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細菌のアラニン排出輸送体に関する構造と機能解析および発酵生産への応用の基盤研究

研究課題

研究課題/領域番号 17J03042
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 応用微生物学
研究機関東北大学

研究代表者

勝部 哲  東北大学, 農学研究科, 特別研究員(PD)

研究期間 (年度) 2017-04-26 – 2019-03-31
研究課題ステータス 完了 (2018年度)
配分額 *注記
1,900千円 (直接経費: 1,900千円)
2018年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
2017年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
キーワード大腸菌 / AlaE / 結晶化 / YtfF / L-アラニン / 構成的
研究実績の概要

本年度は、排出輸送体の機能強化によってL-アラニンの発酵生産効率を上げるためにはAlaEに関する構造の研究を行うことが重要であると考え、AlaEの結晶化を試みた。
結晶化実験においてはまず、AlaEのN-末端またはC-末端に10×His-tagを付加したAlaE発現プラスミドを構築した。これを大腸菌において発現させた結果、C-末端にHis-tagを付加したものでは精製するために十分な量のAlaEの発現がみられた。このC-His_AlaEを大腸菌において発現させた後、破砕を行い、膜画分を回収した。その後、界面活性剤用いて可溶化実験を行った。しかし、一般的に可溶化に用いられる界面活性剤であるDDMやOGなどにはほとんどAlaEを可溶化することはできなかった。そこで、様々な界面活性剤でAlaEを可溶化できるものを探索した結果、ヘッドの部分の構造が小さい界面活性剤によってAlaEが可溶化できることが分かった。ヘッドの構造が小さい界面活性剤を用い可溶化を行い、その後Talon-resinを用い1次精製を行った。その結果、800 mgの膜タンパク質から約15mgのAlaEを精製することができた。このAlaEをFPLCを用いて2次精製を行ったところ、数mgのAlaEを獲得することができた。よって、精製後のAlaEと結晶化スクリーニングキットを用いてAlaEの結晶を獲得できないか試みた。その結果、1つの条件でAlaEの結晶を獲得することができた。この条件下においては、再現性のある結晶を獲得することに成功している。この結晶をx線で解析した結果、まだ低い分解能しか得ることはできなかった。現在この結晶化条件を基準とし、良質な分解能を持つ結晶を獲得するために沈殿剤の濃度やバッファーpHを変化させることや金属イオン、基質の添加など様々な条件を検討し構造解析可能なAlaEの結晶を獲得すること試みている。

現在までの達成度 (段落)

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2018 実績報告書
  • 2017 実績報告書
  • 研究成果

    (5件)

すべて 2018 2017

すべて 学会発表 (5件) (うち国際学会 3件)

  • [学会発表] Detergent study for improved stabilization of melibiose transporter MelB2018

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Katsube, Hariharan Parameswaran, Muhammad Ehsan, Lubna Ghani, Pil S. Chae, Lan Guan
    • 学会等名
      10th Annual CMPR Symposium
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 新規アラニン排出輸送体YtfFの膜貫通領域内荷電アミノ酸の役割2018

    • 著者名/発表者名
      勝部 哲、安藤 太助、磯貝 恵美子、米山 裕
    • 学会等名
      2018年度 農芸化学会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Characterization of a Novel Amino Acid Exporter YtfF of Escherichia coli2017

    • 著者名/発表者名
      S. Katsube, S.Kim, T. Ando, E. Isogai, H.Yoneyama
    • 学会等名
      ASM Microbe 2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Export of D-alanine by Escherichia coli2017

    • 著者名/発表者名
      S. Katsube, K. Sato, T. Ando, E. Isogai, H. Yoneyama
    • 学会等名
      IDAR 2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 大腸菌のアラニン排出輸送体の生理的役割の解明 新規L-アラニンおよびD-アラニン排出輸送体の同定と機能解析2017

    • 著者名/発表者名
      勝部 哲、安藤 太助、磯貝 恵美子、米山 裕
    • 学会等名
      2017年度 農芸化学会東北支部 若手の会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書

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公開日: 2017-05-25   更新日: 2024-03-26  

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