一般集団におけるがん関連遺伝子群の機能未知多様体の発がんへの影響の検討

• 研究課題/領域番号: 17K07193
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 腫瘍診断学
• 研究機関: 地方独立行政法人宮城県立病院機構宮城県立がんセンター(研究所) (2018-2020); 東北大学 (2017)
• 研究代表者: 安田 純 地方独立行政法人宮城県立病院機構宮城県立がんセンター(研究所), 発がん制御研究部, 部長 (00281684)
• 研究分担者: 齋藤 さかえ 東北大学, 東北メディカル・メガバンク機構, 講師 (20335491)
• 研究期間 (年度): 2017-04-01 – 2021-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2020年度)
• 配分額: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円); 2019年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2018年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2017年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
• キーワード: がん素因遺伝子 / VUS / 前向きゲノムコホート / 家族性乳がん卵巣がん症候群 / 有害変異 / がん関連遺伝子 / 一般住民 / 全ゲノム解読 / ゲノム解析

研究成果の概要

家族性腫瘍関連遺伝子の中等度に病的なVUSについて東北大学の日本人全ゲノム参照パネルデータを元に、悪性腫瘍の既往歴・家族歴の蓄積を示すかを調査票情報に基づいて検討した。日本人標準ゲノムパネルである3.5KJPNv2に収載されている遺伝性乳がん卵巣がん症候群の原因遺伝子BRCA1/2について検討し、中等度に病的な変異の条件(CADD>25, Eigen>0.5, MAF<0.0005)を確立した。さらに、東北メディカル・メガバンク計画で収集された3.5万人の既往歴、家族歴情報と比較し、これら中等度の病的変異を持つコホート参加者の姉妹のがん罹患率が統計的に有意に高いことを示し欧文査読誌に報告した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

家族性腫瘍関連遺伝子の中等度に病的なVUSの腫瘍発症への寄与が統計学的に検出可能であることを示したのは前向きゲノムコホートが研究上有用であることを示した。また、こうした腫瘍関連遺伝子の中等度の病的変異を持つ個人にとってがんの発症予防や早期の検診受診などで直接利益が生まれる可能性がある。今後こうした中等度の病的変異をリスク要因として組み込んだ精密医療の確立に大きく資する研究成果と考えられる。

研究成果

• [雑誌論文] Study Profile of the Tohoku Medical Megabank Community-Based Cohort Study (2021)
  • 著者名/発表者名: Hozawa A, Tanno K, Nakaya N, Nakamura T, Tsuchiya N, Hirata T, Narita A, Kogure M, Nochioka K, Sasaki R, Takanashi N, Otsuka K, Sakata K, Kuriyama S, Kikuya M, 13名略, Kobayashi T, 53名略, Yamamoto M.
  • 雑誌名: Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｅｐｉｄｅｍｉｏｌｏｇｙ 巻: 31 号: 1 ページ: 65-76
  • DOI: 10.2188/jea.JE20190271
  • NAID: 130007966030
  • ISSN: 0917-5040, 1349-9092
  • 年月日: 2021-01-05
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Robustness of a Cancer Profiling Test Using Formalin-fixed Paraffin Embedded Tumor Specimens (2021)
  • 著者名/発表者名: ITO SHIN、SATO IKURO、MOCHIZUKI MAI、YAMAGUCHI KAZUNORI、TAMAI KEIICHI、MINATO TAKAMICHI、TANUMA NOBUHIRO、SHIMA HIROSHI、YASUDA JUN
  • 雑誌名: Anticancer Research 巻: 41 号: 3 ページ: 1341-1348
  • DOI: 10.21873/anticanres.14891
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] A global phylogenetic analysis of Japanese tonsil-derived Epstein-Barr virus strains using viral whole-genome cloning and long-read sequencing (2021)
  • 著者名/発表者名: Yajima Misako、Kakuta Risako、Saito Yutaro、Kitaya Shiori、Toyoda Atsushi、Ikuta Kazufumi、Yasuda Jun、Ohta Nobuo、Kanda Teru
  • 雑誌名: Journal of General Virology 巻: 102 号: 3
  • DOI: 10.1099/jgv.0.001549
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Construction and integration of three de novo Japanese human genome assemblies toward a population-specific reference (2021)
  • 著者名/発表者名: Takayama Jun、Tadaka Shu、Yano Kenji、Katsuoka Fumiki、Gocho Chinatsu、Funayama Takamitsu、Makino Satoshi、Okamura Yasunobu、Kikuchi Atsuo、Sugimoto Sachiyo、Kawashima Junko、Otsuki Akihito、Sakurai-Yageta Mika、Yasuda Jun、Kure Shigeo、Kinoshita Kengo、Yamamoto Masayuki、Tamiya Gen
