• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

底生有孔虫類の遺伝的分化機構の解明:生態的な要因が遺伝的集団の分化に与える影響

研究課題

研究課題/領域番号 17K05696
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 層位・古生物学
研究機関国立研究開発法人海洋研究開発機構

研究代表者

土屋 正史  国立研究開発法人海洋研究開発機構, 地球環境部門(海洋生物環境影響研究センター), グループリーダー代理 (00435835)

研究期間 (年度) 2017-04-01 – 2020-03-31
研究課題ステータス 完了 (2019年度)
配分額 *注記
4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2019年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2018年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2017年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
キーワード層位・古生物学 / 系統進化 / 海洋生態 / 古環境変遷 / 底生有孔虫 / 同位体生態 / 分子系統学 / 共生
研究成果の概要

本研究では日本沿岸の岩礁地性底生有孔虫(Elphidium crispum、Pararotalia nipponica)の遺伝的分化機構が、日本海の閉鎖といった地理的隔離だけではなく、内生微細藻類や宿主の環境応答様式などの生態的要因によることを、1)分子系統地理学、2)生態学、3)同位体生態学の視点から明らかにした。両種は同様の有性生殖様式を持つが、遺伝的集団の規模が異なるだけではなく、遺伝的分化パターンが異なっていた。環境中から獲得する内生微細藻やその環境応答様式、有孔虫の餌資源利用形態の違いなどの生態的要因が、宿主の地域集団の形成や遺伝的分化に寄与する可能性が高いことを見いだした。

研究成果の学術的意義や社会的意義

海洋酸性化や温暖化など海洋環境変化は、基礎生産の一翼を担う有孔虫などの多様性や生物量にも影響を及ぼすため、個体や集団だけではなく、海洋生態系構造を変化させうる。その結果、海洋生態系の恩恵を享受する人間活動においても、影響を与える可能性が高い。環境変化に対して有孔虫がどのように微小生息空間に適応し集団を形成するのか、どのように遺伝的分化するのかを解明することで、将来起こりうる環境変動に対する石灰化生物の応答を評価できる。有孔虫を利用した海洋酸性化実験では、宿主や共生藻の種ごとに殻の溶解度が異なる。宿主の環境応答や代謝だけではなく、集団の形成にも共生藻類との相互作用の解明が必要であることを示す。

報告書

(4件)
  • 2019 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2018 実施状況報告書
  • 2017 実施状況報告書
  • 研究成果

    (60件)

すべて 2020 2019 2018 2017 その他

すべて 国際共同研究 (14件) 雑誌論文 (12件) (うち国際共著 5件、 査読あり 12件、 オープンアクセス 7件) 学会発表 (33件) (うち国際学会 13件、 招待講演 2件) 図書 (1件)

  • [国際共同研究] リール大学(フランス)

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [国際共同研究] ウルビノ大学(イタリア)

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [国際共同研究] ヘルシンキ大学(フィンランド)

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [国際共同研究] ジュネーブ大学(スイス)

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [国際共同研究] Geomarine Research(ニュージーランド)

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [国際共同研究] University of Geneva/Ecole Polytechnique Federale de Lausanne/University of Lausanne(スイス)

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [国際共同研究] University of Helsinki(フィンランド)

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [国際共同研究] Universite d'Angers(フランス)

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [国際共同研究] Woods Hole Oceanographic Institution(米国)

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [国際共同研究] University of Bremen(ドイツ)

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [国際共同研究] ウッズホール海洋研究所(米国)

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [国際共同研究] アンジェ大学(フランス)

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [国際共同研究] スイス連邦工科大学ローザンヌ校/ローザンヌ大学/ジュネーブ大学(スイス)

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [国際共同研究] ヘルシンキ大学(フィンランド)

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Characterization of microplastics on filter substrates based on hyperspectral imaging: Laboratory assessments2020

    • 著者名/発表者名
      Zhu Chunmao、Kanaya Yugo、Nakajima Ryota、Tsuchiya Masashi、Nomaki Hidetaka、Kitahashi Tomo、Fujikura Katsunori
    • 雑誌名

