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HIV-1複製制御に向けたスプライス暗号の解読

研究課題

研究課題/領域番号 17K08860
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 ウイルス学
研究機関徳島大学

研究代表者

野間口 雅子  徳島大学, 大学院医歯薬学研究部(医学域), 教授 (80452647)

研究期間 (年度) 2017-04-01 – 2020-03-31
研究課題ステータス 完了 (2019年度)
配分額 *注記
4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円)
2019年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2018年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2017年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
キーワードHIV-1 / 同義1塩基置換 / 適応 / Vif / 選択的スプライシング / Vpr / alternative splicing / スプライシング / 変異 / 遺伝子発現 / ウイルス複製 / 変異・適応 / ウイルス / RNAスプライシング
研究成果の概要

HIV-1の遺伝子発現は厳密に制御された過程であり、この過程の崩壊はウイルス複製に大きく影響する。我々は、HIV-1馴化実験・適応研究により、ウイルス複製に必須であるVifタンパク質の発現量調節領域(SA1D2prox)をウイルスゲノム上に同定した。SA1D2prox RNA内では、ステムループ構造(SLSA1)が形成される。変異体解析から、SLSA1のエネルギー安定性が増加すると、vif-mRNA産生量が低下することが分かり、SLSA1構造のウイルス学的意義が初めて明らかになった。さらに、ウイルス学的手法を駆使することで、これまで未同定であったVif発現量調節領域も見出した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

HIV-1 Vifタンパク質は、宿主細胞のウイルス抑制因子APOBEC3タンパク質群と拮抗するため、ウイルス複製に必須である。Vifの発現量や活性の変化は、ウイルス複製を変動させる主な要因の一つである。したがって、Vifの発現量調節機構の解明は極めて重要であるが、様々なHIV-1ゲノム配列や宿主因子群などが関与するため、その機構は非常に複雑である。本研究における詳細なウイルス学的研究により、Vif発現量調節に関与するゲノム領域と構造を明らかすることができた。今後、Vifの発現量調節機構の全貌解明を尚一層進展させ、Vif発現量を介したHIV-1複製制御手法の確立を目指す。

報告書

(4件)
  • 2019 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2018 実施状況報告書
  • 2017 実施状況報告書
  • 研究成果

    (26件)

すべて 2019 2018 2017

すべて 雑誌論文 (13件) (うち国際共著 1件、 査読あり 13件、 オープンアクセス 12件) 学会発表 (13件)

  • [雑誌論文] PIM kinases facilitate lentiviral evasion from SAMHD1 restriction via Vpx phosphorylation2019

    • 著者名/発表者名
      Miyakawa Kei、Matsunaga Satoko、Yokoyama Masaru、Nomaguchi Masako、Kimura Yayoi、Nishi Mayuko、Kimura Hirokazu、Sato Hironori、Hirano Hisashi、Tamura Tomohiko、Akari Hirofumi、Miura Tomoyuki、Adachi Akio、Sawasaki Tatsuya、Yamamoto Naoki、Ryo Akihide
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 10 号: 1 ページ: 1844-1844

    • DOI

      10.1038/s41467-019-09867-7

    • NAID

      120006949469

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Allosteric Regulation of HIV-1 Capsid Structure for Gag Assembly, Virion Production, and Viral Infectivity by a Disordered Interdomain Linker.2019

    • 著者名/発表者名
      2.Koma T, Kotani O, Miyakawa K, Ryo A, Yokoyama M, Doi N, Adachi A, Sato H, Nomaguchi M
    • 雑誌名

      Journal of Virology

      巻: 93 (17) 号: 17

    • DOI

      10.1128/jvi.00381-19

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Role for Gag-CA Interdomain Linker in Primate Lentiviral Replication2019

    • 著者名/発表者名
      Doi Naoya、Koma Takaaki、Adachi Akio、Nomaguchi Masako
    • 雑誌名

      Frontiers in Microbiology

      巻: 10

    • DOI

      10.3389/fmicb.2019.01831

    • NAID

      120006937679

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Expression Level of HIV-1 Vif Can Be Fluctuated by Natural Nucleotide Variations in the vif-Coding and Regulatory SA1D2prox Sequences of the Proviral Genome2019

