moriya、Igarashi Yasuhiro、Tanasupawat Somboon
  • 雑誌名: The Journal of Antibiotics 巻: 74 号: 1 ページ: 51-58
  • DOI: 10.1038/s41429-020-0353-y
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Nocardia aurantiaca sp. nov., isolated from soil in Thailand (2020)
  • 著者名/発表者名: Kanchanasin Pawina、Yuki Masahiro、Kudo Takuji、Ohkuma Moriya、Phongsopitanun Wongsakorn、Tanasupawat Somboon
  • 雑誌名: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 巻: 70 号: 10 ページ: 5432-5438
  • DOI: 10.1099/ijsem.0.004432
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Streptomyces mimosae sp. nov., an endophytic actinomycete isolated from the root of Mimosa pudica in Thailand (2020)
  • 著者名/発表者名: Klykleung Nattaporn、Yuki Masahiro、Kudo Takuji、Ohkuma Moriya、Phongsopitanun Wongsakorn、Inahashi Yuki、Matsumoto Atsuko、Tanasupawat Somboon
  • 雑誌名: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 巻: 70 号: 5 ページ: 3316-3322
  • DOI: 10.1099/ijsem.0.004170
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Cutibacterium modestum sp. nov., isolated from meibum of human meibomian glands, and emended descriptions of Cutibacterium granulosum and Cutibacterium namnetense. (2020)
  • 著者名/発表者名: Dekio I, Sakamoto M, Suzuki T, Yuki M, Kinoshita S, Murakami Y, Ohkuma M.
  • 雑誌名: Int J Syst Evol Microbiol 巻: 70 号: 4 ページ: 2457-2462
  • DOI: 10.1099/ijsem.0.004058
  • 査読あり
• [雑誌論文] Streptomyces bauhiniae sp. nov., isolated from tree bark of Bauhinia variegata Linn. in Thailand (2020)
  • 著者名/発表者名: Kanchanasin Pawina、Yuki Masahiro、Kudo Takuji、Ohkuma Moriya、Kuncharoen Nattakorn、Phongsopitanun Wongsakorn、Tanasupawat Somboon
  • 雑誌名: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 巻: 70 号: 1 ページ: 228-233
  • DOI: 10.1099/ijsem.0.003743
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Microbispora catharanthi sp. nov., a novel endophytic actinomycete isolated from the root of Catharanthus roseus (2020)
  • 著者名/発表者名: Klykleung Nattaporn、Yuki Masahiro、Kudo Takuji、Ohkuma Moriya、Phongsopitanun Wongsakorn、Pittayakhajonwut Pattama、Tanasupawat Somboon
  • 雑誌名: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 巻: 70 号: 2 ページ: 964-970
  • DOI: 10.1099/ijsem.0.003858
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Thermaurantimonas aggregans gen. nov., sp. nov., a moderately thermophilic heterotrophic aggregating bacterium isolated from microbial mats at a terrestrial hot spring (2020)
  • 著者名/発表者名: Iino Takao、Kawai Shigeru、Yuki Masahiro、Dekio Itaru、Ohkuma Moriya、Haruta Shin
  • 雑誌名: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 巻: 70 号: 2 ページ: 1117-1121
  • DOI: 10.1099/ijsem.0.003888
  • 査読あり
• [雑誌論文] Micromonospora musae sp. nov., an endophytic actinomycete isolated from roots of Musa species (2019)
  • 著者名/発表者名: Kuncharoen Nattakorn、Kudo Takuji、Yuki Masahiro、Okuma Moriya、Booncharoen Auttaporn、Tanasupawat Somboon
  • 雑誌名: Systematic and Applied Microbiology 巻: 42 号: 6 ページ: 126020-126020
  • DOI: 10.1016/j.syapm.2019.126020
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Nonomuraea phyllanthi sp. nov., an endophytic actinomycete isolated from the leaf of Phyllanthus amarus (2019)
  • 著者名/発表者名: Klykleung Nattaporn、Yuki Masahiro、Kudo Takuji、Ohkuma Moriya、Phongsopitanun Wongsakorn、Pittayakhajonwut Pattama、Tanasupawat Somboon
