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網羅的O型糖タンパク質定量プロファイル法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 17K15097
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 機能生物化学
研究機関公益財団法人がん研究会

研究代表者

芳賀 淑美  公益財団法人がん研究会, がんプレシジョン医療研究センター がんオーダーメイド医療開発プロジェクト, 研究員 (40525789)

研究期間 (年度) 2017-04-01 – 2019-03-31
研究課題ステータス 完了 (2018年度)
配分額 *注記
4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2018年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
2017年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
キーワード糖鎖 / 質量分析 / グライコプロテオミクス / 癌 / プロテオーム
研究成果の概要

本研究は、微量の生体試料中のO型糖鎖結合部位を網羅的に定量プロファイル解析する技術の開発に基づく、がん特異的O型糖鎖修飾タンパク質の同定を目的とした。O型糖鎖修飾部位を複数持つことが知られているモデルタンパク質を用いた実験では、非常に高い糖ペプチドの濃縮効率を達成し、未報告の新規O型糖鎖付加部位を複数同定することができた。さらにがん細胞抽出物を用いた解析では、ムチンやNF-κBなど、がんに関連する分子に実際にO型糖鎖修飾が起こっていることを確認した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

糖鎖のうちN型糖鎖は付加部位のコンセンサス配列や基幹構造と呼ばれる共通の基礎構造があり、全N型糖鎖を遊離可能な酵素PNGase-Fも知られているため比較的研究がよく進んでいる。しかし、O型糖鎖はこれらの規則、ツールが全て無く、従来法や最新の質量分析計を駆使しても単一タンパク質のO型糖鎖付加部位を決定することさえ困難な状況であった。本開発技術は、あらゆる生体サンプル中から網羅的にO型糖鎖付加部位の同定と付加頻度の定量化を一度の質量分析で同時に可能とする世界初の分析手法である。

報告書

(3件)
  • 2018 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2017 実施状況報告書
  • 研究成果

    (5件)

すべて 2019 2018 2017

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 2件)

  • [雑誌論文] Identification of Multisialylated LacdiNAc Structures as Highly Prostate Cancer Specific Glycan Signatures on PSA.2019

    • 著者名/発表者名
      Haga, Y., Uemura, M., Baba, S., Inamura, K., Takeuchi, K., Nonomura, N., and Ueda, K.
    • 雑誌名

      Analytical chemistry

      巻: 91 号: 3 ページ: 2247-2247

    • DOI

      10.1021/acs.analchem.8b04829

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 前立腺癌特異的PSA糖鎖構造の同定による高特異度前立腺癌マーカーPSA G-indexの開発2018

    • 著者名/発表者名
      芳賀淑美、植村元秀、稲村健太郎、竹内賢吾、野々村祝夫、植田幸嗣
    • 学会等名
      第77回日本癌学会学術総会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Rapid profiling of prostate cancer-specific PSA glycoforms as a specificity-enhanced secondary biomarker2018

    • 著者名/発表者名
      Yoshimi Haga, Motohide Uemura, Kentaro Inamura, Kengo Takeuchi, Norio Nonomura and Koji Ueda
    • 学会等名
      HUPO 2018
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Identification of highly prostate cancer-specific PSA glyco-isoforms (PSA G-index)2017

    • 著者名/発表者名
      Yoshimi Haga, Motohide Uemura, Norio Nonomura and Koji Ueda
    • 学会等名
      第76回日本癌学会学術総会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] Identification of highly prostate cancer-specific PSA glyco-isoforms (PSA G-index)2017

    • 著者名/発表者名
      Yoshimi Haga, Motohide Uemura, Norio Nonomura and Koji Ueda
    • 学会等名
      International Symposium"Systems Glycobiology and Beyond"
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 国際学会

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公開日: 2017-04-28   更新日: 2020-03-30  

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