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ホストを乗り換え永続するアイナメ属半クローンゲノムの起源と進化、遺伝子の特定まで

研究課題

研究課題/領域番号 17H03856
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 水圏生産科学
研究機関北海道大学

研究代表者

宗原 弘幸  北海道大学, 北方生物圏フィールド科学センター, 教授 (80212249)

研究分担者 藤本 貴史  北海道大学, 水産科学研究院, 准教授 (10400003)
荒井 克俊  北海道大学, 水産科学研究院, 特任教授 (00137902)
三木 玲香 (三木玲香)  東京農業大学, 生物資源ゲノム解析センター, 研究員 (30451842)
研究期間 (年度) 2017-04-01 – 2020-03-31
研究課題ステータス 完了 (2019年度)
配分額 *注記
17,940千円 (直接経費: 13,800千円、間接経費: 4,140千円)
2019年度: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2018年度: 6,370千円 (直接経費: 4,900千円、間接経費: 1,470千円)
2017年度: 7,280千円 (直接経費: 5,600千円、間接経費: 1,680千円)
キーワード遺伝学 / トランスクリプトーム解析 / 二次的遭遇 / ハイブリドジェネシス / 遺伝学的集団構造 / 系統寿命 / アイナメ属雑種 / 半クローン遺伝子 / 水産学 / ゲノム / 染色体 / 魚類 / 交雑 / 集団構造 / 半クローン / 遺伝学集団構造 / 進化 / クローン
研究成果の概要

配偶子形成の際に組み換えをしない半クローンやクローンは、単性生物であるため短期的な増殖速度が高いが、系代間に生ずる悪性変異がゲノムに蓄積し、長く続かないと考えられてきた。しかし、実際には理論値を超えて存続する系統寿命の長いクローンおよび半クローン生物が知られている。にもかかわらず、系統寿命が延長出来る仕組みは、不明であった。本研究では、半クローンの海産魚アイナメ属で半クローンゲノムのクローン世代と有性世代の非周期的なサイクルにより、半クローンゲノムを更新していることを明らかにした。また父種ゲノムの削除に関わる細胞周期と遺伝子の特定も進め、中心体の形成に関わる遺伝子の不働の可能性を示唆した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

地球上には、多くの子孫を残す自然淘汰による進化を通じて様々な生物が生まれてきた。そのひとつがクローンや半クローンで、雌だけで子を残せるため有利なはずである。しかし子孫の遺伝的な多様性を作り出せない欠点があるため、種や系統の寿命が短く、有性生殖に比べて繁栄出来ないと考えられていた。本研究では、交雑起源の海産魚のアイナメ属の半クローンについて、系代飼育と野外調査を実施した集団構造の解析から、有性生殖世代と半クローン世代を非周期的に交互に行うことで長い系統寿命を持つことを明らかにした。生物多様性の新たな側面と希少種の保存に役立つ半クローン遺伝子の特定と発現に関しても部分的に明らかにすることが出来た。

報告書

(4件)
  • 2019 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2018 実績報告書
  • 2017 実績報告書
  • 研究成果

    (20件)

すべて 2020 2019 2018 2017

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 6件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (13件) (うち招待講演 2件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Dispersion and settlement of two sympatric sculpins of the genus Gymnocanthus2020

    • 著者名/発表者名
      Yamazaki Aya、Ogino Akino、Munehara Hiroyuki
    • 雑誌名

      Journal of Fish Biology

      巻: 96 号: 4 ページ: 1004-1013

    • DOI

      10.1111/jfb.14291

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Unisexual hybrids break through an evolutionary dead end by two‐way backcrossing2020

    • 著者名/発表者名
      Suzuki Shota、Miyake Shota、Arai Katsutoshi、Munehara Hiroyuki
    • 雑誌名

      Evolution

      巻: 74 号: 2 ページ: 392-403

    • DOI

      10.1111/evo.13903

    • NAID

      120006955196

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Freeze Tolerance in Sculpins (Pisces; Cottoidea) Inhabiting North Pacific and Arctic Oceans: Antifreeze Activity and Gene Sequences of the Antifreeze Protein2019

    • 著者名/発表者名
      Yamazaki Aya、Nishimiya Yoshiyuki、Tsuda Sakae、Togashi Koji、Munehara Hiroyuki
    • 雑誌名

      Biomolecules

      巻: 9 号: 4 ページ: 139-151

    • DOI

      10.3390/biom9040139

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Host selection and ovipositor length in eight sympatric species of sculpins that deposit their eggs into tunicates or sponges2019