  • 雑誌名: Archives of Microbiology 巻: 202 号: 1 ページ: 55-61
  • DOI: 10.1007/s00203-019-01717-w
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Isolation and characterization of a thermophilic sulfur- and iron-reducing thaumarchaeote from a terrestrial acidic hot spring (2019)
  • 著者名/発表者名: Kato Shingo、Itoh Takashi、Yuki Masahiro、Nagamori Mai、Ohnishi Masafumi、Uematsu Katsuyuki、Suzuki Katsuhiko、Takashina Tomonori、Ohkuma Moriya
  • 雑誌名: The ISME Journal 巻: 13 号: 10 ページ: 2465-2474
  • DOI: 10.1038/s41396-019-0447-3
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Comparative genomics of Parolsenella catena and Libanicoccus massiliensis: Reclassification of Libanicoccus massiliensis as Parolsenella massiliensis comb. nov. (2019)
  • 著者名/発表者名: Sakamoto Mitsuo、Ikeyama Nao、Murakami Takumi、Mori Hiroshi、Yuki Masahiro、Ohkuma Moriya
  • 雑誌名: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 巻: 69 号: 4 ページ: 1123-1129
  • DOI: 10.1099/ijsem.0.003283
  • 査読あり
• [雑誌論文] Horizontally-acquired genetic elements in the mitochondrial genome of a centrohelid Marophrys sp. SRT127. (2019)
  • 著者名/発表者名: Yuki Nishimura, Takashi Shiratori, Ken-ichiro Ishida, Tetsuo Hashimoto, Moriya Ohkuma, Yuji Inagaki
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 9 号: 1 ページ: 4850-4850
  • DOI: 10.1038/s41598-019-41238-6
  • NAID: 120007128095
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] マイクロビオームの一細胞解析技術の現状（The current state of single-cell analysis for microbiome） (2019)
  • 著者名/発表者名: 雪 真弘、大熊盛也
  • 雑誌名: 実験医学（Experimental Medicine） 巻: 37 ページ: 186-191
  • 査読あり
• [雑誌論文] Draft Genome Sequence of Lactococcus sp. Strain NtB2, Isolated from the Gut of the Termite Nasutitermes takasagoensis (2018)
  • 著者名/発表者名: S. Noda, C. Aihara, M. Yuki, and M. Ohkuma
  • 雑誌名: Genome Announc 巻: 6 号: 24
  • DOI: 10.1128/genomea.00445-18
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Lactococcus termiticola sp. nov., isolated from the gut of higher termite Nasutitermes takasagoensis (2018)
  • 著者名/発表者名: S. Noda, M. Sakamoto, C. Aihara, M. Yuki, M. Katsuhara, and M. Ohkuma
  • 雑誌名: IJSEM 巻: 68 号: 12 ページ: 3832-3836
  • DOI: 10.1099/ijsem.0.003068
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genome analyses of uncultured TG2/ZB3 bacteria in ‘Margulisbacteria’ specifically attached to ectosymbiotic spirochetes of protists in the termite gut (2018)
  • 著者名/発表者名: Utami Yuniar Devi、Kuwahara Hirokazu、Igai Katsura、Murakami Takumi、Sugaya Kaito、Morikawa Takahiro、Nagura Yuichi、Yuki Masahiro、Deevong Pinsurang、Inoue Tetsushi、Kihara Kumiko、Lo Nathan、Yamada Akinori、Ohkuma Moriya、Hongoh Yuichi
  • 雑誌名: The ISME Journal 巻: 13 号: 2 ページ: 455-467
  • DOI: 10.1038/s41396-018-0297-4
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Ectosymbiotic bacterial microbiota densely colonize the surface of thelastomatid nematodes in the gut of the wood-feeding cockroach Panesthia angustipennis (2018)
  • 著者名/発表者名: Murakami Takumi、Onouchi Shu、Igai Katsura、Ohkuma Moriya、Hongoh Yuichi
  • 雑誌名: FEMS Microbiology Ecology 巻: 95 号: 2
  • DOI: 10.1093/femsec/fiy238
  • 査読あり
• [雑誌論文] Tempo and Mode of Genome Evolution in the Budding Yeast Subphylum (2018)
  • 著者名/発表者名: Shen Xing-Xing et al.