      Environmental Pollution

      巻: 263 ページ: 114296-114296

    • DOI

      10.1016/j.envpol.2020.114296

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Sediment sampling with a core sampler equipped with aluminum tubes and an onboard processing protocol to avoid plastic contamination2019

    • 著者名/発表者名
      Tsuchiya Masashi、Nomaki Hidetaka、Kitahashi Tomo、Nakajima Ryota、Fujikura Katsunori
    • 雑誌名

      MethodsX

      巻: 6 ページ: 2662-2668

    • DOI

      10.1016/j.mex.2019.10.027

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Combined Molecular and Morphological Taxonomy of the Beccarii/T3 Group of the Foraminiferal Genus Ammonia2019

    • 著者名/発表者名
      Hayward Bruce W.、Holzmann Maria.、Tsuchiya Masashi
    • 雑誌名

      Journal of Foraminiferal Research

      巻: 49 号: 4 ページ: 367-389

    • DOI

      10.2113/gsjfr.49.4.367

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] A new small device made of glass for separating microplastics from marine and freshwater sediments2019

    • 著者名/発表者名
      Ryota Nakajima, Masashi Tsuchiya, Dhugal J. Lindsay, Tomo Kitahashi, Katsunori Fujikura and Tomohiko Fukushima
    • 雑誌名

      PeerJ

      巻: 7 ページ: e7915-e7915

    • DOI

      10.7717/peerj.7915

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] A small, stainless-steel sieve optimized for laboratory beaker-based extraction of microplastics from environmental samples2019

    • 著者名/発表者名
      Nakajima R, Lindsay DJ, Tsuchiya M, Matsui R, Kitahashi T, Fujikura K, Fukushima T
    • 雑誌名

      MethodsX

      巻: 6 ページ: 1677-1682

    • DOI

      10.1016/j.mex.2019.07.012

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Taming chlorophylls allowed eukaryotes to prosper on the oxygenated Earth.2019

    • 著者名/発表者名
      Kashiyama Y, Yokoyama A, Shiratori T, Bachy C, Gutierrez-Rodriguez A, Not F, Hess S, Wang M, Chen M, Gong Y, Seto K, Kagami M, Hamamoto Y, Honda D, Umetani T, Shihongi A, Kayama M, Matsuda T, Taira J, Yabuki A, Tsuchiya M, Hirakawa Y, Kawaguchi A, Nomura M, Nakamura A, Namba N, Matsumoto M, Tanaka T, Yoshino T et al.
    • 雑誌名

      The ISME journal

      巻: - 号: 8 ページ: 1-12

    • DOI

      10.1038/s41396-019-0377-0

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Compound-specific isotope analysis of benthic foraminifer amino acids suggests microhabitat variability in rocky-shore environments.2018

    • 著者名/発表者名
      Tsuchiya M, Chikaraishi Y, Nomaki H, Sasaki Y, Tame A, Uematsu K, Ohkouchi N
    • 雑誌名

      Ecology and Evolution

      巻: 00 号: 16 ページ: 1-16

    • DOI

      10.1002/ece3.4358

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] A new analytical method for determination of the nitrogen isotopic composition of methionine: Its application to aquatic ecosystems with mixed resources.2018

    • 著者名/発表者名
      Ishikawa NF, Chikaraishi Y, Takano Y, Sasaki Y, Takizawa Y, Tsuchiya M, Tayasu I, Nagata T, Ohkouchi N
    • 雑誌名

      Limnology & Oceanography: Methods

      巻: 16 号: 9 ページ: 607-620

    • DOI

      10.1002/lom3.10272

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] A new method for acquiring images of meiobenthic images using the FlowCAM.2018

    • 著者名/発表者名
      Kitahashi T, Watanabe H, Tsuchiya M, Yamamoto Hideyuki, Yamamoto Hiroyuki
    • 雑誌名

