癌・幹細胞増殖性維持に関わる翻訳抑制複合体の形成原理と創薬に向けた分子基盤の構築

• 研究課題/領域番号: 17K07307
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 構造生物化学
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 永田 崇 京都大学, エネルギー理工学研究所, 准教授 (10415250)
• 研究期間 (年度): 2017-04-01 – 2021-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2020年度)
• 配分額: 4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円); 2019年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2018年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2017年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
• キーワード: Musashi / RNA / NMR / AFM / RNA結合 / 核酸結合 / DNAオリガミ

研究成果の概要

癌・幹細胞増殖性維持に関わるMusashi1 (Msi1)は、２つのRNA結合ドメインRBD1、RBD2を持つ。まず、RBD1が標的RNAを特異的に認識する原動力を水和の統計力学理論により解明した。また、RBD2:標的RNA複合体の立体構造を決定し、結合様式を明らかにした。Msi1 RBD1-RBD2:標的RNA複合体の構造モデルを構築するとともに、長さの異なる標的RNAと実際に結合出来ることを実験により検証した。神経変性疾患に関わるFUSが標的RNAとの結合により大きく構造変化することを実証した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

Msi1は種々の癌細胞において過剰発現しており創薬ターゲットである。本研究ではMsi1のRNA結合認識機構をミクロな視点で明らかにした。得られた知見と我々の方法論は、Msi1が標的RNAと結合するのを阻害する化合物のスクリーニング及び設計に役立てることが可能であり、既にスクリーニングにおいては活用されている。一方で、FUSの機能発現の理解につながる重要な知見をマクロな視点から得ることが出来た。

研究成果

• [国際共同研究] Goethe-University Frankfurt am Main(ドイツ)
• [国際共同研究] University at Albany(米国)
• [国際共同研究] Goethe University Frankfurt am Main(Germany)
• [雑誌論文] Non-coding RNA suppresses FUS aggregation caused by mechanistic shear stress on pipetting in a sequence-dependent manner (2021)
  • 著者名/発表者名: Hamad Nesreen、Yoneda Ryoma、So Masatomo, Kurokawa Riki、Nagata Takashi、Katahira Masato
  • 雑誌名: Scientific Reports, in press 巻: -
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Nucleus Accumbens-Associated Protein 1 Binds DNA Directly through the BEN Domain in a Sequence-Specific Manner (2020)
  • 著者名/発表者名: Nakayama Naomi、Sakashita Gyosuke、Nagata Takashi、Kobayashi Naohiro、Yoshida Hisashi、Park Sam-Yong、Nariai Yuko、Kato Hiroaki、Obayashi Eiji、Nakayama Kentaro、Kyo Satoru、Urano Takeshi
  • 雑誌名: Biomedicines 巻: 8 号: 12 ページ: 608-608
  • DOI: 10.3390/biomedicines8120608
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Observation of nucleic acids inside living human cells by in-cell NMR spectroscopy (2020)
  • 著者名/発表者名: Yamaoki Yudai、Nagata Takashi、Sakamoto Tomoki、Katahira Masato
  • 雑誌名: Biophysics and Physicobiology 巻: 17 号: 0 ページ: 36-41
  • DOI: 10.2142/biophysico.BSJ-2020006
  • NAID: 130007863867
  • ISSN: 2189-4779
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Direct visualization of the conformational change of FUS/TLS upon binding to promoter-associated non-coding RNA (2020)
  • 著者名/発表者名: Nesreen Hamad, Hiroki Watanabe, Takayuki Uchihashi, Riki Kurokawa, Takashi Nagata, and Masato Katahira
  • 雑誌名: Chemical Communications 巻: 56 号: 64 ページ: 9134-9137
  • DOI: 10.1039/d0cc03776a
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Development and structural determination of an anti-PrPC aptamer that blocks pathological conformational conversion of prion protein (2020)
  • 著者名/発表者名: Mashima Tsukasa、Lee Joon-Hwa、Kamatari Yuji O.、Hayashi Tomohiko、Nagata Takashi、Nishikawa Fumiko、Nishikawa Satoshi、Kinoshita Masahiro、Kuwata Kazuo、Katahira Masato
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 10 号: 1 ページ: 4934-4934
  • DOI: 10.1038/s41598-020-61966-4
  • NAID: 120006813315
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Recent progress of in-cell NMR of nucleic acids in living human cells (2020)
  • 著者名/発表者名: Yamaoki, Y., Nagata, T., Sakamoto, T., and Katahira, M.