  • 雑誌名: Cell 巻: 175 号: 6 ページ: 1533-1545.e20
  • DOI: 10.1016/j.cell.2018.10.023
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Novel Self-Transmissible and Broad-Host-Range Plasmids Exogenously Captured From Anaerobic Granules or Cow Manure (2018)
  • 著者名/発表者名: Yanagiya Kosuke、Maejima Yoshiaki、Nakata Hiroki、Tokuda Maho、Moriuchi Ryota、Dohra Hideo、Inoue Kengo、Ohkuma Moriya、Kimbara Kazuhide、Shintani Masaki
  • 雑誌名: Frontiers in Microbiology 巻: 9 ページ: 2602-2602
  • DOI: 10.3389/fmicb.2018.02602
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Lactobacillus paragasseri sp. nov., a sister taxon of Lactobacillus gasseri, based on whole-genome sequence analyses (2018)
  • 著者名/発表者名: Tanizawa Y, Tada I, Kobayashi H, Endo A, Maeno S, Toyoda A, Arita M, Nakamura Y, Sakamoto M, Ohkuma M, Tohno M
  • 雑誌名: Int J Syst Evol Microbiol 巻: 68 号: 11 ページ: 3512-3517
  • DOI: 10.1099/ijsem.0.003020
  • 査読あり
• [雑誌論文] Complete Genome Sequence of Ferriphaselus amnicola Strain OYT1, a Neutrophilic, Stalk-Forming, Iron-Oxidizing Bacterium (2018)
  • 著者名/発表者名: Kato Shingo、Yuki Masahiro、Itoh Takashi、Ohkuma Moriya
  • 雑誌名: Microbiology Resource Announcements 巻: 7 号: 12
  • DOI: 10.1128/mra.00911-18
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Draft Genome Sequence of Faecalimonas umbilicata JCM 30896T, an Acetate-Producing Bacterium Isolated from Human Feces (2018)
  • 著者名/発表者名: Sakamoto Mitsuo、Ikeyama Nao、Yuki Masahiro、Ohkuma Moriya
  • 雑誌名: Microbiology Resource Announcements 巻: 7 号: 9
  • DOI: 10.1128/mra.01091-18
  • 査読あり
• [雑誌論文] Parallel and Gradual Genome Erosion in the Blattabacterium Endosymbionts of Mastotermes darwiniensis and Cryptocercus Wood Roaches (2018)
  • 著者名/発表者名: Kinjo Yukihiro、Bourguignon Thomas、Tong Kwei Jun、Kuwahara Hirokazu、Lim Sang Jin、Yoon Kwang Bae、Shigenobu Shuji、Park Yung Chul、Nalepa Christine A、Hongoh Yuichi、Ohkuma Moriya、Lo Nathan、Tokuda Gaku
  • 雑誌名: Genome Biology and Evolution 巻: 10 号: 6 ページ: 1622-1630
  • DOI: 10.1093/gbe/evy110
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Draft Genome Sequence of Lawsonibacter asaccharolyticus JCM 32166 T , a Butyrate-Producing Bacterium, Isolated from Human Feces (2018)
  • 著者名/発表者名: Sakamoto Mitsuo、Ikeyama Nao、Yuki Masahiro、Ohkuma Moriya
  • 雑誌名: Genome Announcements 巻: 6 号: 25
  • DOI: 10.1128/genomea.00563-18
