• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

鉄硫黄クラスター生合成における反応中間体捕捉と触媒機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 17K14510
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 生体関連化学
研究機関埼玉大学

研究代表者

藤城 貴史  埼玉大学, 理工学研究科, 助教 (20740450)

研究期間 (年度) 2017-04-01 – 2020-03-31
研究課題ステータス 完了 (2019年度)
配分額 *注記
4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2019年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2018年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2017年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
キーワード鉄硫黄クラスター / 生合成 / 反応中間体 / X線結晶構造解析 / PLP / Chelatase / 枯草菌 / 構造ゲノム / 硫黄 / システイン / 鉄 / 触媒 / 酵素
研究成果の概要

生命活動に重要な無機補因子である鉄硫黄(Fe-S)クラスターの生合成系(NIF、ISC、SUF、SUF-likeマシナリー)における、硫黄供給酵素群の反応中間体の構造と触媒反応機構を明らかとした。NIFとSUF-likeマシナリーのシステイン脱硫酵素NifSとSufSが、共通の反応中間体PLP-L-システインを形成すること、並びに、触媒ループの構造の違いにより、硫黄運搬過程が異なることを示した。また、SufS-SufU複合体の構造解析により、SufUのZn周りの構造変化をスイッチとして、SufSによってL-システインから生成した無機硫黄がSufSからSufUへと、渡される触媒機構を解明した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

これまで鉄硫黄クラスター生合成系酵素の生化学的解析、遺伝学的解析、立体構造解析は数多くなされてきた。しかしながら、酵素それぞれの反応中間体の解析に焦点を当てて、生合成機構を化学的な観点から詳細に調べた例は多くなく、そのため本研究は挑戦的な試みであった。鉄硫黄クラスターの無機硫黄供給系の化学的な理解により、4種の異なる生合成系の多様性や分子進化について、分子構造の観点から考察が可能となったため、今後、鉄硫黄クラスターが環境に合わせた生物の進化・多様化によりどのような特性を獲得したかについて、生物学的な知見を得ることができるようになると期待される。

報告書

(4件)
  • 2019 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2018 実施状況報告書
  • 2017 実施状況報告書
  • 研究成果

    (25件)

すべて 2020 2019 2018 2017 その他

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 6件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (17件) (うち国際学会 4件、 招待講演 3件) 図書 (1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Snapshots of PLP‐substrate and PLP‐product external aldimines as intermediates in two types of cysteine desulfurase enzymes2019

    • 著者名/発表者名
      Nakamura Ryosuke、Hikita Masahide、Ogawa Shoko、Takahashi Yasuhiro、Fujishiro Takashi
    • 雑誌名

      The FEBS Journal

      巻: 287 号: 6 ページ: 1138-1154

    • DOI

      10.1111/febs.15081

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure of sirohydrochlorin ferrochelatase SirB: the last of the structures of the class II chelatase family2019

    • 著者名/発表者名
      Fujishiro Takashi、Shimada Yukino、Nakamura Ryosuke、Ooi Miho
    • 雑誌名

      Dalton Transactions

      巻: 48 号: 18 ページ: 6083-6090

    • DOI

      10.1039/c8dt04727h

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書 2018 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of IscU residues critical for de novo iron-sulfur cluster assembly2019

    • 著者名/発表者名
      Tanaka Naoyuki、Yuda Eiki、Fujishiro Takashi、Hirabayashi Kei、Wada Kei、Takahashi Yasuhiro
    • 雑誌名

      Molecular Microbiology

      巻: 112 号: 6 ページ: 1769-1783

    • DOI

      10.1111/mmi.14392

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Distinct roles for U-type proteins in iron-sulfur cluster biosynthesis revealed by genetic analysis of the Bacillus subtilis sufCDSUB operon2018

    • 著者名/発表者名
      Yokoyama Nao、Nonaka Chihiro、Ohashi Yukari、Shioda Masaharu、Terahata Takuya、Chen Wen、Sakamoto Kotomi、Maruyama Chihiro、Saito Takuya、Yuda Eiki、Tanaka Naoyuki、Fujishiro Takashi、Kuzuyama Tomohisa、Asai Kei、Takahashi Yasuhiro
    • 雑誌名

      Mol Microbiol

      巻: 107 号: 6 ページ: 688-703

    • DOI

      10.1111/mmi.13907

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Zinc-Ligand Swapping Mediated Complex Formation and Sulfur Transfer between SufS and SufU for Iron?Sulfur Cluster Biogenesis in Bacillus subtilis2017

    • 著者名/発表者名
      Fujishiro Takashi、Terahata Takuya、Kunichika Kouhei、Yokoyama Nao、Maruyama Chihiro、Asai Kei、Takahashi Yasuhiro
    • 雑誌名

      J Am Chem Soc

      巻: 139 号: 51 ページ: 18464-18467

    • DOI

      10.1021/jacs.7b11307

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mapping the key residues of SufB and SufD essential for biosynthesis of iron-sulfur clusters2017

    • 著者名/発表者名
      Yuda Eiki、Tanaka Naoyuki、Fujishiro Takashi、Yokoyama Nao、Hirabayashi Kei、Fukuyama Keiichi、Wada Kei、Takahashi Yasuhiro
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 7 号: 1 ページ: 9387-9387

    • DOI

      10.1038/s41598-017-09846-2

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 鉄硫黄クラスター生合成系のPLP依存型酵素SufSのシクロセリンによる阻害機構の解明2020