    • 著者名/発表者名
      Doi Naoya、Koma Takaaki、Adachi Akio、Nomaguchi Masako
    • 雑誌名

      Frontiers in Microbiology

      巻: 10

    • DOI

      10.3389/fmicb.2019.02758

    • NAID

      120006937680

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Concomitant enhancement of HIV-1 replication potential and neutralization-resistance in concert with three adaptive mutations in Env V1/C2/C4 domains.2019

    • 著者名/発表者名
      Doi N, Yokoyama M, Koma T, Kotani O, Sato H, Adachi A, Nomaguchi M.
    • 雑誌名

      Frontiers in Microbiology

      巻: 10 ページ: 2510-2510

    • DOI

      10.3389/fmicb.2019.00002

    • NAID

      120006937678

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] CXCR4- and CCR5-tropic HIV-1 clones are both tractable to grow in rhesus macaques.2018

    • 著者名/発表者名
      Doi N, Miura T, Mori H, Sakawaki H, Koma T, Adachi A, and Nomaguchi M.
    • 雑誌名

      Frontiers in Microbiology

      巻: 9 ページ: 2510-2510

    • DOI

      10.3389/fmicb.2018.02510

    • NAID

      120006937677

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Virological characterization of HIV‐1 CA‐NTD mutants constructed in a virus‐lineage reflected manner2018

    • 著者名/発表者名
      Nakanishi Shouko、Watanabe sakimi、Doi Naoya、Koma Takaaki、Adachi Akio、Nomaguchi Masako
    • 雑誌名

      The Journal of Medical Investigation

      巻: 65 号: 1.2 ページ: 110-115

    • DOI

      10.2152/jmi.65.110

    • NAID

      130006575575

    • ISSN
      1343-1420, 1349-6867
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] HIV-1 mutates to adapt in fluxing environments2017

    • 著者名/発表者名
      Nomaguchi Masako、Doi Naoya、Koma Takaaki、Adachi Akio
    • 雑誌名

      Microbes and Infection

      巻: S1286-4579(17)30118-1 号: 9-10 ページ: 610-614

    • DOI

      10.1016/j.micinf.2017.08.003

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書 2017 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Comparison of Biochemical Properties of HIV-1 and HIV-2 Capsid Proteins2017

    • 著者名/発表者名
      Miyazaki Yasuyuki、Miyake Ariko、Doi Noya、Koma Takaaki、Uchiyama Tsuneo、Adachi Akio、Nomaguchi Masako
    • 雑誌名

      Frontiers in Microbiology

      巻: 8

    • DOI

      10.3389/fmicb.2017.01082

    • NAID

      120006937689

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Novel In Vitro Screening System Based on Differential Scanning Fluorimetry to Search for Small Molecules against the Disassembly or Assembly of HIV-1 Capsid Protein2017

    • 著者名/発表者名
      Miyazaki Yasuyuki、Doi Naoya、Koma Takaaki、Adachi Akio、Nomaguchi Masako
    • 雑誌名

      Frontiers in Microbiology

      巻: 8

    • DOI

      10.3389/fmicb.2017.01413

    • NAID

      120006937688

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Generation and characterization of new CCR5-tropic HIV-1rmt clones2017

    • 著者名/発表者名
      Doi Naoya、Sakai Yosuke、Adachi Akio、Nomaguchi Masako
    • 雑誌名

      The Journal of Medical Investigation

      巻: 64 号: 3.4 ページ: 272-279

    • DOI

      10.2152/jmi.64.272

    • NAID

      130006105186

    • ISSN
      1343-1420, 1349-6867
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Complete genome sequences of human immunodeficiency type 1 viruses genetically engineered to be tropic for rhesus macaques2017

    • 著者名/発表者名
      Nomaguchi Masako、Doi Naoya、Koma Takaaki、Adachi Akio
    • 雑誌名

      Genome Announcements

      巻: 5 号: 39

    • DOI

      10.1128/genomea.01063-17

    • NAID

      120007001411

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Production of HIV-1 vif mRNA Is Modulated by Natural Nucleotide Variations and SLSA1 RNA Structure in SA1D2prox Genomic Region2017

    • 著者名/発表者名
      Nomaguchi Masako、Doi Naoya、Yoshida Tomoya、Koma Takaaki、Adachi Shun、Ode Hirotaka、Iwatani Yasumasa、Yokoyama Masaru、Sato Hironori、Adachi Akio
    • 雑誌名

