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4者複合体の構造解析によるtranssulfursomeのtRNA変換機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 17H03637
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 構造生物化学
研究機関北海道大学

研究代表者

姚 閔  北海道大学, 先端生命科学研究院, 教授 (40311518)

研究分担者 尾瀬 農之  北海道大学, 先端生命科学研究院, 准教授 (80380525)
田中 良和  東北大学, 生命科学研究科, 教授 (20374225)
加藤 公児  北海道大学, 先端生命科学研究院, 助教 (30452428)
研究期間 (年度) 2017-04-01 – 2020-03-31
研究課題ステータス 完了 (2019年度)
配分額 *注記
17,420千円 (直接経費: 13,400千円、間接経費: 4,020千円)
2019年度: 3,380千円 (直接経費: 2,600千円、間接経費: 780千円)
2018年度: 6,110千円 (直接経費: 4,700千円、間接経費: 1,410千円)
2017年度: 7,930千円 (直接経費: 6,100千円、間接経費: 1,830千円)
キーワードCys-tRNA(Cys) / transsulfursome / アミルアシルtRNA合成 / 間接合成経路 / X線結晶解析 / クライオ電子顕微鏡 / 小角散乱 / 結晶構造解析 / クライオ電顕解析 / 核酸 / 酵素 / cys-tRNA(cys) / X線結晶構造解析 / 間接合成 / アミノアシルtRNA合成 / 構造解析
研究成果の概要

タンパク質が遺伝暗号通りに正しく翻訳されるためには,原料となるアミノアシルtRNA(aa-tRNA)が正確に合成されている必要がある.その合成役割を担うのが合成酵素(aaRS)である.しかし,メタン生成古細菌では,transsulfursomeと呼ばれる3者複合体(SepRS、SepCys、SepCysS)がCys-tRNA(Cys)の合成を行う.
本研究では,私達はX線結晶構造解析法,X線小角散乱法,電子顕微鏡観察,生化学的手法を用いてtranssulfursomeとtRNA から成る4者複合体の構造・機能解析によって,Cys-tRNA(Cys)合成の動的なプロセスの分子機構を明らかにした.

研究成果の学術的意義や社会的意義

transsulfursomeは,aaRS誕生の足跡に残そた化石酵素である。得られた分子機構は遺伝暗号に関わる酵素の誕生と進化の理解を大きく前進させると期待できる.
また、リンカーで繋がった3つのドメインが異なる分子にそれぞれ結合して複雑な反応を可能にする本システムは,簡単な系からより複雑な系へ進化する過程の理解も前進させた.
さらに、リン酸化セリンを部位特異的にタンパク質に導入する技術は,ヒトの病気と密接に関係する研究にとって非常に重要であり,transsulfursomeの作用機序の解明は「タンパク質へのリン酸化セリンの自在な取り込み」を達成する上で非常に大きな一歩になる.

報告書

(4件)
  • 2019 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2018 実績報告書
  • 2017 実績報告書
  • 研究成果

    (19件)

すべて 2019 2018 2017 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 2件、 査読あり 4件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (10件) (うち国際学会 5件、 招待講演 3件) 図書 (1件) 備考 (2件)

  • [国際共同研究] MaxPlanck研究所(ドイツ)

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [雑誌論文] The pH-dependent conformational change of eukaryotic translation initiation factor 5: Insights into partner-binding manner2019

    • 著者名/発表者名
      Ye Yuxin、Chen Meirong、Kato Koji、Yao Min
    • 雑誌名

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      巻: 519 号: 1 ページ: 186-191

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2019.08.128

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Neutron crystallographic study of heterotrimeric glutamine amidotransferase CAB2019

    • 著者名/発表者名
      Li Long、Adachi Motoyasu、Yu Jian、Kato Koji、Shinoda Akira、Ostermann Andreas、Schrader Tobias E.、Ose Toyoyuki、Yao Min
    • 雑誌名

      Acta Crystallographica Section F Structural Biology Communications

      巻: 75 号: 3 ページ: 193-196

    • DOI

      10.1107/s2053230x19000220

    • NAID

      120006727601

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] tRNA依存的アミノ酸システインの生合成複合体の分子機構2018