  • 雑誌名: Biophysical Reviews 巻: - 号: 2 ページ: 411-417
  • DOI: 10.1007/s12551-020-00664-x
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] RNA sequence and length contribute to RNA-induced conformational change of TLS/FUS (2020)
  • 著者名/発表者名: Hamad Nesreen、Mashima Tsukasa、Yamaoki Yudai、Kondo Keiko、Yoneda Ryoma、Oyoshi Takanori、Kurokawa Riki、Nagata Takashi、Katahira Masato
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 10 号: 1 ページ: 2629-2629
  • DOI: 10.1038/s41598-020-59496-0
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Suppression of Fast Proton Conduction by Dilution of a Hydronium Solvate Ionic Liquid: Localization of Ligand Exchange (2020)
  • 著者名/発表者名: Kawata Kio、Kitada Atsushi、Tsuchida Naoki、Saimura Masayuki、Nagata Takashi、Katahira Masato、Fukami Kazuhiro、Murase Kuniaki
  • 雑誌名: Journal of The Electrochemical Society 巻: 167 号: 4 ページ: 046508-046508
  • DOI: 10.1149/1945-7111/ab75fc
  • NAID: 120007006216
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] How Does the Recently Discovered Peptide MIP Exhibit Much Higher Binding Affinity than an Anticancer Protein p53 for an Oncoprotein MDM2 (2019)
  • 著者名/発表者名: Yamada Tatsuya、Hayashi Tomohiko、Hikiri Simon、Kobayashi Naohiro、Yanagawa Hiroshi、Ikeguchi Mitsunori、Katahira Masato、Nagata Takashi、Kinoshita Masahiro
  • 雑誌名: Journal of Chemical Information and Modeling 巻: 59 号: 8 ページ: 3533-3544
  • DOI: 10.1021/acs.jcim.9b00226
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] An insight into the dependence of the deamination rate of human APOBEC3F on the length of single-stranded DNA, which is affected by the concentrations of APOBEC3F and single-stranded DNA (2019)
  • 著者名/発表者名: Wan Li、Kamba Keisuke、Nagata Takashi、Katahira Masato
  • 雑誌名: Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects 巻: In Press 号: 2 ページ: 129346-129346
  • DOI: 10.1016/j.bbagen.2019.04.011
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Identification of key residues for activities of atypical glutathione S-transferase of Ceriporiopsis subvermispora, a selective degrader of lignin in woody biomass, by crystallography and functional mutagenesis (2019)
  • 著者名/発表者名: Osman Wan Hasnidah Wan、Mikami Bunzo、Saka Naoki、Kondo Keiko、Lin Meng-I、Nagata Takashi、Katahira Masato
  • 雑誌名: International Journal of Biological Macromolecules 巻: 132 ページ: 222-229
  • DOI: 10.1016/j.ijbiomac.2019.03.199
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] The anti‐prion RNA aptamer R12 disrupts the Alzheimer's disease‐related complex between prion and amyloid β (2019)
  • 著者名/発表者名: Iida Mamiko、Mashima Tsukasa、Yamaoki Yudai、So Masatomo、Nagata Takashi、Katahira Masato
  • 雑誌名: The FEBS Journal 巻: 印刷中 号: 12 ページ: 2355-2365
  • DOI: 10.1111/febs.14819
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Structure of a serine-type glutathione S-transferase of Ceriporiopsis subvermispora and identification of the enzymatically important non-canonical residues by functional mutagenesis (2019)
  • 著者名/発表者名: Wan Osman Wan Hasnidah、Mikami Bunzo、Saka Naoki、Kondo Keiko、Nagata Takashi、Katahira Masato
  • 雑誌名: Biochemical and Biophysical Research Communications 巻: 510 号: 1 ページ: 177-183
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2019.01.076
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Classification of fungal glucuronoyl esterases (FGEs) and characterization of two new FGEs from Ceriporiopsis subvermispora and Pleurotus eryngii (2018)
  • 著者名/発表者名: Lin Meng-I、Hiyama Akiho、Kondo Keiko、Nagata Takashi、Katahira Masato
  • 雑誌名: Applied Microbiology and Biotechnology 巻: 102 号: 22 ページ: 9635-9645
  • DOI: 10.1007/s00253-018-9318-5
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Mechanism of protein-RNA recognition: analysis based on the statistical mechanics of hydration (2018)
  • 著者名/発表者名: Hayashi Tomohiko, Matsuda Tomoaki, Nagata Takashi, Katahira Masato, Kinoshita Masahiro
