| 研究課題/領域番号 |
17K15040
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| 研究種目 |
若手研究(B)
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| 配分区分 | 基金 |
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| 研究分野 |
ゲノム生物学
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| 研究機関 | 東京大学 (2018)
京都大学 (2017) |
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研究代表者 |
中村 正裕 東京大学, 大学院工学系研究科(工学部), 特任研究員 (40634449)
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| 研究期間 (年度) |
2017-04-01 – 2019-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2018年度)
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| 配分額 *注記 |
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2018年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
2017年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
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| キーワード | 心筋 / クロマチン / シングルセル / クロマチン構造 / 心筋細胞 / エピゲノム / 再生医学 |
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| 研究成果の概要 |
本研究では、ヒト多能性幹細胞から心筋細胞への分化各段階におけるクロマチン構造解析（オープンクロマチン領域の同定）及びシングルセル発現解析を行い、心筋分化を促進させる新規転写因子を同定し、また、新規転写因子が心筋細胞のクロマチン構造をどう変化させうるのかを、少数細胞を用いたChIP-seq解析およびシングルセル発現解析を用いることによって明らかにすることを目的とした。申請者は、改良版ATAC-seqを用いて、ヒト多能性幹細胞から心筋細胞への分化各段階における、オープンクロマチン領域を同定した。各サンプル間の比較、差分を行い、各時期に特異的なオープンクロマチン領域を同定することができた。
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| 研究成果の学術的意義や社会的意義 |
クロマチン構造は染色体上の様々な位置で開閉することにより転写因子と協調し、遺伝子発現を調節し、発生・分化段階における細胞の状態を制御しているが、ヒト心筋分化過程において各々のクロマチン構造がどのような順番で変化していくかは知られていなかった。申請者は、改良版ATAC-seqを用いて、ヒト多能性幹細胞から心筋細胞への分
化各段階における、オープンクロマチン領域を1塩基レベルで同定したことにより、オープンクロマチン領域の経時的変化が明らかとなった。分化特異的オープンクロマチン解析では新規転写因子の同定に成功した。今後これら転写因子の心筋分化における役割の解明を目指す。
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