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薬剤耐性アシネトバクターのゲノム疫学解析による耐性機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 17K10026
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 感染症内科学
研究機関大阪市立大学

研究代表者

金子 幸弘  大阪市立大学, 大学院医学研究科, 教授 (90469958)

研究分担者 仁木 満美子  大阪市立大学, 大学院医学研究科, 准教授 (20438229)
老沼 研一  大阪市立大学, 大学院医学研究科, 助教 (20635619)
掛屋 弘  大阪市立大学, 大学院医学研究科, 教授 (40398152)
鈴木 仁人  国立感染症研究所, 薬剤耐性研究センター, 主任研究官 (70444073)
研究期間 (年度) 2017-04-01 – 2020-03-31
研究課題ステータス 完了 (2019年度)
配分額 *注記
4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2019年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2018年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2017年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
キーワード薬剤耐性菌 / プラスミド / 全ゲノム解析 / アシネトバクター / カルバペネマーゼ / 網羅的遺伝子検出 / 耐性因子のリスト化 / 新規耐性遺伝子の検出 / 科学的・効率的な感染制御の実践 / 日和見感染症 / 臨床ゲノム
研究成果の概要

本研究では、科学的・効率的な感染制御の実践に寄与することを目指し、1)アシネトバクター属細菌の全ゲノム解析による耐性遺伝子の網羅的検出と解析(ドラフトゲノム解析、MLST解析、POT解析)および薬剤感受性、2)新規耐性因子の探索と解析、3)コリスチン耐性菌を指示菌とする新しい抗菌薬探索法の確立、4)プラスミドデータベースの作成を行った。1)に関しては、3つのカルバペネマーゼを保有する臨床分離株(OCUAc16株)や、15種以上のプラスミドを保有する臨床分離株(OCUAc18株)といった世界的にも希少な株を同定した。また、標準株であるATCC19606株の全ゲノム解析も完了した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

アシネトバクター属細菌の全ゲノム解析による耐性遺伝子の網羅的検出と解析(ドラフトゲノム解析、MLST解析、POT解析)および薬剤感受性によって、科学的・効率的な感染制御の実践に寄与した。また、コリスチン耐性菌を指示菌とする新しい抗菌薬探索法の確立し、増加傾向にあるグラム陰性薬剤耐性菌に対する新規抗菌薬のシーズが得られた。また、3つのカルバペネマーゼを保有する臨床分離株(OCUAc16株)や、15種以上のプラスミドを保有する臨床分離株(OCUAc18株)といった世界的にも希少な株のプラスミドを解析し、プラスミドデータベースの作成を行った。

報告書

(4件)
  • 2019 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2018 実施状況報告書
  • 2017 実施状況報告書
  • 研究成果

    (17件)

すべて 2020 2019 2018 2017 その他

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (12件) 図書 (1件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Genome-Based Epidemiological Analysis of 13 <i>Acinetobacter</i> Strains Isolated from Blood Cultures of Hospitalized Patients from a University Hospital in Japan2019

    • 著者名/発表者名
      Oinuma KI, Suzuki M, Nakaie K, Sato K, Saeki K, Sakiyama A, Takizawa E, Niki M, Niki M, Yamada K, Shibayama K, Kakeya H, Kaneko Y
    • 雑誌名

      Japanese Journal of Infectious Diseases

      巻: 72 号: 4 ページ: 274-280

    • DOI

      10.7883/yoken.JJID.2018.403

    • NAID

      130007682332

    • ISSN
      1344-6304, 1884-2836
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Successful Treatment of Intestinal Mycosis Caused by a Simultaneous Infection with <i>Lichtheimia ramosa</i> and <i>Aspergillus calidoustus</i>2018

    • 著者名/発表者名
      Kaneko Y, Oinuma KI, Terachi T, Arimura Y, Niki M, Yamada K, Kakeya H, Mizutani T
    • 雑誌名

      Internal Medicine

      巻: 57 号: 16 ページ: 2421-2424

    • DOI

      10.2169/internalmedicine.0254-17

    • NAID

      130007435932

    • ISSN
      0918-2918, 1349-7235
    • 年月日
      2018-08-15
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 耐性菌の疫学2020

    • 著者名/発表者名
      金子 幸弘
    • 学会等名
      第31回日本臨床微生物学会総会・学術集会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 多剤耐性アシネトバクター2019