    • 著者名/発表者名
      小川 翔子, 中村 亮裕, 小松 茉里佳, 引田 理英, 藤城 貴史, 高橋 康弘
    • 学会等名
      日本化学会第100春季年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 鉄硫黄クラスター生合成SUF-likeマシナリーにおける亜鉛依存型硫黄運搬タンパク質SufUの構造と機能2019

    • 著者名/発表者名
      藤城 貴史, 寺畑 拓也, 島田 侑希乃, 高橋 康弘
    • 学会等名
      第92回日本生化学大会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 特殊な環境に生育する微生物由来の鉄硫黄クラスター生合成系の試験管再構成の試み2019

    • 著者名/発表者名
      國近 航平、藤城 貴史、山川 誠、和田 啓、高橋 康弘
    • 学会等名
      第92回日本生化学大会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 異なる2つのグループに属するシステインデスルフラーゼに対する阻害剤の作用機構の解析2019

    • 著者名/発表者名
      中村 亮裕、小松 茉莉佳、小川 翔子、國近 航平、藤城 貴史、高橋 康弘
    • 学会等名
      第92回日本生化学大会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 鉄硫黄クラスター生合成系における硫黄供給酵素のシステイン脱硫反応機構2019

    • 著者名/発表者名
      中村 亮裕、藤城 貴史、高橋 康弘
    • 学会等名
      2019年度 日本生化学会関東支部例会-ノーベル賞と生化学-
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Structure-function relationship of sirohydrochlorin ferrochelatase SirB2019

    • 著者名/発表者名
      T. Fujishiro, Y. Shimada, R. Nakamura, M. Ooi
    • 学会等名
      19th International Conference on Biological Inorganic Chemistry (ICBIC19)
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] X-ray crystallographic snapshots of catalytic intermediates of cysteine desulfurases2019

    • 著者名/発表者名
      R. Nakamura, T. Fujishiro, Y. Takahashi
    • 学会等名
      19th International Conference on Biological Inorganic Chemistry (ICBIC19)
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] X-ray crystallographic snapshots of sulfur mobilization to iron-sulfur cluster biosynthesis2018

    • 著者名/発表者名
      Takashi Fujishiro
    • 学会等名
      The International Symposium on Bioinorganic Chemistry 201
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] [Fe]-Hydrogenase-cofactor biosynthesis2018

    • 著者名/発表者名
      Takashi Fujishiro
    • 学会等名
      The 43rd International Conference on Coordination Chemistry (ICCC2018)
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Exploring an unusual Cys-rich motif-containing Fe-S enzyme2018

    • 著者名/発表者名
      Takashi Fujishiro, Miho Ooi, Yasuhiro Takahashi
    • 学会等名
      第91回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] Zinc-mediated sulfur acquisition by SufS-SufU complex involved in biosynthesis of iron-sulfur cluster in Bacillus subtilis2018

    • 著者名/発表者名
      Takashi Fujishiro, Takuya Terahata, Kunichika Kouhei, Chihiro Maruyama, Kei Asai, Yasuhiro Takahashi
    • 学会等名
      錯体化学会第68回討論会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] X-ray crystallographic snapshot of SufS-SufU complex in iron-sulfur cluster biosynthetic SUF-like machinery2018

    • 著者名/発表者名
      Takashi Fujishiro, Takuya Terahata, Kunichika Kouhei, Chihiro Maruyama, Kei Asai, Yasuhiro Takahashi
    • 学会等名
      第18回日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] 枯草菌の鉄硫黄クラスター生合成系の硫黄供給酵素複合体のX線結晶構造解析2018

    • 著者名/発表者名
      藤城 貴史・寺畑 拓也・國近 航平・横山 奈央・丸山 ちひろ・朝井 計・高橋 康弘
    • 学会等名
      日本化学会第98春季年会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] 超好熱性細菌の鉄硫黄クラスター生合成系:IscS2‐IscU複合体のX線結晶構造解析2018

    • 著者名/発表者名
      國近 航平・藤城 貴史・山川 誠・平林 佳・岩永 朋子・福山 恵一・和田 啓・高橋 康弘
    • 学会等名
      日本化学会第98春季年会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] 構造情報を利用した枯草菌由来金属キレターゼ様タンパク質の性状解析2017

    • 著者名/発表者名
      藤城 貴史・朝井 計・高橋 康弘
    • 学会等名
      2017年度生命科学系学会合同年次大会(ConBio2017)
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] The NIF machinery for iron-sulfur cluster biogenesis2017

    • 著者名/発表者名
      Takashi Fujishiro,Yasuhiro Takahashi
    • 学会等名
      第17回日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Elucidation of catalytic mechanism of cysteine desulfurase NifS of NIF machinery in iron-sulfur cluster biogenesis2017

    • 著者名/発表者名
      中村亮裕、藤城貴史,高橋康弘
    • 学会等名
      第17回日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [図書] Bioorganometallic Chemistry2020

    • 著者名/発表者名
      Prof. Dr. Wolfgang Weigand and Dr. Ulf-Peter Apfel, Ed.
    • 総ページ数
      435
    • 出版者
      De Gruyter
    • ISBN
      9783110496505
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [備考] システインから無機硫黄を取り出す酵素反応の瞬間を捉える!

    • URL

      http://www.saitama-u.ac.jp/topics_archives/2017-1215-0953-9.html

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2017-04-28   更新日: 2021-02-19  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi