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RNAアプタマースイッチを利用した低オフターゲット効果ゲノム編集法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 17J08531
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 化学系薬学
研究機関東京医科歯科大学

研究代表者

松本 大亮  東京医科歯科大学, 大学院医歯学総合研究科, 特別研究員(DC2)

研究期間 (年度) 2017-04-26 – 2019-03-31
研究課題ステータス 完了 (2018年度)
配分額 *注記
1,900千円 (直接経費: 1,900千円)
2018年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
2017年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
キーワードゲノム編集 / CRISPR / 抗CRISPR / 相同性組換え / 細胞周期 / CRISPR/Cas9 / RNAアプタマー
研究実績の概要

現在ゲノム編集技術において主に用いられる配列特異的なDNA切断酵素であるCRISPR/Cas9システム(CRISPR)に対して、近年報告されたCRISPR阻害タンパク質である抗CRISPR分子を組み合わせることで、細胞周期依存的に活性化できるCRISPR制御系を構築した。
本研究の目的は相同性組換えが高頻度で起こるS/G2期においてDNA二本鎖切断を導入することにより、正確性の高いゲノム編集を行うことである。当初の研究実施計画では、CRISPRの配列認識に用いられるガイドRNAをRNAアプタマーを利用して阻害し、このRNAアプタマーが細胞周期に応じてスイッチする系を試みた。しかし、アプタマーの入手が困難であったため、抗CRISPR分子を用いることとした。
哺乳類細胞において細胞周期のS期からM期の間での分解を促進するCdt1由来のアミノ酸配列を抗CRISPR分子(AcrIIA4)に融合したAcrIIA4-Cdt1を構築した。これにより、G1期ではAcrIIA4によるCas9活性の阻害、S期以降ではAcrIIA4の分解によるCas9の活性化が可能となる。実際に、ゲノム編集の正確性の向上を確認することができた。
本手法では、ベクターを工夫することによってDNAを導入するのみで自律的にCRISPRの細胞周期依存的な活性化が可能である。そのため、薬剤を用いた細胞の同調培養やCas9タンパク質やガイドRNAの精製も不要であり、細胞にとって低侵襲でかつ低コストな手法である。また、相同性組換えを介した標的配列での正確な修復効率の向上に加え、標的外での配列における変異導入(オフターゲット作用)の低減も確認できた。したがって、本手法はゲノム編集技術の医学分野やバイオ産業分野への応用が期待される。

現在までの達成度 (段落)

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2018 実績報告書
  • 2017 実績報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2019 2018 2017

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (7件) (うち国際学会 5件)

  • [雑誌論文] Direct Delivery of Cas9-sgRNA Ribonucleoproteins into Cells Using a Nanoneedle Array2019

    • 著者名/発表者名
      Yamagishi Ayana、Matsumoto Daisuke、Kato Yoshio、Honda Yuki、Morikawa Mone、Iwata Futoshi、Kobayashi Takeshi、Nakamura Chikashi
    • 雑誌名

      Applied Sciences

      巻: 9 号: 5 ページ: 965-965

    • DOI

      10.3390/app9050965

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Efficient and Orthogonal Transcription Regulation by Chemically Inducible Artificial Transcription Factors.2018

    • 著者名/発表者名
      Wataru Nomura, Daisuke Matsumoto, Taisuke Sugii, Takuya Kobayakawa, Hirokazu Tamamura
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 57 号: 45 ページ: 6452-6459

    • DOI

      10.1021/acs.biochem.8b00741

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Split site-specific nucleases for controlled genome editing by chemicals2018

    • 著者名/発表者名
      Daisuke Matsumoto, Wataru Nomura, Hirokazu Tamamura
    • 学会等名
      Frontiers2018 symposium
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 化合物誘導型ヌクレアーゼを用いたゲノム編集効率の評価2018

    • 著者名/発表者名
      松本大亮、野村渉、玉村啓和
    • 学会等名
      第62回日本薬学会関東支部大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] FokIを基盤とした化合物誘導型ヌクレアーゼによるゲノム編集法の開発2018

    • 著者名/発表者名
      松本大亮、野村渉、玉村啓和
    • 学会等名
      日本ケミカルバイオロジー学会第13回年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Distinct chemically inducible system for orthogonal differential regulation of endogenous genes2018

    • 著者名/発表者名
      Wataru Nomura, Daisuke Matsumoto, Taisuke Sugii, Takuya Kobayakawa, Hirokazu Tamamura
    • 学会等名
      Keystone symposia Precision Genome Engineering (B1) 2018
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Genome editing with a FokI-based chemically inducible nuclease system2018

    • 著者名/発表者名
      Daisuke Matsumoto, Wataru Nomura, Hirokazu Tamamura
    • 学会等名
      Keystone symposia Precision Genome Engineering (B1) 2018
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Differential regulation of endogenous genes in an orthogonal manner by distinct chemically inducible systems2017

    • 著者名/発表者名
      Wataru Nomura, Daisuke Matsumoto, Taisuke Sugii, Takuya Kobayakawa, Hirokazu Tamamura
    • 学会等名
      International Conference on Epigenetics and Bioengineering 2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Controllable genome editing by chemically inducible split site-specific nucleases2017

    • 著者名/発表者名
      Daisuke Matsumoto, Wataru Nomura, Hirokazu Tamamura
    • 学会等名
      Keystone symposia Precision Genome Engineering (A2) 2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会

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公開日: 2017-05-25   更新日: 2024-03-26  

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