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CRISPRスクリーニングによるがん微小環境下での浸潤関連遺伝子の網羅的解析

研究課題

研究課題/領域番号 17K15045
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 ゲノム医科学
研究機関広島大学

研究代表者

中出 翔太  広島大学, 理学研究科, 研究員 (70795509)

研究期間 (年度) 2017-04-01 – 2019-03-31
研究課題ステータス 完了 (2018年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2018年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2017年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
キーワードゲノム編集 / CRISPR-Cas9 / がん細胞 / スクリーニング / ゲノム / 癌 / ノックイン
研究成果の概要

本研究では、乳がん細胞におけるCRISPR-Cas9を用いたノックアウトスクリーニングの基盤となる遺伝子改変の効率化技術としてLoAD法を開発した。同法は、ゲノム編集領域にDNAの二本鎖切断(DSB)修復因子を集積させることで遺伝子改変を効率化を可能にする。我々はこれにより培養細胞におけるノックイン効率の上昇、同時多重ノックインの実用化など多岐に応用可能であることを証明した。また、ウィルスベクターを用いてCas9タンパク質を恒常的に発現する乳がん細胞株の作製などの整備を実施した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

LoAD法の開発によって、ゲノム編集によるノックイン効率を大きく上昇させることに成功した。これは遺伝子改変細胞株の樹立効率を引き上げ、ゲノム編集を用いた遺伝学的解析に必要な期間を大幅に短縮する。また、CRISPR-Cas9の変異導入効率や遺伝子導入効率が低い細胞種でも改変株作製が高効率に可能になった。さらに同法は、局在化させるDSB 修復遺伝子をカスタマイズすることで、オーダーメイドな遺伝子改変を誘導する手法の発展に繋がる。

報告書

(3件)
  • 2018 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2017 実施状況報告書
  • 研究成果

    (10件)

すべて 2018 2017 その他

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (7件) (うち国際学会 4件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Biased genome editing using the local accumulation of DSB repair molecules system.2018

    • 著者名/発表者名
      Nakade S, Mochida K, Kunii A, Nakamae K, Aida T, Tanaka K, Sakamoto N, Sakuma T, Yamamoto T
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 9(1) 号: 1 ページ: 3270-3270

    • DOI

      10.1038/s41467-018-05773-6

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Cancer induction and suppression with transcriptional control and epigenome editing technologies.2017

    • 著者名/発表者名
      Nakade S, Yamamoto T, Sakuma T.
    • 雑誌名

      Journal of human genetics

      巻: 1 号: 2 ページ: 187-194

    • DOI

      10.1038/s10038-017-0377-8

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Parallel generation of multiplex knock-in cell collections using CRISPR-Cas9 assisted by locally enhanced MMEJ.2018

    • 著者名/発表者名
      Nakade Shota、Mochida Keiji、Kunii Atsushi、Nakamae Kazuki、Aida Tomomi、Tanaka Kohichi、Sakamoto Naoaki、Sakuma Tetsushi、Yamamoto Takashi
    • 学会等名
      FASEB Science Research Conference 2018
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Biased genome editing using the LoAD (local accumulation of DSB repair molecules) system.2018

    • 著者名/発表者名
      Nakade Shota、Mochida Keiji、Kunii Atsushi、Nakamae Kazuki、Aida Tomomi、Tanaka Kohichi、Sakamoto Naoaki、Sakuma Tetsushi、Yamamoto Takashi
    • 学会等名
      CHSL meeting 2018, Genome Engineering: The CRISPR/Cas Revolution.
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] LoADシステム:ゲノム編集において任意のDSB修復経路を誘導する汎用的手法2018

    • 著者名/発表者名
      中出翔太、持田圭次、中前和恭、相田知海、田中光一、坂本尚昭、佐久間哲史、山本卓
    • 学会等名
      第三回ゲノム編集学会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Biased genome editing using the LoAD (local accumulation of DSB repair molecules) system.2018

    • 著者名/発表者名
      Sakuma T, Nakade S, Mochida K, Nakamae K, Aida T, Tanaka K, Sakamoto N, and Yamamoto T.
    • 学会等名
      Precision Genome Editing with Programmable Nucleases (B1)
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 短い相同配列を介した遺伝子ノックインにおいて選択される DSB 修復経路の解析2017

    • 著者名/発表者名
      中出翔太、中前和恭、佐久間哲史、山本卓
    • 学会等名
      ConBio2017
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] Selective choice of MMEJ repair pathway and its accuracy profile during the process of PITCh knock-in.2017

    • 著者名/発表者名
      Nakade S, Sakuma T, Nakamae K, Yamamoto T
    • 学会等名
      CSHL meeting, Genome Engineering: The CRISPR/Cas Revolution
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] PITCh法によるノックインの過程で生じる DSB 修復経路の選択とその正確性2017

    • 著者名/発表者名
      中出翔太、中前和恭、佐久間哲史、山本卓
    • 学会等名
      第二回ゲノム編集学会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [備考] 広島大学 分子遺伝学研究室

    • URL

      http://www.mls.sci.hiroshima-u.ac.jp/smg/index.html

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書

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公開日: 2017-04-28   更新日: 2020-03-30  

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