| 研究課題/領域番号 |
17H03753
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| 研究種目 |
基盤研究(B)
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 研究分野 |
遺伝育種科学
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| 研究機関 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構 |
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研究代表者 |
川勝 泰二 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 生物機能利用研究部門, 上級研究員 (30435614)
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| 研究分担者 |
川原 善浩 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 次世代作物開発研究センター, 主任研究員 (30546370)
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| 研究期間 (年度) |
2017-04-01 – 2020-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2019年度)
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| 配分額 *注記 |
18,330千円 (直接経費: 14,100千円、間接経費: 4,230千円)
2019年度: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2018年度: 8,580千円 (直接経費: 6,600千円、間接経費: 1,980千円)
2017年度: 5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円)
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| キーワード | イネ / 胚乳 / 転写因子 / 遺伝子発現 / 物質生産 / 発現制御ネットワーク / シストローム / 種子 / 遺伝子ネットワーク / 転写制御 |
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| 研究成果の概要 |
本研究ではイネ胚乳における遺伝子発現制御ネットワークの理解のため、332個のイネ転写因子の結合領域およびターゲット遺伝子候補をカタログ化し、イネシストロームリソースを構築した。全転写因子を統合すると約160万の領域に転写因子が結合し、イネゲノムの36%は遺伝子発現制御に関わりうる領域であることが明らかとなった。同じファミリーの転写因子間でも共通のターゲット遺伝子に加えて、異なる機能を持つ遺伝子群をターゲット遺伝子としており、機能分化が可視化された。
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| 研究成果の学術的意義や社会的意義 |
本研究で構築したリソースは各研究者が興味を持つ転写因子もしくは転写因子ファミリーが制御しうる遺伝子を推定することを可能とする。多くの転写因子は胚乳以外の組織でも発現しているため、全てのイネ研究者にとって重要なリソースと考えられる。今後、クロマチンアクセシビリティやヒストン修飾パターン情報と統合することで、より精度の高い遺伝子発現制御ネットワークの構築が可能になることが期待される。
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