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流入下水中ヒトウイルスの選択的メタゲノム解析による新規病原ウイルスの検出

研究課題

研究課題/領域番号 17K06614
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 土木環境システム
研究機関東京大学 (2018-2019)
お茶の水女子大学 (2017)

研究代表者

風間 しのぶ  東京大学, 大学院工学系研究科(工学部), 特任講師 (20749444)

研究期間 (年度) 2017-04-01 – 2020-03-31
研究課題ステータス 完了 (2019年度)
配分額 *注記
4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円)
2019年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2018年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2017年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
キーワード腸管系ウイルス / メタゲノム / 流入下水 / 未知塩基配列 / メタゲノム解析 / 下水 / 土木環境システム / ウイルス / 感染症 / ゲノム
研究成果の概要

一本鎖(+)RNAウイルスを効率的に検出する選択的メタゲノム解析手法を用いて、流入下水およびヒト便検体から新たなウイルスゲノムと考えられる配列を検出することに成功した。当該配列は流入下水検体(31検体)から100%、および胃腸炎患者便検体(50検体)から86%の割合で検出された。本研究で用いた手法により、将来的なウイルス感染症の早期検出が期待され、また、本研究で検出した配列は新たな糞便汚染指標としても有用であることが示唆された。

研究成果の学術的意義や社会的意義

途上国のみならず先進国においても,毎年ノロウイルス等の病原微生物による感染性胃腸炎が流行しており,我が国においてもその社会的損失は計り知れない。今後,社会の国際化や地球温暖化等による病原微生物の生態変化によって,新興ウイルスあるいは,これまで我が国では感染報告の無いウイルスによる新たな感染症の増加が懸念される。本研究では、新たなウイルスと考えられるゲノムの一部を下水から検出し、また地域における分布状況を示した。今後、本手法を応用することで、ウイルス感染症の発生状況を把握し,将来的なウイルス感染症の早期検出が期待される。

報告書

(4件)
  • 2019 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2018 実施状況報告書
  • 2017 実施状況報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2019 2018 2017

すべて 学会発表 (6件) (うち国際学会 1件、 招待講演 2件)

  • [学会発表] 下水由来ss(+)RNAウイルスゲノム中の未知塩基配列の探索2019

    • 著者名/発表者名
      森山一葉,風間しのぶ,真砂佳史,大瀧雅寛
    • 学会等名
      第53回 水環境学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書 2018 実施状況報告書
  • [学会発表] 下水中のノロウイルスモニタリングによる胃腸炎監視システム2019

    • 著者名/発表者名
      風間しのぶ, 三浦尚之,真砂佳史,今田義光,当广謙太郎,真中太佳史,劉暁芳,伊藤絵里香,渡部徹,植木洋,甲野藤弘憲,斉藤繭子,押谷仁,大村達夫
    • 学会等名
      ウイルス性下痢症研究会第31回学術集会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Exploring unidentifiable RNA virus sequences from metagenomic analysis of domestic wastewater2019

    • 著者名/発表者名
      Shinobu Kazama, Hitoha Moriyama, Yoshifumi Masago, Masahiro Otaki
    • 学会等名
      20th International Symposium on Health Related Water Microbiology
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 下水由来(+)ssRNAウイルスのメタゲノム解析を用いた未知胃腸炎ウイルスの探索2018

    • 著者名/発表者名
      風間しのぶ、真砂佳史、森山一葉、大瀧雅寛
    • 学会等名
      第5回環境水質工学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] nvestigation of Unknown Genomes through Metagenomic Analysis of (+)ssRNA Viruses in Wastewater2018

    • 著者名/発表者名
      Hitoha Moriyama, Shinobu Kazama, Yoshifumi Masago, and Masahiro Otaki
    • 学会等名
      the Water and Environment Technology Conference 2018
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] 下水由来ss (+) RNAウイルスメタゲノム中の未知塩基配列の探索2017

    • 著者名/発表者名
      風間 しのぶ,真砂 佳史,三浦 尚之,今田 義光,井原 賢,田中 宏明,森山 一葉,大瀧 雅寛
    • 学会等名
      第20回日本水環境学会シンポジウム
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書

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公開日: 2017-04-28   更新日: 2021-02-19  

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