  • 雑誌名: Nature Communications 巻: 12 号: 1 ページ: 226-226
  • DOI: 10.1038/s41467-020-20146-8
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Novel candidates of pathogenic variants of the BRCA1 and BRCA2 genes from a dataset of 3,552 Japanese whole genomes (3.5KJPNv2) (2021)
  • 著者名/発表者名: Tokunaga Hideki、Iida Keita、Hozawa Atsushi、Ogishima Soichi、Watanabe Yoh、Shigeta Shogo、Shimada Muneaki、Yamaguchi-Kabata Yumi、Tadaka Shu、Katsuoka Fumiki、Ito Shin、Kumada Kazuki、Hamanaka Yohei、Fuse Nobuo、Kinoshita Kengo、Yamamoto Masayuki、Yaegashi Nobuo、Yasuda Jun
  • 雑誌名: PLOS ONE 巻: 16 号: 1 ページ: e0236907-e0236907
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0236907
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Discovery of a chemical compound that suppresses expression of BEX2, a dormant cancer stem cell-related protein (2021)
  • 著者名/発表者名: Saijoh S, Nakamura-Shima M, Shibuya-Takahashi R, Ito R, Sugawara A, Yamazaki T, Imai T, Asada Y, Matsuura K, Iwai W, Wakui Y, Abue M, Kawamura S, Katayose Y, Fujimori H, Mochizuki M, Yasuda J, Yamaguchi K, Sugamura K,Satoh K, Katori Y, Tamai K.
  • 雑誌名: Biochemical and Biophysical Research Communications 巻: 537 ページ: 132-139
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2020.11.022
  • 査読あり
• [雑誌論文] BEX2 suppresses mitochondrial activity and is required for dormant cancer stem cell maintenance in intrahepatic cholangiocarcinoma (2020)
  • 著者名/発表者名: Tamai Keiichi、Nakamura-Shima Mao、Shibuya-Takahashi Rie、Kanno Shin-Ichiro、Yasui Akira、Mochizuki Mai、Iwai Wataru、Wakui Yuta、Abue Makoto、Yamamoto Kuniharu、Miura Koh、Mizuma Masamichi、Unno Michiaki、Kawamura Sadafumi、Sato Ikuro、Yasuda Jun、Yamaguchi Kazunori、Sugamura Kazuo、Satoh Kennichi
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 10 号: 1 ページ: 21592-21592
  • DOI: 10.1038/s41598-020-78539-0
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Aberrant (pro)renin receptor expression induces genomic instability in pancreatic ductal adenocarcinoma through upregulation of SMARCA5/SNF2H (2020)
  • 著者名/発表者名: Shibayama,Y., Takahashi, K., Yamaguchi, H., Yasuda, J., Yamazaki, D., Rahman, A., Fujimori, T., Fujisawa, Y., Takai, S., Furukawa, T., Nakagawa, T., Ohsaki, H., Kobara, H., Wong, J.H., Masaki, T., Yuzawa, Y., Kiyomoto, H., Yachida, S., Fujimoto, A., Nishiyama, A.
  • 雑誌名: Communications Biology 巻: 3 号: 1 ページ: 724-724
  • DOI: 10.1038/s42003-020-01434-x
  • NAID: 130008001357
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Analysis of HLA-G long-read genomic sequences in mother?offspring pairs with preeclampsia (2020)
  • 著者名/発表者名: Nishizawa Ayako、Kumada Kazuki、Tateno Keiko、Wagata Maiko、Saito Sakae、Katsuoka Fumiki、Mizuno Satoshi、Ogishima Soichi、Yamamoto Masayuki、Yasuda Jun、Sugawara Junichi
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 10 号: 1 ページ: 20027-20027
  • DOI: 10.1038/s41598-020-77081-3
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Identification of the novel variants in patients with chronic thromboembolic pulmonary hypertension (2020)
  • 著者名/発表者名: Yaoita N, Satoh K, Tatebe S, Yasuda S, Shimokawa H et al.