    • 著者名/発表者名
      金子 幸弘
    • 学会等名
      第89回日本感染症学会西日本地方会学術集会・第62回日本感染症学会中日本地方会学術集会・第67回日本化学療法学会西日本支部総会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 微生物の基本を知る:耐性はどうして広がりやすいのか?2019

    • 著者名/発表者名
      金子 幸弘
    • 学会等名
      第34回日本環境感染学会総会・学術集会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] 当院で分離されたカルバペネム高度耐性Acinetobacter baumannii株のカルバペネマーゼ遺伝子の周辺構造と接合伝達性2019

    • 著者名/発表者名
      老沼 研一, 鈴木 仁人, 佐伯 康匠, 坪内 泰志, 仁木 満美子, 山田 康一, 柴山 恵吾, 掛屋 弘, 金子 幸弘
    • 学会等名
      第53回緑膿菌感染症研究会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] アシネトバクター属細菌の内因性因子によるカルバペネム耐性獲得機構の解析2019

    • 著者名/発表者名
      榮山 新, 老沼 研一, 金子 幸弘
    • 学会等名
      第53回緑膿菌感染症研究会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] わが国の現状2018

    • 著者名/発表者名
      金子 幸弘
    • 学会等名
      第92回日本感染症学会学術講演会・第66回日本化学療法学会総会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] 我が国における耐性菌の現状2018

    • 著者名/発表者名
      金子 幸弘
    • 学会等名
      日本臨床検査自動化学会第50回大会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] 薬剤耐性菌対策に向けた海洋微生物資源ライブラリの構築2018

    • 著者名/発表者名
      坪内 泰志, 小山 純弘, 金子 幸弘
    • 学会等名
      第22回天然薬物の開発と応用シンポジウム
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] 散発事例でのAcinetobacter baumanniiにおけるPOT法とMLSTでの遺伝子型の相違2018

    • 著者名/発表者名
      榮山 新, 老沼 研一, 鈴木 仁人, 佐藤 佳奈子, 佐伯 康匠, 中家 清隆, 滝沢 恵津子, 仁木 誠, 仁木 満美子, 山田 康一, 柴山 恵吾, 掛屋 弘, 金子 幸弘
    • 学会等名
      第52回緑膿菌感染症研究会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] 当院で分離されたカルバペネム高度耐性アシネトバクター株の耐性因子の特定と解析2018

    • 著者名/発表者名
      老沼 研一, 鈴木 仁人, 佐藤 佳奈子, 佐伯 康匠, 中家 清隆, 滝沢 恵津子, 仁木 誠, 仁木 満美子, 山田 康一, 柴山 恵吾, 掛屋 弘, 金子 幸弘
    • 学会等名
      第52回緑膿菌感染症研究会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] 血液由来のAcinetobacter baumanniiのPOT法とMLSTによる遺伝子型の比較2017

    • 著者名/発表者名
      榮山 新, 老沼 研一, 鈴木 仁人, 佐藤 佳奈子, 佐伯 康匠, 中家 清隆, 滝沢 恵津子, 仁木 誠, 仁木 満美子, 山田 康一, 柴山 恵吾, 掛屋 弘, 金子 幸弘
    • 学会等名
      第87回日本感染症学会西日本地方会学術集会・第60回日本感染症学会中日本地方会学術集会・第65回日本化学療法学会西日本支部総会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] NDM型とTMB型の2種のメタロ-β-ラクタマーゼを有するアシネトバクター属臨床分離株の発見と解析2017

    • 著者名/発表者名
      老沼 研一, 鈴木 仁人, 佐藤 佳奈子, 佐伯 康匠, 中家 清隆, 滝沢 恵津子, 仁木 誠, 仁木 満美子, 山田 康一, 柴山 恵吾, 掛屋 弘, 金子 幸弘
    • 学会等名
      第87回日本感染症学会西日本地方会学術集会・第60回日本感染症学会中日本地方会学術集会・第65回日本化学療法学会西日本支部総会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [図書] 染方史郎の楽しく覚えず好きになる感じる細菌学x抗菌薬2020

    • 著者名/発表者名
      金子 幸弘
    • 総ページ数
      347
    • 出版者
      じほう
    • ISBN
      9784840752640
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [備考] 細菌学テキスト

    • URL

      http://www.med.osaka-cu.ac.jp/bacteriology/b-online/btext/btext.shtml

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [備考] 大阪市立大学大学院医学研究科細菌学ホームページ 業績

    • URL

      http://www.med.osaka-cu.ac.jp/bacteriology/research_achievements/research-achievement.shtml

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書

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公開日: 2017-04-28   更新日: 2021-02-19  

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