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光合成系における光エネルギー伝達機構の理論的解明

研究課題

研究課題/領域番号 17K05757
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 物理化学
研究機関京都大学 (2018-2020)
琉球大学 (2017)

研究代表者

東 雅大  京都大学, 工学研究科, 准教授 (20611479)

研究期間 (年度) 2017-04-01 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2020年度)
配分額 *注記
4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円)
2020年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2019年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2018年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2017年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
キーワード光捕集アンテナ / 励起エネルギー移動 / 分子シミュレーション / 光合成色素 / 光捕集複合体 / 理論解析 / LH2 / バクテリオクロロフィル / FMOタンパク / 光合成 / 光エネルギー伝達 / 理論計算
研究成果の概要

本研究の目的は、我々が独自に開発してきた手法を活用し、光捕集アンテナの光エネルギー伝達機能とタンパク質の構造および揺らぎとの相関を分子論的に明らかにすることである。まず、光捕集アンテナに含まれる色素の励起エネルギーや色素の励起状態間のカップリングを解析したところ、実験結果とよく一致した。また、光エネルギーの伝達ダイナミクスを解析したところ、異なるタンパク質環境に置かれた色素の励起エネルギーの揺らぎの違いがエネルギー伝達を加速していることが明らかになった。また、光合成色素の高励起状態からの緩和過程も解析し、配位子が重要な役割を果たすことも明らかにした。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究では、光捕集アンテナが内部に含まれる色素の励起エネルギーの揺らぎを最適化することで効率的なエネルギー伝達を実現していることを明らかにした。さらに、極低温よりも室温で揺らぎを最適化していることも明らかにしている。これらの研究成果は、これまで解析が困難だった揺らぎの役割を初めて明らかにしたものであり、学術的意義は大きいと考えられる。今後、本研究で得られた成果が人工光合成や太陽電池などの分子設計の指針となることも期待される。

報告書

(5件)
  • 2020 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2019 実施状況報告書
  • 2018 実施状況報告書
  • 2017 実施状況報告書
  • 研究成果

    (31件)

すべて 2021 2020 2019 2018 2017 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (10件) (うち国際共著 4件、 査読あり 10件、 オープンアクセス 5件) 学会発表 (20件) (うち国際学会 7件、 招待講演 12件)

  • [国際共同研究] Universitat de Valencia(スペイン)

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Kabirimine, a New Cyclic Imine from an Okinawan Dinoflagellate2019

    • 著者名/発表者名
      Hermawan Idam、Higa Mikako、Hutabarat Philipus Uli Basa、Fujiwara Takeshi、Akiyama Kiyotaka、Kanamoto Akihiko、Haruyama Takahiro、Kobayashi Nobuyuki、Higashi Masahiro、Suda Shoichiro、Tanaka Junichi
    • 雑誌名

      Marine Drugs

      巻: 17 号: 6 ページ: 353-353

    • DOI

      10.3390/md17060353

    • NAID

      120006782210

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Effects of Water Addition on a Catalytic Fluorination of Dienamine2019

    • 著者名/発表者名
      Kuraoku Daiki、Yonamine Tsunaki、Koja Genta、Yoshida Norio、Arimitsu Satoru、Higashi Masahiro
    • 雑誌名

      Molecules

      巻: 24 号: 19 ページ: 3428-3428

    • DOI

      10.3390/molecules24193428

    • NAID

      120006800746

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Site-Dependent Fluctuations Optimize Electronic Energy Transfer in the Fenna?Matthews?Olson Protein2019

    • 著者名/発表者名
      Saito Shinji、Higashi Masahiro、Fleming Graham R.
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry B

      巻: 123 号: 46 ページ: 9762-9772

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.9b07456

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Intramolecular Vibrations Complement the Robustness of Primary Charge Separation in a Dimer Model of the Photosystem II Reaction Center2018

    • 著者名/発表者名
      Fujihashi Yuta、Higashi Masahiro、Ishizaki Akihito
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry Letters

      巻: 9 号: 17 ページ: 4921-4929

    • DOI

      10.1021/acs.jpclett.8b02119

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Vibrational and Molecular Properties of Mg2+ Binding and Ion Selectivity in the Magnesium Channel MgtE2018

    • 著者名/発表者名
      Kimura Tetsunari、Lorenz-Fonfria Victor A.、Douki Shintaro、Motoki Hideyoshi、Ishitani Ryuichiro、Nureki Osamu、Higashi Masahiro、Furutani Yuji
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry B

      巻: 122 号: 42 ページ: 9681-9696

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.8b07967

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] 光合成タンパク質の光励起状態の高精度モデリング2018

    • 著者名/発表者名
      HIGASHI Masahiro
    • 雑誌名

      生物物理

      巻: 58 号: 5 ページ: 270-274

    • DOI

      10.2142/biophys.58.270

    • NAID

      130007492287

    • ISSN
      0582-4052, 1347-4219
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Theoretical analysis of the domain-swapped dimerization of cytochrome c: An MD and 3D-RISM approach2018

    • 著者名/発表者名
      Yoshida Norio、Higashi Masahiro、Motoki Hideyoshi、Hirota Shun
    • 雑誌名

      The Journal of Chemical Physics

      巻: 148 号: 2 ページ: 025102-025102

    • DOI

      10.1063/1.5009785

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structural properties determining low K+affinity of the selectivity filter in the TWIK1 K+channel2018

    • 著者名/発表者名
      Tsukamoto Hisao、Higashi Masahiro、Motoki Hideyoshi、Watanabe Hiroki、Ganser Christian、Nakajo Koichi、Kubo Yoshihiro、Uchihashi Takayuki、Furutani Yuji
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: 293 号: 18 ページ: 6969-6984

    • DOI

      10.1074/jbc.ra118.001817

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Cinchona-Based Primary Amine Catalyzed a Proximal Functionalization of Dienamines: Asymmetric α-Fluorination of α-Branched Enals2017

    • 著者名/発表者名
      Arimitsu Satoru、Yonamine Tsunaki、Higashi Masahiro
    • 雑誌名

      ACS Catalysis

      巻: 7 号: 7 ページ: 4736-4740

    • DOI

      10.1021/acscatal.7b01178

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Two Furanosesterterpenoids from the Sponge Luffariella variabilis2017

    • 著者名/発表者名
      Ahmadi Peni、Higashi Masahiro、Voogd Nicole J. de、Tanaka Junichi
    • 雑誌名

      Marine Drugs

      巻: 15 号: 8 ページ: 249-249

    • DOI

      10.3390/md15080249

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] バクテリオクロロフィルaの励起状態緩和ダイナミクスに配位子が与える効果の解析2021

    • 著者名/発表者名
      高林侑示,佐藤啓文,東雅大
    • 学会等名
      京都大学福井謙一記念研究センターオンラインシンポジウム
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 分子動力学シミュレーションを用いた光捕集複合体LH2の吸収スペクトルの解析2021

    • 著者名/発表者名
      薮俊佑,佐藤啓文,東雅大
    • 学会等名
      日本化学会第101春季年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] バクテリアクロロフィルaの励起状態緩和ダイナミクスの理論解析2020

    • 著者名/発表者名
      高林侑示,東雅大,佐藤啓文
    • 学会等名
      分子科学会 オンライン討論会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 凝縮系における光反応ダイナミクスの理論解析2020

    • 著者名/発表者名
      東雅大
    • 学会等名
      第24回光科学若手研究会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] バクテリアクロロフィルaの励起状態緩和過程に関する理論的研究2020

    • 著者名/発表者名
      髙林 侑示,東 雅大,佐藤 啓文
    • 学会等名
      研究会「凝縮系の理論化学2020」
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] Theoretical study on excitation energy transfer in photosynthetic proteins2019

    • 著者名/発表者名
      Masahiro Higashi
    • 学会等名
      The 10th Conference of the Asian Consortium on Computational Materials Science
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 光合成タンパク質複合体の機能解明を目指して2019

    • 著者名/発表者名
      東 雅大
    • 学会等名
      QIQBセミナー「量子化学と量子情報・量子生命の接点」
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Toward a molecular understanding of excitation energy transfer in light-harvesting complexes2019

    • 著者名/発表者名
      Masahiro Higashi
    • 学会等名
      China-Japan-Korea Workshop on Theoretical & Computational Chemistry
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Theoretical study on excited-state reactions in condensed phases2018

    • 著者名/発表者名
      Masahiro Higashi
    • 学会等名
      The International Conference on Materials Research and Innovation
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 凝縮系の励起状態反応ダイナミクスの理論解析2018

    • 著者名/発表者名
      東 雅大
    • 学会等名
      第3回環境・生体の関わる物理・化学の研究会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 高効率ポテンシャル関数生成手法による光捕集複合体中の色素の励起エネルギーの大きさと揺らぎの定量的評価2018

    • 著者名/発表者名
      東 雅大,斉藤 真司
    • 学会等名
      第21回理論化学討論会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] 光捕集複合体の励起状態の高精度モデリング2018

    • 著者名/発表者名
      東 雅大,斉藤 真司
    • 学会等名
      第12回分子科学討論会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] 凝縮系の励起状態反応ダイナミクスの定量的理解を目指して2018

    • 著者名/発表者名
      東雅大
    • 学会等名
      第32回量子系分子科学研究セミナー
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Quantitative evaluation of site energies and their fluctuations of pigments in the light-harvesting complex with an efficient method for generating a potential energy surface2018

    • 著者名/発表者名
      Masahiro Higashi, Shinji Saito
    • 学会等名
      255 th ACS National Meeting & Exposition
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Theoretical analysis of regio- and stereoselectivity of new organic reactions2017

    • 著者名/発表者名
      Masahiro Higashi
    • 学会等名
      International Symposium on Pure & Applied Chemistry 2017
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Theoretical investigation of excited-state reactions and properties in condensed phases2017

    • 著者名/発表者名
      Masahiro Higashi
    • 学会等名
      國立交通大學應用化學系106年 前瞻跨領域基礎科學中心 尖端生物分子探測 専題演講
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Toward quantitative understanding of excitation energy transfer in light-harvesting complexes2017

    • 著者名/発表者名
      Masahiro Higashi
    • 学会等名
      The 9th Conference of the Asian Consortium on Computational Materials Science
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 高効率ポテンシャル関数生成手法による光捕集アンテナ中の色素の励起エネルギーの大きさと揺らぎの定量的評価2017

    • 著者名/発表者名
      東雅大
    • 学会等名
      レア・イベントの計算科学
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 凝縮系の反応ダイナミクスを記述可能な計算手法の開発と応用2017

    • 著者名/発表者名
      東雅大
    • 学会等名
      北大理論化学研究会:実践理論化学の最前線
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] シンコナアルカロイド触媒を用いた α,β-不飽和アルデヒドの高立体選択的フッ素化反応に関する理論的研究2017

    • 著者名/発表者名
      東雅大,喜屋武茜,亀井翔矢,與那嶺綱希,有光暁
    • 学会等名
      第20回理論化学討論会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書

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公開日: 2017-04-28   更新日: 2022-01-27  

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