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金属酵素の機能制御機構における酵素分子全体の動的構造効果:モデル蛋白質による検証

研究課題

研究課題/領域番号 17K01947
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 生物分子化学
研究機関奈良先端科学技術大学院大学

研究代表者

松尾 貴史  奈良先端科学技術大学院大学, 先端科学技術研究科, 准教授 (50432521)

研究期間 (年度) 2017-04-01 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2020年度)
配分額 *注記
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2019年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2018年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2017年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
キーワード金属酵素 / 構造柔軟性 / タンパク質 / サブチリシン / 金属配位 / 補助配位子 / 動的構造効果 / 銅錯体 / H/D交換
研究成果の概要

本研究では、金属含有酵素の機能発現メカニズムに対する、活性部位である遷移金属イオン近傍を覆うタンパク質構造の動的な構造効果を、チオールサブチリシンをモデルタンパク質として検証した。その結果、チオールサブチリシンのシステイン残基に結合したCu(II)イオンの性質は、その近傍の構造的な要因だけでなく、その部位から遠く離れたカルシウムイオンの結合状態によって制御されることが実験的に証明できた。その遠く離れた部位の構造的摂動は、タンパク質全体の構造柔軟性効果によって説明することができ、タンパク質という自由度の大きい構造が、結合した金属イオンの性質を決める要因であることを実証することができた。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究は、タンパク質という生体高分子の分子自由度が、遷移金属イオンの反応性を決める要因であり、金属酵素の理解には、金属配位部位近傍の構造的要因のみだけでなく、タンパク質全体の構造効果を加味する必要性を実験的に証明したものである。分子量数万の金属含有酵素の機能は、「小さな」遷移金属イオン上で発揮される。したがって、本研究で得られた知見は、「小さな金属イオンの性質をコントロールするのに、なぜ、大きなタンパク質構造が必要か?」という構造生物学の根本的な疑問に1つの答えを与えるものであり、今後、タンパク質工学的に金属含有酵素の機能を制御する際の新しいアプローチを提案するものである。

報告書

(5件)
  • 2020 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2019 実施状況報告書
  • 2018 実施状況報告書
  • 2017 実施状況報告書
  • 研究成果

    (24件)

すべて 2021 2020 2019 2018 2017 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 1件、 査読あり 5件) 学会発表 (15件) (うち国際学会 3件、 招待講演 2件) 図書 (1件) 備考 (2件)

  • [国際共同研究] Jadavpur University(インド)

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Second-coordination sphere effects on the reactivities of Hoveyda-Grubbs-type catalysts: a ligand exchange study using phenolic moiety-functionalized ligands2020

    • 著者名/発表者名
      Jatmika Catur、Goshima Kenta、Wakabayashi Kazumo、Akiyama Naoki、Hirota Shun、Matsuo Takashi
    • 雑誌名

      Dalton Transactions

      巻: 49 号: 33 ページ: 11618-11627

    • DOI

      10.1039/d0dt02353a

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Porphyrin-based Probe for Simultaneous Detection of Interface Acidity and Polarity during Lipid Phase Transition of Vesicles.2020

    • 著者名/発表者名
      Rini Majumder, Snigdha Roy, Kentaro Okamoto, Satoshi Nagao, Takashi Matsuo, Partha Pratim Parui
    • 雑誌名

      Langmuir

      巻: 36 号: 1 ページ: 426-434

    • DOI

      10.1021/acs.langmuir.9b02781

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Regioselective Chemical Modification of Cysteine Residues on Protein Surfaces Focusing on Local Environment around the Conjugation Sites2020

    • 著者名/発表者名
      Teruyuki Miyake, Ryosei Tamaki, Moeko Asanuma, Yoji Fukada, Shun Hirota, Takashi Matsuo
    • 雑誌名

      Bioconjugate Chem.

      巻: 31 号: 3 ページ: 794-802

    • DOI

      10.1021/acs.bioconjchem.9b00869

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Recent Developmetns on Creation of Artificial Metalloenzymes.2019

    • 著者名/発表者名
      Takashi Matsuo, Teruyuki, Miyake, Shun Hirota
    • 雑誌名

      Tetrahedron Lett.

      巻: 60 号: 45 ページ: 151226-151226

    • DOI

      10.1016/j.tetlet.2019.151226

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Global Structural Flexibility of Metalloproteins Regulates Reactivity of Transition Metal Ion in the Protein Core: An Experimental Study Using Thiol-subtilisin as a Model Protein2018

    • 著者名/発表者名
      Matsuo Takashi、Kono Takamasa、Shobu Isamu、Ishida Masaya、Gonda Katsuya、Hirota Shun
    • 雑誌名

      Chem. Eur. J.