  • 査読あり
• [雑誌論文] Lactobacillus metriopterae sp. nov., a novel lactic acid bacterium isolated from the gut of grasshopper Metrioptera engelhardti (2018)
  • 著者名/発表者名: Chiba Makoto、Itabashi Takanori、Hirai Koujiro、Sakamoto Mitsuo、Ohkuma Moriya、Ishige Taichiro、Kawasaki Shinji
  • 雑誌名: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 巻: 68 号: 5 ページ: 1484-1489
  • DOI: 10.1099/ijsem.0.002694
  • 査読あり
• [雑誌論文] Lactococcus reticulitermitis sp. nov., isolated from the gut of the subterranean termite Reticulitermes speratus (2018)
  • 著者名/発表者名: Yuki Masahiro、Sakamoto Mitsuo、Nishimura Yuki、Ohkuma Moriya
  • 雑誌名: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 巻: 68 号: 2 ページ: 596-601
  • DOI: 10.1099/ijsem.0.002549
  • 査読あり
• [雑誌論文] Host-Symbiont Cospeciation of Termite-Gut Cellulolytic Protists of the Genera <i>Teranympha</i> and <i>Eucomonympha</i> and their <i>Treponema</i> Endosymbionts (2018)
  • 著者名/発表者名: Noda Satoko、Shimizu Daichi、Yuki Masahiro、Kitade Osamu、Ohkuma Moriya
  • 雑誌名: Ｍｉｃｒｏｂｅｓ ａｎｄ ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔｓ 巻: 33 号: 1 ページ: 26-33
  • DOI: 10.1264/jsme2.ME17096
  • NAID: 130006581788
  • ISSN: 1342-6311, 1347-4405
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Phylogenetic Diversity and Single-Cell Genome Analysis of “<i>Melainabacteria</i>”, a Non-Photosynthetic Cyanobacterial Group, in the Termite Gut (2018)
  • 著者名/発表者名: Utami Yuniar Devi、Kuwahara Hirokazu、Murakami Takumi、Morikawa Takahiro、Sugaya Kaito、Kihara Kumiko、Yuki Masahiro、Lo Nathan、Deevong Pinsurang、Hasin Sasitorn、Boonriam Warin、Inoue Tetsushi、Yamada Akinori、Ohkuma Moriya、Hongoh Yuichi
  • 雑誌名: Ｍｉｃｒｏｂｅｓ ａｎｄ ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔｓ 巻: 33 号: 1 ページ: 50-57
  • DOI: 10.1264/jsme2.ME17137
  • NAID: 130006581744
  • ISSN: 1342-6311, 1347-4405
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Multiple losses of photosynthesis and convergent reductive genome evolution in the colourless green algae Prototheca (2018)
  • 著者名/発表者名: Shigekatsu Suzuki, Rikiya Endoh, Ri-ichiroh Manabe, Moriya Ohkuma, Yoshihisa Hirakawa
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 8 号: 1 ページ: 940-940
  • DOI: 10.1038/s41598-017-18378-8
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Draft Genome Sequence of Lactococcus sp. Strain Rs-Y01, Isolated from the Gut of the Lower Termite Reticulitermes speratus (2017)
  • 著者名/発表者名: Yuki Masahiro、Sakamoto Mitsuo、Kuwahara Hirokazu、Hongoh Yuichi、Ohkuma Moriya
  • 雑誌名: Genome Announcements 巻: 5 号: 38
  • DOI: 10.1128/genomea.00999-17
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Pseudonocardia thailandensis sp. nov., an actinomycete isolated from a subterranean termite nest (2017)
  • 著者名/発表者名: Sujarit Kanaporn、Sujada Nikhom、Kudo Takuji、Ohkuma Moriya、Pathom-Aree Wasu、Lumyong Saisamorn
  • 雑誌名: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 巻: 67 号: 8 ページ: 2773-2778
  • DOI: 10.1099/ijsem.0.002017
  • 査読あり
• [雑誌論文] Screening and evolution of a novel protist xylose isomerase from the termite Reticulitermes speratus for efficient xylose fermentation in Saccharomyces cerevisiae (2017)
  • 著者名/発表者名: Katahira Satoshi、Muramoto Nobuhiko、Moriya Shigeharu、Nagura Risa、Tada Nobuki、Yasutani Noriko、Ohkuma Moriya、Onishi Toru、Tokuhiro Kenro
  • 雑誌名: Biotechnology for Biofuels 巻: 10 号: 1 ページ: 203-203
  • DOI: 10.1186/s13068-017-0890-1
  • 査読あり
• [雑誌論文] Discovery of ectosymbiotic Endomicrobium lineages associated with protists in the gut of stolotermitid termites (2017)
  • 著者名/発表者名: Izawa Kazuki、Kuwahara Hirokazu、Sugaya Kaito、Lo Nathan、Ohkuma Moriya、Hongoh Yuichi
  • 雑誌名: Environmental Microbiology Reports 巻: 9 号: 4 ページ: 411-418
  • DOI: 10.1111/1758-2229.12549
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Different transferability of incompatibility (Inc) P-7 plasmid pCAR1 and IncP-1 plasmid pBP136 in stirring liquid conditions (2017)
  • 著者名/発表者名: Nakazawa Shunsuke、Haramiishi Akira、Fukuda Kohei、Kanayama Yukie、Watanabe Toshinori、Yuki Masahiro、Ohkuma Moriya、Takeda Kazuhiro、Kimbara Kazuhide、Shintani Masaki
  • 雑誌名: PLOS ONE 巻: 12 号: 10 ページ: e0186248-e0186248
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0186248
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Draft Genome Sequence of Tepidibacter mesophilus Strain JCM 16806T Isolated from Soil Polluted by Crude Oil in China (2017)
  • 著者名/発表者名: Lee Chol Gyu、Yuki Masahiro、Iida Toshiya、Nakaho Kazuhiro、Ohkuma Moriya
  • 雑誌名: Genome Announcements 巻: 5 号: 47
  • DOI: 10.1128/genomea.01308-17
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] シロアリ腸内原生生物共生Endomicrobium属細菌の完全長ゲノム比較で見出された基幹代謝系の改変 (2021)