      Frontiers in Microbiology

      巻: 8 ページ: 2542-2542

    • DOI

      10.3389/fmicb.2017.02542

    • NAID

      120006937675

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] CCR5指向性HIV-1のEnv V3 tip内1アミノ酸変異による種特異的増殖促進の分子基盤2019

    • 著者名/発表者名
      土肥直哉、駒貴明、足立昭夫、野間口雅子
    • 学会等名
      第67回日本ウイルス学会学術集会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] HIV-1ゲノムのSA1D2prox変異と適応変異によるVif発現量決定機構の解析2019

    • 著者名/発表者名
      野間口雅子、駒貴明、土肥直哉、山本秀樹、渡邊京介、竹本真依、足立昭夫
    • 学会等名
      第67回日本ウイルス学会学術集会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] HIV-1 Gag集合初期に関わる集合促進因子の探索2019

    • 著者名/発表者名
      駒貴明、土肥直哉、中嶋敏司、足立昭夫、野間口雅子
    • 学会等名
      第67回日本ウイルス学会学術集会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] HIV-1 Gag集合初期に関わる内在性集合促進因子の探索2019

    • 著者名/発表者名
      駒貴明、土肥直哉、足立昭夫、野間口雅子
    • 学会等名
      第33回日本エイズ学会学術集会・総会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Biological analysis on virus growth enhancement by Env alterations identified in adapted R5-tropic HIV-1rmt clones2018

    • 著者名/発表者名
      土肥直哉,駒貴明,中西仁奈,吉田和子,足立昭夫,野間口雅子
    • 学会等名
      日本ウイルス学会学術集会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] HIV-1 SA1D2prox variant of low Vif type, NL-gat, enhances its growth by adaptive mutation to increase Vif level or by mutation in env2018

    • 著者名/発表者名
      野間口雅子,土肥直哉,駒貴明,吉田和子,足立昭夫
    • 学会等名
      日本ウイルス学会学術集会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] Analysis on viral adaptation process under a high APOBEC3G level of HIV-1 SA1D2prox variant, NL-tac, that expresses a faint amount of Vif2018

    • 著者名/発表者名
      足立昭夫,土肥直哉,駒貴明,大久保隼人,吉田和子,野間口雅子
    • 学会等名
      日本ウイルス学会学術集会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] Role for the Gag-CA linker domain in the late HIV-1 replication phase2018

    • 著者名/発表者名
      駒貴明,小谷治,土肥直哉,宮川 敬,梁明秀,横山勝,佐藤裕徳,足立昭夫,野間口雅子
    • 学会等名
      日本ウイルス学会学術集会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] HIV-1複製後期過程におけるGag-CA リンカー領域内アミノ酸残基S149及びIa50の役割.2017

    • 著者名/発表者名
      Koma, T., Doi, N., Miyakawa, K., Ryo, A., Adachi, A., and Nomaguchi, M.
    • 学会等名
      第65回日本ウイルス学会学術集会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] HIV-1 vif 産生量とSLSA1の構造・エネルギー庵芸性の連関解析.2017

    • 著者名/発表者名
      Adachi, A., Doi, N., Koma, T., Nakanishi, S., Watanabe, S., and Nomaguchi, M.
    • 学会等名
      第65回日本ウイルス学会学術集会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] Env domain swappingにより増殖効率が向上した馴化型R5-tropic HIV-1rmtの構築.2017

    • 著者名/発表者名
      Doi, N., Koma, T., Nakanishi, S., Watanabe, S., Nomaguchi, M., and Adachi, A.
    • 学会等名
      第65回日本ウイルス学会学術集会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] HIV-1 SA1D2prox Vif低発現変異体は複製抑制下で適応しVif発現を回復する.2017

    • 著者名/発表者名
      Watanabe, S., Nakanishi, S., Koma, T., Doi, N., Adachi, A., and Nomaguchi, M.
    • 学会等名
      第65回日本ウイルス学会学術集会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] HIV-1 Env V1/C4 domain 内の1アミノ酸変異は協調的にCD4親和性を増加させ、ウイルス増殖を促進する.2017

    • 著者名/発表者名
      Nakanishi, S., Watanabe, S., Doi, N., Koma, T., Adachi, A., and Nomaguchi, M.
    • 学会等名
      第65回日本ウイルス学会学術集会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書

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公開日: 2017-04-28   更新日: 2021-02-19  

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