      Methods X

      巻: 5 ページ: 1330-1335

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Ultrastructural observations on prokaryotic associates of benthic foraminifera: Food, mutualistic symbionts, or parasites?2018

    • 著者名/発表者名
      Bernhard Joan M.、Tsuchiya Masashi、Nomaki Hidetaka
    • 雑誌名

      Marine Micropaleontology

      巻: 138 ページ: 33-45

    • DOI

      10.1016/j.marmicro.2017.09.001

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Ultrastructure and distribution of kleptoplasts in benthic foraminifera from shallow-water (photic) habitats2018

    • 著者名/発表者名
      Jauffrais Thierry、LeKieffre Charlotte、Koho Karoliina A.、Tsuchiya Masashi、Schweizer Magali、Bernhard Joan M.、Meibom Anders、Geslin Emmanuelle
    • 雑誌名

      Marine Micropaleontology

      巻: 138 ページ: 46-62

    • DOI

      10.1016/j.marmicro.2017.10.003

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Syringammina limosa sp. nov., the first xenophyophore from the deep Sea of Okhotsk: morphological and genetic description2017

    • 著者名/発表者名
      Voltski Ivan、Weiner Agnes K.M.、Tsuchiya Masashi、Kitazato Hiroshi
    • 雑誌名

      Deep Sea Research Part II: Topical Studies in Oceanography

      巻: in press ページ: 32-46

    • DOI

      10.1016/j.dsr2.2017.12.001

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書 2017 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] Elphidum batialisの分子系統学的位置と深海への適応・集団の形成機構2020

    • 著者名/発表者名
      土屋正史、長谷川四郎
    • 学会等名
      2019年度 微化石リファレンスセンター(MRC)研究集会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 膠着質有孔虫を用いたマイクロプラスチック汚染の実態把握2020

    • 著者名/発表者名
      土屋正史
    • 学会等名
      2019年度 微化石リファレンスセンター(MRC)研究集会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] ナイルレッド染色したマイクロプラスチックの自動検出法開発2020

    • 著者名/発表者名
      土屋正史、北橋 倫、平 陽介、斎藤仁志、中嶋亮太、Dhugal J. Lindsay、藤倉克則、福島朋彦
    • 学会等名
      第54回日本水環境学会(2019年度)
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] ハイパースペクトルカメラを用いたマイクロプラスチックの材質自動判別の試み2020

    • 著者名/発表者名
      北橋 倫、中嶋亮太、野牧秀隆、土屋正史、山口壮二朗、朱 春茂、金谷有剛、Dhugal Lindsay、千葉早苗、藤倉克則
    • 学会等名
      第54回日本水環境学会(2019年度)
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Ecological factors affecting the formation and persistence of genetic populations of rocky-shore benthic foraminifera2019

    • 著者名/発表者名
      Masashi Tsuchiya、Katsunori Fujikura
    • 学会等名
      TMS 2019, The Micropaleontological Society’s Joint Foraminifera and Nanofossil Meeting
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Microplastic as a "micro"indicator for Anthropocene: understanding the actual condition of microplastic pollution by using agglutinated foraminifera2019

    • 著者名/発表者名
      Masashi Tsuchiya
    • 学会等名
      TMS 2019, The Micropaleontological Society’s Joint Foraminifera and Nanofossil Meeting
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Metabarcoding reveals putative interactions between sediment bacteria and deep-sea benthic foraminifera2019

    • 著者名/発表者名
      Iines Salonen、Panagiota-Myrsini Chronopoulou、Dewi Langlet、Hidetaka Nomaki、Masashi Tsuchiya、KaroliinaKoho K
    • 学会等名
      TMS 2019, The Micropaleontological Society’s Joint Foraminifera and Nanofossil Meeting
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] A new threat for marine environments and foraminifera: micro- and nano- plastics (TMS Workshop)2019

