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トランスポゾン侵略から生殖ゲノムをまもるpiRNA作動原理の統合的理解

研究課題

研究課題/領域番号 17H06111
研究種目

基盤研究(S)

配分区分補助金
研究分野 生物分子化学
研究機関東京大学

研究代表者

塩見 美喜子  東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 教授 (20322745)

研究期間 (年度) 2017-05-31 – 2020-03-31
研究課題ステータス 中途終了 (2019年度)
配分額 *注記
202,540千円 (直接経費: 155,800千円、間接経費: 46,740千円)
2019年度: 38,220千円 (直接経費: 29,400千円、間接経費: 8,820千円)
2018年度: 45,630千円 (直接経費: 35,100千円、間接経費: 10,530千円)
2017年度: 45,760千円 (直接経費: 35,200千円、間接経費: 10,560千円)
キーワードPIWI / piRNA / トランスポゾン / RNAサイレンシング / ショウジョウバエ / Piwi
研究実績の概要

トランスポゾンの利己的な転移活性による生殖ゲノムの損傷は種の保存を脅かすため、有性生殖を伴う動物は、進化の過程でpiRNAを中核因子とするRNAサイレンシング機構を自己防衛手段として獲得したと考えられている。しかし、その動作原理は未だ不明である。本研究では、piRNAの動作原理を明らかにすることを目的とした。piRNAは、piRNAクラスタから転写された前駆体から生成されるが、piRNA生合成の仕組みは未だ明らかになっていないため、その解明に取り組んだ。piRNA生合成の必須因子としてArmitageが知られる。ArmitageのRNA結合様式を調べたところ、通常の状態ではArmitage はpiRNA前駆体に特異的に結合するが、上流因子Ybが存在しない場合は様々な細胞内RNAに結合してしまい、また、これらのRNAからトランスポゾン抑制の機能をもたないpiRNAを作り出してしまうことが判明した。つまりYbはArmiのRNA結合の特異性を制御する因子であり、ArmitageはpiRNA生合成を促進する因子であることが判明した。この成果はCell Reports誌に報告した。並行してpiRNA生合成の場として知られるYb bodyの形成機構及び要求性に関して研究を進めた。Yb bodyに局在する因子としてはYb、Armitage、SoYb、Vretが知られる。本解析から、YbのRNA結合能があればYb bodyが形成されること、その形成後は、Armi、Soyb/Vretの順番でタンパク質相互作用を介してYb bodyに順次局在することがわかった。Yb bodyが液相分離によって形成されることも判明した。この成果はEMBO Reports誌に報告した。

現在までの達成度 (段落)

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(5件)
  • 2019 実績報告書
  • 2018 実績報告書
  • 2017 研究概要(採択時) ( PDF )   審査結果の所見 ( PDF )   実績報告書
  • 研究成果

    (39件)

すべて 2019 2018 2017 その他

すべて 雑誌論文 (9件) (うち国際共著 1件、 査読あり 9件、 オープンアクセス 9件) 学会発表 (27件) (うち国際学会 12件、 招待講演 13件) 図書 (1件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Distinct and collaborative functions of Yb and Armitage in transposon-targeting piRNA biogenesis2019

    • 著者名/発表者名
      Hirotsugu Ishizu, Tatsuki Kinoshita, Shigeki Hirakata, Chihiro Komatsuzaki, and Mikiko C. Siomi
    • 雑誌名

      Cell Reports

      巻: 27 号: 6 ページ: 1822-1835

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2019.04.029

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書 2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Requirements for multivalent Yb body assembly in transposon silencing in Drosophila2019

    • 著者名/発表者名
      Shigeki Hirakata, Hirotsugu Ishizu, Aoi Fujita, Yumiko Tomoe, Mikiko C. Siomi
    • 雑誌名

      EMBO Reports

      巻: 印刷中 号: 7

    • DOI

      10.15252/embr.201947708

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Two distinct transcriptional controls triggered by nuclear Piwi-piRISCs in the Drosophila piRNA pathway2018

    • 著者名/発表者名
      Sato K, Siomi MC.
    • 雑誌名

      Curr. Opin. Struct. Biol.