      巻: 24 号: 11 ページ: 2767-2775

    • DOI

      10.1002/chem.201705920

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] タンパク質表面システイン残基の化学修飾に対する局所的構造効果の検証2021

    • 著者名/発表者名
      玉置椋星、三宅輝幸、廣田俊、松尾貴史
    • 学会等名
      日本化学会第101春季大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] Hoveyda-Grubbs型錯体の構造修飾 (1):第二配位圏効果による錯体の安定性および触媒活性制御2021

    • 著者名/発表者名
      秋山 直生、Catur Jatmika、五嶋 健太、廣田 俊、松尾 貴史
    • 学会等名
      日本化学会第101春季大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] Hoveyda-Grubbs型錯体の構造修飾 (2):生体分子への固定化反応の適用2021

    • 著者名/発表者名
      中村 伊武輝、Catur Jatmika、秋山 直生、廣田 俊、山口 浩靖、松尾 貴史
    • 学会等名
      日本化学会第101春季大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] アデニル酸キナーゼ三変異体(A55C/C77S/V169C)の表面システイン残基の反応性に対する局所的構造要因の検証2020

    • 著者名/発表者名
      玉置椋星、三宅輝幸、浅沼萌子、松尾貴史、廣田俊
    • 学会等名
      日本化学会第100春季大会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] Sequential Conjugation of Different Molecules onto Protein Surface and Comparison of Reactivities of Cysteine Residues2019

    • 著者名/発表者名
      Teruyuki Miyake, Yoji Fukada, Shun Hirota, Takashi Matsuo
    • 学会等名
      15th International Symposium on Applied Bioinorganic Chemistry (ISABC15)
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ヘム鉄の軸配位子としてイミダゾールをもつミオグロビンの研究2019

    • 著者名/発表者名
      杉田達郎、百武篤也、山本泰彦、松尾貴史、廣田俊、鈴木秋弘、根矢三郎、荘司長三、渡辺芳人
    • 学会等名
      第46回生体分子科学討論会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] システイン残基周辺の局所的環境の違いを利用したタンパク質化学修飾の反応制御2019

    • 著者名/発表者名
      松尾貴史、三宅輝幸、廣田俊
    • 学会等名
      第19回蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] Sequential conjugation of different synthetic molecules onto protein surface with two cysteine residues based on the reactivities of cysteine thiols2019

    • 著者名/発表者名
      Teruyuki Miyake, Yoji Fukada, Shun Hirota, Takashi Matsuo
    • 学会等名
      日本化学会第99春季年会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] チオールサブチリシンに結合したカルシウムイオンの結合状態が及ぼす主鎖の構造柔軟性およびシステインの反応性評価2018

    • 著者名/発表者名
      松尾貴史、菖蒲勇、河野尊匡、権田勝也、廣田俊
    • 学会等名
      第45回生体分子科学討論会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] Combination of metathesis catalyst complexes and protein: From the development of metathesis-catalyzing artificial enzymes to application as a biorthogonal tool2018

    • 著者名/発表者名
      Takashi Matsuo, Takefumi Yoshida, Chie Imai, Shun Hirota, Kazumo Wakabayashi, Catur Jatmika
    • 学会等名
      43rd International Conference on Coordination Chemistry 2018 (ICCC-2018)
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Construction of “metathesase” with protein scaffold and potential application of olefin metathesis as a biochemical tool2018

    • 著者名/発表者名
      Takashi Matsuo, Takefumi Yoshida, Chie Imai, Shun Hirota, Kazumo Wakabayashi,
    • 学会等名
      International Congress of Pure and Applied Chemistry-2018(ICPAC-2018)
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] タンパク質内部の遷移金属イオンの性質とタンパク質構造柔軟性:チオールサブチリシンをモデルタンパク質とした相関関係の実験的検討2017

    • 著者名/発表者名
      松尾貴史、菖蒲勇、石田昌也、河野尊匡、廣田俊
    • 学会等名
      第17回日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] タンパク質の動的構造効果による機能制御2017

    • 著者名/発表者名
      松尾貴史
    • 学会等名
      第30回生物無機化学夏季セミナー
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 金属錯体-金属錯体相互作用のスイッチングを目指したCoサレン錯体修飾アデニル酸キナーゼの物性評価2017

    • 著者名/発表者名
      三宅輝幸、松尾貴史、廣田俊
    • 学会等名
      錯体化学会第67回討論会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] タンパク質の構造的二面性に立脚した反応場の機能制御2017

    • 著者名/発表者名
      松尾貴史、三宅輝幸、藤井亮、菖蒲勇、河野尊匡、廣田俊
    • 学会等名
      第66回高分子討論会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [図書] Advances in Bioorganometallic Chemistry2018

    • 著者名/発表者名
      Daniel F. Sauer, Takashi Matsuo, Akira Onoda, Jun Okuda, Takashi Hayashi
    • 総ページ数
      472
    • 出版者
      Elsevier
    • ISBN
      9780128141977
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [備考] 松尾貴史 ホームページ

    • URL

      https://mswebs.naist.jp/LABs/hirota/tmatsuo/matsuo_jpn.html

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [備考] 松尾貴史ホームページ

    • URL

      http://mswebs.naist.jp/LABs/hirota/tmatsuo/matsuo_jpn.html

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書 2017 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2017-04-28   更新日: 2022-01-27  

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