    • 著者名/発表者名
      Hidetaka Nomaki、Fabrizio Frontalini、Vincent Bouchet、Dewi Langlet、Masashi Tsuchiya
    • 学会等名
      TMS 2019, The Micropaleontological Society’s Joint Foraminifera and Nanofossil Meeting
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Variations in 3-D cytoplasmic structures of foraminifera (protistan meiofauna): microfocus X-ray CT and TEM observations2019

    • 著者名/発表者名
      Hidetaka Nomaki、Masashi Tsuchiya、Akihiro Tame、Takuya Matsuzaki、Masafumi Murayama
    • 学会等名
      17th International Meiofauna Conference
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 人新世の微化石指標:砂質有孔虫を用いたマイクロプラスチック汚染の実態把握2019

    • 著者名/発表者名
      土屋正史、野牧秀隆、木元克典、中嶋亮太、北橋 倫、川村喜一郎、生田哲朗、小栗一将、千葉早苗、藤倉克則
    • 学会等名
      日本古生物学会2019年年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 底生有孔虫Chilostomella細胞内の板状構造と推察される役割2019

    • 著者名/発表者名
      野牧秀隆、Chen Chong、小田加也、土屋正史、松崎琢也、多米晃裕、植松勝之
    • 学会等名
      日本古生物学会2019年年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 人新世の微化石指標:人為的なマイクロプラスチック化石の検出と変遷2019

    • 著者名/発表者名
      土屋正史、斎藤めぐみ、辻本 彰、野牧秀隆
    • 学会等名
      日本古生物学会2019年年会(夜間小集会)
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 砂質有孔虫を用いたマイクロプラスチック汚染の実態把握2019

    • 著者名/発表者名
      土屋正史
    • 学会等名
      2019年日本ベントス学会・日本プランクトン学会・合同大会(自由集会)
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] メイオファウナを用いた環境影響評価手法の検討2019

    • 著者名/発表者名
      北橋 倫,中村匡聡,西島美由紀,猪又健太郎,土屋正史,渡部裕美,山本啓之
    • 学会等名
      ブルーアースサイエンス・テク2019
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] 海底堆積物からマイクロプラスチックを分離するための新しい器具の考案2019

    • 著者名/発表者名
      中嶋亮太,土屋正史,北橋 倫,Dhugal Lindsay,藤倉克則,福島朋彦
    • 学会等名
      第53回日本水環境学会年会(2018年度)
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] Syringammina limosa sp. nov. and other xenophyophores from the north-west Pacific (the Sea of Okhotsk and Kuril-Kamchatka Trench region)2018

    • 著者名/発表者名
      Voltski I, Weiner AKM, Tsuchiya M, Kitazato H
    • 学会等名
      International Symposium on Foraminifera (FORAMS 2018)
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] A comprehensive look on the endobiotic community and ecology of deep-sea foraminifera Bolivina subornata.2018

    • 著者名/発表者名
      Karoliina A. Koho, Iines Salonen, Hidetaka Nomaki, Myrsini Chronopoulou, Dewi Langlet and Masashi Tsuchiya
    • 学会等名
      International Symposium on Foraminifera (FORAMS 2018)
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] The adaptation potential of benthic foraminifera from extremely warm reefs in the Persian Gulf.2018

    • 著者名/発表者名
      Schmidt C, Morard, R, Burt J, Theara G, Vaughan G, Tsuchiya M, Kucera M
    • 学会等名
      International Symposium on Foraminifera (FORAMS 2018)
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Cellular ultrastructure in benthic foraminifera: general observations and focus on kleptoplasts.2018

    • 著者名/発表者名
      LeKieffre C, Jauffrais T, Geslin E, Koho KA, Tsuchiya M, Meibom A, Bernhard J
    • 学会等名
      International Symposium on Foraminifera (FORAMS 2018)
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Variation in foraminiferal cytoplasm structures and its possible relationships between environmental conditions.2018

    • 著者名/発表者名
      Nomaki H, Tsuchiya M, Tame A, Matsuzaki T
    • 学会等名
      International Symposium on Foraminifera (FORAMS 2018)
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Abyssal ecosystems and biogeochemical cycles revealed by in-situ experiments.2018

