クロマチン組成が規定する骨格筋分化制御機構の解明

• 研究課題/領域番号: 17H03608
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: ゲノム生物学
• 研究機関: 九州大学
• 研究代表者: 大川 恭行 九州大学, 生体防御医学研究所, 教授 (80448430)
• 研究期間 (年度): 2017-04-01 – 2020-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2019年度)
• 配分額: 17,030千円 (直接経費: 13,100千円、間接経費: 3,930千円); 2019年度: 4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円); 2018年度: 5,720千円 (直接経費: 4,400千円、間接経費: 1,320千円); 2017年度: 6,370千円 (直接経費: 4,900千円、間接経費: 1,470千円)
• キーワード: クロマチン / ヒストンバリアント / 骨格筋分化 / 転写調節 / エピゲノム解析 / 発現制御 / 遺伝子 / 発生・分化 / エピゲノム / クロマチン構造 / 細胞分化

研究成果の概要

細胞分化では、転写因子、ヒストン修飾を始めとする様々なエピゲノム制御により、一群の分化関連遺伝子が選択的に発現する。近年、ヒストンバリアントが特定の組成比でクロマチン構造を形成し、ゲノム上の遺伝子の選択から転写量調節まで幅広く関与していることが明らかとなった。しかし、その成立機序や機能は未だ不明な点が多い。そこで、本研究では骨格筋幹細胞から成熟した筋組織に至る過程の様々な前駆細胞、成熟筋組織に至る過程で、新規に同定した骨格筋特異的ヒストンバリアントが分化遺伝子の選択から、発現後の転写レベル調節を行う際のゲノム上のクロマチン組成とその機能解明を行い、一部は論文発表し、残りは論文投稿中である。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究では、骨格筋幹細胞から筋肉を形成する遺伝子発現プログラムの解明を進めた。細胞内の遺伝子発現は、クロマチン構造の変換により制御されている。その構造を担っているのが、ヒストンである。本研究ではヒストンの亜種の解析、特に骨格筋幹細胞に発現するものに焦点を絞って解析を行い、骨格筋分化を促進、あるいは阻害する機能をもつ新規ヒストンを同定した。今後これらヒストンを起点とした筋再生機構の解明や応用が期待できる。

研究成果

• [雑誌論文] The role of galanin in the differentiation of mucosal mast cells in mice. (2020)
  • 著者名/発表者名: Yamaguchi T., Ikeda Y., Tashiro K., Ohkawa Y., Kawabata K.
  • 雑誌名: Eur. J. Immunol. 巻: 50 号: 1 ページ: 110-118
  • DOI: 10.1002/eji.201848061
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• [雑誌論文] Chromatin-bound CRM1 recruits SET-Nup214 and NPM1c onto HOX clusters causing aberrant HOX expression in leukemia cells. (2019)
  • 著者名/発表者名: Oka M, Mura S, Otani M, Miyamoto Y, Nogami J, Maehara K, Harada A, Tachibana T, Yoneda Y, Ohkawa Y
  • 雑誌名: Elife 巻: 8
  • DOI: 10.7554/elife.46667
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• [雑誌論文] Cell competition corrects noisy Wnt morphogen gradients to achieve robust patterning in the zebrafish embryo (2019)
  • 著者名/発表者名: Akieda Yuki、Ogamino Shohei、Furuie Hironobu、Ishitani Shizuka、Akiyoshi Ryutaro、Nogami Jumpei、Masuda Takamasa、Shimizu Nobuyuki、Ohkawa Yasuyuki、Ishitani Tohru
  • 雑誌名: Nature Communications 巻: 10 号: 1 ページ: 4710-4710
  • DOI: 10.1038/s41467-019-12609-4
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• [雑誌論文] Sustained expression of HeyL is critical for the proliferation of muscle stem cells in overloaded muscle. (2019)
  • 著者名/発表者名: Fukuda S, Kaneshige A, Kaji T, Noguchi YT, Takemoto Y, Zhang L, Tsujikawa K, Kokubo H, Uezumi A, Maehara K, Harada A, Ohkawa Y, Fukada SI.