    • 著者名/発表者名
      Awata Satoshi, Sasaki Haruka, Goto Tomohito, Koya Yasunori, Takeshima Hirohiko, Yamazaki Aya, Munehara Hiroyuki
    • 雑誌名

      Marine Biology

      巻: 166 号: 5 ページ: 59

    • DOI

      10.1007/s00227-019-3506-4

    • NAID

      120006847758

    • URL

      https://ocu-omu.repo.nii.ac.jp/records/2020094

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書 2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Gene expression of antifreeze protein in relation to historical distributions of Myoxocephalus fish species2018

    • 著者名/発表者名
      Yamasaki A., Nishimiya Y., Tsuda S., Togashi K., Munehara H.
    • 雑誌名

      Marine Biology

      巻: 165 号: 11 ページ: 181-181

    • DOI

      10.1007/s00227-018-3440-x

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Karyological evidence of hybridogenesis in Greenlings (Teleostei: Hexagrammidae)2017

    • 著者名/発表者名
      Shota Suzuki, Katsutoshi Arai, Hiroyuki Munehara
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 12 号: 7 ページ: e0180626-e0180626

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0180626

    • NAID

      120006335572

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] クジメ系半クローン雑種由来の野外組み換え雑種の出現2019

    • 著者名/発表者名
      鈴木将太・宗原弘幸
    • 学会等名
      日本水産学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 非捕獲的手法によるアイナメHexagrammos otakiiなわばり雄の成長と繁殖成功度の経年変化2019

    • 著者名/発表者名
      大河内裕典・宗原弘幸・橋爪伸崇・鈴木将太・吉田隼祐・中村陽一
    • 学会等名
      日本水産学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 海産の卵寄託魚では宿主の種類やサイズの違いが産卵管形態の種内変異を生み出す2019

    • 著者名/発表者名
      安房田智司・五十嵐直・瓜生知史・古屋康則・宗原弘幸
    • 学会等名
      日本生態学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] クジメ系半クローン雑種由来の野外組み換え雑種の出現2019

    • 著者名/発表者名
      鈴木 将太・宗原 弘幸
    • 学会等名
      日本水産学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 非捕獲的手法によるアイナメHexagrammos otakiiなわばり雄の成長と繁殖成功度の経年変化2019

    • 著者名/発表者名
      大河内裕典・宗原弘幸・橋爪伸崇・ 鈴木将太・吉田隼祐・中村陽一
    • 学会等名
      日本水産学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 海産の卵寄託魚では宿主の種類やサイズの違いが産卵管形態の種内変異を生み出す2019

    • 著者名/発表者名
      安房田 智司・五十嵐 直・瓜生 知史・古屋 康則・宗原 弘幸
    • 学会等名
      日本生態学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] アイナメ属野外雑種の双方向戻し交配2018

    • 著者名/発表者名
      鈴木 将太・三宅 翔太・宗原 弘幸
    • 学会等名
      日本魚類学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] RNA-seqによるアイナメ属半クローンの発現変動遺伝子の抽出2018

    • 著者名/発表者名
      宗原弘幸・鈴木将太・川原玲香
    • 学会等名
      日本魚類学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 半クローン生殖由来のスジアイナメを用いたF1雑種の遺伝様式の検証2017

    • 著者名/発表者名
      吉田隼祐・鈴木将太・宗原弘幸
    • 学会等名
      日本魚類学会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 半クローンの細胞遺伝学2017

    • 著者名/発表者名
      鈴木将太・三宅翔太・荒井克俊・藤本貴史・宗原弘幸
    • 学会等名
      日本魚類学会シンポジウム
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 人為的環境改変を利用するアイナメの繁殖生態2017

    • 著者名/発表者名
      宗原弘幸
    • 学会等名
      日本魚類学会シンポジウム
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 築港工事根固め材(網袋)で出来るアイナメの繁殖コロニー (ホッケ資源回復へのヒント)2017

    • 著者名/発表者名
      宗原弘幸・鈴木将太・橋爪伸崇・加藤大棋・吉田隼祐・大河内裕典・東村拓志
    • 学会等名
      日本水産学会北海道支部会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 3Dデジタルカメラを用いたアイナメなわばり雄の非捕獲的全長測定2017

    • 著者名/発表者名
      橋爪伸崇・宗原弘幸
    • 学会等名
      日本魚類学会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [図書] 北海道の磯魚たちのグレートジャーニー2020

    • 著者名/発表者名
      宗原弘幸
    • 総ページ数
      128
    • 出版者
      海文堂出版
    • ISBN
      9784303800048
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書

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公開日: 2017-04-28   更新日: 2021-02-19  

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