    • 著者名/発表者名
      姚 閔、陳 美容
    • 雑誌名

      生化学

      巻: 90 号: 4 ページ: 512-518

    • DOI

      10.14952/SEIKAGAKU.2018.900512

    • NAID

      40021670681

    • ISSN
      0037-1017
    • 年月日
      2018-08-25
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [雑誌論文] Structural basis for tRNA-dependent cysteine biosynthesis2017

    • 著者名/発表者名
      Chen Meirong、Kato Koji、Kubo Yume、Tanaka Yoshikazu、Liu Yuchen、Long Feng、Whitman William B.、Lill Pascal、Gatsogiannis Christos、Raunser Stefan、Shimizu Nobutaka、Shinoda Akira、Nakamura Akiyoshi、Tanaka Isao、Yao Min
    • 雑誌名

      Nature Commun.

      巻: 8 号: 1 ページ: 1521-1521

    • DOI

      10.1038/s41467-017-01543-y

    • NAID

      120006370606

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Biochemical and structural characterization of oxygen-sensitive 2-thiouridine synthesis catalyzed by an iron-sulfur protein TtuA2017

    • 著者名/発表者名
      Chen Minghao、Asai Shin-ichi、Narai Shun、Nambu Shusuke、Omura Naoki、Sakaguchi Yuriko、Suzuki Tsutomu、Ikeda-Saito Masao、Watanabe Kimitsuna、Yao Min、Shigi Naoki、Tanaka Yoshikazu
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      巻: 114 号: 19 ページ: 4954-4959

    • DOI

      10.1073/pnas.1615585114

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 間接経路によってCys-tRNACysを合成するタンパク質複合体transsulfursomeにおけるtRNA channelingメカニズムの解明2019

    • 著者名/発表者名
      河野 覚, 陳 美容, 于 健, 姚 閔
    • 学会等名
      第42回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Dynamic structure is requited for transslufursome on the Cys-tRNA(Cys) synthesis in indirect pathway2019

    • 著者名/発表者名
      Min Yao, Meirong Chen, Satoru Kono, Isao Tanaka
    • 学会等名
      アジア結晶学会Asian Crystallographic Association2019
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Structural analysis platform for Native-SAD2019

    • 著者名/発表者名
      Yu Jian, Kato Koji, Tanaka Iso, Yao Min
    • 学会等名
      International Symposium on Diffraction Structural Biology 2019
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Study on the tRNA channeling mechanism of transsulfursome for Cys-tRNA(Cys) synthesis in indirect pathway2018

    • 著者名/発表者名
      Satoru Kono, MeirongChen, Yume Kubo, Koji Kato, Min Yao
    • 学会等名
      International Symposium on “Proteins; from the Cradle to the Grave”
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Attempting to adjust the elongation speed of the nascent cahin elongation on ribosome2018

    • 著者名/発表者名
      姚閔
    • 学会等名
      International Symposium on “Proteins; from the Cradle to the Grave”
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 真核生物リボソームの生合成因子のマルチ機能の解析2018

    • 著者名/発表者名
      姚閔
    • 学会等名
      第5回Ribosome Meeting
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 中性子回折によるアミド基転移酵素GatCABのアンモニア輸送機構解明の試み2018

    • 著者名/発表者名
      姚閔
    • 学会等名
      平成30年度第1回構造生物学研究会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Nucleotide elongation in the reverse (3’-5’) direction by TLP(Thg1-Like Protein)2017

    • 著者名/発表者名
      姚閔
    • 学会等名
      第15回、中国生化学と薬理学学会年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Challenging to visualize ammonia transposition in a channel of amidotransferase GatCAB using neutron macromolecular crystallography2017

    • 著者名/発表者名
      姚閔
    • 学会等名
      第55回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] SAXS解析によるtranssulfursome のダイナミクス研究の事例2017

    • 著者名/発表者名
      姚閔
    • 学会等名
      第4回タンパク質X線溶液散乱講習会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [図書] 生化学2018

    • 著者名/発表者名
      姚 閔、陳 美容
    • 総ページ数
      7
    • 出版者
      化学同人
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [備考] 研究室ホームページ

    • URL

      http://altair.sci.hokudai.ac.jp/g6/

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書 2018 実績報告書
  • [備考] 研究室のホームページ

    • URL

      http://altair.sci.hokudai.ac.jp/g6/

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書

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公開日: 2017-04-28   更新日: 2021-02-19  

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