  • 雑誌名: Phys Chem Chem Phys 巻: 20 号: 14 ページ: 9167-9180
  • DOI: 10.1039/c8cp00155c
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Characterization of the glutathione S-transferases that belong to the GSTFuA class in Ceriporiopsis subvermispora : Implications in intracellular detoxification and metabolism of wood-derived compounds (2018)
  • 著者名/発表者名: Osman Wan Hasnidah Wan、Lin Meng-I、Kondo Keiko、Nagata Takashi、Katahira Masato
  • 雑誌名: Int J Biol Macromol 巻: 113 ページ: 1158-1166
  • DOI: 10.1016/j.ijbiomac.2018.03.029
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Characterisation of an aptamer against the Runt domain of AML1 (RUNX1) by NMR and mutational analyses (2018)
  • 著者名/発表者名: Takada Kenta、Amano Ryo、Nomura Yusuke、Tanaka Yoichiro、Sugiyama Shigeru、Nagata Takashi、Katahira Masato、Nakamura Yoshikazu、Kozu Tomoko、Sakamoto Taiichi
  • 雑誌名: FEBS Open Bio 巻: 8 号: 2 ページ: 264-270
  • DOI: 10.1002/2211-5463.12368
  • NAID: 120006457124
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Plastic roles of phenylalanine and tyrosine residues of TLS/FUS in complex formation with the G-quadruplexes of telomeric DNA and TERRA (2018)
  • 著者名/発表者名: Kondo Keiko、Mashima Tsukasa、Oyoshi Takanori、Yagi Ryota、Kurokawa Riki、Kobayashi Naohiro、Nagata Takashi、Katahira Masato
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 8 号: 1 ページ: 2864-2864
  • DOI: 10.1038/s41598-018-21142-1
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] High yield production of fungal manganese peroxidases by E. coli through soluble expression, and examination of the activities (2018)
  • 著者名/発表者名: Lin Meng-I、Nagata Takashi、Katahira Masato
  • 雑誌名: Protein Expr Purif 巻: 145 ページ: 45-52
  • DOI: 10.1016/j.pep.2017.12.012
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] The first successful observation of in-cell NMR signals of DNA and RNA in living human cells (2018)
  • 著者名/発表者名: Yamaoki Yudai、Kiyoishi Ayaka、Miyake Masayuki、Kano Fumi、Murata Masayuki、Nagata Takashi、Katahira Masato
  • 雑誌名: Phys Chem Chem Phys 巻: 20 号: 5 ページ: 2982-2985
  • DOI: 10.1039/c7cp05188c
  • NAID: 130007557810
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] The C-terminal cytidine deaminase domain of APOBEC3G itself undergoes intersegmental transfer for a target search, as revealed by real-time NMR monitoring (2018)
  • 著者名/発表者名: Kamba Keisuke、Nagata Takashi、Katahira Masato
  • 雑誌名: Phys Chem Chem Phys 巻: 20 号: 5 ページ: 2976-2981
  • DOI: 10.1039/c7cp05171a
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Influence of the DNA sequence/length and pH on deaminase activity, as well as the roles of the amino acid residues around the catalytic center of APOBEC3F (2018)
  • 著者名/発表者名: Wan Li、Nagata Takashi、Katahira Masato
  • 雑誌名: Phys Chem Chem Phys 巻: 20 号: 5 ページ: 3109-3117
  • DOI: 10.1039/c7cp04477a
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Conjugation of two RNA aptamers improves binding affinity to AML1 Runt domain (2017)
  • 著者名/発表者名: Nomura Yusuke、Yamazaki Kaori、Amano Ryo、Takada Kenta、Nagata Takashi、Kobayashi Naohiro、Tanaka Yoichiro、Fukunaga Junichi、Katahira Masato、Kozu Tomoko、Nakamura Yoshikazu、Haishima Yuji、Torigoe Hidetaka、Sakamoto Taiichi
  • 雑誌名: J Biochem 巻: 162 号: 6 ページ: 431-436
  • DOI: 10.1093/jb/mvx049
  • NAID: 40021421327
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Observation by Real-Time NMR and Interpretation of Length- and Location-Dependent Deamination Activity of APOBEC3B (2017)
  • 著者名/発表者名: Wan Li、Nagata Takashi、Morishita Ryo、Takaori-Kondo Akifumi、Katahira Masato
  • 雑誌名: ACS Chem Biol 巻: 12 号: 11 ページ: 2704-2708
  • DOI: 10.1021/acschembio.7b00662
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Backbone and side chain assignments of the second RNA-binding domain of Musashi-1 in its free form and in complex with 5-mer RNA (2017)
  • 著者名/発表者名: Iwaoka Ryo、Nagata Takashi、Tsuda Kengo、Imai Takao、Okano Hideyuki、Kobayashi Naohiro、Katahira Masato
  • 雑誌名: Biomol NMR Assign 巻: 11 号: 2 ページ: 265-268
  • DOI: 10.1007/s12104-017-9760-9
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Structural Insight into the Recognition of r(UAG) by Musashi-1 RBD2, and Construction of a Model of Musashi-1 RBD1-2 Bound to the Minimum Target RNA (2017)
  • 著者名/発表者名: Iwaoka Ryo、Nagata Takashi、Tsuda Kengo、Imai Takao、Okano Hideyuki、Kobayashi Naohiro、Katahira Masato
  • 雑誌名: Molecules 巻: 22 号: 7 ページ: 1207-1207
  • DOI: 10.3390/molecules22071207
  • NAID: 120006492019
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Development of an RNA aptamer that acquires binding capacity against HIV-1 Tat protein via G-quadruplex formation in response to potassium ions (2017)
  • 著者名/発表者名: Yamaoki, Y., Nagata, T., Mashima, T., Katahira, M.
  • 雑誌名: Chemical communications 巻: 53 号: 52 ページ: 7056-7059
  • DOI: 10.1039/c7cc03312e
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] Analysis of the interaction between Msi1 RBD1-RBD2 and RNAs (2020)
  • 著者名/発表者名: Tu. W. H, Kamba K, Nagata T, Katahira M
  • 学会等名: 第43回日本分子生物学会年会
• [学会発表] in-cell NMR 法による非標準構造を形成する DNA のヒト生細胞 内観測 (2020)
  • 著者名/発表者名: 阪本知樹，山置佑大，永田崇，片平正人
  • 学会等名: 第43回日本分子生物学会年会
• [学会発表] HIV Vif 5者複合体はAPOBEC3GとAPOBEC3Fの脱アミノ化を阻害する (2020)
  • 著者名/発表者名: 神庭 圭佑, 万 里, 雲財 悟, 森下 了, 永田 崇, 片平 正人
  • 学会等名: 第59回NMR討論会
• [学会発表] STRUCTURAL AND PHYSICAL BASIS FOR THE HIGHER AFFINITY TO ONCOPROTEIN MDM2 OF A PEPTIDE SELECTED WITH MRNA DISPLAY OVER TUMOR SUPPRESSOR P53 (2020)
  • 著者名/発表者名: Nagata T, Yamada T, Hayashi T, Hikiri S, Kobayashi N, Ikeguchi M, Katahira M, Kinoshita M, Yanagawa H
  • 学会等名: 64th Annual Meeting of the Biophysical Society, San Diego
  • 国際学会
• [学会発表] 天然変性領域を含むタンパク質のNMR解析 (2020)
  • 著者名/発表者名: 永田 崇
  • 学会等名: 蛋白研セミナー 生体系NMR法の最前線 基礎から学ぶ最新 NMR解析法（第一回）ー構造解析の自動化
  • 招待講演
• [学会発表] Heterologous expression and oxidative activity of four fungal ligninolytic enzymes by Pichia pastoris (2020)
  • 著者名/発表者名: Kenneth TSK, Kondo K, Nagata T, Katahira M
  • 学会等名: 日本農芸化学会2020年度大会
• [学会発表] 選択的白色腐朽菌が産する溶解性多糖モノオキシゲナーゼの構造および活性の解析 (2020)
  • 著者名/発表者名: 近藤 敬子, グエン フエン, ワンサミハルジャ アンドリー, 小瀧 努, 三上 文三, 渡辺 隆司, 永田 崇, 片平 正人
  • 学会等名: 日本農芸化学会2020年度大会
• [学会発表] リグニン・多糖複合体分解に関与する白色腐朽菌由来グルクロノイルエステラーゼの速度論解析および添加剤耐性 (2020)
  • 著者名/発表者名: 坂井勇太, 林孟宜, 檜山明穂, 米沢柚香, 近藤敬子, 永田崇, 片平正人
  • 学会等名: 日本農芸化学会2020年度大会
• [学会発表] In-cell NMR法を用いた非標準構造を形成する核酸の構造安定性の解析 (2020)
  • 著者名/発表者名: 阪本知樹, 山置佑大, 加納ふみ, 村田昌之, 永田崇, 片平正人
  • 学会等名: 第100回日本化学会年会
• [学会発表] リグニンオリゴマーモデルとセルラーゼ糖質結合モジュール間の相互作用を原子・分子レベルで可視化するためのNMR解析 (2020)
  • 著者名/発表者名: 徳永 有希, 永田 崇, 近藤 敬子, 片平 正人, 渡辺 隆司
  • 学会等名: 第70回日本木材学会大会
• [学会発表] Oxidative activity of four heterologously expressed fungal ligninolytic enzymes by Pichia pastoris (2020)
  • 著者名/発表者名: Kenneth TSK, Kondo K, Nagata T, Katahira M
  • 学会等名: 第70回日本木材学会大会
• [学会発表] STRUCTURAL AND PHYSICAL BASIS FOR THE HIGHER AFFINITY TO ONCOPROTEIN MDM2 OF A PEPTIDE SELECTED WITH MRNA DISPLAY OVER TUMOR SUPPRESSOR P53 (2020)
  • 著者名/発表者名: Nagata Takashi、Yamada Tatsuya、Hayashi Tomohiko、Hikiri Shimon、Kobayashi Naohiro、Ikeguchi Mitsunori、Katahira Masato、Kinoshita Masahiro、Yanagawa Hiroshi
  • 学会等名: 64th Annual Meeting of the Biophysical Society
  • 国際学会
• [学会発表] Structural and functional study of the G-quadruplex anti-prion RNA aptamer and in-cell NMR of nucleic acids (2019)
  • 著者名/発表者名: Nagata Takashi
  • 学会等名: International IPR Seminar, Open up a new era of structural biology with advanced NMR study
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Development of anti-prion RNA aptamers and destruction of the Alzheimer's disease-related complex (2019)
  • 著者名/発表者名: Mashima Tsukasa、Iida Mamiko、Lee Joon-Hwa、Yamaoki Yudai、So Masatomo、Kamatari Yuji O.、Hayashi Tomohiko、Kinoshita Masahiro、Kuwata Kazuo、Nagata Takashi、Katahira Masato
  • 学会等名: The 46th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry, The 3rd Annual Meeting of Japan Society of Nucleic Acids Chemistry
  • 国際学会
• [学会発表] AFMで測定したDNA粒子の特徴抽出と機械学習による四重鎖判別法の開発 (2019)
  • 著者名/発表者名: 田中陽一郎, 永田崇, 萩野俊郎
  • 学会等名: 第42回日本分子生物学会年会
• [学会発表] NADPH再生系を内包するハイブリッド型アゾレダクターゼの開発 (2019)
  • 著者名/発表者名: 堀内正隆, 永田崇, 片平正人, 小橋川敬博, 鈴木定彦, 落合正則
  • 学会等名: 第42回日本分子生物学会年会
• [学会発表] Promoter associated non-coding RNA, pncRNA, can diminish the aggregation of TLS caused by shearing stress (2019)
  • 著者名/発表者名: Hamad NH, Mashima T, Yamaoki Y, Kondo K, Yoneda R, Kurokawa R, Nagata T, Katahira, M
  • 学会等名: 第42回日本分子生物学会年会
• [学会発表] HIV Vifによるユビキチン化を介さないヒトAOBEC3G活性の阻害 (2019)
  • 著者名/発表者名: 神庭圭佑, 万里, 雲財悟, 森下了, 永田崇, 片平正人
  • 学会等名: 第42回日本分子生物学会年会
• [学会発表] Vif - CBFβ - CUL5 - ELOB - ELOC 複合体に結合するアプタマーの解析 (2019)
  • 著者名/発表者名: 熊谷紀志, 鈴木拓也, 関川湧斗, 神庭圭介, 万里, 永田佳代子, 高折晃史, 片平正人, 永田崇, 坂本泰一
  • 学会等名: 第42回日本分子生物学会年会
• [学会発表] 選択的白色腐朽菌に由来するLytic polysaccharide monooxygenaseのX線結晶構造および活性の解析 (2019)
  • 著者名/発表者名: 近藤敬子, Nuyen Nguyen, Andry Wangsamihardja, 小瀧努, 三上文三, 渡辺隆司, 永田崇, 片平正人
  • 学会等名: 第42回日本分子生物学会年会
• [学会発表] In-cell NMR法によるヒト生細胞内の核酸の構造およびダイナミクスの解析 (2019)
  • 著者名/発表者名: 山置佑大, 永田崇, 阪本知樹, 高見昇平, 加納ふみ, 村田昌之, 片平正人
  • 学会等名: 第42回日本分子生物学会年会
• [学会発表] ヒト生細胞内における核酸の非標準構造および構造安定性のin-cell NMR法を用いた解析 (2019)
  • 著者名/発表者名: 阪本知樹, 山置佑大, 加納ふみ, 村田昌之, 永田崇, 片平正人
  • 学会等名: 第42回日本分子生物学会年会
• [学会発表] In-cell NMR法によるヒト生細胞内における核酸‐リガンド相互作用の解析 (2019)
  • 著者名/発表者名: 高見昇平, 山置佑大, 加納ふみ, 村田昌之, 坂本秦一, 原田和雄, 永田崇, 片平正人
  • 学会等名: 第42回日本分子生物学会年会
• [学会発表] In-cell NMR法を用いたヒト生細胞内のDNAおよびRNAの構造安定性評価 (2019)
  • 著者名/発表者名: 山置佑大, 永田崇, 高見昇平, 阪本知樹, 片平正人
  • 学会等名: 第58回NMR討論会(2019)(NMR討論会・SEST2019連合大会)
• [学会発表] 非常に高い活性を有する抗プリオンRNAアプタマーの構造機能相関 (2019)
  • 著者名/発表者名: 永田崇, 真嶋司, Lee Joon-Hwa, 鎌足雄司, 林智彦, 木下正弘, 桑田一夫, 片平正人
  • 学会等名: 第58回NMR討論会(2019)(NMR討論会・SEST2019連合大会)
• [学会発表] The observation of in-cell NMR signals of nucleic acids in living human cells (2019)
  • 著者名/発表者名: Yamaoki Y, Kiyoishi A, Miyake M, Lin KH, Kano F, Murata M, Nagata T, Katahira M
  • 学会等名: 7th International Meeting of Quadruplex Nucleic Acids
  • 国際学会
• [学会発表] In-cell NMR法を用いたヒト生細胞内核酸の構造およびダイナミクスの評価 (2019)
  • 著者名/発表者名: 山置佑大, 永田崇, 清石 彩華, 三宅 雅之, 加納ふみ, 村田昌之, 片平正人
  • 学会等名: 第57回日本生物物理学会年会
• [学会発表] HIV Vif-ヒトE3ユビキチンリガーゼ複合体によるヒト抗ウイルス因子APOBEC3Gの脱アミノ化阻害の分子メカニズム (2019)
  • 著者名/発表者名: 神庭圭佑, 万里, 雲財悟, 森下了, 永田崇, 片平正人
  • 学会等名: 第57回日本生物物理学会年会
• [学会発表] The effect of the distance between the RNA sequences recognized by two RNA-binding domains on the affinity of the MSI1-RNA interaction (2019)
  • 著者名/発表者名: Tu Wei Hsm, 神庭 圭佑, 永田 崇, 片平 正人
  • 学会等名: 第57回日本生物物理学会年会
• [学会発表] NMR Analysis for Molecular Insight into the Interaction between Lignin and Carbohydrate Binding Module of Cel7A from Trichoderma reesei (2019)
  • 著者名/発表者名: Tokunaga, Y, Nagata, T, Kondo, K, Katahira, M, Watanabe, T
  • 学会等名: The 20th International Symposium on Wood, Fiber and Pulping Chemistry
  • 国際学会
• [学会発表] Structural analyses of covalent linkages between lignin and hemicellulose in wood cell walls (2019)
  • 著者名/発表者名: H. Nishimura, K. Nagata, M. Yamada, T. Nagata, M. Katahira, T. Watanabe
  • 学会等名: 1st International Lignin Symposium
  • 国際学会
• [学会発表] NMR study on Binding Sites of 13C-Lignin Oligomer Models with Carbohydrate Binding Module of Cel7A from Trichoderma reesei (2019)
  • 著者名/発表者名: Tokunaga, Y, Nagata, T, Kondo, K, Katahira, M, Watanabe, T
  • 学会等名: 1st International Lignin Symposium
  • 国際学会
• [学会発表] Strategy of lignocellulose conversion using catalysts with controlled affinity to lignin (2019)
  • 著者名/発表者名: Watanabe, T, Tokunaga, Y, Oshiro, S, Saito, K, Okano, H, Nishimura, H, Nagata, T, Kondo, K, Katahira, M, Isozaki, K, Takaya, H, Nakamura, M
  • 学会等名: 1st International Lignin Symposium
  • 国際学会
• [学会発表] セルラーゼ糖質結合モジュールに対するリグニンモデル吸着部位の解析 (2019)
  • 著者名/発表者名: 德永有希, 永田崇, 近藤敬子, 片平正人, 渡辺隆司
  • 学会等名: 第33回セルラーゼ研究会
• [学会発表] Disruption of the Alzheimer’s disease-related complex between prion and amyloid β by an anti-prion aptamer (2019)
  • 著者名/発表者名: T. Mashima, Y. M. Iida, Yamaoki, M. So, T. Nagata, M. Katahira
  • 学会等名: Commemorative International Symposium of the Japan Society of Nucleic Acids Chemistry (CISNAC) 2019
  • 国際学会
• [学会発表] In-cell NMR法を用いたヒト生細胞内の核酸の構造と安定性の評価 (2019)
  • 著者名/発表者名: 山置佑大, 永田崇, 清石彩華, 三宅雅之, Lin Kuan-Heng, 高見昇平, 加納ふみ, 村田昌之, 片平正人
  • 学会等名: 第21回日本RNA学会年会
• [学会発表] プリオンタンパク質の構造変換を抑制するRNAアプタマーの開発と構造決定 (2019)
  • 著者名/発表者名: 真嶋司, Lee Joon-Hwa, 鎌足雄司, 林智彦, 永田崇, 西川富美子, 西川諭, 木下正弘, 桑田一夫, 片平正人
  • 学会等名: 第21回日本RNA学会年会
• [学会発表] An insight into the target search and HIV Vif-dependent inactivation of APOBEC3F and APOBEC3G elucidated by tracking the deamination events (2019)
  • 著者名/発表者名: Kamba K, Wan L, Nagata T, Katahira M
  • 学会等名: 8th Asia-Pacific NMR Symposium
  • 国際学会
• [学会発表] APOBEC3FとAPOBEC3Gの脱アミノ化速度は、それら及びDNAの濃度、さらにDNAの長さに影響を受ける (2019)
  • 著者名/発表者名: 神庭圭佑, 万里, 永田崇, 片平正人
  • 学会等名: 第19回日本蛋白質科学会年会 第71回日本細胞生物学会大会 合同年次大会
• [学会発表] 白色腐朽菌Pleurotus eryngii由来のリグニン・多糖複合体分解酵素グルクロノイルエステラーゼの発現・精製・活性検証と各種添加剤の活性への影響に関する速度論解析 (2019)
  • 著者名/発表者名: 坂井勇太, 林孟宜, 檜山明穂, 近藤敬子, 永田崇, 片平正人
  • 学会等名: 第69回日本木材学会大会
• [学会発表] In-cell NMR studies on structure and dynamics of DNA and RNA introduced inside the living human cells (2018)
  • 著者名/発表者名: Yamaoki Yudai、Nagata Takashi、 Kiyoishi Ayaka、Miyake Masayuki、Kano Fumi、Murata Masayuki、Katahira Masato
  • 学会等名: ISNAC2018
  • 国際学会
• [学会発表] An RNA aptamer disrupts the interaction of prion protein with Amyloid β (2018)
  • 著者名/発表者名: Mamiko IIDA, Tsukasa MASHIMA, Yudai YAMAOKI, Masatomo SO, Takashi NAGATA, Masato KATAHIRA
  • 学会等名: 第56回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Classification of a lignin-carbohydrate complex (LCC) degradation enzymes, fungal glucuronoyl esterases (FGEs), and expression/ characterization of two new FGEs of white rot fungi (2018)
  • 著者名/発表者名: 林孟宜, 檜山明穂, 近藤敬子, 坂井勇太, 永田崇, 片平正人
  • 学会等名: 第63回リグニン討論会
• [学会発表] In-cell NMR法を用いたヒト生細胞内の核酸の解析 (2018)
  • 著者名/発表者名: 山置 佑大, 永田 崇, 清石 彩華, 三宅雅之, Lin Kuan-Heng, 高見昇平, 加納 ふみ, 村田 昌之, 片平 正人
  • 学会等名: 第41回日本分子生物学会年会
• [学会発表] HIV VifーヒトE3ユビキチンリガーゼ複合体はAPOBEC3Gの脱アミノ化を直接阻害する (2018)
  • 著者名/発表者名: 神庭圭佑，汪 寧馨，雲財 悟3，森下 了，永田崇，片平正人
  • 学会等名: 第41回日本分子生物学会年会
• [学会発表] Vif - CBFβ - CUL5 - ELOB - ELOC 複合体に結合する 2’F 化した aptamer の取得 (2018)
  • 著者名/発表者名: 関川 湧斗，水澤 果那，神庭 圭介，鈴木 拓也，万 里，片平 正人，永田 崇，坂本 泰一
  • 学会等名: 第41回日本分子生物学会年会
• [学会発表] Characteristics of the C-terminal domain of anti-viral factor APOBEC3G: mechanism behind a target search and inhibition by HIV-1 Vif protein (2018)
  • 著者名/発表者名: Kamba Keisuke、Nagata Takashi、Katahira Masato
  • 学会等名: XXVIII International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
  • 国際学会
• [学会発表] Structural and theoretical insights into the RNA-recognition mechanism by Musashi-1 (2018)
  • 著者名/発表者名: Nagata Takashi、Iwaoka Ryo、Tsuda Kengo、Imai Takao、Okano Hideyuki、Kobayashi Naohiro、 Katahira Masato
  • 学会等名: XXVIII International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
  • 国際学会
• [学会発表] Observation of imino proton signals of DNA and RNA introduced inside the living human cells by using in-cell NMR spectroscopy (2018)
  • 著者名/発表者名: Yudai Yamaoki, Tsukasa Mashima, Takashi Nagata, Masato Katahira
  • 学会等名: XXVIII International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
  • 国際学会
• [学会発表] MDM2-p53NTDとMDM2-MIPの結合自由エネルギーに見られる大きな差の物理起源 (2018)
  • 著者名/発表者名: Tatsuya Yamada, Tomohiko Hayashi, Simon Hikiri, Naohiro Kobayashi, Hiroshi Yanagawa, Mitsunori Ikeguchi, Masato Kinoshita, Takashi Nagata, Masahiro Kinoshita
  • 学会等名: 第56回日本生物物理学会年会
• [学会発表] In-cell NMR法を用いたヒト生細胞内のDNAおよびRNAの構造とダイナミクスの解析 (2018)
  • 著者名/発表者名: 山置 佑大, 永田 崇, 清石 彩華, 三宅雅之, 加納 ふみ, 村田 昌之, 片平 正人
  • 学会等名: 第57回NMR討論会
• [学会発表] 抗プリオン活性を有する四重鎖RNAの構造解析 (2018)
  • 著者名/発表者名: 真嶋司，Lee Joon-Hwa，林 智彦，西川富美子，鎌足雄司，永田崇，西川諭，桑田一夫，木下 正弘，片平正人
  • 学会等名: 第57回NMR討論会
• [学会発表] 抗プリオンアプタマーによるプリオンタンパク質とアミロイドβの相互作用の阻害 (2018)
  • 著者名/発表者名: 飯田 真美子, 真嶋 司, 山置 佑大, 宗 正智, 永田 崇, 片平正人
  • 学会等名: 第20回日本RNA学会年会
• [学会発表] HIV-1 RRE由来のRNA断片と人工ペプチドの相互作用の解析 (2018)
  • 著者名/発表者名: 野村祐介、渡邊 なつき，木名瀬智章，永田崇，片平正人，原田和雄，坂本泰一
  • 学会等名: 第20回日本RNA学会年会
• [学会発表] Vif-CBFβ-CUL5-ELOB-ELOC複合体に対するアプタマーの取得と解析 (2018)
  • 著者名/発表者名: 鈴木拓也，万里，関川湧斗，田中陽一郎，神庭圭介， 片平正人，永田崇，坂本泰一
  • 学会等名: 平成30年度日本生化学会関東支部例会
• [学会発表] HIV Vif-E3ユビキチンリガーゼ複合体と核酸の相互作用 (2018)
  • 著者名/発表者名: 神庭圭佑，永田崇，片平正人
  • 学会等名: 第18回日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] Detection of different conformational changes of Translocated in liposarcoma, TLS, upon its binding to various nucleic acids (2018)
  • 著者名/発表者名: Nesreen Hamad, Tsukasa Mashima, Yudai Yamaoki, Hiroki Watanabe, Takayuki Uchihashi, Riki Kurokawa, Takashi Nagata, Masato Katahira
  • 学会等名: 第18回日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] Evaluation of the structural stability and dynamics of nucleic acids inside the living cells by using in-cell NMR spectroscopy (2018)
  • 著者名/発表者名: Takashi Nagata, Yudai Yamaoki, Masato Katahira
  • 学会等名: The 18th Annual Meeting of the Protein Society of Japan
  • 招待講演
• [学会発表] セルラーゼ糖質結合モジュールとリグニン間相互作用部位のNMRによる解析 (2018)
  • 著者名/発表者名: 徳永有希、大城理志、永田崇、近藤敬子、西村裕志、片平正人、渡辺隆司
  • 学会等名: 第68回日本木材学会
• [学会発表] Modeling of the tandem RNA-binding domains of a neural and oncogenic protein, Musashi1, engaging the minimum target RNA (2017)
  • 著者名/発表者名: Ryo Iwaoka, Takashi Nagata, Kengo Tsuda, Takao Imai, Hideyuki Okano, Naohiro Kobayashi, Masato Katahira
  • 学会等名: 第40回日本分子生物学会年会
• [学会発表] The effect of different target nucleic acids on the structural change of TLS (2017)
  • 著者名/発表者名: Nesreen Hamad, Tsukasa Mashima, Hiroki Watanabe, Takayuki Uchihashi, Riki Kurokawa, Takashi Nagata, Masato Katahira
  • 学会等名: 第40回日本分子生物学会年会
• [学会発表] Studies on lytic polysaccharide monooxygenase (LPMO) from the selective white rot fungus, Ceriporiposis subvermispora (2017)
  • 著者名/発表者名: Yuu Iseki, Satoshi Oshiro, Takashi Nagata, Keiko Kondo, Hiroshi Nishimura, Masato Katahira, Takashi Watanabe
  • 学会等名: Humanosphere Science School 2017
  • 国際学会
• [学会発表] Analysis of Adsorption Mechanism between Carbohydrate Binding Module of Cellulase and Lignin by NMR (2017)
  • 著者名/発表者名: Yuki Tokunaga, Satoshi Oshiro, Takashi Nagata, Keiko Kondo, Hiroshi Nishimura, Masato Katahira, Takashi Watanabe
  • 学会等名: Humanosphere Science School 2017
  • 国際学会
• [学会発表] Analysis of Lignin-Carbohydrate Complexes in Woody Biomass by Using NMR (2017)
  • 著者名/発表者名: Shizuka Sakon, Hiroshi Nishimura, Misato Yamada, Yukari Ohta, Keiko Kondo, Yudai Yamaoki, Takashi Nagata, Masato Katahira, Takashi Watanabe
  • 学会等名: Humanosphere Science School 2017
  • 国際学会
• [学会発表] 翻訳開始前複合体において形成される翻訳開始因子間の結合ネットワークの役割 (2017)
  • 著者名/発表者名: 永田崇、吉田尚志、雲財悟、浦野健、浅野桂、尾林栄治
  • 学会等名: 第56回NMR討論会
• [学会発表] In-cell NMR法によるヒト細胞内DNAおよびRNAの観測 (2017)
  • 著者名/発表者名: 山置 佑大, 清石 彩華, 三宅雅之, 加納 ふみ, 村田 昌之, 永田 崇, 片平 正人
  • 学会等名: 第56回NMR討論会
• [学会発表] RNA結合タンパク質Musashi-1のRBD2:r(GUAGU)複合体溶液構造決定と標的RNA選択メカニズムの解明 (2017)
  • 著者名/発表者名: 岩岡諒，永田崇，津田健吾，今井貴雄，岡野栄之，小林直宏，片平正人
  • 学会等名: 第56回NMR討論会
• [学会発表] Characterization of the cytidine deamination properties of human APOBEC3B by real-time NMR, which are quite different from those of APOBEC3G (2017)
  • 著者名/発表者名: Li Wan, Takashi Nagata, Ryo Morishita, Akifumi Takaori-Kondo, Masato Katahira
  • 学会等名: The 44th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry, The 1st Annual Meeting of Japan Society of Nucleic Acids Chemistry
  • 国際学会
• [学会発表] 深層学習により強化されたNMR立体構造解析 (2017)
  • 著者名/発表者名: 小林直宏、永田崇、服部良一、新家粧子、Julia M. Wurz、Peter Guntert、児嶋長次郎、藤原敏道
  • 学会等名: 第56回NMR討論会
• [学会発表] Analysis of peroxidase activity, lignin model degradation of heterologous expressed soluble fungal ligninolytic enzymes (2017)
  • 著者名/発表者名: Meng-I Lin, Keiko Kondo, Takashi Nagata, Masato Katahira
  • 学会等名: 2017 Taiwan-Japan Biomedical Symposium on Magnetic Resonance
  • 国際学会
• [学会発表] Sphingombium sp. YG1由来guaiacylglycerol-β-guaiacyl ether - Cα位酸化酵素の酵素学的解析と利用 (2017)
  • 著者名/発表者名: 前田亜鈴悠、宋晶、西真郎、黒澤佳奈子、市川淳子、 塩谷美夏、山置佑大、永田崇、片平正人、山田美沙登、渡辺隆司、大田ゆかり
  • 学会等名: 第62回リグニン討論会
• [学会発表] フラグメント分子軌道法を活用したリグニンβ-O-4還元開裂酵素の機能改変 (2017)