  • 雑誌名: eLife 巻: 8
  • DOI: 10.7554/elife.48284
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• [雑誌論文] Calcineurin Broadly Regulates the Initiation of Skeletal Muscle-Specific Gene Expression by Binding Target Promoters and Facilitating the Interaction of the SWI/SNF Chromatin Remodeling Enzyme. (2019)
  • 著者名/発表者名: Witwicka H, Nogami J, Syed SA, Maehara K, Padilla-Benavides T, Ohkawa Y, Imbalzano AN
  • 雑誌名: Mol Cell Biol. 巻: 39 号: 19
  • DOI: 10.1128/mcb.00063-19
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• [雑誌論文] The Eleanor ncRNAs activate the topological domain of the ESR1 locus to balance against apoptosis. (2019)
  • 著者名/発表者名: †Abdalla MOA, †Yamamoto T, Maehara K, Ohkawa Y, Miura H, Hiratani I, Nakayama H, Nakao M, *Saitoh N
  • 雑誌名: Nat Commun 巻: 10 号: 1 ページ: 3778-3778
  • DOI: 10.1038/s41467-019-11378-4
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• [雑誌論文] Biochemical analysis of nucleosome targeting by Tn5 transposase (2019)
  • 著者名/発表者名: Sato S, Arimura Y, Kujirai T, Harada A, Maehara K, Nogami J, Ohkawa Y, Kurumizaka H.
  • 雑誌名: Open Biol. 巻: 9 号: 8 ページ: 190116-190116
  • DOI: 10.1098/rsob.190116
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• [雑誌論文] Dmrt factors determine the positional information of cerebral cortical progenitors via differential suppression of homeobox genes. (2019)
  • 著者名/発表者名: Konno D, Kishida C, Maehara K, Ohkawa Y, Kiyonari H, Okada S, Matsuzaki F
  • 雑誌名: Development 巻: 146 号: 15 ページ: 174243-174243
  • DOI: 10.1242/dev.174243
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• [雑誌論文] Anti-tumour effects of antimicrobial peptides, components of the innate immune system, against haematopoietic tumours in Drosophila mxc mutants. (2019)
  • 著者名/発表者名: Araki M, Kurihara M, Kinoshita S, Awane R, Sato T, Ohkawa Y, Inoue YH
  • 雑誌名: Dis Model Mech. 巻: 12 号: 6
  • DOI: 10.1242/dmm.037721
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• [雑誌論文] Regulation of ectopic heterochromatin-mediated epigenetic diversification by the JmjC family protein Epe1. (2019)
  • 著者名/発表者名: Sorida M, Hirauchi T, Ishizaki H, Kaito W, Shimada A, Mori C, Chikashige Y, Hiraoka Y, Suzuki Y, Ohkawa Y, Kato H, Takahata S, Murakami Y
  • 雑誌名: PLoS Genet. 巻: 15
  • NAID: 120007002166
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• [雑誌論文] CLEC3A, MMP7, and LCN2 as Novel Markers for Predicting Recurrence in Resected G1 and G2 Pancreatic Neuroendocrine Tumors (2019)
  • 著者名/発表者名: Miki M, Oono T, Fujimori N, Takaoka T, Kawabe K, Miyasaka Y, Ohtsuka T, Saito D, Nakamura M, Ohkawa Y, Oda N, Suyama M, Ito T, Ogawa Y.
  • 雑誌名: Cancer Medicine 巻: in press 号: 8 ページ: 3748-3760
  • DOI: 10.1002/cam4.2232
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• [雑誌論文] Macrophage centripetal migration drives spontaneous healing process after spinal cord injury (2019)
  • 著者名/発表者名: Kobayakawa K、Ohkawa Y、 Yoshizaki S、T、Saito T、Kijima Ken、Yokota K、Hara M、Kubota K、Matsumoto Y、Harimaya K、Ozato K、Masuda T、Tsuda M、Tamura T、Inoue K、Edgerton V. R、Iwamoto Y、Nakashima Y、Okada S
  • 雑誌名: Science Advances 巻: 5 号: 5
  • DOI: 10.1126/sciadv.aav5086
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• [雑誌論文] Locomotor Training Increases Synaptic Structure With High NGL-2 Expression After Spinal Cord Hemisection (2019)
  • 著者名/発表者名: Kobayakawa Kazu、DePetro Kyleigh Alexis、Zhong Hui、Pham Bau、Hara Masamitsu、Harada Akihito、Nogami Jumpei、Ohkawa Yasuyuki、Edgerton V. Reggie
  • 雑誌名: Neurorehabilitation and Neural Repair 巻: 33 号: 3 ページ: 225-231
  • DOI: 10.1177/1545968319829456
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• [雑誌論文] miR-124 dosage regulates prefrontal cortex function by dopaminergic modulation. (2019)
  • 著者名/発表者名: Kozuka T, Omori Y, Watanabe S, Tarusawa E, Yamamoto H, Chaya T, Furuhashi M, Morita M, Sato T, Hirose S, Ohkawa Y, Yoshimura Y, Hikida T, Furukawa T.
