| 研究課題/領域番号 |
17H03786
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| 研究種目 |
基盤研究(B)
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 研究分野 |
応用微生物学
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| 研究機関 | 東北大学 |
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研究代表者 |
金子 淳 東北大学, 農学研究科, 准教授 (30221188)
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| 研究期間 (年度) |
2017-04-01 – 2020-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2019年度)
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| 配分額 *注記 |
17,680千円 (直接経費: 13,600千円、間接経費: 4,080千円)
2019年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
2018年度: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2017年度: 11,180千円 (直接経費: 8,600千円、間接経費: 2,580千円)
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| キーワード | Selenomonas ruminantium / polyamide / porin / transformation / RNA-seq / Negativicutes / vinyl-ether bond / outer membrane / anaerobic growth / 微生物機能 / anaerobic / plasmalogen / polyamine |
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| 研究成果の概要 |
Selenomonas ruminantium subsp. lactilyticaは外膜を有する偏性嫌気性のグラム陽性ルーメン細菌である。本研究では、ゲノム情報を元にプラズマローゲンを豊富に含有する細胞膜、ポリアミン結合型ペプチドグリカンと外膜主要タンパク質Mep45が関わる新奇外膜保持機構、嫌気条件で乳酸を資化できる機構に関わる遺伝子群を解析した。大腸菌や枯草菌でゲノムから予測した候補遺伝子を発現させてその機能を解析する手法とRNA-seq解析により、さらなる研究に有益なポストゲノム情報を得ることができた。
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| 研究成果の学術的意義や社会的意義 |
ルーメン細菌S. ruminantiumの嫌気的乳酸資化能力は、ルーメンアシドーシスの対抗因子として家畜の健康維持に重要な性質である。RNA-seqの結果は本菌のゲノムを情報から構築した嫌気的乳酸資化時のエネルギー生産系のモデルを説明する事ができ、本菌のルーメン内でのnicheな生態の解明に迫る基盤となり、ルーメン微生物生態研究に貢献できると確信する。一方、ゲノム情報から絞り込んだ候補遺伝子大腸菌や枯草菌に導入してその機能を解析するアプローチや、形質転換系の確立は難航している。RNA-seqでは今後の研究に大いに活用候補遺伝子や関連遺伝子の発現情報も得られており、ブレークスルーが期待される。
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