      巻: 53 ページ: 69-76

    • DOI

      10.1016/j.sbi.2018.06.005

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Piwi Nuclear Localization and Its Regulatory Mechanism in Drosophila Ovarian Somatic Cells2018

    • 著者名/発表者名
      Yashiro Ryu、Murota Yukiko、Nishida Kazumichi M.、Yamashiro Haruna、Fujii Kaede、Ogai Asuka、Yamanaka Soichiro、Negishi Lumi、Siomi Haruhiko、Siomi Mikiko C.
    • 雑誌名

      Cell Reports

      巻: 23 号: 12 ページ: 3647-3657

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2018.05.051

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Hierarchical roles of mitochondrial Papi and Zucchini in Bombyx germline piRNA biogenesis2018

    • 著者名/発表者名
      Nishida Kazumichi M.、Sakakibara Kazuhiro、Iwasaki Yuka W.、Yamada Hiromi、Murakami Ryo、Murota Yukiko、Kawamura Takeshi、Kodama Tatsuhiko、Siomi Haruhiko、Siomi Mikiko C.
    • 雑誌名

      Nature

      巻: 555 号: 7695 ページ: 260-264

    • DOI

      10.1038/nature25788

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Evidence for convergent evolution of SINE-directed Staufen-mediated mRNA decay.2018

    • 著者名/発表者名
      Lucas BA, Lavi E, Shiue L, Cho H, Katzman S, Miyoshi K, Siomi MC, Carmel L, Ares M Jr, Maquat LE.
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci U S A.

      巻: 115 号: 5 ページ: 968-973

    • DOI

      10.1073/pnas.1715531115

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] The PIWI-Interacting RNA Molecular Pathway: Insights From Cultured Silkworm Germline Cells2018

    • 著者名/発表者名
      Sakakibara Kazuhiro、Siomi Mikiko C.
    • 雑誌名

      BioEssays

      巻: 40 号: 1 ページ: 1700068-1700068

    • DOI

      10.1002/bies.201700068

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] PIWI-Interacting RNA in Drosophila: Biogenesis, Transposon Regulation, and Beyond2017

    • 著者名/発表者名
      Yamashiro Haruna、Siomi Mikiko C.
    • 雑誌名

      CHEMICAL REVIEWS

      巻: - 号: 8 ページ: 4404-4421

    • DOI

      10.1021/acs.chemrev.7b00393

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Use of the CRISPR-Cas9 system for genome editing in cultured Drosophila ovarian somatic cells.2017

    • 著者名/発表者名
      Ishizu H, Sumiyoshi T, Siomi MC
    • 雑誌名

      Methods

      巻: 126 ページ: 186-192

    • DOI

      10.1016/j.ymeth.2017.05.021

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] piRNA Biogenesis2019

    • 著者名/発表者名
      塩見美喜子
    • 学会等名
      Keystone Symposia/Small Regulatory RMAs
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] piRNA biogenesis and function in Drosophila2019

    • 著者名/発表者名
      塩見美喜子,塩見美喜子
    • 学会等名
      第20回武田科学財団生命科学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Involvement of the Drosophila Brahma chromatin remodeling complex in Piwi-mediated transcriptional transposon silencing2019

    • 著者名/発表者名
      大西遼,塩見美喜子
    • 学会等名
      第20回武田科学財団生命科学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Hierarchical roles of mitochondrial PAPI and Zucchini in Bombyx germline piRNA biogenesis2018

    • 著者名/発表者名
      塩見美喜子
    • 学会等名
      Chromatin,Epigenetics & Transcription
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] piRNA biogenesis and function2018

    • 著者名/発表者名
      塩見美喜子
    • 学会等名
      Regulatory & Non-coding RNA
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Hierarchical roles of mitochondrial Papi and Zucchini in Bombyx germline piRNA biogenesis2018

    • 著者名/発表者名
      西田知訓,塩見美喜子
    • 学会等名
      RNA2018
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] piRNA依存的な転写抑制機構におけるヒストンメチル化酵素SETDB1の作用機序の解明2018

    • 著者名/発表者名
      大角健,塩見美喜子
    • 学会等名
      第20回日本RNA学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Requirements for multivalent Yb body assembly in transposon silencing in Drosophila2018

    • 著者名/発表者名
      塩見美喜子
    • 学会等名
      EMBO Workshop piRNAs and PIWI protein
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] piRNA biogenesis and function2018

    • 著者名/発表者名
      塩見美喜子
    • 学会等名
      China Nucleic Acids Forum
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] カイコ生殖細胞のトランスポゾン抑制機構におけるQinの機能解析2018

    • 著者名/発表者名
      西田知訓,塩見美喜子
    • 学会等名
      第41回分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] PIWI-Interacting RNA : Its Biogenesis and Functions2018

    • 著者名/発表者名
      Mikiko C.Siomi
    • 学会等名
      2018 Keystone Symposia
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Crystal Structure of Silkworm PIWI-Clade Argonaute Siwi Bound to piRNA2017