  • 雑誌名: Sci Rep. 巻: Mar 5;9(1) 号: 1 ページ: 3445-3445
  • DOI: 10.1038/s41598-019-38910-2
  • NAID: 120006579467
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• [雑誌論文] Cell-autonomous and redundant roles of Hey1 and HeyL in muscle stem cells: HeyL requires Hes1 to bind diverse DNA sites (2019)
  • 著者名/発表者名: Noguchi Yu-taro、Nakamura Miki、Hino Nobumasa、Nogami Jumpei、Tsuji Sayaka、Sato Takahiko、Zhang Lidan、Tsujikawa Kazutake、Tanaka Toru、Izawa Kohei、Okada Yoshiaki、Doi Takefumi、Kokubo Hiroki、Harada Akihito、Uezumi Akiyoshi、Gessler Manfred、Ohkawa Yasuyuki、Fukada So-ichiro
  • 雑誌名: Development 巻: 146 号: 4 ページ: 163618-163618
  • DOI: 10.1242/dev.163618
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Pathological changes of distal motor neurons after complete spinal cord injury (2019)
  • 著者名/発表者名: Yokota Kazuya、Kubota Kensuke、Kobayakawa Kazu、Saito Takeyuki、Hara Masamitsu、Kijima Ken、Maeda Takeshi、Katoh Hiroyuki、Ohkawa Yasuyuki、Nakashima Yasuharu、Okada Seiji
  • 雑誌名: Molecular Brain 巻: 12 号: 1
  • DOI: 10.1186/s13041-018-0422-3
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• [雑誌論文] Transcriptome profiling of refractory atopic keratoconjunctivitis by RNA sequencing (2019)
  • 著者名/発表者名: Matsuda Akira、Asada Yosuke、Suita Naomasa、Iwamoto Satoshi、Hirakata Toshiaki、Yokoi Norihiko、Ohkawa Yasuyuki、Okada Yukinori、Yokomizo Takehiko、Ebihara Nobuyuki
  • 雑誌名: Journal of Allergy and Clinical Immunology 巻: 143 号: 4 ページ: 1610-1614
  • DOI: 10.1016/j.jaci.2018.11.007
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• [雑誌論文] Mouse polycomb group gene Cbx2 promotes osteoblastic but suppresses adipogenic differentiation in postnatal long bones (2019)
  • 著者名/発表者名: Katoh-Fukui Yuko、Baba Takashi、Sato Tetsuya、Otake Hiroyuki、Nagakui-Noguchi Yuko、Shindo Miyuki、Suyama Mikita、Ohkawa Yasuyuki、Tsumura Hideki、Morohashi Ken-ichirou、Fukami Maki
  • 雑誌名: Bone 巻: 120 ページ: 219-231
  • DOI: 10.1016/j.bone.2018.10.021
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• [雑誌論文] A chromatin integration labelling method enables epigenomic profiling with lower input (2018)
  • 著者名/発表者名: Harada Akihito、Maehara Kazumitsu、Handa Tetsuya、Arimura Yasuhiro、Nogami Jumpei、Hayashi-Takanaka Yoko、Shirahige Katsuhiko、Kurumizaka Hitoshi、Kimura Hiroshi、Ohkawa Yasuyuki
  • 雑誌名: Nature Cell Biology 巻: 21 号: 2 ページ: 287-296
  • DOI: 10.1038/s41556-018-0248-3
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• [雑誌論文] Fetal Leydig cells dedifferentiate and serve as adult Leydig stem cells (2018)
  • 著者名/発表者名: Shima Yuichi、Miyabayashi Kanako、Sato Tetsuya、Suyama Mikita、Ohkawa Yasuyuki、Doi Masao、Okamura Hitoshi、Suzuki Kentaro
  • 雑誌名: Development 巻: 145 号: 23 ページ: 169136-169136
  • DOI: 10.1242/dev.169136
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• [雑誌論文] Prolonged inhibition of hepatocellular carcinoma cell proliferation by combinatorial expression of defined transcription factors (2018)
  • 著者名/発表者名: Takashima Yasuo、Horisawa Kenichi、Udono Miyako、Ohkawa Yasuyuki、Suzuki Atsushi
  • 雑誌名: Cancer Science 巻: 109 号: 11 ページ: 3543-3553
  • DOI: 10.1111/cas.13798
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• [雑誌論文] Cancer-associated mutations of histones H2B, H3.1 and H2A.Z.1 affect the structure and stability of the nucleosome (2018)