    • 著者名/発表者名
      Nomaki H, Rastelli E, Amaro T, Tsuchiya M, Seike K, Kitahashi T, Suga H, Miyamoto N, Ogawa NO, Danovaro R, Nunoura T, Ohkouchi N
    • 学会等名
      15th Deep Sea Biology Symposium 2018
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Detecting the effect of scientific drilling on meiofauna with the traditional, metagenomic and image-based methods2018

    • 著者名/発表者名
      Kitahashi T, Sugime S, Nakamura M, Nishijima M, Inomata K, Tsuchiya M, Watanabe HK, Yamamoto H
    • 学会等名
      15th Deep Sea Biology Symposium 2018
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] A new small device made of glass for separating microplastics from marine sediments.2018

    • 著者名/発表者名
      Nakajima R, Tsuchiya M, Kitahashi T, Lindsay D, Fujikura K, Fukushima T
    • 学会等名
      The Association for the Sciences of Limnology and Oceanography (ASLO 2018)
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 深海底科学掘削に伴う掘削屑がメイオファウナ群集に与えた影響ーイメージング・フローサイトメーターを用いた結果との比較2018

    • 著者名/発表者名
      北橋 倫,杉目幸恵,土屋正史,渡部裕美,山本啓之
    • 学会等名
      日本地球惑星科学連合2018年大会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] 生態的要因による岩礁地性底生有孔虫の遺伝的集団の遷移と形成2018

    • 著者名/発表者名
      土屋正史,石渡祐一,吉田尊雄,藤倉克則
    • 学会等名
      日本古生物学会2018年年会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] 有孔虫類の分子生物学的研究2018

    • 著者名/発表者名
      土屋正史
    • 学会等名
      日本古生物学会2018年年会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 掘足類ヤカドツノガイと経卵伝達される細菌の関係2018

    • 著者名/発表者名
      生田哲朗,多米晃裕,高木善弘,齋藤正輝,力石嘉人,土屋正史,藤倉克則,吉田尊雄
    • 学会等名
      第2回日本共生生物学会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] アミノ酸窒素同位体比に基づく栄養段階推定によって明らかになった微小生息空間内の多様な資源利用形態2018

    • 著者名/発表者名
      土屋正史,力石嘉人,野牧秀隆,佐々木瑶子,多米晃裕,植松勝之,大河内直彦
    • 学会等名
      日本古生物学会第167回例会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] 底生有孔虫Globobulimina affinisの細胞立体構造・微細構造の特徴と貧酸素環境への適応戦略2018

    • 著者名/発表者名
      野牧秀隆,土屋正史,多米晃裕,矢生晋介,松崎琢也,村山雅史
    • 学会等名
      日本古生物学会第167回例会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] 有孔虫の起源と進化2018

    • 著者名/発表者名
      土屋正史
    • 学会等名
      2017年度微古生物学リファレンスセンター研究集会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Elphidiidae科有孔虫の系統関係の解明2018

    • 著者名/発表者名
      石渡祐一,土屋正史,吉田尊雄,藤倉克則
    • 学会等名
      2017年度微古生物学リファレンスセンター研究集会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] 嫌気環境下における底生有孔虫Ammonia sp.の適応機構2017

    • 著者名/発表者名
      土屋正史,野牧秀隆
    • 学会等名
      日本古生物学会2017年年会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] 深海底科学掘削に伴う掘削屑がメイオファウナ群集に与えた影響2017

    • 著者名/発表者名
      北橋 倫,杉目幸恵,土屋正史
    • 学会等名
      2017年日本プランクトン学会・日本ベントス学会合同大会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [図書] アメーバのはなし2018

    • 著者名/発表者名
      永宗 喜三郎、島野 智之、矢吹 彬憲(「2.8.2自由生活性」「コラム 微化石」を分担執筆)
    • 総ページ数
      152
    • 出版者
      朝倉書店
    • ISBN
      9784254171686
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2017-04-28   更新日: 2022-02-21  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi