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バクテリアコンデンシンMukBEFの染色体DNAへの結合の分子機構

研究課題

研究課題/領域番号 17H07328
研究種目

研究活動スタート支援

配分区分補助金
研究分野 分子生物学
研究機関国立遺伝学研究所

研究代表者

秋山 光市郎  国立遺伝学研究所, 遺伝形質研究系, 博士研究員 (10800675)

研究期間 (年度) 2017-08-25 – 2019-03-31
研究課題ステータス 完了 (2019年度)
配分額 *注記
2,730千円 (直接経費: 2,100千円、間接経費: 630千円)
2018年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2017年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
キーワードバクテリアコンデンシン / 染色体 / MukBEF / 大腸菌 / 部位特異的光架橋実験 / rDNA
研究成果の概要

本研究では大腸菌のコンデンシンであるMukBの染色体DNAへの結合の分子機構の解明に取り組んだ。MukBの変異体を22種類作製した。それらの変異体を用いた大腸菌細胞内及び試験管内での実験により、MukBのDNA結合に重要なアミノ酸残基を特定した。MukBの立体構造と照らし合わせると、それらの残基は一直線上に整列していた。これらの結果を元に、MukBによるDNA結合の新たなモデルを立てた。

研究成果の学術的意義や社会的意義

コンデンシンタンパク質は大腸菌からヒトまで広く存在する。コンデンシンは一般に一本鎖DNAと二本鎖DNAのいずれにも結合するが、一本鎖DNAへの結合能をどの様に利用しているかに関しては不明点が多い。本研究ではMukBの一本鎖DNA結合に着目することでDNAへの結合の分子機構について新たな機能モデルを示した。この成果は大腸菌にとどまらず、コンデンシンの普遍的な機能の理解に貢献するものである。

報告書

(3件)
  • 2019 研究成果報告書 ( PDF )
  • 2018 実績報告書
  • 2017 実績報告書
  • 研究成果

    (8件)

すべて 2019 2018

すべて 雑誌論文 (1件) (うち国際共著 1件、 査読あり 1件) 学会発表 (7件) (うち国際学会 2件)

  • [雑誌論文] In Vivo and In Vitro Assay for Monitoring the Topological Loading of Bacterial Condensins on DNA2019

    • 著者名/発表者名
      Koichi Yano, Koichiro Akiyama, and Hironori Niki
    • 雑誌名

      Methods in Molecular Biology

      巻: 2004 ページ: 181-196

    • DOI

      10.1007/978-1-4939-9520-2_14

    • ISBN
      9781493995196, 9781493995202
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] バクテリアコンデンシンMukBの DNA構造を認識したローディング機構2019

    • 著者名/発表者名
      秋山光市郎、仁木宏典
    • 学会等名
      第37回染色体ワークショップ
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] バクテリアコンデンシンMukBのDNA構造を認識したローディング機構2019

    • 著者名/発表者名
      秋山光市郎、仁木宏典
    • 学会等名
      第42回分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Sensor residues of MukB for the binding to single-stranded DNA2019

    • 著者名/発表者名
      Koichiro Akiyama, Hironori Niki
    • 学会等名
      Gordon Research Conference; Chromosome Dynamics
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 大腸菌コンデンシンMukBのDNA構造を認識したローディング機構2019

    • 著者名/発表者名
      秋山光市郎、仁木宏典
    • 学会等名
      第16回21世紀大腸菌研究会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 大腸菌コンデンシンMukBの一本鎖DNA認識機構2019

    • 著者名/発表者名
      秋山光市郎、仁木宏典
    • 学会等名
      第13回日本ゲノム微生物学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] バクテリアコンデンシンの一本鎖DNA 認識機構2019

    • 著者名/発表者名
      秋山光市郎、仁木宏典
    • 学会等名
      第36回染色体ワークショップ
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Bacterial condensin MukB binds to RNA2018

    • 著者名/発表者名
      Koichiro Akiyama, Hironori Niki
    • 学会等名
      The 11th 3R&3C Symposium
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会

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公開日: 2017-08-25   更新日: 2021-02-19  

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