  • 著者名/発表者名: Arimura Yasuhiro、Ikura Masae、Fujita Risa、Noda Mamiko、Kobayashi Wataru、Horikoshi Naoki、Sun Jiying、Shi Lin、Kusakabe Masayuki、Harata Masahiko、Ohkawa Yasuyuki、Tashiro Satoshi、Kimura Hiroshi、Ikura Tsuyoshi、Kurumizaka Hitoshi
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: - ページ: 10007-10018
  • DOI: 10.1093/nar/gky661
  • NAID: 120006545208
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] MNase, as a probe to study the sequence-dependent site exposures in the +1 nucleosomes of yeast (2018)
  • 著者名/発表者名: Luo Di、Kato Daiki、Nogami Jumpei、Ohkawa Yasuyuki、Kurumizaka Hitoshi、Kono Hidetoshi
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: 46 号: 14 ページ: 7124-7137
  • DOI: 10.1093/nar/gky502
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Genome-wide analysis of the spatiotemporal regulation of firing and dormant replication origins in human cells (2018)
  • 著者名/発表者名: Sugimoto Nozomi、Maehara Kazumitsu、Yoshida Kazumasa、Ohkawa Yasuyuki、Fujita Masatoshi
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: 46 号: 13 ページ: 6683-6696
  • DOI: 10.1093/nar/gky476
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Identification of miR-305, a microRNA that promotes aging, and its target mRNAs in Drosophila (2018)
  • 著者名/発表者名: Ueda Makiko、Sato Tetsuya、Ohkawa Yasuyuki、Inoue Yoshihiro H.
  • 雑誌名: Genes to Cells 巻: 23 号: 2 ページ: 80-93
  • DOI: 10.1111/gtc.12555
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Histone H3.3 sub-variant H3mm7 is required for normal skeletal muscle regeneration (2018)
  • 著者名/発表者名: Harada Akihito、Maehara Kazumitsu、Ono Yusuke、Taguchi Hiroyuki、Yoshioka Kiyoshi、Kitajima Yasuo、Xie Yan、Sato Yuko、Iwasaki Takeshi、Nogami Jumpei、Okada Seiji、Komatsu Tetsuro、Semba Yuichiro、Takemoto Tatsuya、Kimura Hiroshi、Kurumizaka Hitoshi、Ohkawa Yasuyuki
  • 雑誌名: Nature Communications 巻: 9 号: 1 ページ: 1400-1400
  • DOI: 10.1038/s41467-018-03845-1
  • NAID: 120006949474
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• [雑誌論文] Ad4BP/SF-1 regulates cholesterol synthesis to boost the production of steroids (2018)
  • 著者名/発表者名: Takashi Baba, Hiroyuki Otake, Miki Inoue, Tetsuya Sato, Yasuhiro Ishihara, Ju-Yeon Moon, Megumi Tsuchiya, Kanako Miyabayashi, Hidesato Ogawa, Yuichi Shima, Lixiang Wang, Ryuichiro Sato, Takeshi Yamazaki, Mikita Suyama, Masatoshi Nomura, Man Ho Choi, Yasuyuki Ohkawa & Ken-ichirou Morohashi
  • 雑誌名: Communications Biology 巻: 1 号: 1 ページ: 1-9
  • DOI: 10.1038/s42003-018-0020-z
  • NAID: 120006799378
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Sensitive detection of fluorescence in western blotting by merging images (2018)
  • 著者名/発表者名: Kondo Yukari、Higa Shinichiro、Iwasaki Takeshi、Matsumoto Tomoya、Maehara Kazumitsu、Harada Akihito、Baba Yoshihiro、Fujita Masatoshi、Ohkawa Yasuyuki
  • 雑誌名: PLOS ONE 巻: 13 号: 1 ページ: 0191532-0191532
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0191532
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• [雑誌論文] The Autism-Related Protein CHD8 Cooperates with C/EBPβ to Regulate Adipogenesis (2018)
  • 著者名/発表者名: Kita Yasuyuki、Katayama Yuta、Shiraishi Taichi、Oka Takeru、Sato Tetsuya、Suyama Mikita、Ohkawa Yasuyuki、Miyata Keishi、Oike Yuichi、Shirane Michiko、*Nishiyama Masaaki、*Nakayama Keiichi I.