  • 雑誌名: J Am Heart Assoc . 巻: 9 号: 21 ページ: 1-12
  • DOI: 10.1161/jaha.120.015902
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Establishment of a Monoclonal Antibody That Recognizes Cysteine-Rich Domain 1 of Human CD271 (2020)
  • 著者名/発表者名: Morita Shinkichi、Mochizuki Mai、Shibuya-Takahashi Rie、Nakamura-Shima Mao、Yamazaki Tomoko、Imai Takayuki、Asada Yukinori、Matsuura Kazuto、Kawamura Sadafumi、Yamaguchi Kazunori、Yasuda Jun、Sugamura Kazuo、Katori Yukio、Satoh Kennichi、Tamai Keiichi
  • 雑誌名: Monoclonal Antibodies in Immunodiagnosis and Immunotherapy 巻: 39 号: 1 ページ: 6-11
  • DOI: 10.1089/mab.2019.0040
  • 査読あり
• [雑誌論文] Novel activating KRAS mutation candidates in lung adenocarcinoma (2020)
  • 著者名/発表者名: Abe Jiro、Tanuma Nobuhiro、Nomura Miyuki、Ito Shin、Kasugai Isao、Sato Ikuro、Tamai Keiichi、Mochizuki Mai、Yamaguchi Kazunori、Shima Hiroshi、Okada Yoshinori、Yasuda Jun
  • 雑誌名: Biochemical and Biophysical Research Communications 巻: 522 号: 3 ページ: 690-696
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2019.11.151
  • 査読あり
• [雑誌論文] CD109 promotes the tumorigenic ability and metastatic motility of pancreatic ductal adenocarcinoma cells (2020)
  • 著者名/発表者名: Hatsuzawa Yuuri、Yamaguchi Kazunori、Takanashi Tomoka、Sato Ikuro、Tamai Keiichi、Mochizuki Mai、Iwai Wataru、Wakui Yuta、Abue Makoto、Yamamoto Kuniharu、Yasuda Jun、Mizuma Masamichi、Unno Michiaki、Sugamura Kazuo
  • 雑誌名: Pancreatology 巻: 20 号: 3 ページ: 493-500
  • DOI: 10.1016/j.pan.2020.01.013
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of genetic alterations in extramammary Paget disease using whole exome analysis (2019)
  • 著者名/発表者名: Kiniwa Yukiko、Yasuda Jun、Saito Sakae、Saito Rumiko、Motoike Ikuko N.、Danjoh Inaho、Kinoshita Kengo、Fuse Nobuo、Yamamoto Masayuki、Okuyama Ryuhei
  • 雑誌名: Journal of Dermatological Science 巻: 94 号: 1 ページ: 229-235
  • DOI: 10.1016/j.jdermsci.2019.03.006
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Pathogenic mutations identified by a multimodality approach in 117 Japanese Fanconi anemia patients. (2019)
  • 著者名/発表者名: Mori M, Hira A, Yoshida K, Muramatsu H, Okuno Y, Shiraishi Y, Anmae M, Yasuda J, Tadaka S, Kinoshita K, Osumi T, Noguchi Y, Adachi S, Kobayashi R, Kawabata H, Imai K, Morio T, Tamura K, Takaori-Kondo A, Yamamoto M, Miyano S, Kojima S, Ito E, Ogawa S, Matsuo K, Yabe H, Yabe M, Takata M.