    • 著者名/発表者名
      Mikiko C. Siomi
    • 学会等名
      2017 International Conference on Structural Biological Macromolecules
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] piRNA biogenesis in Drosophila and Bombyx germlines2017

    • 著者名/発表者名
      Mikiko C.Siomi
    • 学会等名
      Microsymposium2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] The role of Zucchini in 3’ end processing of the piRNA intermediate within the Siwi-pre-piRISC in silkworm germ cells2017

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Sakakibara, Kazumichi M Nishida, Yuka W Iwasaki, Hiromi Yamada, Ryo Murakami, Haruhiko Siomi, and Mikiko C Siomi
    • 学会等名
      Microsymposium2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Molecular mechanism of Piwi-piRNA nuclear localization in ovarian somas2017

    • 著者名/発表者名
      Mikiko C. Siomi
    • 学会等名
      第43回内藤コンファレンス
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] piRNAはトランスポゾンの侵略から生殖ゲノムをどのように守るのか2017

    • 著者名/発表者名
      塩見美喜子
    • 学会等名
      千里ライフサイエンス振興財団セミナー
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ショウジョウバエpiRNA生合成因子Ybの機能解析2017

    • 著者名/発表者名
      平形 樹生、石津 大嗣、塩見 美喜子
    • 学会等名
      第19回日本RNA学会年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Molecular mechanism of piRNA biogenesis2017

    • 著者名/発表者名
      Mikiko C.Siomi
    • 学会等名
      EMBO EMBL Symposia /The Non-Coding Genome
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Requirement of nuclear mono-ubiquitination of Eggless/SETDB1 in piRNA-dependent transposon silencing2017

    • 著者名/発表者名
      Ken Ohsumi, Masaru Ariura, Saori Suzuki, Ryo Onishi, Kaoru Sato, Mikiko C. Siomi
    • 学会等名
      RNAフロンティアミーティング2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] piRNA 生合成経路における Vreteno の機能解析2017

    • 著者名/発表者名
      藤田 あおい ,平形 樹生 ,石津 大嗣 ,巴裕 美子 ,塩見 美喜子
    • 学会等名
      RNAフロンティアミーティング2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] piRNAを介したトランスポゾン転写抑制機構の解析2017

    • 著者名/発表者名
      大西 遼、佐藤 薫、塩見 美喜子
    • 学会等名
      ConBio2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] ショウジョウバエ脳腫瘍抑制遺伝子2017

    • 著者名/発表者名
      山本 瞳、佐藤 薫、塩見 美喜子
    • 学会等名
      ConBio2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] PAPIリン酸化修飾によるpiRNA成熟化制御機構の解明2017

    • 著者名/発表者名
      山田 紘実、西田 知訓、榊原 和洋、塩見 美喜子
    • 学会等名
      ConBio2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] ミトコンドリア外膜に局在するpiRNA生合成因子GasZの機能解析2017

    • 著者名/発表者名
      山城 はるな、石津 大嗣、塩見 美喜子
    • 学会等名
      ConBio2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] ショウジョウバエ卵巣体細胞におけるpiRNAとendo-siRNAのクロストーク2017

    • 著者名/発表者名
      小松崎 千尋、石津 大嗣、塩見 美喜子
    • 学会等名
      ConBio2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] piRNA生合成因子BmQinの機能解析2017

    • 著者名/発表者名
      Yumi Miyata, Kazumichi M. Nishida, Yuka W. Iwasaki, Haruhiko Siomi and Mikiko C. Siomi1
    • 学会等名
      ConBio2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] primary piRNA生合成におけるRNAヘリカーゼ Armitageの機能解析2017

    • 著者名/発表者名
      木下 達貴、石津 大嗣、塩見 美喜子
    • 学会等名
      ConBio2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [図書] ナノバイオ・メディシン2017

    • 著者名/発表者名
      宇理須 恒雄、佐久間 哲史、高田 望、竹中 繁織、小澤 岳昌、吉村 英哲、胡桃坂 仁志、越阪部 晃永、原田 昌彦、束田 裕一、宮成 悠介、塩見 美喜子、大西 遼
    • 総ページ数
      232
    • 出版者
      近代科学社
    • ISBN
      4764950286
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [備考] 塩見研究室ホームページ

    • URL

      http://www-siomilab.biochem.s.u-tokyo.ac.jp/index.html

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書 2018 実績報告書
  • [備考] 塩見研究室

    • URL

      http://www-siomilab.biochem.s.u-tokyo.ac.jp/index.html

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書

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公開日: 2017-06-01   更新日: 2023-10-16  

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