  • 雑誌名: Cell Reports 巻: 23 号: 7 ページ: 1988-2000
  • DOI: 10.1016/j.celrep.2018.04.050
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Cryo-EM structure of the nucleosome containing the ALB1 enhancer DNA sequence (2018)
  • 著者名/発表者名: Takizawa Yoshimasa、Tanaka Hiroki、Machida Shinichi、Koyama Masako、Maehara Kazumitsu、Ohkawa Yasuyuki、Wade Paul A.、Wolf Matthias、Kurumizaka Hitoshi
  • 雑誌名: Open Biology 巻: 8 号: 3 ページ: 170255-170255
  • DOI: 10.1098/rsob.170255
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Direct Reprogramming of Spiral Ganglion Non-neuronal Cells into Neurons: Toward Ameliorating Sensorineural Hearing Loss by Gene Therapy (2018)
  • 著者名/発表者名: Noda T, Meas SJ, Nogami J, Amemiya Y, Uchi R, Ohkawa Y, Nishimura K, Dabdoub A
  • 雑誌名: Front Cell Dev Biol 巻: 6:16 ページ: 1-14
  • DOI: 10.3389/fcell.2018.00016
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Temporal regulation of chromatin during myoblast differentiation (2017)
  • 著者名/発表者名: Harada Akihito、Ohkawa Yasuyuki、Imbalzano Anthony N.
  • 雑誌名: Seminars in Cell & Developmental Biology 巻: 72 ページ: 77-86
  • DOI: 10.1016/j.semcdb.2017.10.022
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Roles of histone H3.5 in human spermatogenesis and spermatogenic disorders (2017)
  • 著者名/発表者名: Shiraishi K.、Shindo A.、Harada A.、Kurumizaka H.、Kimura H.、Ohkawa Y.、Matsuyama H.
  • 雑誌名: Andrology 巻: 6 号: 1 ページ: 158-165
  • DOI: 10.1111/andr.12438
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Ser7 of RNAPII-CTD facilitates heterochromatin formation by linking ncRNA to RNAi (2017)
  • 著者名/発表者名: Kajitani Takuya、Kato Hiroaki、Chikashige Yuji、Tsutsumi Chihiro、Hiraoka Yasushi、Kimura Hiroshi、Ohkawa Yasuyuki、Obuse Chikashi、Hermand Damien、Murakami Yota
  • 雑誌名: Proceedings of the National Academy of Sciences 巻: 114 号: 52
  • DOI: 10.1073/pnas.1714579115
  • NAID: 120006539374
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Histone methyltransferase G9a is a key regulator of the starvation-induced behaviors in Drosophila melanogaster. (2017)
  • 著者名/発表者名: Shimaji, K., Tanaka, R., Maeda, T., Ozaki, M., Yoshida, H., Ohkawa, Y., Sato, T., Suyama, M. and Yamaguchi, M.
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 7 号: 1 ページ: 14763-14763
  • DOI: 10.1038/s41598-017-15344-2
  • NAID: 120006368029
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• [雑誌論文] The novel heme-dependent inducible protein, SRRD regulates heme biosynthesis and circadian rhythms. (2017)
  • 著者名/発表者名: Adachi Y, Umeda M, Kawazoe A, Sato T, Ohkawa Y, Kitajima S, Izawa S, Sagami I, Taketani S.
