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間期核内におけるセントロメアの三次元ゲノム構造の解明

研究課題

研究課題/領域番号 17K15041
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 ゲノム生物学
研究機関大阪大学

研究代表者

西村 浩平  大阪大学, 生命機能研究科, 特任助教(常勤) (80582709)

研究期間 (年度) 2017-04-01 – 2019-03-31
研究課題ステータス 完了 (2018年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2018年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
2017年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
キーワードセントロメア / 4C-seq / ヘテロクロマチン / 4C法 / Auxin inducible degron / 染色体
研究成果の概要

ニワトリDT40細胞を用いてゲノム間相互作用解析4C-seqを行なった。これにより、間期核内におけるセントロメアの特殊な構造が明らかとなった。また我々は通常とは別の位置にセントロメアが形成されているネオセントロメア株や標的とするタンパク質を短時間のうちに分解除去することが可能なAuxin Inducible Degron法を用いてこのセントロメアにおけるゲノム間相互作用に関わる因子を同定した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

遺伝情報を担う染色体の正確な分配は、細胞増殖に不可欠な現象であり、生命の基本原理とも言える。染色体分配の要となるキネトコア(動原体)はタンパク質の巨大複合体として染色体上のセントロメアDNA上に形成される。一方、セントロメア領域は、分裂期のみならず間期の核内でも特殊な構造と機能を有すると長く考えられてきたが、解析の困難さから間期のセントロメアの構造に関する知見は乏しかった。申請者はニワトリの細胞を用いることによって、間期核内におけるセントロメアの特殊な構造を検出することに成功した。この発見は間期細胞におけるセントロメアの役割解明に非常に重要なステップとなると期待される。

報告書

(3件)
  • 2018 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2017 実施状況報告書
  • 研究成果

    (8件)

すべて 2019 2018 2017

すべて 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 2件、 査読あり 3件、 オープンアクセス 2件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 2件)

  • [雑誌論文] 3D genomic architecture reveals that neocentromeres associate with heterochromatin regions2018

    • 著者名/発表者名
      Nishimura Kohei、Komiya Masataka、Hori Tetsuya、Itoh Takehiko、Fukagawa Tatsuo
    • 雑誌名

      The Journal of Cell Biology

      巻: 218 号: 1 ページ: 134-149

    • DOI

      10.1083/jcb.201805003

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] An efficient method to generate conditional knockout cell lines for essential genes by combination of auxin-inducible degron tag and CRISPR/Cas9.2017

    • 著者名/発表者名
      Nishimura K, Fukagawa T
    • 雑誌名

      Chromosome Res.

      巻: 25 号: 3-4 ページ: 816-829

    • DOI

      10.1007/s10577-017-9559-7

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Acute Inactivation of the Replicative Helicase in Human Cells Triggers MCM8-9-dependent DNA Synthesis2017

    • 著者名/発表者名
      Natsume T, Nishimura K, Minocherhomji S, Bhwmick R, Hickson ID, Kanemaki MT
    • 雑誌名

      Genes & Development

      巻: advanced online 号: 8 ページ: 816-829

    • DOI

      10.1101/gad.297663.117

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [学会発表] 4C解析による核内セントロメア構造 分子基盤とその役割の解明2019

    • 著者名/発表者名
      西村浩平
    • 学会等名
      第36回 染色体ワークショップ
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Easy construction of Auxin Inducible Degron mutants in vertebrate cells2018

    • 著者名/発表者名
      Kohei Nishimura
    • 学会等名
      Genome Editing and Functional Genomics 2018
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ネオセントロメアから迫るセントロメア領域における染色体構造の解析2018

    • 著者名/発表者名
      西村浩平
    • 学会等名
      第41回 日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 3D structural analysis of neo-centromere region in vertebrate cell2017

    • 著者名/発表者名
      Kohei Nishimura
    • 学会等名
      EMBP Workshop Dynamic Kinetochore
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ネオセントロメアから迫るセントロメア領域における染色体構造の解析2017

    • 著者名/発表者名
      Kohei Nishimura
    • 学会等名
      日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書

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公開日: 2017-04-28   更新日: 2020-03-30  

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