  • 著者名/発表者名: 吉岡拓哉, 伊澤和輝, 桑原宏和, 竹内真理子, 加藤大貴, 澤村岩風, 大熊盛也, 本郷裕一
  • 学会等名: 第15回日本ゲノム微生物学会年会
• [学会発表] シロアリ腸内原生生物に細胞内共生するClostridiales目細菌の比較ゲノム解析 (2021)
  • 著者名/発表者名: 高橋一樹, 桑原宏和, 堀川雄太郎, 伊澤和輝, 雪真弘, 大熊盛也, 本郷裕一
  • 学会等名: 第15回日本ゲノム微生物学会年会
• [学会発表] シロアリ腸内原生生物Mixotricha paradoxa細胞表面共生Bacteroidales目細菌のゲノム解析 (2021)
  • 著者名/発表者名: 傅 潔洋、桑原宏和、木原久美子，大熊盛也、本郷裕一
  • 学会等名: 第15回日本ゲノム微生物学会年会
• [学会発表] シロアリ腸内原生生物運動共生スピロヘータのゲノム解析 (2021)
  • 著者名/発表者名: Yiting Liu, 桑原宏和, 間渕貴子，木原久美子，大熊盛也，本郷裕一
  • 学会等名: 第15回日本ゲノム微生物学会年会
• [学会発表] コレステロール低下作用を有する孟宗竹リグノヘミセルロースの調製と作用機構の解析 (2021)
  • 著者名/発表者名: 王 建鵬、平本 茂、盧 超、池山 菜緒、雪 真弘、大熊 盛也、坂本 光央、椎葉 究
  • 学会等名: 日本農芸化学会2021年度大会
• [学会発表] 同一不和合性群に属する塩基組成の異なるプラスミドの宿主域比較 (2021)
  • 著者名/発表者名: 德田 真穂、鈴木 治夫、雪 真弘、大熊 盛也、金原 和秀、新谷 政己
  • 学会等名: 日本農芸化学会2021年度大会
• [学会発表] IncPromA群に属するプラスミドの異なる温度条件下での挙動の比較 (2021)
  • 著者名/発表者名: 千葉 怜碧、德田 真穂、雪 真弘、大熊 盛也、金原 和秀、新谷 政己
  • 学会等名: 日本農芸化学会2021年度大会
• [学会発表] Plasmids with different base composition showed different host ranges (2020)
  • 著者名/発表者名: Maho Tokuda, Haruo Suzuki, Masahiro Yuki, Moriya Ohkuma, Kazuhide Kimbara, Masaki Shintani
  • 学会等名: FEMS ONLINE CONFERENCE ON MICROBIOLOGY 2020
  • 国際学会
• [学会発表] 同一不和合性群に属する塩基組成の異なるプラスミドの宿主域比較 (2020)
  • 著者名/発表者名: 德田真穂，鈴木治夫，雪真弘，大熊盛也，水口千穂，野尻秀昭，金原和秀，新谷政己
  • 学会等名: 日本進化学会第22回オンライン大会
• [学会発表] 不和合性群IncPromA群に属するプラスミドの異なる温度条件下における挙動の比較 (2020)
  • 著者名/発表者名: 千葉怜碧，德田真穂，雪真弘，大熊盛也，金原和秀，新谷政己
  • 学会等名: 日本進化学会第22回オンライン大会
• [学会発表] Single-cell genomics of termite-gut symbionts. (2019)
  • 著者名/発表者名: Moriya Ohkuma
  • 学会等名: Okinawa Institute of Science and Technology Graduate University (OIST) Mini-Symposium “Ecology and Evolution of Termite Gut Microbes”
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Cultured microbial resources and single-cell genomics of yet-uncultured for integrated symbiology. (2019)
  • 著者名/発表者名: Moriya Ohkuma
  • 学会等名: RIKEN-Japan Society of Symbiosis Joint Symposium "Toward applied symbiosis biology"
  • 招待講演
• [学会発表] Sutterellaceae 科に属する新菌種 (2019)
  • 著者名/発表者名: 坂本光央、池山菜緒、國弘忠生、飯野隆夫、雪真弘、大熊盛也
  • 学会等名: 第93回日本細菌学会総会
• [学会発表] Recent Activities of RIKEN BRC-JCM (2019)
  • 著者名/発表者名: Moriya Ohkuma
  • 学会等名: Asian Network of Research Resource Centers, the 11th International Meeting
  • 国際学会
• [学会発表] Spirotrichonymphea 綱原生生物の分子系統解析 (2019)
  • 著者名/発表者名: 野田 悟子、北出 理、大熊盛也
  • 学会等名: 第52回日本原生生物学会大会
• [学会発表] ヤマトシロアリ腸内オキシモナス群集におけるエコタイプ仮説の検証 (2019)
  • 著者名/発表者名: 猪飼 桂、北出 理、傅 潔洋、大熊 盛也、本郷 裕一
  • 学会等名: 第52回日本原生生物学会大会
• [学会発表] 難培養微生物のシングルセルゲノム解析 (2019)
  • 著者名/発表者名: 雪 真弘、大熊 盛也
  • 学会等名: 第52回日本原生生物学会大会
  • 招待講演
• [学会発表] シロアリ腸内原生生物と細胞内・表面共生細菌間の相互作用 (2019)
  • 著者名/発表者名: 雪 真弘、大熊 盛也
  • 学会等名: 日本微生物生態学会第33回大会
  • 招待講演
• [学会発表] シロアリ腸内から分離された新規 Paraburkholderia 属細菌 2 種の比較解析 (2019)
  • 著者名/発表者名: 雪 真弘, 高島 昌子, 清水 美智留, 加藤 真悟, 大熊 盛也
  • 学会等名: 日本微生物生態学会第33回大会
• [学会発表] ヤマトシロアリ腸内に共生する原生生物の多様性と機能の解析 (2019)
  • 著者名/発表者名: 西村 祐貴, 佐藤 渚, 大熊 盛也
  • 学会等名: 日本微生物生態学会第33回大会
• [学会発表] 原生生物細胞内共生 Endomicrobium 属細菌の宿主環境への適応進化による基幹代謝系の改変 (2019)
  • 著者名/発表者名: 伊澤 和輝 , 雪 真弘, 吉岡 拓哉, 桑原 宏和, 大熊 盛也, 本郷 裕一
  • 学会等名: 日本微生物生態学会第33回大会
• [学会発表] シロアリ腸内から分離された Burkholderia sp. 2 種の比較ゲノム解析 (2019)
  • 著者名/発表者名: 雪 真弘, 高島 昌子, 清水 美智留, 加藤 真悟, 大熊 盛也
  • 学会等名: 日本微生物生資源学会第33回大会
• [学会発表] 難培養性原生生物におけるシングルセルトランスクリプトーム: シロアリ共生原生生物をモデルとして (2019)
  • 著者名/発表者名: 西村 祐貴、小田切 正人、雪 真弘、守屋 繁春、大熊 盛也
  • 学会等名: 第13回日本ゲノム微生物学会年会
• [学会発表] シロアリ腸内に共生する原生生物のTreponema 属細胞内共生細菌の比較ゲノム解析 (2018)
  • 著者名/発表者名: Masahiro Yuki, Hirokazu Kuwahara, Satoko Noda, Yuichi Hongoh, Moriya Ohkuma
  • 学会等名: 日本微生物生態学会第32回大会
• [学会発表] 高等シロアリNasutitermes takasagoensis の腸内から単離したLactococcus 属の新種 (L. termiticola) (2018)
  • 著者名/発表者名: Chihiro Aihara, Megumi Katsuhara, Mitsuo Sakamoto, Masahiro Yuki, Moriya Ohkuma, Satoko Noda
  • 学会等名: 日本微生物生態学会第32回大会
• [学会発表] シングルセルに基づくシロアリ腸内原生生物のトランスクリプトーム解析 (2018)
  • 著者名/発表者名: Yuki Nishimura, Masato Otagiri, Masahiro Yuki, , Michiru Shimizu, Nagisa Sato, Shigeharu Moriya, Moriya Ohkuma
  • 学会等名: 日本微生物生態学会第32回大会
• [学会発表] Genome analyses of uncultured ZB3/TG2 bacteria (“Margulisbacteria”) attached to ectosymbiotic spirochetes of protist cells in the termite gut (2018)
  • 著者名/発表者名: Yuniar Devi Utami, Masahiro Yuki, Akinori Yamada, Moriya Ohkuma, Yuichi Hongoh
  • 学会等名: 17th International Symposium on Microbial Ecology (ISME17)
  • 国際学会
• [学会発表] Insight into adaptive genome evolution: comparative genomics of Desulfovibrio symbionts of termite-gut protists and a free-living relative (2018)
  • 著者名/発表者名: Mariko Kasuya, Hirokazu Kuwahara, Takumi Murakami, Atsushi Toyoda, Moriya Ohkuma, Yuichi Hongoh
  • 学会等名: 17th International Symposium on Microbial Ecology (ISME17)
  • 国際学会
• [学会発表] Genome analysis of a methanogenic endosymbiont of a novel Mixotricha protist species in the termite gut (2018)
  • 著者名/発表者名: Miho Sakai, Katsura Igai, Takako Mabuchi, Hirokazu Kuwahara, Nathan Lo, Moriya Ohkuma, Kumiko Kihara, Yuichi Hongoh
  • 学会等名: 17th International Symposium on Microbial Ecology (ISME17)
  • 国際学会
• [学会発表] Single cell transcriptome analyses of symbiotic protists in wood-feeding termites (2018)
  • 著者名/発表者名: Yuki Nishimura, Masato Otagiri, Masahiro Yuki, Michiru Shimiu, Nagisa Sato, Shigeharu Moriya, Moriya Ohkuma
  • 学会等名: 17th International Symposium on Microbial Ecology (ISME17)
  • 国際学会
• [学会発表] True Diversity and Phylogenetic Relationships of Oxymonad Protists in the Gut of the Termite Reticulitermes speratus (2018)
  • 著者名/発表者名: Katsura Igai, Osamu Kitade, Moriya Ohkuma,, hYuichi Hongoh
  • 学会等名: The 5th joint meeting of the Phycological Society of America & International Society of Protistologists
  • 国際学会
• [学会発表] Next generation technology for integrated symbiology and microbial resources of symbionts (2018)
  • 著者名/発表者名: Moriya Okuma
  • 学会等名: RIKEN International Symposium "Frontiers in Integrated Symbiology"
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] シングルセルゲノム解析によるシロアリ腸内原生生物と細胞内・表面共生細菌の共生関係の解明 (2017)
  • 著者名/発表者名: 雪 真弘、大熊盛也
  • 学会等名: 第50回日本原生生物学会大会第１回日本共生生物学会大会合同大会
  • 招待講演
• [学会発表] シングルセルトランスクリプトームによりシロアリ腸内原生生物の一種がキチン分解を通して効率的な窒素の利用に資することが示された (2017)
  • 著者名/発表者名: 西村祐貴、小田切正人、雪 真弘、井上潤一、守屋 繁春、大熊 盛也
  • 学会等名: 第50回日本原生生物学会大会第１回日本共生生物学会大会合同大会
• [学会発表] Activity of RIKEN BRC JCM to contribute microbial researches in Asia (2017)
  • 著者名/発表者名: Moriya Ohkuma
  • 学会等名: Joint Meeting of the 9th ANRRC International Meeting and International Microbiome Workshop
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] シングルセルトランスクリプトームに基づくイエシロアリ共生原生生物の機能解明 (2017)
  • 著者名/発表者名: 西村祐貴、小田切正人、雪 真弘、井上潤一、守屋 繁春、大熊 盛也
  • 学会等名: 環境微生物系学会合同大会2017
• [学会発表] 環境微生物研究に貢献するカルチャーコレクションのあり方 (2017)
  • 著者名/発表者名: 大熊盛也
  • 学会等名: 環境微生物系学会合同大会2017
  • 招待講演
• [学会発表] シングルセルゲノム解析から推定された原生生物細胞表面共生細菌のファージ感染耐性機構 (2017)
  • 著者名/発表者名: 雪 真弘、桑原宏和、河合幹彦、伊澤和輝、Starns David、清水、美智留、野田悟子、本郷裕一、大熊盛也
  • 学会等名: 環境微生物系学会合同大会2017
• [備考] 理研ニュース研究最前線2018年4月号pp6-9 腸内細菌で健康や環境に貢献する
  • URL: http://www.riken.jp/~/media/riken/pr/publications/news/2018/rn201804.pdf
• [備考] 理研ニュース2018年4月号研究最前線「腸内細菌で健康や環境に貢献する」
  • URL: http://www.riken.jp/~/media/riken/pr/publications/news/2018/rn201804.pdf