  • 雑誌名: Arch Biochem Biophys. 巻: 631 ページ: 19-29
  • DOI: 10.1016/j.abb.2017.08.006
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• [雑誌論文] Biochemical and immunological characterization of a novel monoclonal antibody against mouse leukotriene B4 receptor 1. (2017)
  • 著者名/発表者名: Sasaki F, Koga T, Saeki K, Okuno T, Kazuno S, Fujimura T, Ohkawa Y, Yokomizo T
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 12 号: 9 ページ: 0185133-0185133
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0185133
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• [雑誌論文] The requirement of Mettl3-promoted MyoD mRNA maintenance in proliferative myoblasts for skeletal muscle differentiation (2017)
  • 著者名/発表者名: Kudou Kensuke、Komatsu Tetsuro、Nogami Jumpei、Maehara Kazumitsu、Harada Akihito、Saeki Hiroshi、Oki Eiji、Maehara Yoshihiko、Ohkawa Yasuyuki
  • 雑誌名: Open Biology 巻: 7 号: 9 ページ: 170119-170119
  • DOI: 10.1098/rsob.170119
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• [雑誌論文] Evolution of the sperm methylome of primates is associated with retrotransposon insertions and genome instability (2017)
  • 著者名/発表者名: Fukuda Kei、Inoguchi Yukihiro、Ichiyanagi Kenji、Ichiyanagi Tomoko、Go Yasuhiro、Nagano Masashi、Yanagawa Yojiro、Takaesu Noboru、Ohkawa Yasuyuki、Imai Hiroo、Sasaki Hiroyuki
  • 雑誌名: Human Molecular Genetics 巻: 26 号: 18 ページ: 3508-3519
  • DOI: 10.1093/hmg/ddx236
  • NAID: 120006367980
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• [雑誌論文] Persistent detection of alternatively spliced BCR-ABL variant results in a failure to achieve deep molecular response (2017)
  • 著者名/発表者名: Yuda Junichiro、Miyamoto Toshihiro、Odawara Jun、Ohkawa Yasuyuki、Semba Yuichiro、Hayashi Masayasu、Miyamura Koichi、Tanimoto Mitsune、Yamamoto Kazuhito、Taniwaki Masafumi、Akashi Koichi
  • 雑誌名: Cancer Science 巻: 108 号: 11 ページ: 2204-2212
  • DOI: 10.1111/cas.13353
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• [雑誌論文] Interaction of reactive astrocytes with type I collagen induces astrocytic scar formation through the integrin?N-cadherin pathway after spinal cord injury (2017)
  • 著者名/発表者名: Hara Masamitsu、Kobayakawa Kazu、Ohkawa Yasuyuki、Kumamaru Hiromi、Yokota Kazuya、Saito Takeyuki、Kijima Ken、Yoshizaki Shingo、Harimaya Katsumi、Nakashima Yasuharu、Okada Seiji
  • 雑誌名: Nature Medicine 巻: 23 号: 7 ページ: 818-828
  • DOI: 10.1038/nm.4354
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• [雑誌論文] Chd2 regulates chromatin for proper gene expression toward differentiation in mouse embryonic stem cells (2017)
  • 著者名/発表者名: Semba Yuichiro、Harada Akihito、Maehara Kazumitsu、Oki Shinya、Meno Chikara、Ueda Jun、Yamagata Kazuo、Suzuki Atsushi、Onimaru Mitsuho、Nogami Jumpei、Okada Seiji、Akashi Koichi、Ohkawa Yasuyuki
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: 45 号: 15 ページ: 8758-8772
  • DOI: 10.1093/nar/gkx475
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] GWAS of clinically defined gout and subtypes identifies multiple susceptibility loci that include urate transporter genes (2017)
  • 著者名/発表者名: Nakayama A, Nakaoka H, Yamamoto K, Sakiyama M, Shaukat A, Toyoda Y, Okada Y, Ohkawa Y,他39名
  • 雑誌名: Ann Rheum Dis. 巻: 76 号: 5 ページ: 869
  • DOI: 10.1136/annrheumdis-2016-209632
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Crystal Structure and Characterization of Novel Human Histone H3 Variants, H3.6, H3.7, and H3.8 (2017)
  • 著者名/発表者名: Taguchi H, Xie Y, Horikoshi N, Maehara K, Harada A, Nogami J, Sato K, Arimura Y, Osakabe A, Kujirai T, Iwasaki T, Semba Y, Tachibana T, Kimura H, Ohkawa Y, Kurumizaka H.