  • 著者名/発表者名: 嶋根康弘、黒澤佳奈子、市川淳子、前田亜鈴悠、布浦拓郎、山置佑大、永田崇、片平正人、高谷光、吉田亮太、中村正治、渡辺隆司、大田ゆかり
  • 学会等名: 第62回リグニン討論会
• [学会発表] Kinetic studies of the two fungal glutathione-dependent enzymes and their potential roles in the intracellular detoxification and wood-derived compound metabolism (2017)
  • 著者名/発表者名: Wan Hasnidah Wan Osman, Meng-I Lin, Keiko Kondo, Takashi Nagata, Masato Katahira
  • 学会等名: 第62回リグニン討論会
• [学会発表] Development of the artificial multi-domain enzymes immobilized on the curdlan sheet at low cost. (2017)
  • 著者名/発表者名: Masataka Horiuchi, Takashi Nagata, Masato Katahira, Yoshihiro Kobashigawa, Yasuhiko Suzuki, Masanori Ochiai
  • 学会等名: The 8th International Symposium of Advanced Energy Science
  • 国際学会
• [学会発表] Structure-function relationship of Epstein-Barr Virus EBNA3C NLS and transport receptor (2017)
  • 著者名/発表者名: Go Matsuda, Takashi Nagata, Masato Katahira, Ken-ichi Imadome
  • 学会等名: The 8th International Symposium of Advanced Energy Science
  • 国際学会
• [学会発表] Development of RNA binding peptides based on tertiary structural information (2017)
  • 著者名/発表者名: Natsuki Watanabe, Tomoaki Kinase, Takashi Nagata, Masato Katahira, Kazuo Harada, and Taiichi Sakamoto
  • 学会等名: The 8th International Symposium of Advanced Energy Science
  • 国際学会
• [学会発表] テロメア長短縮をもたらすTLS/FUS蛋白質とテロメアDNAおよびTERRAのグアニン四重鎖との複合体に関するNMR解析 (2017)
  • 著者名/発表者名: 近藤 敬子、 真嶋 司、大吉 崇文、黒川 理樹、小林直宏、永田 崇、片平 正人
  • 学会等名: 第55回生物物理学会
• [学会発表] Influences of length and concentration of the DNA substrate, as well as the location of the target sequence, on deamination by APOBEC3F (2017)
  • 著者名/発表者名: Li Wan, Takashi Nagata, Masato Katahira
  • 学会等名: 第55回生物物理学会
• [学会発表] An anti-prion aptamer inhibits the formation of prion protein-amyloid β oligomer complex that is related to Alzheimer's disease (2017)
  • 著者名/発表者名: Mamiko IIDA, Tsukasa MASHIMA, Yudai YAMAOKI, Takashi NAGATA, Masato KATAHIRA
  • 学会等名: 第55回生物物理学会
• [学会発表] 18-crown-6を用いるヒドロニウム溶媒和イオン液体の基礎物性 (2017)
  • 著者名/発表者名: 北田敦、竹岡駿、近都康平、深見一弘、才村正幸、永田崇、片平正人、邑瀬邦明
  • 学会等名: 2017年電気化学会秋季大会
• [学会発表] TLS/FUSの非コードRNAの認識機構の構造学的研究 (2017)
  • 著者名/発表者名: 真嶋司, 小澤 駿介, Nesreen Hamad, 米田竜馬, 黒川 理樹, 永田崇, 片平 正人
  • 学会等名: 第19回日本RNA学会年会
• [学会発表] NMR法によるセルラーゼ糖質結合モジュール-リグニン間相互作用の解明 (2017)
  • 著者名/発表者名: 徳永有希、大城理志、永田崇、近藤敬子、西村裕志、片平正人、渡辺隆司
  • 学会等名: 第３１回セルラーゼ研究会
• [学会発表] Conformational change detection of translocated in liposarcoma, TLS, upon binding to various RNAs (2017)
  • 著者名/発表者名: Nesreen Hamad, Tsukasa Mashima,Yudai Yamaoki, Keiko Kondo, Takashi Nagata, Masato Katahira
  • 学会等名: 第19回日本RNA学会年会
• [学会発表] NMR Analysis of Interaction Mechanism between Carbohydrate Binding Module of Cellulase and Lignin (2017)
  • 著者名/発表者名: Yuki Tokunaga, Satoshi Oshiro, Keiko Kondo, Takashi Nagata, Hiroshi Nishimura, Masato Katahira, Takashi Watanabe
  • 学会等名: The 2nd Asia Research Node Symposium on Humanosphere Science
  • 国際学会
• [学会発表] HIV-1 RRE由来のRNA断片と人工ペプチドの相互作用の解析 (2017)
  • 著者名/発表者名: 渡邊 なつき，木名瀬智章，永田崇，片平正人，原田和雄，坂本泰一
  • 学会等名: 平成29年度日本生化学会関東支部例会
• [学会発表] TLS/FUSのRNA認識機構と結合に伴うコンフォーメーション変化の研究 (2017)
  • 著者名/発表者名: 真嶋 司, 小澤 駿介, Nesreen Hamad, 米田 竜馬, 黒川 理樹, 永田 崇, 片平 正人
  • 学会等名: 第17回日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] Highly automated NMR signal assignments using peak-noise recognition assisted by Deep Neural Networks (2017)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi, N., Nagata, T., Kojima, C., and Fujiwara, T.
  • 学会等名: Gordon Research Conference. Computational Aspects-Biomol NMR
  • 国際学会
• [学会発表] High yield production, activity analysis, and homologous modeling of soluble fungal peroxidases expressed in E. coli (2017)
  • 著者名/発表者名: Meng-I Lin, Keiko Kondo, Takashi Nagata, Masato Katahira
  • 学会等名: 第17回日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] APOBEC3Gのストランド間移動の実時間NMR法検出 (2017)
  • 著者名/発表者名: 神庭圭佑，永田崇，片平正人
  • 学会等名: 第17回日本蛋白質科学会年会
• [備考] 蛋白質－RNAの認識機構：水和の統計力学理論を用いた解析
  • URL: http://www.iae.kyoto-u.ac.jp/new-iae/NewsRelease/JP/2018/04/05-111751.html