  • 雑誌名: Haematologica. 巻: - 号: 10 ページ: 1962-1973
  • DOI: 10.3324/haematol.2018.207241
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Construction of JRG (Japanese reference genome) with single-molecule real-time sequencing (2019)
  • 著者名/発表者名: Nagasaki Masao、（中略）、Yasuda Jun（２４人中２３番目）、Yamamoto Masayuki
  • 雑誌名: Human Genome Variation 巻: 6 号: 1 ページ: 1-18
  • DOI: 10.1038/s41439-019-0057-7
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Genome analyses for the Tohoku Medical Megabank Project towards establishment of personalized healthcare (2018)
  • 著者名/発表者名: Yasuda Jun、Kinoshita Kengo、et al.,
  • 雑誌名: The Journal of Biochemistry 巻: 165 号: 2 ページ: 139
  • DOI: 10.1093/jb/mvy096
  • NAID: 40021809939
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Regional genetic differences among Japanese populations and performance of genotype imputation using whole-genome reference panel of the Tohoku Medical Megabank Project (2018)
  • 著者名/発表者名: Yasuda Jun、et al.,
  • 雑誌名: BMC Genomics 巻: 19 号: 1 ページ: 551-551
  • DOI: 10.1186/s12864-018-4942-0
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Construction of full-length Japanese reference panel of class I HLA genes with single-molecule, real-time sequencing (2018)
  • 著者名/発表者名: Mimori T, Fumiki K, Sakae S、Naoki N, 、Akira O, Minegishi N, Kinoshita K, Nagasaki M, Yamamoto M
  • 雑誌名: Pharmacogenomics 巻: 63 号: 2 ページ: 213-230
  • DOI: 10.1038/s41397-017-0010-4
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Evaluation of reported pathogenic variants and their frequencies in a Japanese population based on a whole-genome reference panel of 2049 individuals article (2018)
  • 著者名/発表者名: Y Yamaguchi-Kabata, J Yasuda, O Tanabe, Y Suzuki, H Kawame, N Fuse, M Nagasaki, Y Kawai, K Kojima, F Katsuoka, S Saito, I Danjoh, I Motoike, R Yamashita, S Koshiba, D Saigusa, G Tamiya, S Kure, N Yaegashi, Y Kawaguchi, F Nagami, S Kuriyama, J Sugawara, N Minegishi, A Hozawa, T Takai-Igarashi, K Kinoshita, M Yamamoto.
  • 雑誌名: Journal of Human Genetics. 巻: 63 号: 2 ページ: 213
  • DOI: 10.1038/s10038-017-0347-1
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Identification of somatic genetic alterations in ovarian clear cell carcinoma with next generation sequencing (2017)
  • 著者名/発表者名: Shibuya Yusuke、Tokunaga Hideki、Saito Sakae、Shimokawa Kazurou、Katsuoka Fumiki、Bin Li、Kojima Kaname、Nagasaki Masao、Yamamoto Masayuki、Yaegashi Nobuo、Yasuda Jun
  • 雑誌名: Genes Chromosomes Cancer. 巻: 57 号: 2 ページ: 51-60
  • DOI: 10.1002/gcc.22507
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Genome-wide identification of inter-individually variable DNA methylation sites improves the efficacy of epigenetic association studies (2017)
  • 著者名/発表者名: Hachiya Tsuyoshi、Furukawa Ryohei、Shiwa Yuh、Ohmomo Hideki、Ono Kanako、Katsuoka Fumiki、Nagasaki Masao、Yasuda Jun、Fuse Nobuo、Kinoshita Kengo、Yamamoto Masayuki、Tanno Kozo、Satoh Mamoru、Endo Ryujin、Sasaki Makoto、Sakata Kiyomi、Kobayashi Seiichiro、Ogasawara Kuniaki、Hitomi Jiro、Sobue Kenji、Shimizu Atsushi
  • 雑誌名: NPJ Genom Med. 巻: 2 号: 1 ページ: 0016-5
  • DOI: 10.1038/s41525-017-0016-5
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] Mutation spectrum of MEF cells caused by overexpression of novel activating KRAS mutation candidates in lung adenocarcinoma (2020)
  • 著者名/発表者名: Jiro Abe, Nobuhiro Tanuma, Miyuki Nomura, Shin Ito, Isao Kasugai, Ikuro Sato, Keiichi Tamai, Mai Mochizuki, Kazunori Yamaguchi, Hiroshi Shima, Yoshinori Okada, Jun Yasuda
  • 学会等名: Annual Meeting of American Association of Cancer Research
  • 国際学会
• [学会発表] Variants of uncertain significance of the cancer predisposing genes in 3.5 thousand Japanese whole genome sequencing data (2019)
  • 著者名/発表者名: Jun Yasuda
  • 学会等名: AACR Annual Meeting 2019
  • 国際学会
• [学会発表] Identification of somatic genetic alterations in ovarian clear cell carcinomas with next generation seqeuencing (2017)
  • 著者名/発表者名: Yusuke Shibuya, (five others), Jun Yasuda
  • 学会等名: SRI 64th Annual Scientific Meeting
  • 国際学会
• [学会発表] Identification of somatic genetic alterations in ovarian clear cell carcinomas with next generation seqeuencing (2017)
  • 著者名/発表者名: Yusuke Shibuya, (five others), Jun Yasuda
  • 学会等名: 日本産婦人科学会