  • 雑誌名: Biochemistry 巻: 56 号: 16 ページ: 2184-2196
  • DOI: 10.1021/acs.biochem.6b01098
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Thymine DNA glycosylase modulates the DNA damage response and gene expression by base excision repair-dependent and -independent mechanisms (2017)
  • 著者名/発表者名: Tomohumi Nakamura, Kouichi Murakami, Haruto Tada, Yoshihiko Uehara, Jumpei Nogami, Kazumitsu Maehara, Yasuyuki Ohkawa, Hisato Saitoh, Hideo Nishitani, Tetsuya Ono, Ryotaro Nishi, Masayuki Yokoi, Wataru Sakai, and Kaoru Sugasawa
  • 雑誌名: Genes to Cells 巻: 22 号: 4 ページ: 392-405
  • DOI: 10.1111/gtc.12481
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Crystal structure of the overlapping dinucleosome composed of hexasome and octasome (2017)
  • 著者名/発表者名: Daiki Kato, Akihisa Osakabe, Yasuhiro Arimura, Yuka Mizukami, Naoki Horikoshi, Kazumi Saikusa, Satoko Akashi, Yoshifumi Nishimura, Sam-Yong Park, Jumpei Nogami, Kazumitsu Maehara, Yasuyuki Ohkawa, Atsushi Matsumoto, Hidetoshi Kono, Rintaro Inoue, Masaaki Sugiyama, Hitoshi Kurumizaka
  • 雑誌名: Science 巻: 356 号: 6334 ページ: 205-208
  • DOI: 10.1126/science.aak9867
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [学会発表] 遺伝子の発現されやすさはどのように決まるのか？～クロマチンが規定する遺伝子発現制御能力～ (2019)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: 第47回日本分子生物学会年会
• [学会発表] Development of chromatin integration labeling technology for single cell multiomics (2019)
  • 著者名/発表者名: Yasuyuki Ohkawa
  • 学会等名: 第42回日本分子生物学会年会
• [学会発表] Spatial epigenomics approached by chromatin integration labeling technology (2019)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: Trans-Omics for Advanced Medical Sciences
• [学会発表] クロマチン挿入法による単一細胞エピゲノム解析 (2019)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第64回大会
• [学会発表] Chromatin integration labelling Technology for expanding multi-omics (2019)
  • 著者名/発表者名: Yasuyuki Ohkawa
  • 学会等名: EMBO Symposia: Multi-Omics
• [学会発表] Chromatin integration labelling technology for expanding multi-omics (2019)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: 第13回国際ゲノム会議
• [学会発表] 細胞ポテンシャル測定システムの開発 (2019)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: CREST領域会議
• [学会発表] 1細胞トランスクリプトミクス による骨格筋特異的クロマチン構造の解明 発表 (2019)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: ゲノム編集班会議
• [学会発表] Transcriptional Plasticity regulated by novel Histone H3 Varigants (2019)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: 理研連携プロジェクト「エピゲノム操作」
  • 招待講演
• [学会発表] Chromatin Integration Labeling- an Epigenomic Profiling for Single Cell Analysis (2019)
  • 著者名/発表者名: Yasuyuki Ohkawa
  • 学会等名: Cell Symposium: Single Cells: Technology to Biology
  • 国際学会
• [学会発表] 骨格筋再生におけるヒストン転換 (2019)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: 第７回骨格筋生物学研究会
• [学会発表] 単一細胞レベルのエピゲノム解析技術 (2019)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: 九大発産・学・官交流促進シーズ発表会2019
• [学会発表] Low-input Epigenomic Profiling Technology toward Identifying Myogenic Chomatin Structure. (2018)
  • 著者名/発表者名: Yasuyuki Ohkawa
  • 学会等名: Muscle Development, Regeneration and Disease 2018
  • 国際学会
• [学会発表] 遺伝子発現能から迫る骨格筋再生機構の解明～トランスクリプトミクスによるアプローチ～ (2018)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: NCNP神経研究所セミナー
  • 招待講演
• [学会発表] 1細胞エピゲノム解析技術の開発 (2018)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: 第12回日本エピジェネティクス研究会年会
• [学会発表] ゲノムワイドな遺伝子発現制御機構を基盤とした神経組織特異的クロマチン構造の解明 (2018)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: 【ゲノム編集】キックオフミーティング
• [学会発表] ChiLT-an epigenomic Profiling for Single Cell Analysis (2018)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: 第2回代謝統合オミクス領域会議
• [学会発表] クロマチン組成変化から考える細胞分化能制御～トランスクリプトミクスの新たな展開～ (2018)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: 東京大学理学部研究セミナー
• [学会発表] ChiLT-an Epigenomic Profiling for Single Cell Analysis (2018)
  • 著者名/発表者名: Yasuyuki Ohkawa
  • 学会等名: Gordon Research Conference「Chromatin Encounters Shaping Genome Architecture and Function」
  • 国際学会
• [学会発表] Histone H3.3 sub-variants are required for regulating skeletal muscle differentiation. (2018)
  • 著者名/発表者名: Yasuyuki Ohkawa
  • 学会等名: 2018 Federation of American Societies for Experimental Biology (FASEB)
  • 国際学会
• [学会発表] Histone composition in chromatin regulates skeletal muscle regeneration (2018)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: The 6th Society of Skeletal Muscle Cells
• [学会発表] ChILT- an Epigenomic Profiling for Single Cell Analysis (2018)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: CDBシンポジウム2018
  • 招待講演
• [学会発表] ヒストンH3の選択による細胞分化制御機構 ～トランスクリプトミクスによるアプローチ～ (2018)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: よこはまNMR研究会
  • 招待講演
• [学会発表] ヒストンH3の選択による細胞分化制御機構～トランスクリプトミクスによるアプローチ～ (2018)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: 群馬大学生調研セミナー
  • 招待講演
• [学会発表] 骨格筋再生を制御するゲノムワイドな遺伝子制御機構～ヒストンの組成変化が拓く新たなエピゲノム制御～ (2018)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: PROS学術シンポジウム
  • 招待講演
• [学会発表] 1細胞エピゲノム解析技術の開発 (2018)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: 日本がん分子標的治療学会TRワークショップ
  • 招待講演
• [学会発表] ゲノムから遺伝子が選ばれる仕組み (2018)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: クロマチン一般公開シンポジウム
  • 招待講演
• [学会発表] ヒストンバリアントによる細胞運命決定機構 (2017)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: 京都大学 学術講演会
  • 招待講演
• [学会発表] ヒストンH3バリアントで制御される組織特異的構造 Tissue-specific Chromatin Structures regulated by Histone H3 Variants (2017)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: 2017年度生命科学系学会合同年次大会
• [学会発表] ChILT - an immunoprecipitation-free epigenome profiling technology (2017)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: 第12回研究所ネットワーク国際シンポジウム
• [学会発表] Tissue-specific Chromatin Structures According to Histone H3 Variants (2017)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: 研究セミナー
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] ヒストンバリアントによる組織特異的クロマチン構造の形成 (2017)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: 日本遺伝学会第89回大会
  • 招待講演
• [学会発表] Myogenic chromatin structure is formed with the novel histone H3 variant. (2017)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: EMBO Workshop Histone Vriants
  • 国際学会
• [学会発表] ChILT - an Immunoprecipitation-free Epigenome Profiling Technology. (2017)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: 1st Munchen-Japan Mini Symposium
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 骨格筋再生の核内プログラム～トランスクリプトミクス解析の新たな展開～ (2017)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: 運動器科学研究会
  • 招待講演
• [学会発表] Tissue‐specific Chromatin Structures According to Histone H3 Variants (2017)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: 第12回国際ゲノム会議
  • 招待講演
• [学会発表] Myogenic Chromatin Structure Is Formed with the Histone H3 Variant H3mm7 (2017)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: Gordon Research Conference
  • 国際学会
• [学会発表] ChiLT-an Immunoprecipitation-free Epigenome Profiling Technology (2017)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: Single Cell Omics (E3)
  • 国際学会
• [学会発表] ヒストンH3バリアントによる骨格筋特異的クロマチン構造制御 (2017)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: 第11回日本エピジェネティクス研究会年会
• [図書] 実験医学 (2019)
  • 著者名/発表者名: 原田 哲仁,大川 恭行
  • 総ページ数: 6
  • 出版者: 羊土社
• [備考] Ohkawa lab
  • URL: http://tx.bioreg.kyushu-u.ac.jp/
• [産業財産権] 対象核酸の塩基配列を１細胞レベルで並列に検出する方法 (2020)
  • 発明者名: 大川 恭行、原田哲仁
  • 権利者名: 国立大学法人九州大学
  • 産業財産権種類: 特許
  • 出願年月日: 2020
• [産業財産権] DNA結合タンパク質の結合領域の近傍に所望のDNA断片を挿入する方法 (2017)
  • 発明者名: 大川恭行,原田哲仁,胡桃坂仁志,木村宏,半田哲也,他2名
  • 権利者名: 大川恭行,原田哲仁,胡桃坂仁志,木村宏,半田哲也,他2名
  • 産業財産権種類: 特許
  • 出願年月日: 2017
  • 外国